Heatmap: Cluster_145 (HCCA)

View as: (view raw or zlog-transformed)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are normalized against highest expression of the row)

Gene	CCAP211/11P,High light	CCAP211/11P,Low light	CPCC90,BBM,72h,Autotrophy	CPCC90,BBM,97h,Mixotrophy	CPCC90,BBM,98h,Mixotrophy	CPCC90,BBM,120h,Mixotrophy	CPCC90,BBM,144h,Heterotrophy	NJ-7,20C	NJ-7,4C	UTEX259,20C	UTEX259,4C
Transcript_contig_11953 (11953)	0.51	0.39	0.29	0.05	0.0	0.04	0.19	0.3	1.0	0.34	0.4
Transcript_contig_13065 (13065)	0.16	0.08	0.47	1.0	0.41	0.39	0.52	0.13	0.0	0.16	0.03
Transcript_contig_163 (163)	0.7	0.58	0.73	0.64	0.45	0.39	0.67	0.61	1.0	0.66	0.5
Transcript_contig_16430 (16430)	0.38	0.51	0.6	0.55	0.67	0.62	1.0	0.57	0.0	0.72	0.52
Transcript_contig_1913 (1913)	0.68	0.99	0.18	0.14	0.07	0.37	0.46	0.75	0.42	1.0	0.54
Transcript_contig_193 (193)	0.92	1.0	0.39	0.45	0.38	0.26	0.41	0.77	0.66	0.72	0.51
Transcript_contig_20537 (20537)	0.16	0.3	0.02	0.0	0.0	0.07	0.0	0.34	0.07	1.0	0.24
Transcript_contig_21466 (21466)	0.03	0.0	0.07	1.0	0.57	0.09	0.39	0.0	0.1	0.11	0.07
Transcript_contig_2349 (2349)	0.52	0.4	0.29	0.22	0.1	0.96	1.0	0.16	0.94	0.34	0.52
Transcript_contig_2561 (2561)	0.82	1.0	0.51	0.66	0.32	0.4	0.64	0.95	0.01	0.44	0.21
Transcript_contig_3067 (3067)	0.67	0.88	0.59	0.51	0.25	0.43	0.38	0.77	1.0	0.62	0.52
Transcript_contig_3204 (3204)	0.65	0.74	0.46	0.48	0.57	0.65	1.0	0.99	0.33	0.27	0.26
Transcript_contig_3523 (3523)	0.88	0.74	0.99	0.97	0.55	0.66	0.87	1.0	0.15	0.9	0.9
Transcript_contig_3664 (3664)	0.83	1.0	0.45	0.43	0.5	0.36	0.47	0.74	0.3	0.48	0.39
Transcript_contig_4106 (4106)	0.67	0.78	0.75	1.0	0.74	0.39	0.69	0.67	0.07	0.28	0.28
Transcript_contig_4212 (4212)	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	1.0	0.98
Transcript_contig_469 (469)	0.79	0.8	0.5	0.74	1.0	0.42	0.72	0.74	0.17	0.83	0.57
Transcript_contig_5348 (5348)	0.69	0.8	0.2	0.23	0.17	0.29	0.28	1.0	0.05	0.05	0.33
Transcript_contig_54787 (54787)	0.38	0.4	0.47	1.0	0.56	0.35	0.7	0.32	0.06	0.11	0.24
Transcript_contig_54801 (54801)	0.87	1.0	0.36	0.42	0.4	0.24	0.46	0.88	0.34	0.31	0.45
Transcript_contig_55514 (55514)	0.05	0.1	0.01	0.02	0.02	1.0	0.21	0.3	0.01	0.11	0.07
Transcript_contig_55677 (55677)	0.68	0.82	0.49	0.41	0.18	0.6	0.93	1.0	0.0	0.07	0.43
Transcript_contig_55875 (55875)	0.58	0.64	0.65	1.0	0.99	0.52	0.57	0.36	0.28	0.91	0.77
Transcript_contig_56068 (56068)	0.62	0.43	0.04	0.07	0.12	0.24	0.76	0.41	0.02	1.0	0.61
