Heatmap: Cluster_143 (HCCA)

View as: (view raw or zlog-transformed)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are normalized against highest expression of the row)

Gene	CCAP211/11P,High light	CCAP211/11P,Low light	CPCC90,BBM,72h,Autotrophy	CPCC90,BBM,97h,Mixotrophy	CPCC90,BBM,98h,Mixotrophy	CPCC90,BBM,120h,Mixotrophy	CPCC90,BBM,144h,Heterotrophy	NJ-7,20C	NJ-7,4C	UTEX259,20C	UTEX259,4C
Transcript_contig_12204 (12204)	0.76	1.0	0.2	0.17	0.05	0.37	0.18	0.71	0.43	0.16	0.5
Transcript_contig_13030 (13030)	0.68	1.0	0.03	0.04	0.0	0.14	0.22	0.91	0.0	0.1	0.19
Transcript_contig_15820 (15820)	0.38	0.41	1.0	0.4	0.49	0.15	0.18	0.0	0.0	0.07	0.02
Transcript_contig_16119 (16119)	0.46	0.61	0.66	0.69	0.19	0.1	0.29	1.0	0.0	0.0	0.05
Transcript_contig_1830 (1830)	0.87	1.0	0.4	0.57	0.65	0.27	0.64	0.98	0.0	0.0	0.0
Transcript_contig_2272 (2272)	0.62	0.86	0.13	0.2	0.43	0.18	0.15	1.0	0.07	0.11	0.2
Transcript_contig_2556 (2556)	0.65	0.83	0.12	0.09	0.22	0.17	0.37	1.0	0.0	0.0	0.32
Transcript_contig_2630 (2630)	0.51	0.86	1.0	0.95	0.43	0.16	0.57	0.83	0.05	0.12	0.06
Transcript_contig_2765 (2765)	0.63	0.95	0.24	0.38	0.37	0.47	0.39	1.0	0.48	0.21	0.34
Transcript_contig_2928 (2928)	0.42	0.38	1.0	0.74	0.45	0.12	0.31	0.22	0.0	0.05	0.0
Transcript_contig_3517 (3517)	0.79	1.0	0.42	0.29	0.32	0.16	0.51	0.92	0.0	0.11	0.03
Transcript_contig_371 (371)	0.74	1.0	0.52	0.49	0.48	0.18	0.66	0.84	0.0	0.0	0.14
Transcript_contig_3748 (3748)	0.73	1.0	0.37	0.0	0.0	0.25	0.18	0.74	0.0	0.0	0.39
Transcript_contig_4515 (4515)	0.44	0.53	1.0	0.7	0.65	0.42	0.68	0.59	0.0	0.0	0.13
Transcript_contig_488 (488)	0.69	1.0	0.35	0.39	0.33	0.38	0.33	0.96	0.0	0.0	0.27
Transcript_contig_513 (513)	0.96	1.0	0.12	0.06	0.13	0.19	0.27	0.63	0.0	0.0	0.14
Transcript_contig_53951 (53951)	0.43	0.43	1.0	0.78	0.59	0.33	0.6	0.31	0.04	0.11	0.21
Transcript_contig_55202 (55202)	0.68	0.8	1.0	0.89	0.97	0.48	0.97	0.83	0.8	0.0	0.06
Transcript_contig_55340 (55340)	0.76	1.0	0.37	0.55	0.57	0.25	0.59	0.7	0.0	0.0	0.03
Transcript_contig_55727 (55727)	0.77	1.0	0.31	0.59	0.59	0.78	0.62	0.95	0.04	0.51	0.58
Transcript_contig_56056 (56056)	0.82	1.0	0.37	0.48	0.52	0.73	0.56	0.98	0.0	0.0	0.45
Transcript_contig_56204 (56204)	0.69	1.0	0.48	0.39	0.21	0.26	0.46	0.64	0.27	0.0	0.04
Transcript_contig_56284 (56284)	0.64	1.0	0.08	0.21	0.34	0.34	0.11	0.77	0.3	0.02	0.35
Transcript_contig_58363 (58363)	0.36	0.54	1.0	0.86	0.66	0.22	0.31	0.8	0.02	0.0	0.1
Transcript_contig_5966 (5966)	0.53	0.61	1.0	0.67	0.32	0.14	0.29	0.55	0.0	0.0	0.18
Transcript_contig_60086 (60086)	0.51	0.7	0.84	0.77	0.95	0.58	0.65	1.0	0.13	0.15	0.16
Transcript_contig_60322 (60322)	0.49	0.83	0.19	0.31	0.34	0.65	0.23	1.0	0.09	0.58	0.53
Transcript_contig_61207 (61207)	0.19	0.29	1.0	0.73	0.53	0.18	0.4	0.46	0.01	0.06	0.03
Transcript_contig_62190 (62190)	0.48	0.8	0.69	0.98	0.76	0.35	0.29	1.0	0.0	0.03	0.24
Transcript_contig_62455 (62455)	0.51	0.89	0.11	0.1	0.03	0.27	0.17	1.0	0.05	0.21	0.27
Transcript_contig_62526 (62526)	0.62	1.0	0.0	0.0	0.0	0.1	0.08	0.77	0.08	0.0	0.13
Transcript_contig_62596 (62596)	0.69	1.0	0.03	0.04	0.03	0.33	0.13	0.62	0.01	0.01	0.16
