Heatmap: Cluster_80 (HCCA)

View as: (view raw or zlog-transformed)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are normalized against highest expression of the row)

Gene	CCAP211/11P,High light	CCAP211/11P,Low light	CPCC90,BBM,72h,Autotrophy	CPCC90,BBM,97h,Mixotrophy	CPCC90,BBM,98h,Mixotrophy	CPCC90,BBM,120h,Mixotrophy	CPCC90,BBM,144h,Heterotrophy	NJ-7,20C	NJ-7,4C	UTEX259,20C	UTEX259,4C
Transcript_contig_1244 (1244)	0.16	0.01	0.7	1.0	0.47	0.27	0.45	0.0	0.02	0.0	0.09
Transcript_contig_12632 (12632)	0.02	0.0	0.57	0.47	1.0	0.11	0.17	0.0	0.0	0.0	0.0
Transcript_contig_1704 (1704)	0.13	0.02	0.57	0.89	1.0	0.19	0.47	0.01	0.0	0.11	0.08
Transcript_contig_2433 (2433)	0.16	0.06	0.7	1.0	0.76	0.4	0.68	0.02	0.13	0.15	0.08
Transcript_contig_3258 (3258)	0.08	0.03	0.61	1.0	0.49	0.24	0.44	0.0	0.0	0.03	0.0
Transcript_contig_54598 (54598)	0.11	0.0	1.0	0.96	0.73	0.25	0.54	0.0	0.43	0.1	0.15
Transcript_contig_55686 (55686)	0.07	0.0	1.0	0.79	0.91	0.2	0.52	0.0	0.0	0.0	0.05
Transcript_contig_56370 (56370)	0.1	0.05	0.48	0.75	1.0	0.14	0.4	0.05	0.01	0.07	0.05
Transcript_contig_58690 (58690)	0.23	0.05	1.0	0.98	0.93	0.1	0.85	0.14	0.0	0.09	0.12
Transcript_contig_58697 (58697)	0.21	0.1	0.69	0.84	1.0	0.23	0.6	0.09	0.08	0.06	0.09
Transcript_contig_58698 (58698)	0.1	0.0	0.46	0.84	1.0	0.26	0.52	0.0	0.0	0.0	0.1
Transcript_contig_58991 (58991)	0.06	0.0	1.0	0.9	0.54	0.17	0.41	0.0	0.0	0.0	0.01
Transcript_contig_59447 (59447)	0.08	0.0	1.0	0.86	0.73	0.14	0.38	0.0	0.0	0.0	0.02
Transcript_contig_59516 (59516)	0.07	0.01	0.96	1.0	0.64	0.18	0.45	0.02	0.0	0.0	0.01
Transcript_contig_60360 (60360)	0.0	0.0	0.97	1.0	0.8	0.14	0.54	0.0	0.0	0.0	0.0
Transcript_contig_61351 (61351)	0.06	0.0	0.74	1.0	0.83	0.25	0.7	0.0	0.0	0.06	0.04
Transcript_contig_62595 (62595)	0.18	0.07	0.65	1.0	0.82	0.4	0.66	0.03	0.09	0.27	0.11
Transcript_contig_62824 (62824)	0.18	0.1	0.49	0.84	1.0	0.32	0.52	0.09	0.16	0.13	0.12
Transcript_contig_64239 (64239)	0.14	0.01	0.65	1.0	0.66	0.22	0.63	0.0	0.0	0.13	0.1
Transcript_contig_66442 (66442)	0.05	0.0	0.32	0.49	1.0	0.09	0.26	0.0	0.0	0.09	0.17
Transcript_contig_67661 (67661)	0.14	0.04	0.85	1.0	0.95	0.34	0.85	0.05	0.0	0.0	0.13
Transcript_contig_68479 (68479)	0.16	0.13	0.55	0.83	1.0	0.18	0.56	0.15	0.0	0.0	0.02
Transcript_contig_68508 (68508)	0.08	0.01	0.64	0.85	1.0	0.23	0.42	0.02	0.0	0.04	0.03
Transcript_contig_68650 (68650)	0.07	0.0	0.43	0.54	1.0	0.18	0.22	0.0	0.0	0.03	0.04
