Heatmap: Cluster_189 (HCCA)

View as: (view raw or zlog-transformed)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are normalized against highest expression of the row)

Gene	CCAP211/11P,High light	CCAP211/11P,Low light	CPCC90,BBM,72h,Autotrophy	CPCC90,BBM,97h,Mixotrophy	CPCC90,BBM,98h,Mixotrophy	CPCC90,BBM,120h,Mixotrophy	CPCC90,BBM,144h,Heterotrophy	NJ-7,20C	NJ-7,4C	UTEX259,20C	UTEX259,4C
Transcript_contig_1029 (1029)	0.73	1.0	0.81	0.9	0.79	0.29	0.81	0.78	0.0	0.65	0.48
Transcript_contig_12307 (12307)	0.42	0.3	0.62	0.37	0.1	0.48	1.0	0.18	0.29	0.29	0.27
Transcript_contig_1297 (1297)	0.47	0.5	1.0	0.98	0.79	0.2	0.56	0.28	0.07	0.19	0.18
Transcript_contig_1411 (1411)	0.1	0.04	1.0	0.82	0.46	0.42	0.91	0.01	0.01	0.26	0.15
Transcript_contig_15268 (15268)	0.34	0.3	0.62	0.77	0.92	0.66	1.0	0.49	0.31	0.37	0.29
Transcript_contig_15849 (15849)	0.69	0.59	0.9	0.47	0.47	0.51	0.49	0.4	1.0	0.6	0.29
Transcript_contig_19235 (19235)	0.28	0.16	1.0	0.49	0.42	0.29	0.71	0.13	0.0	0.47	0.18
Transcript_contig_232 (232)	0.37	0.51	1.0	0.6	0.6	0.45	0.33	0.48	0.33	0.45	0.2
Transcript_contig_297 (297)	0.39	0.35	0.69	0.36	0.12	0.39	1.0	0.29	0.06	0.07	0.14
Transcript_contig_3326 (3326)	0.36	0.26	1.0	0.55	0.19	0.32	0.71	0.43	0.06	0.27	0.2
Transcript_contig_4011 (4011)	0.51	0.52	0.55	0.69	0.68	0.3	0.75	0.37	1.0	0.49	0.24
Transcript_contig_4949 (4949)	0.62	0.68	1.0	0.77	0.77	0.44	0.92	0.33	0.06	0.42	0.36
Transcript_contig_4955 (4955)	0.67	0.71	1.0	0.76	0.77	0.37	0.89	0.69	0.23	0.54	0.38
Transcript_contig_5300 (5300)	0.2	0.26	0.62	0.48	1.0	0.22	0.39	0.16	0.0	0.08	0.03
Transcript_contig_54080 (54080)	0.62	0.67	1.0	0.91	0.56	0.65	1.0	0.61	0.22	0.73	0.53
Transcript_contig_54195 (54195)	0.73	0.68	0.89	0.58	0.64	0.42	0.74	0.68	1.0	0.52	0.4
Transcript_contig_54611 (54611)	0.34	0.29	1.0	0.72	0.64	0.42	0.59	0.25	0.25	0.54	0.35
Transcript_contig_54643 (54643)	0.2	0.15	1.0	0.64	0.19	0.3	0.57	0.15	0.13	0.27	0.21
Transcript_contig_54658 (54658)	0.39	0.31	1.0	0.66	0.16	0.44	0.94	0.22	0.32	0.49	0.37
Transcript_contig_54810 (54810)	0.31	0.24	1.0	0.51	0.25	0.32	0.77	0.23	0.13	0.24	0.22
Transcript_contig_55188 (55188)	0.61	0.56	0.9	0.77	1.0	0.33	0.72	0.28	0.22	0.46	0.32
Transcript_contig_55216 (55216)	0.47	0.43	0.63	0.4	0.32	0.3	1.0	0.4	0.22	0.24	0.21
Transcript_contig_55478 (55478)	0.35	0.35	1.0	0.73	0.58	0.32	0.58	0.32	0.1	0.29	0.19
Transcript_contig_55561 (55561)	0.74	0.82	1.0	0.68	0.68	0.31	0.58	0.81	0.44	0.39	0.38
Transcript_contig_55881 (55881)	0.64	0.52	0.49	0.51	0.34	0.39	1.0	0.37	0.32	0.37	0.31
