Heatmap: Cluster_106 (HCCA)

View as: (view raw or zlog-transformed)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are normalized against highest expression of the row)

Gene	Light - ZT1	Light - ZT3	Light - ZT5	Light - ZT7	Light - ZT9	Light - ZT11	Light - ZT13	Light - ZT15	Dark - ZT17	Dark - ZT19	Dark - ZT21	Dark - ZT23	Light - ZT25	Nutrient stress - Low nitrogen - 10%	Nutrient stress - Low phosphate - 0%	Nutrient stress - Low sulfate - 2%	Nutrient stress - Low micronutrients - 0%	Nutrient stress - NaCl - 75 mM	Nutrient stress - Mannitol - 100 mM	Nutrient stress - Control	Environmental stress - Prolonged darkness - 72h	Environmental stress - Cold - 4C	Environmental stress - Heat - 37C	Environmental stress - Control	Environmental stress - High light - 150 uE	Environmental stress - Control high light - 40 uE
Cpa\|evm.model.tig00000057.44 (tig00000057_g63.t1)	0.51	0.38	0.36	0.37	0.23	0.1	0.11	0.17	0.02	0.03	0.05	0.05	0.52	0.13	0.06	0.08	0.2	0.07	0.06	0.07	0.0	0.07	0.01	0.07	1.0	0.57
Cpa\|evm.model.tig00000073.18 (tig00000073_g1700.t1)	0.51	0.47	0.39	0.29	0.31	0.21	0.33	0.33	0.11	0.13	0.17	0.14	0.71	0.46	0.37	0.49	0.73	0.51	0.38	0.3	0.34	0.2	0.19	0.12	1.0	0.47
Cpa\|evm.model.tig00000157.5 (tig00000157_g9593.t1)	0.58	0.31	0.23	0.26	0.15	0.15	0.24	0.32	0.13	0.16	0.17	0.2	0.59	0.38	0.25	0.42	0.22	0.34	0.21	0.17	0.06	0.09	0.16	0.13	1.0	0.59
Cpa\|evm.model.tig00000169.34 (tig00000169_g11906.t1)	0.47	0.47	0.5	0.47	0.41	0.38	0.34	0.39	0.27	0.16	0.12	0.12	0.46	0.15	0.21	0.18	0.25	0.32	0.27	0.27	0.07	0.19	0.23	0.15	1.0	0.47
Cpa\|evm.model.tig00000241.114 (tig00000241_g20980.t1)	0.39	0.56	0.57	0.56	0.45	0.37	0.36	0.42	0.3	0.12	0.11	0.12	0.38	0.13	0.15	0.17	0.22	0.28	0.25	0.29	0.03	0.17	0.13	0.06	1.0	0.44
Cpa\|evm.model.tig00000241.155 (tig00000241_g21020.t1)	0.59	0.46	0.3	0.25	0.24	0.21	0.27	0.32	0.19	0.2	0.21	0.22	0.6	0.09	0.11	0.1	0.18	0.33	0.19	0.23	0.01	0.36	0.14	0.15	1.0	0.38
Cpa\|evm.model.tig00000254.47 (tig00000254_g22499.t1)	0.64	0.34	0.24	0.14	0.08	0.1	0.22	0.31	0.12	0.1	0.09	0.12	0.54	0.43	0.4	0.76	0.36	0.39	0.29	0.3	0.06	0.14	0.09	0.16	1.0	0.59
Cpa\|evm.model.tig00000344.14	0.48	0.46	0.36	0.44	0.41	0.3	0.3	0.3	0.1	0.17	0.21	0.26	0.71	0.32	0.23	0.38	0.28	0.21	0.26	0.22	0.0	0.12	0.05	0.11	1.0	0.34