Transcript_contig_69318 (69318)	0.11	0.0	1.0	0.95	0.84	0.2	0.54	0.0	0.0	0.0	0.08
Transcript_contig_69349 (69349)	0.04	0.0	1.0	0.74	0.67	0.21	0.63	0.0	0.0	0.0	0.0
Transcript_contig_69671 (69671)	0.09	0.09	0.36	0.81	1.0	0.12	0.24	0.14	0.0	0.01	0.04
Transcript_contig_70360 (70360)	0.04	0.01	0.81	1.0	0.76	0.19	0.42	0.0	0.0	0.0	0.08
Transcript_contig_70550 (70550)	0.11	0.05	0.53	0.76	1.0	0.12	0.3	0.04	0.1	0.01	0.03
Transcript_contig_70639 (70639)	0.18	0.23	0.6	0.92	1.0	0.34	0.52	0.16	0.55	0.0	0.03
Transcript_contig_71872 (71872)	0.07	0.0	0.55	0.91	1.0	0.08	0.37	0.0	0.0	0.0	0.03
Transcript_contig_72925 (72925)	0.08	0.04	1.0	0.94	0.87	0.24	0.55	0.0	0.04	0.04	0.03
Transcript_contig_7661 (7661)	0.04	0.0	0.58	0.32	1.0	0.1	0.19	0.0	0.0	0.0	0.03
Transcript_contig_78209 (78209)	0.09	0.0	0.73	1.0	0.87	0.26	0.64	0.0	0.0	0.1	0.11
Transcript_contig_78234 (78234)	0.12	0.08	0.34	0.66	1.0	0.18	0.41	0.06	0.0	0.0	0.04
Transcript_contig_78864 (78864)	0.1	0.07	0.61	1.0	0.78	0.3	0.56	0.04	0.0	0.01	0.09
Transcript_contig_79005 (79005)	0.08	0.0	1.0	0.92	0.72	0.37	0.68	0.0	0.0	0.0	0.11
Transcript_contig_79120 (79120)	0.11	0.07	0.95	0.82	1.0	0.27	0.7	0.0	0.0	0.17	0.24
Transcript_contig_79141 (79141)	0.15	0.1	0.64	0.85	1.0	0.29	0.65	0.11	0.04	0.0	0.03
Transcript_contig_79337 (79337)	0.01	0.01	0.6	0.87	1.0	0.15	0.17	0.01	0.1	0.0	0.04
Transcript_contig_79540 (79540)	0.18	0.18	1.0	0.95	0.98	0.3	0.52	0.23	0.04	0.13	0.13
Transcript_contig_79734 (79734)	0.01	0.0	0.75	1.0	0.86	0.13	0.2	0.01	0.02	0.0	0.07
Transcript_contig_79758 (79758)	0.11	0.0	0.81	1.0	0.64	0.13	0.5	0.0	0.0	0.0	0.04
Transcript_contig_79804 (79804)	0.16	0.12	0.71	0.83	1.0	0.23	0.56	0.14	0.0	0.0	0.05
Transcript_contig_79922 (79922)	0.04	0.0	0.62	1.0	0.98	0.19	0.34	0.0	0.0	0.0	0.03
Transcript_contig_79975 (79975)	0.13	0.03	0.97	0.7	1.0	0.31	0.65	0.0	0.0	0.01	0.05
Transcript_contig_79988 (79988)	0.08	0.02	1.0	0.91	0.68	0.23	0.46	0.02	0.01	0.0	0.07
Transcript_contig_8007 (8007)	0.11	0.02	1.0	0.6	0.91	0.25	0.63	0.0	0.0	0.0	0.02
Transcript_contig_80108 (80108)	0.1	0.0	0.66	0.97	1.0	0.15	0.72	0.0	0.0	0.0	0.01
Transcript_contig_80121 (80121)	0.08	0.0	0.7	0.83	1.0	0.21	0.46	0.0	0.0	0.04	0.08
Transcript_contig_80177 (80177)	0.09	0.0	0.77	0.8	1.0	0.17	0.48	0.0	0.0	0.02	0.03
Transcript_contig_80190 (80190)	0.08	0.0	0.75	0.84	1.0	0.21	0.44	0.0	0.01	0.01	0.06