Transcript_contig_63805 (63805)	0.67	1.0	0.37	0.38	0.27	0.36	0.56	0.32	0.0	0.0	0.24
Transcript_contig_6719 (6719)	0.48	0.67	0.25	0.1	0.12	0.29	0.23	1.0	0.25	0.03	0.33
Transcript_contig_68052 (68052)	0.62	0.76	0.9	0.9	0.91	0.54	1.0	0.82	0.0	0.0	0.08
Transcript_contig_68414 (68414)	0.67	1.0	0.22	0.11	0.07	0.11	0.14	0.81	0.0	0.02	0.07
Transcript_contig_69269 (69269)	0.61	1.0	0.28	0.34	0.28	0.72	0.44	0.84	0.04	0.17	0.47
Transcript_contig_69488 (69488)	0.71	1.0	0.45	0.2	0.06	0.41	0.47	0.95	0.02	0.0	0.18
Transcript_contig_69727 (69727)	0.47	0.78	0.02	0.03	0.02	0.23	0.09	1.0	0.02	0.07	0.21
Transcript_contig_69989 (69989)	0.5	0.84	0.64	0.57	0.43	0.25	0.35	1.0	0.43	0.0	0.13
Transcript_contig_70254 (70254)	0.8	1.0	0.14	0.22	0.53	0.18	0.48	0.79	0.0	0.02	0.07
Transcript_contig_70325 (70325)	0.52	0.63	1.0	0.89	0.88	0.71	0.9	0.59	0.0	0.0	0.16
Transcript_contig_78360 (78360)	0.9	1.0	0.18	0.12	0.08	0.4	0.45	0.69	0.12	0.12	0.32
Transcript_contig_78361 (78361)	0.6	0.75	0.92	1.0	0.65	0.38	0.72	0.69	0.0	0.0	0.16
Transcript_contig_78772 (78772)	0.5	0.83	0.25	0.28	0.25	0.2	0.34	1.0	0.0	0.07	0.09
Transcript_contig_79046 (79046)	0.73	1.0	0.61	0.68	0.7	0.49	0.85	0.96	0.0	0.0	0.23
Transcript_contig_79160 (79160)	0.51	0.57	0.89	1.0	0.66	0.43	0.76	0.5	0.0	0.0	0.2
Transcript_contig_79213 (79213)	0.61	0.79	0.62	0.58	0.63	0.37	0.46	1.0	0.03	0.03	0.32
Transcript_contig_79256 (79256)	0.29	0.4	1.0	0.61	0.77	0.25	0.42	0.59	0.0	0.0	0.07
Transcript_contig_796 (796)	0.7	0.77	1.0	0.88	0.82	0.27	0.71	0.76	0.2	0.11	0.08
Transcript_contig_80217 (80217)	0.74	0.97	0.34	0.51	0.79	0.57	0.77	1.0	0.0	0.0	0.19
Transcript_contig_80356 (80356)	0.52	0.55	1.0	0.78	0.65	0.41	0.69	0.77	0.02	0.09	0.25
Transcript_contig_8147 (8147)	0.7	1.0	0.3	0.16	0.0	0.35	0.21	0.5	0.01	0.0	0.21
Transcript_contig_81556 (81556)	0.6	0.68	0.93	0.85	0.59	0.33	1.0	0.34	0.0	0.0	0.08
Transcript_contig_81583 (81583)	0.64	0.8	1.0	0.83	0.65	0.24	0.52	0.82	0.13	0.03	0.08
Transcript_contig_81632 (81632)	0.76	0.87	0.9	0.87	1.0	0.25	0.55	1.0	0.0	0.36	0.29
Transcript_contig_82607 (82607)	0.7	0.84	0.15	0.07	0.05	0.36	0.2	1.0	0.13	0.0	0.25
Transcript_contig_89304 (89304)	0.63	0.71	1.0	0.86	0.5	0.33	0.77	0.53	0.14	0.07	0.15
Transcript_contig_90102 (90102)	0.59	0.89	0.22	0.2	0.04	0.31	0.3	1.0	0.0	0.0	0.1
Transcript_contig_90141 (90141)	0.58	0.93	0.95	1.0	0.63	0.31	0.58	0.76	0.42	0.22	0.14
Transcript_contig_90161 (90161)	0.4	0.64	0.17	0.24	0.27	0.38	0.27	1.0	0.11	0.39	0.36
Transcript_contig_90188 (90188)	0.76	1.0	0.24	0.3	0.46	0.43	0.39	0.76	0.0	0.0	0.29
Transcript_contig_90239 (90239)	0.47	0.69	0.28	0.38	0.56	0.32	0.4	1.0	0.0	0.25	0.32
Transcript_contig_90656 (90656)	0.67	0.83	0.39	0.47	0.57	0.39	0.51	1.0	0.01	0.07	0.25
Transcript_contig_90783 (90783)	0.69	1.0	0.38	0.43	0.42	0.21	0.54	0.68	0.28	0.01	0.02
Transcript_contig_90928 (90928)	0.73	1.0	0.16	0.33	0.31	0.23	0.27	0.8	0.0	0.0	0.16

Details

Expression values normalized per gene (using the maximum value, Green cells indicate low expression and red high. (Dark gray cells indicate missing values)