View as: (view raw or zlog-transformed)
View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)
(Values are normalized against highest expression of the row)
Gene | CCAP211/11P,High light | CCAP211/11P,Low light | CPCC90,BBM,72h,Autotrophy | CPCC90,BBM,97h,Mixotrophy | CPCC90,BBM,98h,Mixotrophy | CPCC90,BBM,120h,Mixotrophy | CPCC90,BBM,144h,Heterotrophy | NJ-7,20C | NJ-7,4C | UTEX259,20C | UTEX259,4C |
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
Transcript_contig_10259 (10259) | 0.62 | 1.0 | 0.0 | 0.0 | 0.0 | 0.01 | 0.01 | 0.74 | 0.0 | 0.02 | 0.01 |
Transcript_contig_10732 (10732) | 0.71 | 0.93 | 0.16 | 0.1 | 0.04 | 0.1 | 0.16 | 1.0 | 0.0 | 0.04 | 0.07 |
Transcript_contig_125 (125) | 0.78 | 1.0 | 0.04 | 0.07 | 0.06 | 0.01 | 0.04 | 0.88 | 0.0 | 0.01 | 0.01 |
Transcript_contig_1434 (1434) | 0.75 | 1.0 | 0.15 | 0.06 | 0.04 | 0.08 | 0.23 | 0.96 | 0.01 | 0.06 | 0.03 |
Transcript_contig_17638 (17638) | 0.77 | 1.0 | 0.03 | 0.05 | 0.06 | 0.03 | 0.07 | 0.73 | 0.0 | 0.11 | 0.07 |
Transcript_contig_3547 (3547) | 0.68 | 1.0 | 0.04 | 0.02 | 0.03 | 0.06 | 0.05 | 0.72 | 0.06 | 0.08 | 0.07 |
Transcript_contig_3932 (3932) | 0.69 | 1.0 | 0.12 | 0.06 | 0.0 | 0.02 | 0.03 | 0.77 | 0.02 | 0.05 | 0.03 |
Transcript_contig_4787 (4787) | 0.8 | 1.0 | 0.18 | 0.07 | 0.0 | 0.05 | 0.15 | 0.66 | 0.19 | 0.16 | 0.14 |
Transcript_contig_53695 (53695) | 0.84 | 1.0 | 0.25 | 0.14 | 0.11 | 0.12 | 0.17 | 0.61 | 0.07 | 0.31 | 0.24 |
Transcript_contig_54052 (54052) | 0.72 | 1.0 | 0.22 | 0.14 | 0.06 | 0.13 | 0.29 | 0.99 | 0.16 | 0.14 | 0.11 |
Transcript_contig_54087 (54087) | 0.78 | 1.0 | 0.18 | 0.17 | 0.25 | 0.19 | 0.38 | 0.86 | 0.46 | 0.34 | 0.27 |
Transcript_contig_54101 (54101) | 0.85 | 1.0 | 0.23 | 0.14 | 0.17 | 0.09 | 0.23 | 0.67 | 0.13 | 0.12 | 0.11 |
Transcript_contig_54327 (54327) | 0.78 | 1.0 | 0.25 | 0.14 | 0.16 | 0.1 | 0.21 | 0.72 | 0.13 | 0.16 | 0.14 |
Transcript_contig_54579 (54579) | 0.78 | 1.0 | 0.11 | 0.08 | 0.08 | 0.11 | 0.19 | 0.78 | 0.17 | 0.11 | 0.11 |
Transcript_contig_54781 (54781) | 0.73 | 1.0 | 0.1 | 0.07 | 0.1 | 0.14 | 0.18 | 0.88 | 0.28 | 0.33 | 0.18 |
Transcript_contig_54924 (54924) | 0.77 | 1.0 | 0.21 | 0.11 | 0.13 | 0.12 | 0.2 | 0.82 | 0.25 | 0.17 | 0.11 |