Transcript_contig_56132 (56132)	0.65	0.68	0.23	0.31	0.53	0.34	0.27	0.53	0.28	1.0	0.68
Transcript_contig_56235 (56235)	0.77	1.0	0.38	0.19	0.13	0.32	0.68	0.7	0.25	0.48	0.32
Transcript_contig_56427 (56427)	0.59	0.73	0.23	0.22	0.28	0.14	0.11	0.82	0.48	1.0	0.83
Transcript_contig_56463 (56463)	0.12	0.05	0.08	0.72	0.76	1.0	0.63	0.04	0.12	0.28	0.41
Transcript_contig_56532 (56532)	0.76	1.0	0.95	0.59	0.23	0.35	0.49	0.86	0.3	0.26	0.3
Transcript_contig_56813 (56813)	0.27	0.15	1.0	0.44	0.01	0.07	0.11	0.06	0.34	0.24	0.26
Transcript_contig_57068 (57068)	0.94	0.67	0.08	0.04	0.0	0.18	0.13	0.2	0.45	1.0	0.75
Transcript_contig_57293 (57293)	0.63	0.76	1.0	0.46	0.08	0.33	0.59	0.9	0.08	0.26	0.45
Transcript_contig_57517 (57517)	0.33	0.54	0.03	0.13	0.23	0.69	0.44	0.77	0.0	1.0	0.75
Transcript_contig_57570 (57570)	0.86	1.0	0.23	0.11	0.05	0.16	0.09	0.5	0.36	0.44	0.27
Transcript_contig_57609 (57609)	0.77	0.93	0.67	0.28	0.17	0.39	1.0	0.3	0.24	0.25	0.3
Transcript_contig_57890 (57890)	0.91	1.0	0.32	0.29	0.22	0.31	0.61	0.92	0.15	0.63	0.46
Transcript_contig_57983 (57983)	0.56	0.14	0.18	0.27	0.64	0.4	1.0	0.05	0.0	0.65	0.76
Transcript_contig_58067 (58067)	0.8	0.86	0.27	0.43	0.34	0.62	0.61	0.24	1.0	0.8	0.46
Transcript_contig_58730 (58730)	0.69	0.7	0.4	0.53	0.75	0.22	0.5	0.99	0.19	1.0	0.7
Transcript_contig_58813 (58813)	0.69	0.77	0.71	0.47	0.26	0.72	0.91	1.0	0.52	0.66	0.82
Transcript_contig_58855 (58855)	0.78	1.0	0.36	0.35	0.2	0.26	0.5	0.79	0.21	0.22	0.26
Transcript_contig_58936 (58936)	0.13	0.0	0.16	0.32	0.24	0.78	1.0	0.0	0.03	0.03	0.29
Transcript_contig_59237 (59237)	0.51	0.64	0.51	0.93	1.0	0.44	0.84	0.53	0.0	0.25	0.17
Transcript_contig_59253 (59253)	0.9	1.0	0.73	0.34	0.04	0.42	0.58	0.82	0.01	0.13	0.36
Transcript_contig_59349 (59349)	0.69	0.92	0.6	0.32	0.34	0.51	0.34	1.0	0.72	0.77	0.46
Transcript_contig_59432 (59432)	0.69	1.0	0.13	0.12	0.08	0.38	0.09	0.67	0.39	0.7	0.47
Transcript_contig_59654 (59654)	0.58	0.91	0.38	0.29	0.07	0.45	1.0	0.53	0.36	0.83	0.66
Transcript_contig_59758 (59758)	0.56	0.51	0.98	0.94	1.0	0.33	0.47	0.33	0.92	0.18	0.27
Transcript_contig_60156 (60156)	0.5	0.73	0.06	0.14	0.05	0.24	0.17	0.73	1.0	0.09	0.05
Transcript_contig_60170 (60170)	0.95	1.0	0.32	0.31	0.14	0.32	0.43	0.62	0.23	0.8	0.72
Transcript_contig_60192 (60192)	0.25	0.02	0.0	0.0	0.0	0.11	0.0	0.0	1.0	0.42	0.39
Transcript_contig_60217 (60217)	0.76	0.73	0.51	0.2	0.12	0.56	0.54	0.45	0.39	1.0	0.97
