Heatmap: Cluster_74 (HCCA)

View as: (view raw or zlog-transformed)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are normalized against highest expression of the row)

Gene	CCAP211/11P,High light	CCAP211/11P,Low light	CPCC90,BBM,72h,Autotrophy	CPCC90,BBM,97h,Mixotrophy	CPCC90,BBM,98h,Mixotrophy	CPCC90,BBM,120h,Mixotrophy	CPCC90,BBM,144h,Heterotrophy	NJ-7,20C	NJ-7,4C	UTEX259,20C	UTEX259,4C
Transcript_contig_1069 (1069)	0.74	0.98	0.16	0.83	0.91	0.51	0.6	1.0	0.03	0.29	0.23
Transcript_contig_10705 (10705)	0.79	1.0	0.48	0.66	0.93	0.74	0.98	0.82	0.16	0.16	0.2
Transcript_contig_10977 (10977)	0.64	0.69	0.59	0.54	0.77	0.83	1.0	0.56	0.19	0.67	0.47
Transcript_contig_12375 (12375)	0.45	0.37	0.22	1.0	0.26	0.19	0.9	0.23	0.0	0.19	0.4
Transcript_contig_1248 (1248)	0.43	0.47	0.32	1.0	0.77	0.18	0.71	0.07	0.27	0.17	0.16
Transcript_contig_180 (180)	0.47	0.64	0.43	0.69	0.77	0.43	0.7	1.0	0.21	0.77	0.58
Transcript_contig_1995 (1995)	0.44	0.47	0.43	0.83	1.0	0.34	0.81	0.38	0.09	0.07	0.12
Transcript_contig_2102 (2102)	0.68	0.84	0.58	0.89	1.0	0.32	0.92	0.8	0.37	0.38	0.3
Transcript_contig_2170 (2170)	0.29	0.3	0.31	0.87	1.0	0.38	0.66	0.28	0.0	0.1	0.12
Transcript_contig_2434 (2434)	0.42	0.53	0.19	0.94	1.0	0.28	0.55	0.63	0.04	0.25	0.17
Transcript_contig_2523 (2523)	0.23	0.35	0.45	0.42	1.0	0.33	0.77	0.48	0.0	0.28	0.13
Transcript_contig_2715 (2715)	0.51	0.52	0.66	0.77	1.0	0.39	0.8	0.56	0.02	0.23	0.19
Transcript_contig_3329 (3329)	0.61	0.91	0.71	0.93	0.78	0.58	0.76	1.0	0.11	0.53	0.23
Transcript_contig_3647 (3647)	0.46	0.48	0.41	0.59	0.91	0.26	0.66	1.0	0.32	0.52	0.33
Transcript_contig_4404 (4404)	0.47	0.76	0.36	0.86	1.0	0.17	0.47	0.81	0.06	0.35	0.15
Transcript_contig_4490 (4490)	0.77	0.83	0.68	1.0	0.66	0.66	0.91	0.83	0.02	0.18	0.41
Transcript_contig_5334 (5334)	0.59	0.71	0.57	1.0	1.0	0.34	0.77	0.71	0.05	0.3	0.22
Transcript_contig_53841 (53841)	0.65	0.75	0.7	0.73	1.0	0.39	0.91	0.99	0.08	0.38	0.28
Transcript_contig_54031 (54031)	0.67	0.72	0.15	0.66	1.0	0.36	0.85	0.79	0.0	0.13	0.13
Transcript_contig_54153 (54153)	0.61	0.77	0.72	0.72	0.8	0.37	0.88	1.0	0.01	0.12	0.11
Transcript_contig_54256 (54256)	0.73	1.0	0.17	0.9	0.81	0.45	0.9	0.61	0.18	0.35	0.21
Transcript_contig_54508 (54508)	0.44	0.74	0.6	0.9	1.0	0.09	0.56	0.46	0.44	0.3	0.16
Transcript_contig_54573 (54573)	0.51	0.59	0.41	0.66	1.0	0.22	0.53	0.64	0.45	0.15	0.19
Transcript_contig_54640 (54640)	0.55	0.57	0.22	0.66	1.0	0.3	0.54	0.49	0.08	0.34	0.21
Transcript_contig_54868 (54868)	0.54	0.63	0.17	0.64	1.0	0.31	0.41	0.41	0.22	0.12	0.15
Transcript_contig_54922 (54922)	0.34	0.51	0.57	0.47	0.66	0.23	0.48	1.0	0.12	0.1	0.08
Transcript_contig_55037 (55037)	0.26	0.41	0.83	1.0	0.98	0.34	0.8	0.74	0.08	0.08	0.16
