Heatmap: Cluster_224 (HCCA)

View as: (view raw or zlog-transformed)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are normalized against highest expression of the row)

Gene	CCAP211/11P,High light	CCAP211/11P,Low light	CPCC90,BBM,72h,Autotrophy	CPCC90,BBM,97h,Mixotrophy	CPCC90,BBM,98h,Mixotrophy	CPCC90,BBM,120h,Mixotrophy	CPCC90,BBM,144h,Heterotrophy	NJ-7,20C	NJ-7,4C	UTEX259,20C	UTEX259,4C
Transcript_contig_10081 (10081)	0.37	0.24	1.0	0.71	0.95	0.34	0.92	0.21	0.7	0.19	0.17
Transcript_contig_10652 (10652)	0.25	0.08	0.43	0.65	0.89	0.53	1.0	0.05	0.06	0.22	0.11
Transcript_contig_10901 (10901)	0.15	0.0	0.8	0.67	1.0	0.36	0.74	0.0	0.22	0.1	0.08
Transcript_contig_11617 (11617)	0.47	0.73	0.28	0.79	0.92	0.27	1.0	0.43	0.45	0.14	0.14
Transcript_contig_1709 (1709)	0.49	0.42	0.9	1.0	0.79	0.33	0.85	0.12	0.43	0.12	0.11
Transcript_contig_1825 (1825)	0.52	0.4	0.78	0.75	0.88	0.42	1.0	0.37	0.44	0.35	0.27
Transcript_contig_1925 (1925)	0.14	0.08	0.3	0.65	1.0	0.31	0.69	0.04	0.0	0.14	0.07
Transcript_contig_2063 (2063)	0.42	0.25	0.25	0.65	0.83	0.33	1.0	0.21	0.17	0.17	0.1
Transcript_contig_3799 (3799)	0.68	0.55	0.34	0.7	1.0	0.49	0.86	0.34	0.22	0.27	0.25
Transcript_contig_400 (400)	0.51	0.41	0.39	0.55	0.51	0.6	1.0	0.36	0.36	0.5	0.39
Transcript_contig_4321 (4321)	0.36	0.31	0.36	0.8	1.0	0.3	0.57	0.3	0.06	0.1	0.09
Transcript_contig_4339 (4339)	0.21	0.2	0.49	0.7	1.0	0.33	0.79	0.13	0.03	0.11	0.1
Transcript_contig_4541 (4541)	0.24	0.09	0.62	0.67	1.0	0.38	0.76	0.03	0.2	0.1	0.08
Transcript_contig_5032 (5032)	0.46	0.42	1.0	0.96	1.0	0.59	0.77	0.45	0.38	0.27	0.17
Transcript_contig_5339 (5339)	0.43	0.29	0.61	0.75	1.0	0.44	0.78	0.24	0.45	0.39	0.36
Transcript_contig_534 (534)	0.24	0.14	0.57	0.59	1.0	0.24	0.64	0.14	0.32	0.13	0.15
Transcript_contig_53754 (53754)	0.39	0.39	0.84	0.8	0.66	0.47	1.0	0.4	0.17	0.18	0.15
Transcript_contig_53768 (53768)	0.42	0.38	0.82	0.78	0.69	0.44	1.0	0.51	0.0	0.18	0.14
Transcript_contig_53961 (53961)	0.56	0.43	0.68	1.0	0.94	0.47	0.93	0.24	0.32	0.39	0.36
Transcript_contig_53993 (53993)	0.5	0.54	0.68	0.86	0.91	0.44	1.0	0.46	0.67	0.41	0.3
Transcript_contig_55023 (55023)	0.38	0.37	0.89	0.98	1.0	0.38	0.91	0.22	0.06	0.25	0.19
Transcript_contig_55679 (55679)	0.27	0.24	0.89	1.0	0.78	0.37	0.77	0.22	0.02	0.31	0.15
Transcript_contig_55763 (55763)	0.33	0.19	0.82	1.0	0.93	0.31	0.7	0.35	0.98	0.2	0.3
Transcript_contig_55873 (55873)	0.35	0.34	0.56	0.7	1.0	0.24	0.71	0.34	0.05	0.18	0.13
