Heatmap: Cluster_163 (HCCA)

View as: (view raw or zlog-transformed)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are normalized against highest expression of the row)

Gene	CCAP211/11P,High light	CCAP211/11P,Low light	CPCC90,BBM,72h,Autotrophy	CPCC90,BBM,97h,Mixotrophy	CPCC90,BBM,98h,Mixotrophy	CPCC90,BBM,120h,Mixotrophy	CPCC90,BBM,144h,Heterotrophy	NJ-7,20C	NJ-7,4C	UTEX259,20C	UTEX259,4C
Transcript_contig_10168 (10168)	0.32	0.55	0.37	0.6	0.75	0.55	0.21	0.5	0.06	1.0	0.67
Transcript_contig_10394 (10394)	0.19	0.13	0.31	0.19	0.24	0.46	0.18	0.05	0.16	1.0	0.54
Transcript_contig_10707 (10707)	0.58	0.61	0.18	0.32	0.41	0.6	0.43	0.34	0.33	1.0	0.58
Transcript_contig_1109 (1109)	0.05	0.06	0.07	0.27	0.18	0.29	0.24	0.01	0.01	1.0	0.7
Transcript_contig_11309 (11309)	0.09	0.16	0.09	0.09	0.2	0.38	0.11	0.19	0.0	1.0	0.69
Transcript_contig_1280 (1280)	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.35	0.0	0.0	0.0	1.0	0.38
Transcript_contig_1316 (1316)	0.29	0.43	0.19	0.36	0.5	0.77	0.35	0.54	0.03	1.0	0.71
Transcript_contig_13378 (13378)	0.04	0.02	0.12	0.15	0.06	0.41	0.09	0.0	0.0	1.0	0.42
Transcript_contig_15502 (15502)	0.56	0.58	0.22	0.44	0.59	0.53	0.5	0.7	0.26	1.0	0.45
Transcript_contig_168 (168)	0.22	0.14	0.02	0.12	0.04	0.31	0.16	0.02	0.29	1.0	0.61
Transcript_contig_1954 (1954)	0.47	0.59	0.14	0.26	0.26	0.44	0.3	0.36	0.03	1.0	0.42
Transcript_contig_1963 (1963)	0.33	0.28	0.15	0.28	0.14	0.21	0.33	0.41	0.0	1.0	0.66
Transcript_contig_3028 (3028)	0.27	0.28	0.3	0.39	0.14	0.31	0.45	0.27	0.11	1.0	0.41
Transcript_contig_3232 (3232)	0.31	0.34	0.11	0.19	0.28	0.44	0.14	0.16	0.12	1.0	0.79
Transcript_contig_3302 (3302)	0.24	0.11	0.31	0.42	0.31	0.5	0.31	0.03	0.22	1.0	0.69
Transcript_contig_3571 (3571)	0.18	0.43	0.38	0.25	0.12	0.25	0.32	0.26	0.04	1.0	0.61
Transcript_contig_3772 (3772)	0.19	0.17	0.15	0.42	0.38	0.6	0.22	0.08	0.16	1.0	0.58
Transcript_contig_386 (386)	0.27	0.36	0.37	0.3	0.59	0.22	0.38	0.33	0.35	1.0	0.5
Transcript_contig_3939 (3939)	0.32	0.38	0.2	0.41	0.51	0.88	0.2	0.2	0.14	1.0	0.77
Transcript_contig_3997 (3997)	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.3	0.0	0.0	0.0	1.0	0.31
Transcript_contig_5129 (5129)	0.27	0.44	0.31	0.32	0.26	0.57	0.43	0.34	0.31	1.0	0.51
Transcript_contig_5335 (5335)	0.11	0.07	0.14	0.26	0.4	0.35	0.18	0.04	0.08	1.0	0.66
Transcript_contig_535 (535)	0.41	0.31	0.45	0.33	0.02	0.27	0.19	0.15	0.39	1.0	0.64
Transcript_contig_53736 (53736)	0.07	0.06	0.01	0.05	0.02	0.36	0.1	0.01	0.13	1.0	0.36
Transcript_contig_5481 (5481)	0.02	0.0	0.02	0.06	0.17	0.29	0.09	0.0	0.06	1.0	0.61
Transcript_contig_55234 (55234)	0.18	0.26	0.03	0.25	0.37	0.49	0.07	0.22	0.41	1.0	0.44
Transcript_contig_55543 (55543)	0.46	0.44	0.27	0.36	0.41	0.62	0.38	0.56	0.7	1.0	0.53
Transcript_contig_55565 (55565)	0.39	0.57	0.07	0.51	0.53	0.64	0.49	0.54	0.16	1.0	0.63
Transcript_contig_56535 (56535)	0.43	0.56	0.11	0.31	0.53	0.68	0.52	0.6	0.25	1.0	0.69
Transcript_contig_56760 (56760)	0.32	0.32	0.22	0.3	0.36	0.42	0.14	0.12	0.16	1.0	0.66
Transcript_contig_57796 (57796)	0.31	0.45	0.12	0.34	0.63	0.53	0.3	0.4	0.06	1.0	0.52
Transcript_contig_58250 (58250)	0.32	0.29	0.52	0.43	0.62	0.32	0.33	0.32	0.33	1.0	0.61
Transcript_contig_58605 (58605)	0.22	0.41	0.28	0.26	0.14	0.24	0.36	0.31	0.0	1.0	0.65