Transcript_contig_55213 (55213)	0.33	0.34	0.68	0.79	1.0	0.32	0.93	0.62	0.04	0.11	0.12
Transcript_contig_55344 (55344)	0.4	0.5	0.31	0.72	1.0	0.48	0.6	0.62	0.24	0.07	0.3
Transcript_contig_55395 (55395)	0.6	0.72	0.5	0.83	0.73	0.51	0.92	1.0	0.02	0.22	0.2
Transcript_contig_56088 (56088)	0.54	0.75	0.17	0.78	1.0	0.49	0.9	0.7	0.03	0.49	0.27
Transcript_contig_56374 (56374)	0.69	1.0	0.38	0.43	0.43	0.76	0.88	0.77	0.13	0.71	0.39
Transcript_contig_56377 (56377)	0.43	0.48	0.41	0.74	1.0	0.27	0.42	0.67	0.53	0.25	0.25
Transcript_contig_56467 (56467)	0.5	0.52	0.51	0.61	1.0	0.4	0.69	0.5	0.04	0.23	0.17
Transcript_contig_56647 (56647)	0.39	0.42	0.52	0.85	1.0	0.45	0.74	0.52	0.07	0.17	0.23
Transcript_contig_56688 (56688)	0.49	0.61	0.57	0.88	0.98	0.37	0.74	1.0	0.25	0.42	0.33
Transcript_contig_56695 (56695)	0.63	0.84	0.36	0.4	0.43	0.34	0.65	1.0	0.25	0.09	0.08
Transcript_contig_56723 (56723)	0.46	0.51	0.75	0.92	1.0	0.28	0.65	0.51	0.15	0.07	0.14
Transcript_contig_56991 (56991)	0.65	0.77	0.27	0.55	1.0	0.29	0.72	0.68	0.33	0.79	0.54
Transcript_contig_57357 (57357)	0.7	0.91	0.65	0.8	0.78	0.35	0.86	1.0	0.01	0.33	0.25
Transcript_contig_58110 (58110)	0.39	0.62	0.58	0.74	0.98	0.26	0.73	1.0	0.28	0.38	0.28
Transcript_contig_58260 (58260)	0.45	0.53	0.77	0.85	1.0	0.4	0.86	0.74	0.23	0.21	0.24
Transcript_contig_58391 (58391)	0.58	0.69	0.71	0.88	1.0	0.41	0.86	0.8	0.09	0.09	0.11
Transcript_contig_58608 (58608)	0.36	0.51	0.8	0.83	1.0	0.26	0.55	0.69	0.15	0.25	0.25
Transcript_contig_58764 (58764)	0.39	0.52	0.93	0.87	1.0	0.32	0.56	0.59	0.21	0.06	0.09
Transcript_contig_58772 (58772)	0.5	0.65	0.56	0.66	0.55	0.3	0.64	1.0	0.03	0.24	0.16
Transcript_contig_58825 (58825)	0.74	0.87	0.78	1.0	0.92	0.61	0.84	0.94	0.18	0.54	0.44
Transcript_contig_58919 (58919)	0.72	1.0	0.75	0.83	0.98	0.29	0.5	0.86	0.28	0.09	0.13
Transcript_contig_58958 (58958)	0.41	0.67	0.82	1.0	0.97	0.49	0.75	0.99	0.69	0.32	0.24
Transcript_contig_59009 (59009)	0.64	0.71	0.14	0.75	1.0	0.34	0.95	0.75	0.03	0.14	0.16
Transcript_contig_59022 (59022)	0.46	0.64	0.33	0.41	0.59	0.31	0.61	1.0	0.07	0.06	0.15
Transcript_contig_59053 (59053)	0.67	0.86	0.61	0.73	0.85	0.39	0.83	1.0	0.13	0.45	0.38
Transcript_contig_59128 (59128)	0.54	0.72	0.73	0.69	1.0	0.38	0.68	0.85	0.06	0.38	0.23
Transcript_contig_59130 (59130)	0.46	0.63	0.25	0.76	1.0	0.31	0.36	0.81	0.09	0.28	0.31
Transcript_contig_59266 (59266)	0.75	1.0	0.61	0.59	0.92	0.17	0.27	0.8	0.14	0.06	0.11
Transcript_contig_59449 (59449)	0.47	0.62	0.26	0.46	0.58	0.17	0.42	1.0	0.08	0.04	0.12
Transcript_contig_59548 (59548)	0.56	0.54	0.71	0.85	0.95	0.39	1.0	0.61	0.0	0.24	0.19
Transcript_contig_59661 (59661)	0.62	0.77	1.0	0.63	0.49	0.48	0.65	0.59	0.0	0.12	0.29
