Heatmap: Cluster_58 (HCCA)

View as: (view raw or zlog-transformed)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are normalized against highest expression of the row)

Gene	CCAP211/11P,High light	CCAP211/11P,Low light	CPCC90,BBM,72h,Autotrophy	CPCC90,BBM,97h,Mixotrophy	CPCC90,BBM,98h,Mixotrophy	CPCC90,BBM,120h,Mixotrophy	CPCC90,BBM,144h,Heterotrophy	NJ-7,20C	NJ-7,4C	UTEX259,20C	UTEX259,4C
Transcript_contig_11331 (11331)	0.12	0.02	0.14	0.14	0.16	0.61	1.0	0.05	0.44	0.47	0.36
Transcript_contig_1178 (1178)	0.06	0.03	0.18	0.1	0.11	0.75	1.0	0.06	0.47	0.43	0.4
Transcript_contig_1358 (1358)	0.1	0.08	0.09	0.05	0.09	0.29	0.4	0.12	1.0	0.22	0.28
Transcript_contig_1667 (1667)	0.07	0.1	0.31	0.11	0.21	0.46	1.0	0.17	0.28	0.23	0.23
Transcript_contig_1726 (1726)	0.16	0.01	0.54	0.3	0.06	0.82	1.0	0.04	0.32	0.23	0.38
Transcript_contig_1822 (1822)	0.05	0.01	0.47	0.2	0.09	0.54	1.0	0.01	0.6	0.39	0.32
Transcript_contig_18233 (18233)	0.07	0.03	0.4	0.16	0.28	0.77	1.0	0.0	0.7	0.51	0.54
Transcript_contig_18627 (18627)	0.04	0.02	0.16	0.14	0.12	0.59	1.0	0.0	0.55	0.25	0.16
Transcript_contig_20675 (20675)	0.19	0.02	0.38	0.16	0.3	0.51	1.0	0.02	0.67	0.56	0.48
Transcript_contig_2162 (2162)	0.04	0.01	0.32	0.16	0.15	0.56	1.0	0.01	0.62	0.08	0.23
Transcript_contig_335 (335)	0.02	0.02	0.26	0.24	0.07	0.56	1.0	0.0	0.48	0.09	0.27
Transcript_contig_3488 (3488)	0.19	0.06	0.21	0.19	0.23	0.52	0.67	0.07	1.0	0.43	0.33
Transcript_contig_3771 (3771)	0.1	0.04	0.4	0.19	0.16	0.97	1.0	0.08	0.34	0.4	0.63
Transcript_contig_3891 (3891)	0.04	0.03	0.24	0.1	0.14	0.49	1.0	0.02	1.0	0.15	0.15
Transcript_contig_4061 (4061)	0.06	0.02	0.41	0.32	0.27	0.77	1.0	0.01	0.42	0.37	0.37
Transcript_contig_412 (412)	0.05	0.02	0.19	0.12	0.08	0.53	0.69	0.05	1.0	0.23	0.32
Transcript_contig_4195 (4195)	0.15	0.02	0.44	0.13	0.16	0.53	1.0	0.04	0.7	0.34	0.25
Transcript_contig_5114 (5114)	0.02	0.01	0.37	0.17	0.17	0.49	0.58	0.0	1.0	0.03	0.06
Transcript_contig_5140 (5140)	0.07	0.02	0.46	0.23	0.21	0.74	1.0	0.03	0.34	0.26	0.35
Transcript_contig_53738 (53738)	0.11	0.07	0.25	0.18	0.27	0.58	1.0	0.15	0.34	0.37	0.33
Transcript_contig_53744 (53744)	0.13	0.12	0.35	0.24	0.37	0.64	1.0	0.26	0.23	0.27	0.35
Transcript_contig_53748 (53748)	0.14	0.09	0.41	0.22	0.27	0.53	1.0	0.15	0.67	0.3	0.31
Transcript_contig_53758 (53758)	0.11	0.01	0.25	0.16	0.18	0.61	1.0	0.01	0.54	0.4	0.4