Transcript_contig_56027 (56027)	0.64	0.62	0.91	0.81	0.98	0.49	1.0	0.47	0.04	0.45	0.3
Transcript_contig_56302 (56302)	0.19	0.08	0.36	0.62	1.0	0.19	0.52	0.02	0.0	0.33	0.15
Transcript_contig_56341 (56341)	0.37	0.48	0.21	0.95	1.0	0.2	0.57	0.13	0.0	0.07	0.08
Transcript_contig_56375 (56375)	0.46	0.35	0.68	0.83	0.79	0.49	1.0	0.28	0.2	0.35	0.33
Transcript_contig_5649 (5649)	0.63	0.35	1.0	0.95	0.96	0.31	0.95	0.23	0.1	0.21	0.18
Transcript_contig_56591 (56591)	0.28	0.26	0.64	0.86	1.0	0.65	0.92	0.22	0.26	0.35	0.46
Transcript_contig_56622 (56622)	0.47	0.37	0.64	0.9	1.0	0.53	0.9	0.31	0.57	0.43	0.41
Transcript_contig_56739 (56739)	0.27	0.22	0.46	0.69	1.0	0.32	0.57	0.24	0.09	0.48	0.24
Transcript_contig_56790 (56790)	0.36	0.32	0.62	1.0	0.95	0.38	0.65	0.14	0.19	0.42	0.24
Transcript_contig_56856 (56856)	0.55	0.45	0.83	0.78	0.69	0.56	1.0	0.3	0.22	0.44	0.35
Transcript_contig_56967 (56967)	0.13	0.09	0.48	0.61	1.0	0.27	0.5	0.05	0.06	0.11	0.09
Transcript_contig_57215 (57215)	0.2	0.14	0.52	0.62	1.0	0.26	0.52	0.06	0.2	0.17	0.09
Transcript_contig_57379 (57379)	0.5	0.53	0.64	0.84	0.84	0.39	1.0	0.39	0.01	0.11	0.09
Transcript_contig_57433 (57433)	0.41	0.33	0.84	0.91	0.64	0.38	1.0	0.14	0.05	0.26	0.18
Transcript_contig_57659 (57659)	0.32	0.24	0.5	0.77	1.0	0.39	0.78	0.11	0.22	0.22	0.16
Transcript_contig_57683 (57683)	0.56	0.45	0.44	0.66	0.68	0.55	1.0	0.34	0.31	0.49	0.31
Transcript_contig_57686 (57686)	0.3	0.22	1.0	0.92	0.79	0.36	0.76	0.12	0.03	0.23	0.17
Transcript_contig_57795 (57795)	0.44	0.18	0.39	0.59	0.51	0.4	1.0	0.11	0.03	0.08	0.08
Transcript_contig_58169 (58169)	0.45	0.33	0.78	1.0	0.8	0.31	0.9	0.25	0.25	0.36	0.24
Transcript_contig_58183 (58183)	0.37	0.28	0.2	0.73	1.0	0.32	0.94	0.38	0.05	0.02	0.03
Transcript_contig_58444 (58444)	0.37	0.2	0.45	0.67	0.96	0.49	1.0	0.2	0.21	0.29	0.21
Transcript_contig_58669 (58669)	0.42	0.31	0.64	0.99	1.0	0.42	0.85	0.07	0.12	0.42	0.27
Transcript_contig_58713 (58713)	0.41	0.05	0.62	0.72	0.8	0.37	1.0	0.08	0.29	0.32	0.3
Transcript_contig_58774 (58774)	0.39	0.29	0.75	0.88	0.94	0.53	1.0	0.38	0.1	0.3	0.25
Transcript_contig_58894 (58894)	0.3	0.26	0.35	0.82	1.0	0.24	0.65	0.22	0.1	0.11	0.13
Transcript_contig_59117 (59117)	0.23	0.09	0.75	0.74	0.69	0.54	0.92	0.12	1.0	0.0	0.15
Transcript_contig_59589 (59589)	0.24	0.0	0.57	0.6	1.0	0.45	0.77	0.0	0.01	0.09	0.14
Transcript_contig_59616 (59616)	0.44	0.31	0.55	0.63	0.7	0.43	1.0	0.17	0.14	0.44	0.29