Transcript_contig_55966 (55966)	0.47	0.54	1.0	0.88	0.8	0.29	0.68	0.56	0.26	0.47	0.29
Transcript_contig_56078 (56078)	0.67	0.57	0.29	0.35	0.23	0.56	1.0	0.3	0.16	0.57	0.29
Transcript_contig_56345 (56345)	0.42	0.42	0.61	0.54	0.47	0.62	1.0	0.29	0.33	0.4	0.28
Transcript_contig_56459 (56459)	0.57	0.58	0.93	0.69	0.5	0.55	1.0	0.26	0.24	0.23	0.26
Transcript_contig_56520 (56520)	0.59	0.53	0.58	0.7	0.67	0.51	1.0	0.29	0.08	0.64	0.31
Transcript_contig_56537 (56537)	0.49	0.47	1.0	0.79	0.53	0.52	0.82	0.36	0.29	0.5	0.33
Transcript_contig_56538 (56538)	0.62	0.56	1.0	0.6	0.13	0.59	0.94	0.55	0.7	0.67	0.47
Transcript_contig_56836 (56836)	0.38	0.29	0.83	0.59	0.12	0.41	1.0	0.18	0.17	0.34	0.25
Transcript_contig_56872 (56872)	0.44	0.54	1.0	0.9	0.87	0.45	0.93	0.44	0.15	0.73	0.42
Transcript_contig_57529 (57529)	0.32	0.23	1.0	0.65	0.52	0.21	0.43	0.11	0.55	0.43	0.27
Transcript_contig_57809 (57809)	0.52	0.45	0.94	0.46	0.1	0.49	1.0	0.23	0.7	0.17	0.16
Transcript_contig_57879 (57879)	0.48	0.59	1.0	0.83	0.89	0.42	0.96	0.71	0.98	0.68	0.45
Transcript_contig_57924 (57924)	0.34	0.34	0.89	0.72	0.56	0.68	1.0	0.44	0.18	0.28	0.35
Transcript_contig_58288 (58288)	0.51	0.52	1.0	0.86	0.99	0.28	0.9	0.35	0.32	0.63	0.33
Transcript_contig_58360 (58360)	0.52	0.61	0.94	1.0	0.73	0.19	0.38	0.56	0.15	0.48	0.3
Transcript_contig_58421 (58421)	0.74	0.86	0.86	1.0	0.24	0.42	0.78	0.84	0.08	0.58	0.4
Transcript_contig_58474 (58474)	0.56	0.73	0.91	0.75	0.52	0.67	1.0	0.77	0.52	0.74	0.49
Transcript_contig_58541 (58541)	0.49	0.33	0.88	0.45	0.33	0.42	1.0	0.15	0.21	0.44	0.29
Transcript_contig_58736 (58736)	0.4	0.38	1.0	0.87	0.73	0.26	0.66	0.17	0.01	0.26	0.16
Transcript_contig_58819 (58819)	0.87	0.93	1.0	0.95	0.78	0.43	0.91	0.72	0.29	0.47	0.44
Transcript_contig_58868 (58868)	0.71	0.56	0.81	0.81	0.42	0.67	1.0	0.48	0.39	0.7	0.51
Transcript_contig_59338 (59338)	0.33	0.32	1.0	0.6	0.61	0.28	0.69	0.34	0.19	0.24	0.2
Transcript_contig_59393 (59393)	0.94	0.99	0.98	1.0	0.89	0.44	0.85	0.92	0.45	0.45	0.36
Transcript_contig_59558 (59558)	0.4	0.21	0.86	0.47	0.15	0.41	1.0	0.25	0.25	0.14	0.21
Transcript_contig_59681 (59681)	0.61	0.55	1.0	0.86	0.81	0.45	0.77	0.57	0.36	0.62	0.43
Transcript_contig_59846 (59846)	0.42	0.36	0.93	0.61	1.0	0.34	0.72	0.22	0.04	0.21	0.16
Transcript_contig_60135 (60135)	1.0	0.58	0.91	0.56	0.23	0.63	0.95	0.34	0.88	0.81	0.55
Transcript_contig_60256 (60256)	0.46	0.39	1.0	0.81	0.47	0.55	0.86	0.38	0.0	0.28	0.26
Transcript_contig_60345 (60345)	0.58	0.6	0.97	1.0	0.38	0.35	0.81	0.52	0.0	0.4	0.31