Transcript_contig_80221 (80221)	0.13	0.08	0.69	0.89	1.0	0.24	0.52	0.13	0.04	0.08	0.14
Transcript_contig_80316 (80316)	0.08	0.04	0.45	0.66	1.0	0.14	0.37	0.05	0.0	0.01	0.03
Transcript_contig_80318 (80318)	0.07	0.0	0.96	1.0	0.7	0.19	0.57	0.0	0.0	0.05	0.05
Transcript_contig_80357 (80357)	0.06	0.01	0.67	1.0	0.88	0.19	0.35	0.01	0.05	0.12	0.11
Transcript_contig_80444 (80444)	0.08	0.01	0.51	0.76	1.0	0.11	0.29	0.01	0.0	0.0	0.01
Transcript_contig_80475 (80475)	0.14	0.03	0.86	1.0	0.84	0.29	0.74	0.04	0.0	0.01	0.06
Transcript_contig_80494 (80494)	0.03	0.01	0.78	0.79	1.0	0.13	0.27	0.01	0.01	0.01	0.02
Transcript_contig_80566 (80566)	0.12	0.0	0.66	1.0	0.8	0.23	0.51	0.0	0.0	0.04	0.11
Transcript_contig_81295 (81295)	0.05	0.0	0.46	0.85	1.0	0.14	0.37	0.0	0.0	0.01	0.02
Transcript_contig_81575 (81575)	0.14	0.0	0.75	1.0	0.85	0.28	0.68	0.0	0.0	0.07	0.06
Transcript_contig_81598 (81598)	0.02	0.0	0.6	0.65	1.0	0.42	0.43	0.0	0.0	0.03	0.06
Transcript_contig_81918 (81918)	0.1	0.0	0.77	0.92	1.0	0.3	0.47	0.0	0.0	0.14	0.1
Transcript_contig_81924 (81924)	0.13	0.0	0.32	0.87	1.0	0.21	0.51	0.0	0.0	0.0	0.04
Transcript_contig_82108 (82108)	0.01	0.0	0.77	0.64	1.0	0.17	0.43	0.0	0.0	0.0	0.05
Transcript_contig_82498 (82498)	0.01	0.0	0.89	0.99	1.0	0.23	0.32	0.0	0.23	0.0	0.01
Transcript_contig_830 (830)	0.26	0.12	0.6	0.99	1.0	0.36	0.6	0.07	0.05	0.34	0.26
Transcript_contig_83048 (83048)	0.13	0.0	0.92	1.0	0.82	0.36	0.69	0.0	0.0	0.0	0.02
Transcript_contig_83160 (83160)	0.18	0.0	0.78	0.62	1.0	0.36	0.68	0.0	0.01	0.11	0.27
Transcript_contig_83648 (83648)	0.09	0.0	0.48	0.7	1.0	0.19	0.43	0.0	0.0	0.0	0.07
Transcript_contig_85029 (85029)	0.08	0.0	0.57	1.0	0.83	0.2	0.5	0.0	0.0	0.08	0.07
Transcript_contig_89286 (89286)	0.07	0.0	0.5	0.65	1.0	0.23	0.42	0.0	0.0	0.02	0.1
Transcript_contig_8949 (8949)	0.13	0.01	0.76	1.0	0.54	0.23	0.62	0.0	0.02	0.01	0.0
Transcript_contig_89566 (89566)	0.28	0.23	0.55	0.88	1.0	0.39	0.6	0.16	0.02	0.02	0.15
Transcript_contig_90470 (90470)	0.12	0.0	0.83	0.75	1.0	0.25	0.56	0.0	0.01	0.06	0.09
Transcript_contig_90526 (90526)	0.11	0.07	0.83	1.0	0.76	0.2	0.61	0.1	0.01	0.0	0.07
Transcript_contig_90626 (90626)	0.07	0.0	0.5	1.0	0.98	0.19	0.43	0.0	0.0	0.0	0.01
Transcript_contig_90979 (90979)	0.07	0.08	0.66	0.77	1.0	0.2	0.35	0.03	0.11	0.0	0.01

Details

Expression values normalized per gene (using the maximum value, Green cells indicate low expression and red high. (Dark gray cells indicate missing values)