Transcript_contig_54952 (54952) | 0.79 | 1.0 | 0.18 | 0.14 | 0.15 | 0.11 | 0.19 | 0.76 | 0.42 | 0.3 | 0.24 |
Transcript_contig_54996 (54996) | 0.76 | 1.0 | 0.26 | 0.1 | 0.02 | 0.04 | 0.09 | 0.77 | 0.21 | 0.12 | 0.12 |
Transcript_contig_55431 (55431) | 0.74 | 1.0 | 0.15 | 0.13 | 0.18 | 0.12 | 0.22 | 0.98 | 0.44 | 0.29 | 0.24 |
Transcript_contig_56185 (56185) | 0.78 | 1.0 | 0.22 | 0.13 | 0.1 | 0.15 | 0.27 | 0.8 | 0.35 | 0.31 | 0.19 |
Transcript_contig_56338 (56338) | 0.75 | 1.0 | 0.19 | 0.09 | 0.05 | 0.1 | 0.22 | 0.79 | 0.21 | 0.17 | 0.12 |
Transcript_contig_56379 (56379) | 0.84 | 1.0 | 0.37 | 0.15 | 0.07 | 0.12 | 0.16 | 0.73 | 0.24 | 0.2 | 0.16 |
Transcript_contig_56426 (56426) | 0.78 | 1.0 | 0.09 | 0.12 | 0.09 | 0.05 | 0.09 | 0.81 | 0.17 | 0.1 | 0.07 |
Transcript_contig_56508 (56508) | 0.76 | 1.0 | 0.17 | 0.16 | 0.13 | 0.15 | 0.22 | 0.97 | 0.35 | 0.31 | 0.25 |
Transcript_contig_56731 (56731) | 0.83 | 1.0 | 0.3 | 0.15 | 0.12 | 0.09 | 0.17 | 0.64 | 0.15 | 0.39 | 0.22 |
Transcript_contig_57022 (57022) | 0.72 | 1.0 | 0.13 | 0.13 | 0.09 | 0.07 | 0.19 | 0.71 | 0.09 | 0.05 | 0.03 |
Transcript_contig_57398 (57398) | 0.78 | 1.0 | 0.1 | 0.07 | 0.04 | 0.1 | 0.15 | 0.79 | 0.05 | 0.09 | 0.06 |
Transcript_contig_57625 (57625) | 0.7 | 1.0 | 0.18 | 0.08 | 0.03 | 0.18 | 0.25 | 0.93 | 0.01 | 0.04 | 0.08 |
Transcript_contig_57834 (57834) | 0.69 | 1.0 | 0.05 | 0.07 | 0.12 | 0.15 | 0.07 | 0.79 | 0.57 | 0.27 | 0.21 |
Transcript_contig_58262 (58262) | 0.7 | 1.0 | 0.28 | 0.15 | 0.07 | 0.2 | 0.34 | 0.97 | 0.14 | 0.1 | 0.09 |
Transcript_contig_58333 (58333) | 0.72 | 1.0 | 0.04 | 0.06 | 0.05 | 0.04 | 0.08 | 0.73 | 0.0 | 0.02 | 0.01 |
Transcript_contig_58388 (58388) | 0.86 | 1.0 | 0.15 | 0.14 | 0.14 | 0.15 | 0.23 | 0.8 | 0.29 | 0.3 | 0.25 |
Transcript_contig_59077 (59077) | 0.75 | 1.0 | 0.29 | 0.17 | 0.17 | 0.15 | 0.34 | 0.95 | 0.05 | 0.06 | 0.06 |
Transcript_contig_59078 (59078) | 0.71 | 0.97 | 0.27 | 0.14 | 0.1 | 0.12 | 0.24 | 1.0 | 0.17 | 0.2 | 0.12 |
Transcript_contig_59358 (59358) | 0.75 | 1.0 | 0.12 | 0.05 | 0.04 | 0.07 | 0.2 | 0.8 | 0.0 | 0.07 | 0.03 |
Transcript_contig_59407 (59407) | 0.63 | 0.82 | 0.04 | 0.05 | 0.05 | 0.12 | 0.08 | 1.0 | 0.12 | 0.33 | 0.2 |