Transcript_contig_60450 (60450)	0.68	0.6	0.59	0.61	0.49	0.42	1.0	0.31	0.19	0.66	0.46
Transcript_contig_61317 (61317)	0.54	0.5	1.0	0.72	0.19	0.59	0.81	0.18	0.3	0.46	0.33
Transcript_contig_61506 (61506)	0.44	0.52	1.0	0.79	0.04	0.48	0.6	0.29	0.27	0.51	0.33
Transcript_contig_61534 (61534)	0.71	1.0	0.88	0.61	0.93	0.42	0.74	0.79	0.08	0.38	0.47
Transcript_contig_61795 (61795)	0.56	0.53	0.95	0.59	0.51	0.39	0.63	0.46	1.0	0.33	0.19
Transcript_contig_61970 (61970)	0.47	0.34	0.52	0.41	0.22	0.28	1.0	0.33	0.11	0.14	0.09
Transcript_contig_62009 (62009)	0.59	0.55	1.0	0.61	0.27	0.47	0.85	0.37	0.33	0.49	0.38
Transcript_contig_62078 (62078)	0.66	0.67	1.0	0.75	0.67	0.27	0.63	0.4	0.71	0.58	0.36
Transcript_contig_62131 (62131)	0.43	0.43	1.0	0.84	0.72	0.55	0.81	0.48	0.06	0.09	0.2
Transcript_contig_62255 (62255)	0.74	0.77	1.0	0.69	0.52	0.24	0.94	0.65	0.31	0.27	0.23
Transcript_contig_62623 (62623)	0.36	0.36	1.0	0.59	0.22	0.32	0.88	0.24	0.05	0.32	0.31
Transcript_contig_65632 (65632)	0.26	0.04	1.0	0.69	0.0	0.07	0.49	0.13	0.0	0.42	0.06
Transcript_contig_6613 (6613)	0.41	0.16	0.79	0.92	0.7	0.53	1.0	0.09	0.1	0.81	0.44
Transcript_contig_66451 (66451)	0.42	0.42	0.55	0.42	0.22	0.45	1.0	0.15	0.13	0.48	0.29
Transcript_contig_66624 (66624)	0.4	0.49	0.82	0.77	1.0	0.36	0.53	0.6	0.16	0.51	0.23
Transcript_contig_67477 (67477)	0.63	0.7	1.0	0.91	0.64	0.49	0.84	0.73	0.34	0.76	0.45
Transcript_contig_67487 (67487)	0.89	0.87	0.98	0.9	0.72	0.58	1.0	0.67	0.64	0.7	0.55
Transcript_contig_67543 (67543)	0.49	0.34	0.89	1.0	0.59	0.39	0.91	0.24	0.34	0.37	0.27
Transcript_contig_68530 (68530)	0.4	0.58	0.85	0.52	0.81	0.26	1.0	0.43	0.22	0.39	0.22
Transcript_contig_68673 (68673)	0.39	0.31	1.0	0.88	0.53	0.46	0.73	0.35	0.04	0.36	0.25
Transcript_contig_68814 (68814)	0.53	0.59	1.0	0.85	0.48	0.3	0.69	0.47	0.08	0.33	0.2
Transcript_contig_68844 (68844)	0.73	0.85	0.95	0.63	0.44	0.44	1.0	0.5	0.29	0.43	0.33
Transcript_contig_69508 (69508)	0.19	0.0	1.0	0.5	0.21	0.36	0.86	0.0	0.0	0.45	0.14
Transcript_contig_78042 (78042)	0.4	0.17	0.81	0.45	0.15	0.41	1.0	0.2	0.31	0.14	0.16
Transcript_contig_78083 (78083)	0.75	0.63	0.98	0.8	0.5	0.56	1.0	0.36	0.35	0.76	0.53
Transcript_contig_78226 (78226)	0.35	0.25	1.0	0.64	0.49	0.23	0.46	0.17	0.35	0.33	0.23
Transcript_contig_78465 (78465)	0.71	0.76	1.0	0.54	0.62	0.44	0.95	0.94	0.98	0.46	0.37
Transcript_contig_78590 (78590)	0.37	0.39	1.0	0.6	0.41	0.22	0.51	0.27	0.12	0.37	0.2
Transcript_contig_78641 (78641)	0.3	0.2	1.0	0.97	0.31	0.34	0.81	0.08	0.39	0.34	0.26