Transcript_contig_53775 (53775)	0.28	0.21	0.44	0.27	0.12	0.56	1.0	0.18	0.99	0.41	0.38
Transcript_contig_53831 (53831)	0.13	0.14	0.36	0.22	0.16	0.69	1.0	0.23	0.49	0.39	0.51
Transcript_contig_53860 (53860)	0.18	0.02	0.35	0.2	0.19	0.56	1.0	0.03	0.77	0.58	0.47
Transcript_contig_54182 (54182)	0.14	0.09	0.42	0.27	0.35	0.68	1.0	0.27	0.6	0.57	0.51
Transcript_contig_54401 (54401)	0.08	0.02	0.24	0.11	0.14	0.7	1.0	0.03	0.56	0.36	0.45
Transcript_contig_54550 (54550)	0.09	0.02	0.24	0.16	0.16	0.65	1.0	0.04	0.39	0.42	0.49
Transcript_contig_54574 (54574)	0.12	0.04	0.32	0.15	0.05	0.42	0.69	0.03	1.0	0.42	0.38
Transcript_contig_54668 (54668)	0.11	0.01	0.3	0.2	0.22	0.69	1.0	0.03	0.44	0.3	0.41
Transcript_contig_54687 (54687)	0.06	0.03	0.32	0.21	0.25	0.6	1.0	0.06	0.49	0.25	0.35
Transcript_contig_54704 (54704)	0.17	0.02	0.38	0.18	0.15	0.63	1.0	0.02	0.59	0.41	0.48
Transcript_contig_54768 (54768)	0.09	0.04	0.37	0.19	0.26	0.43	1.0	0.06	0.39	0.43	0.26
Transcript_contig_54854 (54854)	0.18	0.1	0.34	0.31	0.51	0.47	1.0	0.19	0.59	0.51	0.48
Transcript_contig_54925 (54925)	0.1	0.2	0.33	0.21	0.31	0.53	1.0	0.43	0.68	0.4	0.31
Transcript_contig_54971 (54971)	0.27	0.29	0.4	0.26	0.32	0.58	1.0	0.38	0.97	0.37	0.35
Transcript_contig_55185 (55185)	0.2	0.04	0.25	0.14	0.12	0.49	0.82	0.04	1.0	0.44	0.42
Transcript_contig_55237 (55237)	0.12	0.03	0.35	0.13	0.1	0.61	1.0	0.04	0.67	0.38	0.28
Transcript_contig_55240 (55240)	0.1	0.02	0.51	0.29	0.27	0.55	1.0	0.02	1.0	0.28	0.28
Transcript_contig_55289 (55289)	0.08	0.02	0.29	0.19	0.15	0.54	0.85	0.03	1.0	0.33	0.36
Transcript_contig_55317 (55317)	0.14	0.14	0.3	0.18	0.21	0.58	1.0	0.16	0.64	0.27	0.31
Transcript_contig_55579 (55579)	0.04	0.04	0.25	0.23	0.17	0.85	1.0	0.05	0.38	0.27	0.46
Transcript_contig_55583 (55583)	0.04	0.0	0.09	0.07	0.07	0.24	0.36	0.01	1.0	0.09	0.11
Transcript_contig_55605 (55605)	0.11	0.01	0.3	0.24	0.2	0.55	1.0	0.03	0.71	0.23	0.27
Transcript_contig_55626 (55626)	0.17	0.01	0.31	0.19	0.2	0.59	0.9	0.02	1.0	0.43	0.45
Transcript_contig_55846 (55846)	0.15	0.08	0.27	0.2	0.22	0.64	1.0	0.14	0.59	0.41	0.39
Transcript_contig_55908 (55908)	0.06	0.02	0.26	0.17	0.16	0.72	1.0	0.03	0.68	0.31	0.38
Transcript_contig_55911 (55911)	0.12	0.03	0.32	0.22	0.2	0.82	0.89	0.09	1.0	0.56	0.74
Transcript_contig_56063 (56063)	0.14	0.03	0.32	0.19	0.23	0.61	1.0	0.05	0.55	0.35	0.47