Transcript_contig_60309 (60309)	0.11	0.05	1.0	0.98	0.52	0.31	0.59	0.0	0.0	0.11	0.06
Transcript_contig_60337 (60337)	0.9	0.91	0.62	1.0	1.0	0.37	0.56	1.0	0.11	0.83	0.7
Transcript_contig_60344 (60344)	0.68	0.29	0.92	0.49	0.01	0.34	0.47	0.21	0.43	0.85	1.0
Transcript_contig_60477 (60477)	0.15	0.37	0.09	0.45	0.68	0.36	0.42	0.0	1.0	0.4	0.16
Transcript_contig_60618 (60618)	0.91	0.99	0.27	0.8	0.83	0.64	1.0	0.84	0.02	0.67	0.48
Transcript_contig_60956 (60956)	0.13	0.03	0.31	0.4	0.38	0.29	1.0	0.04	0.06	0.11	0.04
Transcript_contig_61076 (61076)	0.49	0.25	0.04	0.34	0.28	0.21	1.0	0.34	0.0	0.11	0.02
Transcript_contig_61241 (61241)	0.93	1.0	0.63	0.56	0.39	0.23	0.45	0.77	0.91	0.43	0.41
Transcript_contig_61271 (61271)	0.78	0.75	1.0	0.47	0.12	0.43	0.96	0.72	0.01	0.22	0.24
Transcript_contig_61548 (61548)	0.72	0.79	0.15	0.17	0.0	0.28	0.25	0.39	0.0	0.98	1.0
Transcript_contig_61846 (61846)	0.22	0.51	0.14	0.28	0.3	0.28	0.42	1.0	0.02	0.14	0.22
Transcript_contig_62039 (62039)	0.15	0.01	0.18	0.15	0.3	0.54	1.0	0.02	0.01	0.01	0.19
Transcript_contig_62536 (62536)	0.61	0.67	1.0	0.67	0.49	0.42	0.76	0.62	0.0	0.31	0.38
Transcript_contig_62722 (62722)	0.3	0.27	0.19	0.25	0.12	0.09	0.18	0.3	0.0	1.0	0.67
Transcript_contig_62910 (62910)	0.04	0.0	0.06	0.09	0.02	0.37	0.14	0.0	0.21	1.0	0.12
Transcript_contig_66936 (66936)	0.29	0.0	0.0	0.14	0.0	1.0	0.12	0.0	0.0	0.15	0.88
Transcript_contig_67546 (67546)	0.67	1.0	0.24	0.31	0.32	0.29	0.58	0.9	0.05	0.26	0.23
Transcript_contig_67692 (67692)	0.0	0.63	0.47	0.56	0.0	0.39	0.3	1.0	0.0	0.52	0.0
Transcript_contig_67820 (67820)	0.61	1.0	0.22	0.2	0.26	0.88	0.14	0.47	0.0	0.87	0.12
Transcript_contig_67907 (67907)	0.27	0.59	0.0	0.03	0.04	0.2	0.09	1.0	0.0	0.13	0.0
Transcript_contig_67908 (67908)	0.64	0.98	0.02	0.02	0.01	0.04	0.04	1.0	0.0	0.41	0.24
Transcript_contig_67978 (67978)	0.02	0.0	0.09	0.18	0.2	0.03	0.13	0.0	0.0	1.0	0.21
Transcript_contig_68173 (68173)	0.94	0.29	0.99	0.62	1.0	0.45	0.97	0.4	0.8	0.61	0.5
Transcript_contig_68268 (68268)	0.32	0.26	0.17	0.17	0.07	0.11	0.21	0.24	0.0	1.0	0.55
Transcript_contig_68461 (68461)	0.39	0.38	0.11	0.31	0.22	1.0	0.26	0.12	0.0	0.45	0.03
Transcript_contig_69706 (69706)	0.83	0.95	0.42	0.62	0.45	0.23	0.8	1.0	0.87	0.4	0.27
Transcript_contig_69712 (69712)	0.11	0.07	0.16	0.12	0.25	0.26	0.28	0.16	0.33	1.0	0.4
Transcript_contig_70250 (70250)	0.9	0.95	0.37	0.42	0.54	0.36	0.45	1.0	0.57	0.62	0.72
