Heatmap: Cluster_226 (HCCA)

View as: (view raw or zlog-transformed)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are normalized against highest expression of the row)

Gene	CCAP211/11P,High light	CCAP211/11P,Low light	CPCC90,BBM,72h,Autotrophy	CPCC90,BBM,97h,Mixotrophy	CPCC90,BBM,98h,Mixotrophy	CPCC90,BBM,120h,Mixotrophy	CPCC90,BBM,144h,Heterotrophy	NJ-7,20C	NJ-7,4C	UTEX259,20C	UTEX259,4C
Transcript_contig_1066 (1066)	0.71	0.97	0.28	0.3	0.26	0.21	0.31	1.0	0.15	0.41	0.19
Transcript_contig_1155 (1155)	0.58	0.85	0.23	0.29	0.37	0.32	0.7	1.0	0.04	0.27	0.18
Transcript_contig_295 (295)	0.71	0.87	0.44	0.32	0.32	0.32	0.42	1.0	0.27	0.35	0.25
Transcript_contig_53905 (53905)	0.8	1.0	0.33	0.4	0.44	0.35	0.42	0.95	0.31	0.42	0.29
Transcript_contig_54032 (54032)	0.81	1.0	0.32	0.3	0.32	0.34	0.82	0.98	0.23	0.15	0.14
Transcript_contig_54076 (54076)	0.64	0.89	0.38	0.24	0.2	0.16	0.35	1.0	0.39	0.18	0.15
Transcript_contig_54117 (54117)	0.78	1.0	0.18	0.44	0.7	0.24	0.43	0.94	0.47	0.28	0.18
Transcript_contig_54388 (54388)	0.59	0.82	0.48	0.41	0.39	0.34	0.67	1.0	0.01	0.18	0.16
Transcript_contig_54502 (54502)	0.68	1.0	0.4	0.29	0.31	0.22	0.6	0.97	0.02	0.28	0.15
Transcript_contig_54734 (54734)	0.57	0.86	0.38	0.27	0.29	0.4	0.6	1.0	0.08	0.3	0.25
Transcript_contig_55255 (55255)	0.68	0.92	0.5	0.43	0.5	0.31	0.59	1.0	0.71	0.28	0.27
Transcript_contig_55466 (55466)	0.66	0.87	0.54	0.36	0.31	0.22	0.44	1.0	0.34	0.26	0.24
Transcript_contig_55483 (55483)	0.71	1.0	0.33	0.34	0.49	0.2	0.41	0.93	0.06	0.35	0.17
Transcript_contig_55560 (55560)	0.69	0.96	0.22	0.25	0.39	0.45	0.85	1.0	0.22	0.36	0.2
Transcript_contig_55592 (55592)	0.75	0.94	0.21	0.16	0.18	0.34	0.56	1.0	0.13	0.21	0.22
Transcript_contig_55946 (55946)	0.64	1.0	0.08	0.13	0.15	0.17	0.21	0.78	0.1	0.32	0.15
Transcript_contig_56084 (56084)	0.76	0.95	0.4	0.39	0.42	0.48	0.61	1.0	0.13	0.33	0.23
Transcript_contig_56147 (56147)	0.81	1.0	0.38	0.38	0.32	0.27	0.37	0.56	0.38	0.39	0.31
Transcript_contig_56621 (56621)	0.64	0.87	0.49	0.38	0.63	0.42	0.88	1.0	0.09	0.15	0.17
Transcript_contig_56663 (56663)	0.72	1.0	0.24	0.2	0.13	0.19	0.55	0.74	0.18	0.07	0.09
Transcript_contig_57391 (57391)	0.77	1.0	0.33	0.35	0.31	0.16	0.43	0.94	0.27	0.31	0.19
Transcript_contig_57544 (57544)	0.68	0.91	0.39	0.29	0.36	0.35	0.78	1.0	0.25	0.14	0.15
Transcript_contig_57728 (57728)	0.62	1.0	0.28	0.28	0.18	0.27	0.47	0.83	0.25	0.22	0.25
Transcript_contig_57812 (57812)	0.45	0.76	0.31	0.28	0.27	0.18	0.3	1.0	0.03	0.06	0.1