Transcript_contig_56286 (56286)	0.16	0.15	0.43	0.17	0.11	0.53	1.0	0.13	0.38	0.25	0.28
Transcript_contig_56292 (56292)	0.14	0.11	0.41	0.22	0.41	0.52	1.0	0.2	0.46	0.35	0.31
Transcript_contig_56419 (56419)	0.19	0.02	0.18	0.09	0.12	0.42	0.7	0.04	1.0	0.46	0.49
Transcript_contig_56468 (56468)	0.11	0.03	0.17	0.12	0.17	0.62	1.0	0.05	0.45	0.5	0.45
Transcript_contig_56687 (56687)	0.17	0.07	0.35	0.16	0.32	0.64	1.0	0.13	0.92	0.42	0.39
Transcript_contig_56800 (56800)	0.04	0.02	0.27	0.18	0.13	0.63	1.0	0.04	0.55	0.21	0.3
Transcript_contig_56812 (56812)	0.21	0.12	0.31	0.21	0.42	0.61	1.0	0.18	0.56	0.43	0.46
Transcript_contig_56880 (56880)	0.14	0.12	0.34	0.2	0.26	0.53	1.0	0.13	0.8	0.33	0.28
Transcript_contig_56926 (56926)	0.25	0.08	0.46	0.39	0.34	0.56	1.0	0.15	0.31	0.77	0.74
Transcript_contig_56956 (56956)	0.26	0.04	0.39	0.2	0.25	0.51	0.77	0.1	1.0	0.41	0.68
Transcript_contig_57122 (57122)	0.07	0.01	0.28	0.19	0.18	0.59	1.0	0.03	0.59	0.37	0.29
Transcript_contig_57279 (57279)	0.18	0.03	0.35	0.29	0.38	0.61	1.0	0.05	0.63	0.5	0.48
Transcript_contig_57313 (57313)	0.22	0.06	0.52	0.37	0.36	0.61	1.0	0.11	0.5	0.5	0.46
Transcript_contig_57314 (57314)	0.16	0.01	0.22	0.16	0.13	0.41	0.79	0.01	1.0	0.58	0.43
Transcript_contig_57525 (57525)	0.11	0.02	0.12	0.09	0.06	0.32	0.43	0.01	1.0	0.36	0.38
Transcript_contig_57557 (57557)	0.09	0.03	0.33	0.18	0.09	0.5	1.0	0.03	0.53	0.38	0.36
Transcript_contig_57647 (57647)	0.04	0.05	0.2	0.18	0.15	0.9	1.0	0.05	0.64	0.42	0.36
Transcript_contig_57649 (57649)	0.16	0.02	0.27	0.15	0.13	0.47	0.75	0.03	1.0	0.42	0.42
Transcript_contig_57817 (57817)	0.16	0.02	0.23	0.14	0.15	0.5	0.73	0.02	1.0	0.5	0.48
Transcript_contig_57887 (57887)	0.09	0.02	0.37	0.12	0.04	0.57	1.0	0.01	0.27	0.35	0.28
Transcript_contig_57981 (57981)	0.09	0.04	0.27	0.28	0.22	0.61	1.0	0.03	0.83	0.28	0.55
Transcript_contig_58113 (58113)	0.09	0.01	0.22	0.12	0.1	0.33	0.58	0.01	1.0	0.26	0.26
Transcript_contig_58395 (58395)	0.18	0.03	0.23	0.18	0.21	0.5	0.77	0.02	1.0	0.59	0.58
Transcript_contig_58701 (58701)	0.16	0.15	0.29	0.31	0.42	0.62	1.0	0.34	0.54	0.38	0.41
Transcript_contig_59041 (59041)	0.18	0.04	0.29	0.18	0.25	0.54	1.0	0.11	0.66	0.36	0.44
Transcript_contig_59747 (59747)	0.11	0.02	0.24	0.21	0.19	0.65	1.0	0.03	0.55	0.3	0.39
Transcript_contig_60149 (60149)	0.13	0.04	0.23	0.17	0.16	0.67	0.87	0.05	1.0	0.43	0.49
