Heatmap: Cluster_250 (HCCA)

View as: (view raw or zlog-transformed)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are normalized against highest expression of the row)

Gene	CCAP211/11P,High light	CCAP211/11P,Low light	CPCC90,BBM,72h,Autotrophy	CPCC90,BBM,97h,Mixotrophy	CPCC90,BBM,98h,Mixotrophy	CPCC90,BBM,120h,Mixotrophy	CPCC90,BBM,144h,Heterotrophy	NJ-7,20C	NJ-7,4C	UTEX259,20C	UTEX259,4C
Transcript_contig_12327 (12327)	0.79	1.0	0.44	0.51	0.57	0.34	0.67	0.75	0.24	0.72	0.31
Transcript_contig_13629 (13629)	0.71	0.82	0.47	0.66	1.0	0.35	0.41	0.84	0.02	0.31	0.21
Transcript_contig_1688 (1688)	0.53	0.76	0.27	0.65	1.0	0.29	0.26	0.47	0.09	0.17	0.16
Transcript_contig_2013 (2013)	0.45	0.67	0.31	0.66	1.0	0.25	0.44	0.59	0.06	0.06	0.1
Transcript_contig_2640 (2640)	0.36	0.48	0.3	0.43	1.0	0.16	0.28	0.64	0.05	0.32	0.18
Transcript_contig_4329 (4329)	0.94	1.0	0.43	0.85	0.98	0.71	0.83	0.99	0.04	0.52	0.29
Transcript_contig_4415 (4415)	0.58	0.78	0.22	0.46	0.99	0.31	0.4	1.0	0.12	0.58	0.33
Transcript_contig_53798 (53798)	0.65	0.88	0.43	0.78	1.0	0.46	0.6	0.75	0.12	0.39	0.26
Transcript_contig_54257 (54257)	0.62	0.9	0.19	0.46	0.52	0.66	0.68	1.0	0.11	0.43	0.26
Transcript_contig_54568 (54568)	0.47	0.51	0.31	0.53	1.0	0.15	0.33	0.36	0.22	0.31	0.25
Transcript_contig_54850 (54850)	0.44	0.57	0.28	0.39	1.0	0.17	0.23	0.5	0.13	0.3	0.19
Transcript_contig_5510 (5510)	0.78	1.0	0.3	0.56	0.71	0.49	0.76	0.93	0.09	0.45	0.25
Transcript_contig_55603 (55603)	0.45	0.58	0.15	0.51	1.0	0.18	0.27	0.48	0.02	0.3	0.19
Transcript_contig_55827 (55827)	0.82	1.0	0.24	0.69	0.79	0.36	0.62	0.86	0.51	0.28	0.34
Transcript_contig_55864 (55864)	0.7	0.93	0.38	0.53	0.61	0.65	0.57	1.0	0.26	0.44	0.31
Transcript_contig_56328 (56328)	0.72	0.92	0.33	0.79	1.0	0.35	0.41	0.58	0.18	0.44	0.24
Transcript_contig_56652 (56652)	0.75	0.85	0.3	0.73	1.0	0.26	0.4	0.5	0.29	0.24	0.21
Transcript_contig_57774 (57774)	0.7	0.85	0.26	0.36	0.35	0.42	0.68	1.0	0.34	0.54	0.25
Transcript_contig_57953 (57953)	0.71	0.78	0.41	0.62	1.0	0.38	0.53	0.9	0.04	0.65	0.31
Transcript_contig_58367 (58367)	0.85	0.96	0.53	0.55	0.65	0.63	1.0	0.97	0.01	0.6	0.32
Transcript_contig_58609 (58609)	0.84	1.0	0.32	0.51	0.61	0.54	0.65	0.79	0.35	0.7	0.43
Transcript_contig_58878 (58878)	0.49	0.7	0.21	0.31	0.46	0.39	0.66	1.0	0.2	0.33	0.21
Transcript_contig_59088 (59088)	0.58	0.78	0.17	0.59	1.0	0.31	0.34	0.76	0.09	0.32	0.26