Transcript_contig_59668 (59668) | 0.73 | 1.0 | 0.05 | 0.03 | 0.0 | 0.02 | 0.02 | 0.6 | 0.32 | 0.13 | 0.09 |
Transcript_contig_62272 (62272) | 0.73 | 1.0 | 0.33 | 0.21 | 0.07 | 0.09 | 0.09 | 0.71 | 0.14 | 0.2 | 0.11 |
Transcript_contig_62585 (62585) | 0.72 | 0.97 | 0.06 | 0.12 | 0.18 | 0.15 | 0.22 | 1.0 | 0.2 | 0.3 | 0.2 |
Transcript_contig_67457 (67457) | 0.77 | 1.0 | 0.2 | 0.21 | 0.16 | 0.12 | 0.23 | 0.68 | 0.15 | 0.24 | 0.15 |
Transcript_contig_67498 (67498) | 0.71 | 1.0 | 0.12 | 0.07 | 0.04 | 0.04 | 0.12 | 0.9 | 0.07 | 0.05 | 0.04 |
Transcript_contig_70719 (70719) | 0.77 | 0.99 | 0.15 | 0.05 | 0.15 | 0.09 | 0.19 | 1.0 | 0.0 | 0.08 | 0.07 |
Transcript_contig_7405 (7405) | 0.71 | 1.0 | 0.27 | 0.12 | 0.11 | 0.1 | 0.25 | 0.97 | 0.07 | 0.06 | 0.09 |
Transcript_contig_78056 (78056) | 0.69 | 1.0 | 0.02 | 0.03 | 0.04 | 0.07 | 0.09 | 0.97 | 0.5 | 0.25 | 0.14 |
Transcript_contig_78352 (78352) | 0.75 | 1.0 | 0.04 | 0.06 | 0.04 | 0.04 | 0.08 | 0.71 | 0.0 | 0.02 | 0.01 |
Transcript_contig_78754 (78754) | 0.74 | 1.0 | 0.0 | 0.0 | 0.0 | 0.01 | 0.01 | 0.63 | 0.01 | 0.02 | 0.02 |
Transcript_contig_79275 (79275) | 0.75 | 1.0 | 0.07 | 0.07 | 0.07 | 0.15 | 0.12 | 0.88 | 0.19 | 0.2 | 0.18 |
Transcript_contig_89307 (89307) | 0.73 | 1.0 | 0.19 | 0.18 | 0.22 | 0.12 | 0.17 | 0.99 | 0.17 | 0.26 | 0.17 |
Transcript_contig_89460 (89460) | 0.72 | 1.0 | 0.26 | 0.16 | 0.15 | 0.14 | 0.35 | 0.87 | 0.08 | 0.09 | 0.08 |
Transcript_contig_89599 (89599) | 0.74 | 1.0 | 0.25 | 0.12 | 0.1 | 0.07 | 0.17 | 1.0 | 0.25 | 0.19 | 0.13 |
Transcript_contig_89625 (89625) | 0.7 | 1.0 | 0.15 | 0.1 | 0.06 | 0.08 | 0.11 | 0.82 | 0.05 | 0.11 | 0.07 |
Transcript_contig_89748 (89748) | 0.73 | 1.0 | 0.11 | 0.11 | 0.11 | 0.06 | 0.12 | 0.75 | 0.05 | 0.09 | 0.06 |
Transcript_contig_90334 (90334) | 0.75 | 0.97 | 0.2 | 0.07 | 0.1 | 0.14 | 0.14 | 1.0 | 0.05 | 0.28 | 0.18 |
Transcript_contig_90728 (90728) | 0.73 | 1.0 | 0.12 | 0.11 | 0.11 | 0.11 | 0.17 | 0.88 | 0.2 | 0.18 | 0.12 |
Expression values normalized per gene (using the maximum value, Green cells indicate low expression and red high. (Dark gray cells indicate missing values)