Transcript_contig_60155 (60155)	0.1	0.01	0.5	0.24	0.15	0.5	1.0	0.01	0.26	0.26	0.28
Transcript_contig_60198 (60198)	0.05	0.01	0.2	0.12	0.08	0.61	0.77	0.02	1.0	0.17	0.35
Transcript_contig_60504 (60504)	0.15	0.03	0.21	0.06	0.12	0.44	0.47	0.02	1.0	0.43	0.47
Transcript_contig_60646 (60646)	0.11	0.02	0.2	0.28	0.26	0.75	0.97	0.05	1.0	0.4	0.47
Transcript_contig_60689 (60689)	0.18	0.05	0.44	0.23	0.24	0.56	1.0	0.05	0.48	0.43	0.46
Transcript_contig_60860 (60860)	0.06	0.02	0.34	0.16	0.22	0.59	1.0	0.02	0.55	0.28	0.33
Transcript_contig_61048 (61048)	0.04	0.0	0.39	0.31	0.14	0.61	1.0	0.01	0.58	0.27	0.4
Transcript_contig_61084 (61084)	0.04	0.05	0.33	0.14	0.12	1.0	0.88	0.1	0.38	0.23	0.34
Transcript_contig_61264 (61264)	0.1	0.17	0.63	0.04	0.17	0.74	1.0	0.0	0.34	0.35	0.31
Transcript_contig_613 (613)	0.15	0.23	0.64	0.33	0.37	0.67	1.0	0.54	0.53	0.33	0.34
Transcript_contig_61608 (61608)	0.15	0.03	0.25	0.21	0.23	0.56	0.91	0.12	1.0	0.62	0.53
Transcript_contig_61762 (61762)	0.12	0.06	0.39	0.2	0.25	0.83	1.0	0.14	0.76	0.27	0.46
Transcript_contig_63247 (63247)	0.12	0.01	0.26	0.29	0.11	0.75	1.0	0.03	0.53	0.32	0.52
Transcript_contig_6369 (6369)	0.19	0.04	0.24	0.11	0.21	0.68	1.0	0.09	0.98	0.64	0.45
Transcript_contig_6419 (6419)	0.04	0.02	0.3	0.22	0.17	0.65	1.0	0.04	0.53	0.31	0.29
Transcript_contig_6420 (6420)	0.09	0.04	0.33	0.25	0.22	0.8	1.0	0.08	0.62	0.38	0.56
Transcript_contig_67 (67)	0.12	0.03	0.35	0.17	0.28	0.55	1.0	0.07	0.86	0.35	0.41
Transcript_contig_67480 (67480)	0.11	0.1	0.3	0.19	0.3	0.62	1.0	0.21	0.36	0.34	0.38
Transcript_contig_67538 (67538)	0.12	0.1	0.32	0.23	0.17	0.73	1.0	0.2	0.69	0.56	0.5
Transcript_contig_67540 (67540)	0.16	0.05	0.32	0.18	0.27	0.65	1.0	0.1	0.58	0.47	0.45
Transcript_contig_68028 (68028)	0.12	0.1	0.23	0.17	0.14	0.77	1.0	0.13	0.63	0.4	0.35
Transcript_contig_69086 (69086)	0.22	0.2	0.4	0.22	0.4	0.55	1.0	0.29	0.71	0.31	0.27
Transcript_contig_69371 (69371)	0.22	0.19	0.44	0.15	0.25	0.8	1.0	0.39	0.99	0.52	0.67
Transcript_contig_69745 (69745)	0.1	0.01	0.35	0.16	0.07	0.6	0.99	0.03	1.0	0.37	0.37
Transcript_contig_71458 (71458)	0.22	0.03	0.43	0.16	0.21	0.78	1.0	0.07	0.78	0.48	0.47
Transcript_contig_7280 (7280)	0.04	0.02	0.46	0.23	0.18	0.76	1.0	0.03	0.57	0.41	0.39
Transcript_contig_7298 (7298)	0.08	0.07	0.21	0.12	0.19	0.5	1.0	0.11	0.42	0.29	0.27