Transcript_contig_78818 (78818)	0.66	0.59	0.71	0.58	0.54	0.55	1.0	0.35	0.43	0.59	0.34
Transcript_contig_79527 (79527)	0.47	0.34	1.0	0.6	0.17	0.33	0.68	0.11	0.62	0.48	0.42
Transcript_contig_79557 (79557)	0.63	0.46	0.67	0.64	0.33	0.66	1.0	0.38	0.32	0.48	0.36
Transcript_contig_80560 (80560)	0.57	0.41	0.85	0.38	0.2	0.34	0.55	0.22	1.0	0.26	0.27
Transcript_contig_82325 (82325)	0.44	0.49	1.0	0.89	0.51	0.35	0.75	0.56	0.21	0.11	0.12
Transcript_contig_82619 (82619)	0.64	0.59	0.48	0.72	0.77	0.48	1.0	0.54	0.03	0.53	0.4
Transcript_contig_82962 (82962)	0.31	0.28	0.86	1.0	0.94	0.43	0.8	0.13	0.01	0.44	0.19
Transcript_contig_83370 (83370)	0.31	0.41	0.87	0.65	0.72	0.38	1.0	0.34	0.1	0.7	0.38
Transcript_contig_83492 (83492)	0.62	0.6	0.95	0.71	0.32	0.72	1.0	0.38	0.18	0.27	0.31
Transcript_contig_89285 (89285)	0.12	0.0	1.0	0.57	0.23	0.18	0.37	0.0	0.22	0.19	0.31
Transcript_contig_89320 (89320)	0.27	0.21	1.0	0.57	0.1	0.22	0.51	0.2	0.09	0.44	0.28
Transcript_contig_89511 (89511)	0.53	0.5	1.0	0.75	0.3	0.43	0.68	0.33	0.38	0.32	0.26
Transcript_contig_89578 (89578)	0.45	0.39	0.87	1.0	0.49	0.45	0.85	0.18	0.07	0.5	0.3
Transcript_contig_89603 (89603)	0.27	0.24	1.0	0.63	0.47	0.23	0.68	0.19	0.25	0.37	0.21
Transcript_contig_89632 (89632)	0.39	0.22	1.0	0.66	0.69	0.44	0.75	0.12	0.22	0.71	0.46
Transcript_contig_89640 (89640)	0.4	0.33	0.96	1.0	0.57	0.27	0.65	0.13	0.09	0.48	0.26
Transcript_contig_89683 (89683)	0.54	0.64	1.0	0.79	0.53	0.4	0.58	0.8	0.18	0.35	0.34
Transcript_contig_89732 (89732)	0.41	0.37	1.0	0.84	0.17	0.46	0.81	0.16	0.03	0.47	0.3
Transcript_contig_89777 (89777)	0.43	0.42	0.75	0.68	1.0	0.39	0.67	0.42	0.13	0.25	0.23
Transcript_contig_89908 (89908)	0.67	0.61	0.84	0.85	0.65	0.72	1.0	0.33	0.41	0.77	0.6
Transcript_contig_89919 (89919)	0.53	0.36	0.96	0.57	0.24	0.45	1.0	0.26	0.24	0.26	0.2
Transcript_contig_90083 (90083)	0.16	0.1	1.0	0.51	0.06	0.25	0.48	0.1	0.0	0.22	0.27
Transcript_contig_90353 (90353)	0.58	0.66	0.9	1.0	0.13	0.84	0.84	0.24	0.32	0.56	0.58
Transcript_contig_90406 (90406)	0.3	0.32	0.82	0.86	0.36	0.49	1.0	0.32	0.02	0.58	0.39
Transcript_contig_90435 (90435)	0.42	0.35	0.81	0.7	0.47	0.45	1.0	0.18	0.0	0.33	0.14
Transcript_contig_9084 (9084)	0.36	0.2	0.63	0.35	0.11	0.33	1.0	0.22	0.09	0.1	0.14
Transcript_contig_9585 (9585)	0.51	0.26	0.72	0.48	0.38	0.62	1.0	0.14	0.12	0.14	0.15

Details

Expression values normalized per gene (using the maximum value, Green cells indicate low expression and red high. (Dark gray cells indicate missing values)