Transcript_contig_59745 (59745)	0.5	0.58	0.47	0.72	1.0	0.37	0.66	0.76	0.14	0.25	0.2
Transcript_contig_59777 (59777)	0.68	0.86	0.68	0.86	0.95	0.46	0.82	1.0	0.16	0.4	0.26
Transcript_contig_59824 (59824)	0.67	0.82	0.62	0.75	0.83	0.56	1.0	1.0	0.03	0.38	0.24
Transcript_contig_59833 (59833)	0.61	0.82	0.32	0.53	0.54	0.34	0.35	1.0	0.49	0.09	0.14
Transcript_contig_59853 (59853)	0.68	0.79	0.69	0.88	0.71	1.0	0.89	0.58	0.21	0.33	0.28
Transcript_contig_59878 (59878)	0.66	0.8	0.27	0.99	1.0	0.26	0.54	0.93	0.34	0.19	0.23
Transcript_contig_59952 (59952)	0.83	1.0	0.5	0.66	0.86	0.51	0.99	0.97	0.09	0.17	0.13
Transcript_contig_60054 (60054)	0.52	0.49	0.47	0.49	0.39	0.56	1.0	0.33	0.09	0.13	0.15
Transcript_contig_60069 (60069)	0.68	0.67	0.61	0.63	1.0	0.19	0.56	0.46	0.63	0.23	0.21
Transcript_contig_60206 (60206)	0.59	0.75	0.58	0.85	0.83	0.64	1.0	0.88	0.24	0.37	0.22
Transcript_contig_60221 (60221)	0.4	0.52	0.43	0.65	1.0	0.29	0.32	0.49	0.14	0.26	0.37
Transcript_contig_61170 (61170)	0.54	0.83	0.72	0.61	0.32	0.47	1.0	0.71	0.0	0.15	0.24
Transcript_contig_61239 (61239)	0.43	0.56	0.58	0.62	0.46	0.25	1.0	0.64	0.0	0.16	0.22
Transcript_contig_61249 (61249)	0.58	0.63	0.63	0.74	1.0	0.33	0.46	0.8	0.59	0.42	0.31
Transcript_contig_61563 (61563)	0.19	0.38	1.0	0.89	0.82	0.33	0.63	0.87	0.02	0.07	0.11
Transcript_contig_61805 (61805)	0.52	0.64	0.42	0.79	1.0	0.28	0.6	0.55	0.25	0.17	0.21
Transcript_contig_61861 (61861)	0.58	0.7	0.63	0.86	0.98	0.45	0.85	1.0	0.24	0.35	0.31
Transcript_contig_62043 (62043)	0.64	0.77	0.62	0.87	0.93	0.47	0.81	1.0	0.14	0.36	0.24
Transcript_contig_62053 (62053)	0.64	0.64	0.65	0.69	1.0	0.28	0.71	0.59	0.32	0.22	0.2
Transcript_contig_62534 (62534)	0.61	0.8	0.53	0.81	1.0	0.31	0.74	0.96	0.07	0.28	0.21
Transcript_contig_627 (627)	0.65	0.62	0.44	0.88	1.0	0.59	0.87	0.32	0.01	0.34	0.39
Transcript_contig_62928 (62928)	0.59	0.72	0.52	0.76	0.88	0.48	0.71	1.0	0.41	0.28	0.3
Transcript_contig_67575 (67575)	0.66	0.77	0.38	0.81	1.0	0.46	0.78	0.88	0.01	0.3	0.21
Transcript_contig_68442 (68442)	0.69	0.79	0.78	0.74	1.0	0.25	0.79	0.86	0.34	0.31	0.21
Transcript_contig_68478 (68478)	0.64	0.93	0.44	0.78	0.76	0.21	0.36	1.0	0.03	0.05	0.06
Transcript_contig_69200 (69200)	0.71	0.79	0.51	0.49	0.57	0.5	1.0	0.78	0.0	0.35	0.35
Transcript_contig_69291 (69291)	0.58	0.54	0.81	0.79	0.84	0.52	1.0	0.61	0.45	0.12	0.26
Transcript_contig_69292 (69292)	0.46	0.73	0.29	0.56	0.52	0.15	0.22	1.0	0.08	0.12	0.11
Transcript_contig_69652 (69652)	0.68	0.88	0.39	0.63	0.79	0.13	0.36	1.0	0.0	0.08	0.04
Transcript_contig_70332 (70332)	0.51	1.0	0.57	0.9	0.87	0.37	0.6	0.84	0.06	0.71	0.3
Transcript_contig_768 (768)	0.64	0.88	0.74	0.89	0.95	0.28	0.63	1.0	0.07	0.09	0.13
Transcript_contig_78088 (78088)	0.6	0.98	0.23	0.67	0.7	0.64	0.95	1.0	0.04	0.23	0.18