Transcript_contig_58709 (58709)	0.3	0.42	0.15	0.24	0.27	0.43	0.2	0.24	0.05	1.0	0.54
Transcript_contig_5897 (5897)	0.2	0.09	0.49	0.47	0.43	0.57	0.44	0.08	0.55	1.0	0.73
Transcript_contig_59115 (59115)	0.37	0.34	0.59	0.48	0.41	0.45	0.38	0.22	0.72	1.0	0.63
Transcript_contig_59286 (59286)	0.41	0.47	0.2	0.29	0.4	0.5	0.32	0.36	0.4	1.0	0.68
Transcript_contig_59467 (59467)	0.4	0.37	0.24	0.19	0.29	0.3	0.27	0.24	0.1	1.0	0.61
Transcript_contig_59884 (59884)	0.42	0.4	0.33	0.41	0.38	0.55	0.45	0.22	0.48	1.0	0.71
Transcript_contig_61379 (61379)	0.42	0.41	0.74	0.51	0.44	0.45	0.44	0.2	0.87	1.0	0.57
Transcript_contig_61785 (61785)	0.29	0.44	0.14	0.2	0.25	0.48	0.12	0.69	0.09	1.0	0.63
Transcript_contig_62001 (62001)	0.16	0.31	0.13	0.23	0.64	0.99	0.17	0.35	0.0	1.0	0.7
Transcript_contig_62398 (62398)	0.14	0.22	0.54	0.47	0.37	0.81	0.16	0.18	0.15	1.0	0.5
Transcript_contig_62817 (62817)	0.12	0.2	0.04	0.21	0.23	0.35	0.1	0.14	0.04	1.0	0.32
Transcript_contig_63041 (63041)	0.11	0.06	0.26	0.36	0.24	0.21	0.25	0.01	0.0	1.0	0.72
Transcript_contig_63112 (63112)	0.34	0.42	0.16	0.19	0.09	0.26	0.37	0.12	0.02	1.0	0.39
Transcript_contig_66158 (66158)	0.12	0.09	0.18	0.14	0.23	0.44	0.08	0.04	0.06	1.0	0.92
Transcript_contig_68209 (68209)	0.47	0.67	0.23	0.41	0.36	0.47	0.39	0.49	0.14	1.0	0.49
Transcript_contig_68854 (68854)	0.21	0.33	0.18	0.39	0.48	0.65	0.17	0.24	0.01	1.0	0.65
Transcript_contig_68875 (68875)	0.53	0.66	0.15	0.36	0.82	0.61	0.3	0.28	0.05	1.0	0.74
Transcript_contig_69116 (69116)	0.07	0.0	0.0	0.0	0.0	0.28	0.0	0.0	0.0	1.0	0.54
Transcript_contig_7129 (7129)	0.16	0.46	0.08	0.04	0.3	0.62	0.25	0.31	0.0	1.0	0.93
Transcript_contig_72454 (72454)	0.21	0.28	0.03	0.25	0.17	0.47	0.1	0.08	0.01	1.0	0.73
Transcript_contig_7471 (7471)	0.49	0.44	0.35	0.43	0.47	0.56	0.54	0.44	0.47	1.0	0.47
Transcript_contig_79505 (79505)	0.35	0.52	0.17	0.46	0.21	0.5	0.26	0.2	0.36	1.0	0.38
Transcript_contig_79912 (79912)	0.1	0.08	0.08	0.15	0.14	0.46	0.06	0.06	0.47	1.0	0.97
Transcript_contig_81617 (81617)	0.09	0.0	0.03	0.27	0.43	0.59	0.24	0.0	0.07	1.0	0.96
Transcript_contig_82262 (82262)	0.37	0.36	0.24	0.27	0.35	0.5	0.38	0.28	0.06	1.0	0.53
Transcript_contig_82480 (82480)	0.13	0.1	0.13	0.11	0.03	0.48	0.13	0.02	0.09	1.0	0.43
Transcript_contig_82836 (82836)	0.09	0.07	0.1	0.16	0.16	0.31	0.23	0.01	0.02	1.0	0.34
Transcript_contig_82981 (82981)	0.49	0.53	0.18	0.19	0.57	0.6	0.4	0.31	0.67	1.0	0.69
Transcript_contig_8523 (8523)	0.11	0.25	0.24	0.15	0.05	0.3	0.23	0.12	0.0	1.0	0.83
Transcript_contig_8540 (8540)	0.18	0.18	0.03	0.04	0.07	0.3	0.12	0.21	0.1	1.0	0.54
Transcript_contig_89551 (89551)	0.56	0.71	0.27	0.43	0.39	0.59	0.46	0.47	0.25	1.0	0.64
Transcript_contig_90244 (90244)	0.39	0.44	0.51	0.38	0.16	0.3	0.29	0.27	0.34	1.0	0.65
Transcript_contig_90479 (90479)	0.36	0.4	0.26	0.33	0.22	0.3	0.34	0.17	1.0	0.8	0.51
Transcript_contig_90649 (90649)	0.12	0.06	0.3	0.29	0.19	0.42	0.3	0.06	0.3	1.0	0.56
Transcript_contig_90708 (90708)	0.27	0.27	0.18	0.25	0.27	0.38	0.29	0.16	0.13	1.0	0.48
Transcript_contig_90977 (90977)	0.03	0.02	0.06	0.12	0.09	0.35	0.09	0.01	0.0	1.0	0.66
Transcript_contig_9581 (9581)	0.03	0.0	0.07	0.0	0.04	0.23	0.05	0.0	1.0	0.75	0.84

Details

Expression values normalized per gene (using the maximum value, Green cells indicate low expression and red high. (Dark gray cells indicate missing values)