Cpa\|evm.model.tig00000350.14 (tig00000350_g24314.t1)	0.55	0.67	0.74	0.64	0.44	0.29	0.3	0.4	0.27	0.16	0.19	0.2	0.5	0.25	0.29	0.25	0.32	0.38	0.38	0.39	0.01	0.15	0.14	0.16	1.0	0.65
Cpa\|evm.model.tig00000640.27 (tig00000640_g2781.t1)	0.56	0.65	0.55	0.55	0.41	0.29	0.34	0.43	0.35	0.25	0.29	0.3	0.48	0.33	0.34	0.37	0.43	0.38	0.39	0.37	0.02	0.52	0.2	0.3	1.0	0.53
Cpa\|evm.model.tig00000655.47 (tig00000655_g2872.t1)	0.6	0.28	0.25	0.31	0.16	0.06	0.08	0.21	0.05	0.03	0.07	0.1	0.51	0.07	0.05	0.06	0.05	0.06	0.06	0.06	0.01	0.04	0.03	0.06	1.0	0.45
Cpa\|evm.model.tig00000670.24 (tig00000670_g3039.t1)	0.47	0.47	0.41	0.38	0.35	0.26	0.3	0.31	0.15	0.2	0.19	0.21	0.54	0.55	0.47	0.59	0.33	0.46	0.39	0.28	0.09	0.31	0.29	0.27	1.0	0.7
Cpa\|evm.model.tig00000718.27 (tig00000718_g3702.t1)	0.77	0.61	0.66	0.53	0.41	0.3	0.3	0.43	0.29	0.31	0.35	0.36	0.68	0.29	0.31	0.34	0.45	0.19	0.23	0.3	0.06	0.22	0.16	0.27	1.0	0.51
Cpa\|evm.model.tig00000796.24 (tig00000796_g4247.t1)	0.49	0.52	0.54	0.62	0.39	0.18	0.23	0.38	0.2	0.15	0.22	0.22	0.43	0.1	0.1	0.08	0.13	0.22	0.18	0.18	0.0	0.4	0.06	0.08	1.0	0.49
Cpa\|evm.model.tig00000808.38 (tig00000808_g4426.t1)	0.75	0.45	0.33	0.23	0.15	0.07	0.12	0.17	0.06	0.07	0.1	0.12	0.84	0.35	0.54	0.65	0.34	0.67	0.61	0.35	0.24	0.04	0.24	0.18	1.0	0.41
Cpa\|evm.model.tig00000851.13 (tig00000851_g4897.t1)	0.19	0.27	0.32	0.27	0.16	0.11	0.22	0.24	0.17	0.12	0.12	0.15	0.26	0.31	0.31	0.45	0.75	0.5	0.34	0.26	0.02	0.15	0.06	0.07	1.0	0.19
Cpa\|evm.model.tig00000949.8 (tig00000949_g5719.t1)	0.68	0.71	0.8	0.68	0.57	0.43	0.35	0.4	0.19	0.23	0.24	0.28	0.69	0.33	0.24	0.29	0.44	0.28	0.27	0.38	0.01	0.44	0.12	0.16	1.0	0.6
Cpa\|evm.model.tig00000980.32 (tig00000980_g6160.t1)	0.73	0.76	0.58	0.41	0.23	0.18	0.2	0.31	0.24	0.23	0.32	0.4	0.74	0.21	0.21	0.24	0.29	0.29	0.27	0.25	0.28	0.36	0.28	0.38	1.0	0.38
Cpa\|evm.model.tig00001085.20 (tig00001085_g6960.t1)	0.68	0.68	0.71	0.62	0.41	0.23	0.38	0.5	0.29	0.23	0.25	0.24	0.64	0.4	0.37	0.33	0.3	0.37	0.27	0.27	0.04	0.16	0.15	0.15	1.0	0.61
Cpa\|evm.model.tig00001085.21 (tig00001085_g6960.t1)	0.55	0.55	0.47	0.46	0.32	0.23	0.28	0.37	0.22	0.16	0.18	0.19	0.49	0.23	0.24	0.17	0.17	0.25	0.21	0.16	0.04	0.17	0.13	0.15	1.0	0.57
Cpa\|evm.model.tig00001094.34 (tig00001094_g7006.t1)	0.27	0.55	0.6	0.6	0.44	0.28	0.36	0.5	0.4	0.35	0.33	0.29	0.28	0.17	0.25	0.24	0.41	0.47	0.43	0.42	0.0	0.1	0.17	0.13	1.0	0.47