Transcript_contig_58055 (58055)	0.81	1.0	0.44	0.42	0.57	0.3	0.63	1.0	0.57	0.4	0.29
Transcript_contig_58154 (58154)	0.85	1.0	0.46	0.42	0.4	0.3	0.54	0.82	0.32	0.46	0.3
Transcript_contig_58202 (58202)	0.63	0.89	0.29	0.27	0.22	0.23	0.44	1.0	0.19	0.25	0.28
Transcript_contig_58346 (58346)	0.79	1.0	0.5	0.38	0.26	0.27	0.53	0.78	0.5	0.43	0.28
Transcript_contig_58583 (58583)	0.87	1.0	0.25	0.3	0.45	0.16	0.43	0.77	0.13	0.23	0.13
Transcript_contig_58905 (58905)	0.75	0.9	0.48	0.39	0.53	0.31	0.57	1.0	0.63	0.37	0.31
Transcript_contig_59869 (59869)	0.53	0.79	0.25	0.18	0.33	0.32	0.51	1.0	0.06	0.25	0.32
Transcript_contig_59977 (59977)	0.71	0.96	0.33	0.43	0.38	0.34	0.65	1.0	0.09	0.2	0.19
Transcript_contig_60062 (60062)	0.72	0.99	0.33	0.36	0.27	0.24	0.43	1.0	0.14	0.2	0.23
Transcript_contig_60505 (60505)	0.81	1.0	0.39	0.43	0.27	0.34	0.31	0.93	0.54	0.54	0.36
Transcript_contig_610 (610)	0.83	1.0	0.47	0.45	0.34	0.27	0.63	0.89	0.51	0.28	0.26
Transcript_contig_61037 (61037)	0.7	0.94	0.43	0.33	0.26	0.22	0.46	1.0	0.61	0.2	0.2
Transcript_contig_61219 (61219)	0.68	1.0	0.35	0.42	0.37	0.42	0.56	0.86	0.33	0.28	0.33
Transcript_contig_61340 (61340)	0.52	0.77	0.18	0.18	0.12	0.2	0.32	1.0	0.14	0.15	0.15
Transcript_contig_62169 (62169)	0.64	0.91	0.23	0.23	0.27	0.25	0.52	1.0	0.82	0.07	0.1
Transcript_contig_63216 (63216)	0.64	1.0	0.32	0.23	0.1	0.2	0.4	0.8	0.01	0.32	0.24
Transcript_contig_68360 (68360)	0.82	1.0	0.47	0.39	0.24	0.19	0.39	0.83	0.34	0.52	0.21
Transcript_contig_78038 (78038)	0.82	1.0	0.58	0.39	0.35	0.28	0.52	0.9	0.57	0.23	0.2
Transcript_contig_78359 (78359)	0.78	1.0	0.45	0.3	0.33	0.18	0.48	0.89	0.33	0.35	0.21
Transcript_contig_78446 (78446)	0.56	0.86	0.38	0.29	0.39	0.23	0.48	1.0	0.25	0.3	0.17
Transcript_contig_80115 (80115)	0.58	0.85	0.2	0.25	0.22	0.22	0.38	1.0	0.24	0.14	0.17
Transcript_contig_82547 (82547)	0.66	0.95	0.5	0.35	0.65	0.3	0.48	1.0	0.26	0.33	0.32
Transcript_contig_82825 (82825)	0.73	1.0	0.41	0.19	0.2	0.29	0.91	1.0	0.01	0.13	0.05
Transcript_contig_90163 (90163)	0.79	1.0	0.42	0.51	0.38	0.34	0.65	0.97	0.26	0.12	0.22
Transcript_contig_90398 (90398)	0.71	1.0	0.28	0.29	0.15	0.17	0.34	0.86	0.13	0.43	0.25
Transcript_contig_91405 (91405)	0.7	0.96	0.22	0.37	0.4	0.23	0.3	1.0	0.12	0.18	0.13
Transcript_contig_9361 (9361)	0.94	1.0	0.42	0.27	0.3	0.38	0.45	0.95	0.23	0.2	0.28

Details

Expression values normalized per gene (using the maximum value, Green cells indicate low expression and red high. (Dark gray cells indicate missing values)