Transcript_contig_70600 (70600)	0.12	0.0	0.0	0.8	0.0	0.43	0.0	0.0	0.0	0.0	1.0
Transcript_contig_7120 (7120)	0.41	0.16	0.0	0.0	0.0	0.0	0.85	0.53	0.0	1.0	0.84
Transcript_contig_71267 (71267)	0.02	0.08	0.21	0.08	0.0	0.06	0.07	0.07	0.29	1.0	0.42
Transcript_contig_71436 (71436)	0.11	0.17	0.22	0.24	0.29	1.0	0.26	0.31	0.0	1.0	0.87
Transcript_contig_71504 (71504)	0.25	0.47	0.03	0.18	0.13	0.58	0.02	0.52	0.0	1.0	0.58
Transcript_contig_71759 (71759)	0.02	0.03	0.0	0.0	0.0	0.33	0.01	0.06	0.0	1.0	0.61
Transcript_contig_72407 (72407)	0.04	0.08	0.01	0.05	0.07	0.02	0.01	0.08	0.03	1.0	0.55
Transcript_contig_73013 (73013)	0.31	0.39	0.7	0.71	0.31	0.52	1.0	0.28	0.19	0.63	0.37
Transcript_contig_7323 (7323)	0.59	0.41	0.27	0.26	0.17	0.39	0.97	0.29	1.0	0.38	0.36
Transcript_contig_78145 (78145)	0.64	0.78	0.64	0.91	0.62	0.67	0.71	0.27	1.0	0.86	0.73
Transcript_contig_78363 (78363)	0.62	0.86	0.3	0.32	0.17	0.31	0.36	1.0	0.83	0.48	0.4
Transcript_contig_78534 (78534)	0.33	0.05	0.0	0.04	0.03	0.79	1.0	0.05	0.05	0.16	0.15
Transcript_contig_78689 (78689)	0.88	0.87	0.83	0.72	0.7	0.52	0.97	0.87	0.8	1.0	0.77
Transcript_contig_78755 (78755)	0.07	0.0	0.01	0.04	0.14	1.0	0.3	0.01	0.48	0.05	0.8
Transcript_contig_78773 (78773)	0.36	0.12	0.26	0.62	0.99	0.52	1.0	0.15	0.26	0.6	0.56
Transcript_contig_78791 (78791)	0.61	0.18	0.03	0.11	0.15	0.45	1.0	0.12	0.18	0.73	0.38
Transcript_contig_78894 (78894)	0.6	0.57	0.43	0.4	0.5	0.42	0.48	0.41	0.41	1.0	0.69
Transcript_contig_79031 (79031)	0.62	0.51	0.86	0.91	0.45	0.57	1.0	0.4	0.09	0.27	0.57
Transcript_contig_79049 (79049)	0.57	0.54	0.12	0.12	0.03	0.05	0.19	0.23	0.52	1.0	0.74
Transcript_contig_79305 (79305)	0.86	1.0	0.73	0.37	0.2	0.34	0.5	0.83	0.94	0.42	0.41
Transcript_contig_79679 (79679)	0.54	0.0	0.17	0.46	0.23	0.29	1.0	0.0	0.0	0.46	0.13
Transcript_contig_79792 (79792)	0.56	0.86	1.0	0.86	0.54	0.3	0.86	0.62	0.04	0.15	0.16
Transcript_contig_79950 (79950)	0.62	0.89	0.04	0.0	0.01	0.29	0.01	0.7	0.12	1.0	0.64
Transcript_contig_79956 (79956)	0.15	0.03	0.03	0.16	0.1	1.0	0.62	0.03	0.0	0.19	0.35
Transcript_contig_80440 (80440)	0.25	0.0	0.33	0.48	0.0	0.48	0.49	0.07	0.0	0.29	1.0
Transcript_contig_80614 (80614)	0.46	0.43	0.34	0.42	0.28	0.45	0.29	0.25	1.0	0.39	0.29
Transcript_contig_80662 (80662)	0.25	0.27	0.07	0.24	0.35	0.89	0.24	0.35	0.16	1.0	0.86
Transcript_contig_80867 (80867)	0.38	0.09	0.19	0.2	0.11	0.18	0.04	0.13	0.59	1.0	0.67