Cpa\|evm.model.tig00001269.6 (tig00001269_g7977.t1)	0.79	0.69	0.53	0.39	0.14	0.08	0.11	0.2	0.21	0.24	0.35	0.46	0.7	0.16	0.17	0.19	0.31	0.27	0.23	0.25	0.1	0.47	0.28	0.44	1.0	0.45
Cpa\|evm.model.tig00001278.14 (tig00001278_g7993.t1)	0.71	0.53	0.46	0.42	0.35	0.35	0.4	0.39	0.24	0.24	0.26	0.31	0.67	0.27	0.21	0.36	0.37	0.41	0.4	0.28	0.2	0.24	0.18	0.24	1.0	0.51
Cpa\|evm.model.tig00001374.9 (tig00001374_g8501.t1)	0.51	0.59	0.61	0.66	0.57	0.5	0.48	0.54	0.44	0.42	0.41	0.41	0.46	0.27	0.32	0.31	0.43	0.39	0.35	0.36	0.04	0.45	0.3	0.17	1.0	0.48
Cpa\|evm.model.tig00020538.13 (tig00020538_g10320.t1)	0.34	0.32	0.28	0.25	0.27	0.29	0.33	0.29	0.16	0.18	0.16	0.2	0.49	0.6	0.59	0.52	0.55	0.48	0.53	0.32	0.16	0.06	0.25	0.22	1.0	0.56
Cpa\|evm.model.tig00020553.190 (tig00020553_g10680.t1)	0.55	0.4	0.36	0.37	0.21	0.11	0.23	0.32	0.12	0.15	0.2	0.21	0.68	0.17	0.16	0.17	0.13	0.19	0.19	0.16	0.05	0.07	0.13	0.11	1.0	0.43
Cpa\|evm.model.tig00020553.74 (tig00020553_g10564.t1)	0.47	0.53	0.41	0.32	0.28	0.17	0.24	0.24	0.16	0.13	0.16	0.13	0.31	0.08	0.13	0.1	0.2	0.31	0.29	0.27	0.03	0.17	0.15	0.16	1.0	0.38
Cpa\|evm.model.tig00020554.147 (tig00020554_g10924.t1)	0.24	0.36	0.29	0.25	0.21	0.24	0.26	0.28	0.1	0.14	0.15	0.14	0.27	0.31	0.29	0.29	0.24	0.4	0.39	0.21	0.01	0.11	0.16	0.11	1.0	0.54
Cpa\|evm.model.tig00020603.30 (tig00020603_g11762.t1)	0.33	0.52	0.49	0.55	0.46	0.38	0.32	0.34	0.23	0.18	0.16	0.18	0.31	0.15	0.13	0.17	0.2	0.27	0.19	0.21	0.0	0.25	0.08	0.05	1.0	0.31
Cpa\|evm.model.tig00020660.19 (tig00020660_g12512.t1)	0.74	0.48	0.4	0.43	0.34	0.29	0.43	0.46	0.27	0.29	0.3	0.27	0.65	0.33	0.35	0.28	0.31	0.41	0.34	0.27	0.04	0.51	0.25	0.22	1.0	0.47
Cpa\|evm.model.tig00020660.34 (tig00020660_g12531.t1)	0.73	0.67	0.56	0.43	0.32	0.28	0.38	0.45	0.31	0.33	0.36	0.43	0.78	0.26	0.22	0.24	0.28	0.3	0.24	0.25	0.06	0.63	0.29	0.29	1.0	0.42
Cpa\|evm.model.tig00020675.39 (tig00020675_g12623.t1)	0.85	0.7	0.81	0.66	0.52	0.45	0.34	0.39	0.19	0.16	0.17	0.17	0.56	0.21	0.3	0.19	0.31	0.33	0.3	0.37	0.01	0.11	0.09	0.23	1.0	0.69
Cpa\|evm.model.tig00020710.126 (tig00020710_g13390.t1)	0.41	0.5	0.32	0.21	0.12	0.08	0.1	0.13	0.05	0.04	0.06	0.09	0.38	0.15	0.2	0.21	0.31	0.41	0.29	0.28	0.02	0.26	0.05	0.1	1.0	0.42
Cpa\|evm.model.tig00020710.33 (tig00020710_g13266.t1)	0.34	0.4	0.41	0.47	0.46	0.43	0.55	0.53	0.33	0.24	0.19	0.2	0.21	0.23	0.21	0.27	0.26	0.41	0.33	0.35	0.01	0.05	0.07	0.04	1.0	0.48