Transcript_contig_59094 (59094)	0.72	0.92	0.25	0.64	0.83	0.44	0.32	1.0	0.07	0.38	0.29
Transcript_contig_59580 (59580)	0.48	0.71	0.23	0.49	0.66	0.4	0.44	1.0	0.22	0.33	0.22
Transcript_contig_59936 (59936)	0.81	1.0	0.17	0.48	0.8	0.64	0.88	0.99	0.05	0.72	0.31
Transcript_contig_59990 (59990)	0.71	0.88	0.27	0.52	0.72	0.45	0.5	1.0	0.08	0.42	0.28
Transcript_contig_60145 (60145)	0.47	0.68	0.34	0.75	0.9	0.35	0.42	1.0	0.05	0.32	0.27
Transcript_contig_60264 (60264)	0.8	1.0	0.5	0.75	0.87	0.3	0.59	0.86	0.04	0.55	0.38
Transcript_contig_60369 (60369)	0.44	0.64	0.23	0.54	1.0	0.28	0.27	0.8	0.14	0.47	0.25
Transcript_contig_60501 (60501)	0.79	1.0	0.27	0.64	0.62	0.6	0.63	0.96	0.06	0.56	0.25
Transcript_contig_61212 (61212)	0.74	1.0	0.27	0.72	0.87	0.55	0.55	0.79	0.17	0.54	0.33
Transcript_contig_61227 (61227)	0.66	0.86	0.25	0.62	1.0	0.24	0.43	0.78	0.07	0.18	0.16
Transcript_contig_61388 (61388)	0.47	0.63	0.3	0.74	1.0	0.21	0.3	0.53	0.03	0.23	0.18
Transcript_contig_61427 (61427)	0.53	0.64	0.19	0.73	1.0	0.27	0.37	0.79	0.03	0.25	0.27
Transcript_contig_61966 (61966)	0.8	0.94	0.55	0.46	0.45	0.62	0.9	1.0	0.68	0.41	0.28
Transcript_contig_69375 (69375)	0.58	0.84	0.33	0.81	1.0	0.12	0.27	0.51	0.08	0.25	0.18
Transcript_contig_78251 (78251)	0.47	0.61	0.34	0.7	1.0	0.26	0.39	0.65	0.25	0.3	0.26
Transcript_contig_78426 (78426)	0.75	1.0	0.2	0.55	0.59	0.51	0.73	0.91	0.47	0.31	0.2
Transcript_contig_78551 (78551)	0.7	0.96	0.2	0.71	0.8	0.55	0.79	1.0	0.04	0.56	0.34
Transcript_contig_78606 (78606)	0.46	0.73	0.43	0.51	1.0	0.17	0.43	0.93	0.03	0.37	0.21
Transcript_contig_78969 (78969)	0.67	0.95	0.12	0.52	0.59	0.56	0.4	1.0	0.3	0.44	0.2
Transcript_contig_79457 (79457)	0.8	1.0	0.39	0.73	0.86	0.48	0.71	0.76	0.21	0.59	0.35
Transcript_contig_79606 (79606)	0.76	1.0	0.22	0.54	0.8	0.34	0.45	0.81	0.04	0.42	0.21
Transcript_contig_80436 (80436)	0.58	0.69	0.24	0.56	1.0	0.25	0.46	0.84	0.0	0.65	0.31
Transcript_contig_89249 (89249)	0.72	0.87	0.28	0.6	1.0	0.31	0.46	0.92	0.3	0.42	0.31
Transcript_contig_89585 (89585)	0.76	1.0	0.25	0.55	0.47	0.57	0.71	0.81	0.05	0.51	0.21
Transcript_contig_90387 (90387)	0.72	0.99	0.29	0.57	1.0	0.52	0.45	0.99	0.03	0.47	0.25

Details

Expression values normalized per gene (using the maximum value, Green cells indicate low expression and red high. (Dark gray cells indicate missing values)