Transcript_contig_81091 (81091)	0.2	0.36	0.36	0.11	0.18	0.27	0.29	0.4	0.05	1.0	0.69
Transcript_contig_81671 (81671)	0.17	0.12	0.23	0.54	0.48	0.66	0.19	0.21	0.0	1.0	0.59
Transcript_contig_81900 (81900)	0.8	1.0	0.64	0.93	0.79	0.56	0.94	0.58	0.03	0.27	0.25
Transcript_contig_81958 (81958)	0.76	0.9	0.62	1.0	0.88	0.41	0.72	0.51	0.2	0.5	0.31
Transcript_contig_82210 (82210)	0.69	1.0	0.58	0.31	0.12	0.33	0.4	0.9	0.03	0.17	0.26
Transcript_contig_82240 (82240)	0.79	1.0	0.2	0.3	0.19	0.18	0.44	0.76	0.03	0.04	0.07
Transcript_contig_82306 (82306)	0.42	0.75	0.48	1.0	0.6	0.18	0.84	0.2	0.0	0.43	0.15
Transcript_contig_82651 (82651)	0.01	0.02	0.0	0.06	0.09	0.79	0.02	0.0	0.0	1.0	0.44
Transcript_contig_82680 (82680)	0.01	0.09	0.0	0.01	0.01	0.36	0.01	0.07	0.0	1.0	0.45
Transcript_contig_82703 (82703)	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.09	0.09	0.0	0.0	0.72	1.0
Transcript_contig_83065 (83065)	0.52	0.76	0.21	0.22	0.04	0.68	0.31	1.0	0.11	0.69	0.91
Transcript_contig_83384 (83384)	0.79	0.59	0.75	0.81	0.06	0.29	1.0	0.73	0.11	0.37	0.38
Transcript_contig_83396 (83396)	0.06	0.09	1.0	0.35	0.45	0.78	0.44	0.16	0.0	0.43	0.51
Transcript_contig_83870 (83870)	0.32	0.03	0.62	0.82	0.4	0.96	1.0	0.0	0.0	0.54	0.46
Transcript_contig_85883 (85883)	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.62	0.59	0.0	0.0	0.81	1.0
Transcript_contig_89576 (89576)	0.76	0.77	0.18	0.16	0.26	0.16	0.22	1.0	0.25	0.97	0.76
Transcript_contig_89619 (89619)	0.71	1.0	0.17	0.19	0.21	0.11	0.16	0.98	0.0	0.07	0.05
Transcript_contig_89671 (89671)	0.52	0.8	0.29	0.63	0.52	0.8	0.21	1.0	0.04	0.43	0.23
Transcript_contig_90054 (90054)	0.23	0.39	0.0	0.0	0.0	0.11	0.23	0.41	0.02	1.0	0.25
Transcript_contig_90216 (90216)	0.43	0.93	0.04	0.01	0.03	0.58	0.15	0.98	0.16	1.0	0.47
Transcript_contig_90279 (90279)	0.13	0.03	0.4	0.49	0.5	1.0	0.5	0.04	0.34	0.26	0.21
Transcript_contig_90327 (90327)	0.21	0.36	0.07	0.01	0.02	0.02	0.01	0.67	0.35	1.0	0.66
Transcript_contig_90528 (90528)	0.77	0.6	1.0	0.29	0.0	0.43	0.31	0.19	0.47	0.42	0.32
Transcript_contig_90569 (90569)	0.41	0.71	0.0	0.0	0.0	0.05	0.01	1.0	0.0	0.02	0.03
Transcript_contig_91310 (91310)	0.36	0.07	0.36	0.41	0.13	0.19	0.16	0.05	0.21	1.0	0.48
Transcript_contig_9571 (9571)	0.68	1.0	0.11	0.1	0.06	0.06	0.14	0.61	0.01	0.05	0.03

Details

Expression values normalized per gene (using the maximum value, Green cells indicate low expression and red high. (Dark gray cells indicate missing values)