Transcript_contig_74 (74)	0.16	0.01	0.27	0.09	0.14	0.26	0.45	0.08	1.0	0.37	0.32
Transcript_contig_78052 (78052)	0.22	0.21	0.38	0.23	0.37	0.61	0.94	0.32	1.0	0.37	0.38
Transcript_contig_78173 (78173)	0.25	0.12	0.39	0.26	0.35	0.54	1.0	0.22	0.79	0.6	0.44
Transcript_contig_78281 (78281)	0.15	0.07	0.26	0.39	0.34	0.6	1.0	0.08	0.8	0.21	0.32
Transcript_contig_78511 (78511)	0.17	0.11	0.4	0.21	0.16	0.62	0.98	0.17	1.0	0.31	0.41
Transcript_contig_78531 (78531)	0.14	0.11	0.49	0.24	0.39	0.45	1.0	0.21	0.54	0.34	0.28
Transcript_contig_78574 (78574)	0.15	0.02	0.31	0.23	0.16	0.68	1.0	0.02	1.0	0.46	0.54
Transcript_contig_78584 (78584)	0.13	0.1	0.29	0.18	0.17	0.68	1.0	0.09	0.89	0.38	0.46
Transcript_contig_78602 (78602)	0.12	0.16	0.32	0.21	0.23	0.59	1.0	0.24	0.55	0.26	0.4
Transcript_contig_78646 (78646)	0.09	0.11	0.28	0.25	0.29	0.71	1.0	0.16	0.45	0.28	0.37
Transcript_contig_78800 (78800)	0.15	0.03	0.29	0.19	0.15	0.69	1.0	0.04	0.63	0.48	0.49
Transcript_contig_78820 (78820)	0.27	0.26	0.25	0.31	0.29	0.65	1.0	0.38	0.56	0.39	0.36
Transcript_contig_79036 (79036)	0.12	0.02	0.28	0.15	0.1	0.59	0.92	0.04	1.0	0.31	0.39
Transcript_contig_79430 (79430)	0.14	0.0	0.15	0.09	0.08	0.29	0.47	0.01	1.0	0.29	0.29
Transcript_contig_79627 (79627)	0.18	0.03	0.27	0.19	0.11	0.74	1.0	0.04	0.96	0.56	0.62
Transcript_contig_79725 (79725)	0.07	0.01	0.1	0.08	0.08	0.34	0.46	0.02	1.0	0.24	0.26
Transcript_contig_80264 (80264)	0.08	0.14	0.48	0.19	0.31	0.48	1.0	0.19	0.15	0.22	0.25
Transcript_contig_80988 (80988)	0.07	0.0	0.23	0.23	0.16	0.72	1.0	0.0	0.55	0.14	0.34
Transcript_contig_82883 (82883)	0.11	0.01	0.26	0.16	0.1	0.56	0.79	0.01	1.0	0.58	0.5
Transcript_contig_89360 (89360)	0.07	0.05	0.29	0.21	0.18	0.8	1.0	0.09	0.56	0.27	0.36
Transcript_contig_89489 (89489)	0.04	0.02	0.36	0.24	0.15	0.67	1.0	0.04	0.56	0.27	0.3
Transcript_contig_89606 (89606)	0.13	0.03	0.33	0.22	0.18	0.61	1.0	0.05	0.79	0.36	0.39
Transcript_contig_89611 (89611)	0.09	0.01	0.35	0.24	0.18	0.66	1.0	0.02	0.7	0.31	0.4
Transcript_contig_89843 (89843)	0.05	0.01	0.37	0.22	0.19	0.63	1.0	0.01	0.48	0.29	0.3
Transcript_contig_89925 (89925)	0.27	0.13	0.38	0.25	0.3	0.58	1.0	0.17	0.89	0.53	0.47

Details

Expression values normalized per gene (using the maximum value, Green cells indicate low expression and red high. (Dark gray cells indicate missing values)