Transcript_contig_78395 (78395)	0.3	0.51	0.58	0.69	0.83	0.21	0.49	1.0	0.11	0.12	0.15
Transcript_contig_78522 (78522)	0.51	0.72	0.4	0.7	0.64	0.15	0.41	1.0	0.07	0.07	0.08
Transcript_contig_78656 (78656)	0.55	0.61	0.64	0.81	1.0	0.26	0.74	0.35	0.27	0.21	0.25
Transcript_contig_78661 (78661)	0.57	0.8	0.45	0.84	0.91	0.33	0.61	1.0	0.02	0.22	0.21
Transcript_contig_78866 (78866)	0.85	0.88	0.82	0.79	1.0	0.45	0.8	0.9	0.62	0.34	0.25
Transcript_contig_78910 (78910)	0.65	0.8	0.55	0.79	0.96	0.54	0.9	1.0	0.08	0.24	0.22
Transcript_contig_79058 (79058)	0.44	0.38	0.68	0.86	0.59	0.43	1.0	0.41	0.04	0.24	0.22
Transcript_contig_79136 (79136)	0.83	0.9	1.0	0.87	0.63	0.68	0.98	0.89	0.49	0.49	0.47
Transcript_contig_79179 (79179)	0.5	0.54	0.51	0.76	1.0	0.28	0.63	0.6	0.05	0.18	0.13
Transcript_contig_79240 (79240)	0.45	0.7	0.34	0.35	0.41	0.32	0.57	1.0	0.07	0.12	0.13
Transcript_contig_79316 (79316)	0.63	0.85	0.9	0.83	0.49	0.65	1.0	0.92	0.23	0.54	0.51
Transcript_contig_79433 (79433)	0.59	0.7	0.5	1.0	0.79	0.2	0.51	0.85	0.38	0.08	0.08
Transcript_contig_79645 (79645)	0.52	0.56	0.41	0.73	1.0	0.47	0.88	0.61	0.1	0.24	0.24
Transcript_contig_79983 (79983)	0.46	0.45	0.14	1.0	0.82	0.21	0.57	0.33	0.0	0.04	0.05
Transcript_contig_80002 (80002)	0.61	0.63	0.73	0.83	1.0	0.38	0.64	0.69	0.45	0.35	0.31
Transcript_contig_80152 (80152)	0.51	0.56	0.59	0.93	1.0	0.4	0.68	0.61	0.01	0.12	0.24
Transcript_contig_81100 (81100)	0.37	0.47	1.0	0.71	0.86	0.37	0.69	0.58	0.0	0.25	0.1
Transcript_contig_81162 (81162)	0.69	0.82	0.75	0.75	0.42	1.0	0.59	0.75	0.18	0.5	0.1
Transcript_contig_82456 (82456)	0.69	0.95	0.63	0.75	1.0	0.65	0.51	0.89	0.01	0.35	0.22
Transcript_contig_82821 (82821)	0.71	0.8	0.62	0.87	1.0	0.26	0.93	0.68	0.13	0.29	0.21
Transcript_contig_89169 (89169)	0.72	0.89	0.58	0.7	1.0	0.23	0.62	0.87	0.11	0.19	0.21
Transcript_contig_89271 (89271)	0.69	0.87	0.59	0.89	1.0	0.47	0.8	1.0	0.14	0.48	0.31
Transcript_contig_89416 (89416)	0.68	0.72	1.0	0.99	0.69	0.43	0.83	0.62	0.0	0.09	0.23
Transcript_contig_89456 (89456)	0.79	1.0	0.49	0.79	0.96	0.97	0.93	0.81	0.29	0.46	0.39
Transcript_contig_89622 (89622)	0.6	0.67	0.48	0.96	1.0	0.48	0.82	0.66	0.18	0.23	0.28
Transcript_contig_89778 (89778)	0.78	0.9	0.57	0.49	0.15	1.0	0.74	0.64	0.0	0.29	0.22
Transcript_contig_90237 (90237)	0.25	0.39	0.56	0.69	1.0	0.22	0.6	0.66	0.2	0.24	0.17
Transcript_contig_90374 (90374)	0.36	0.54	0.73	0.68	1.0	0.26	0.51	0.63	0.03	0.55	0.31
Transcript_contig_9186 (9186)	0.7	0.91	0.56	0.72	0.53	0.97	0.71	0.21	1.0	0.39	0.35

Details

Expression values normalized per gene (using the maximum value, Green cells indicate low expression and red high. (Dark gray cells indicate missing values)