Cpa\|evm.model.tig00020734.51 (tig00020734_g13603.t1)	0.41	0.43	0.47	0.46	0.27	0.18	0.24	0.36	0.13	0.14	0.15	0.15	0.45	0.23	0.23	0.25	0.25	0.2	0.17	0.17	0.02	0.16	0.1	0.11	1.0	0.41
Cpa\|evm.model.tig00020830.39 (tig00020830_g14420.t1)	0.56	0.53	0.47	0.45	0.44	0.32	0.32	0.31	0.22	0.22	0.23	0.27	0.6	0.29	0.24	0.32	0.31	0.45	0.3	0.32	0.06	0.57	0.2	0.2	1.0	0.55
Cpa\|evm.model.tig00020952.44 (tig00020952_g16502.t1)	0.55	0.36	0.28	0.2	0.11	0.1	0.17	0.24	0.05	0.09	0.11	0.15	0.66	0.16	0.15	0.18	0.23	0.27	0.18	0.2	0.01	0.05	0.11	0.09	1.0	0.3
Cpa\|evm.model.tig00020961.57 (tig00020961_g16679.t1)	0.53	0.61	0.58	0.44	0.34	0.34	0.41	0.48	0.34	0.28	0.25	0.27	0.41	0.22	0.3	0.24	0.35	0.46	0.41	0.38	0.09	0.24	0.19	0.17	1.0	0.53
Cpa\|evm.model.tig00021037.52 (tig00021037_g17460.t1)	0.72	0.77	0.46	0.56	0.36	0.36	0.37	0.38	0.31	0.3	0.33	0.39	0.63	0.34	0.42	0.28	0.28	0.32	0.33	0.35	0.09	0.25	0.26	0.3	1.0	0.46
Cpa\|evm.model.tig00021038.81 (tig00021038_g17570.t1)	0.56	0.57	0.54	0.39	0.32	0.23	0.39	0.51	0.26	0.27	0.35	0.34	0.38	0.19	0.27	0.18	0.24	0.31	0.36	0.27	0.02	0.03	0.11	0.21	1.0	0.43
Cpa\|evm.model.tig00021108.36 (tig00021108_g18328.t1)	0.46	0.3	0.26	0.21	0.22	0.24	0.4	0.45	0.2	0.19	0.19	0.19	0.62	0.28	0.5	0.35	0.51	0.42	0.28	0.2	0.1	0.35	0.2	0.16	1.0	0.41
Cpa\|evm.model.tig00021537.1 (tig00021537_g22258.t1)	0.57	0.39	0.32	0.31	0.27	0.18	0.26	0.32	0.17	0.19	0.2	0.2	0.6	0.28	0.19	0.27	0.2	0.31	0.23	0.19	0.03	0.18	0.16	0.15	1.0	0.27
Cpa\|evm.model.tig00021616.13 (tig00021616_g22918.t1)	0.6	0.4	0.31	0.34	0.27	0.27	0.3	0.31	0.1	0.06	0.06	0.08	0.57	0.2	0.18	0.23	0.17	0.25	0.14	0.11	0.03	0.14	0.06	0.07	1.0	0.32
Cpa\|evm.model.tig00021617.18 (tig00021617_g22945.t1)	0.56	0.3	0.19	0.21	0.18	0.14	0.23	0.27	0.06	0.08	0.09	0.1	0.65	0.17	0.22	0.2	0.21	0.33	0.34	0.14	0.09	0.12	0.14	0.13	1.0	0.3
Cpa\|evm.model.tig00021680.19 (tig00021680_g23041.t1)	0.39	0.26	0.22	0.22	0.13	0.22	0.23	0.24	0.12	0.11	0.12	0.09	0.45	0.35	0.4	0.34	0.32	0.3	0.32	0.18	0.01	0.01	0.19	0.11	1.0	0.36
Cpa\|evm.model.tig00022075.74 (tig00022075_g23635.t1)	0.58	0.36	0.34	0.34	0.26	0.18	0.27	0.31	0.07	0.12	0.12	0.15	0.62	0.35	0.18	0.29	0.19	0.11	0.12	0.1	0.02	0.09	0.12	0.09	1.0	0.49

Details

Expression values normalized per gene (using the maximum value, Green cells indicate low expression and red high. (Dark gray cells indicate missing values)