Transcript_contig_59633 (59633)	0.28	0.24	0.34	0.82	1.0	0.36	0.82	0.28	0.01	0.19	0.11
Transcript_contig_59931 (59931)	0.4	0.28	0.47	0.59	1.0	0.32	0.99	0.31	0.03	0.1	0.12
Transcript_contig_59949 (59949)	0.15	0.03	0.41	0.65	1.0	0.19	0.52	0.02	0.21	0.07	0.05
Transcript_contig_59951 (59951)	0.3	0.26	0.74	0.74	1.0	0.39	0.62	0.15	0.39	0.34	0.23
Transcript_contig_60022 (60022)	0.55	0.34	1.0	0.88	0.71	0.39	0.94	0.34	0.32	0.28	0.25
Transcript_contig_60073 (60073)	0.29	0.11	0.73	0.67	1.0	0.26	0.72	0.06	0.29	0.16	0.18
Transcript_contig_60084 (60084)	0.51	0.52	0.64	0.82	1.0	0.48	0.88	0.39	0.21	0.31	0.2
Transcript_contig_60232 (60232)	0.46	0.37	0.31	0.57	1.0	0.37	0.87	0.28	0.22	0.24	0.22
Transcript_contig_60266 (60266)	0.38	0.31	0.6	0.56	0.64	0.37	1.0	0.28	0.02	0.06	0.02
Transcript_contig_60370 (60370)	0.41	0.33	0.81	1.0	0.91	0.24	0.83	0.29	0.04	0.14	0.08
Transcript_contig_60511 (60511)	0.32	0.21	0.43	0.6	0.92	0.33	1.0	0.2	0.0	0.27	0.12
Transcript_contig_60894 (60894)	0.3	0.21	0.47	0.78	1.0	0.46	0.71	0.17	0.75	0.26	0.24
Transcript_contig_6090 (6090)	0.43	0.47	0.32	0.72	1.0	0.27	0.75	0.26	0.06	0.09	0.12
Transcript_contig_61359 (61359)	0.41	0.3	0.84	0.78	1.0	0.42	0.81	0.28	0.0	0.32	0.28
Transcript_contig_61748 (61748)	0.39	0.3	0.83	0.8	1.0	0.46	0.96	0.41	0.41	0.09	0.1
Transcript_contig_61956 (61956)	0.27	0.2	0.75	0.83	0.74	0.51	1.0	0.18	0.05	0.16	0.12
Transcript_contig_61975 (61975)	0.49	0.48	0.5	0.54	1.0	0.42	0.88	0.54	0.15	0.21	0.2
Transcript_contig_61982 (61982)	0.22	0.45	0.79	0.86	0.85	0.17	0.57	1.0	0.2	0.0	0.03
Transcript_contig_62290 (62290)	0.23	0.11	0.36	0.47	1.0	0.24	0.59	0.1	0.17	0.28	0.26
Transcript_contig_62371 (62371)	0.4	0.27	0.69	0.85	1.0	0.4	0.94	0.25	0.66	0.3	0.26
Transcript_contig_62456 (62456)	0.41	0.39	0.3	0.63	1.0	0.35	0.75	0.54	0.43	0.2	0.23
Transcript_contig_62918 (62918)	0.24	0.17	1.0	0.86	0.78	0.31	0.89	0.17	0.02	0.08	0.12
Transcript_contig_62944 (62944)	0.15	0.0	0.69	1.0	0.89	0.51	0.97	0.0	0.31	0.0	0.06
Transcript_contig_6349 (6349)	0.43	0.44	0.57	0.88	1.0	0.46	0.99	0.43	0.22	0.28	0.2
Transcript_contig_64005 (64005)	0.61	0.5	0.83	0.99	0.88	0.47	1.0	0.49	0.22	0.34	0.29
Transcript_contig_66112 (66112)	0.38	0.38	0.35	0.98	0.66	0.44	1.0	0.07	0.01	0.13	0.07
Transcript_contig_68278 (68278)	0.61	0.4	0.5	0.66	1.0	0.42	0.89	0.47	0.21	0.34	0.25
Transcript_contig_68644 (68644)	0.52	0.48	0.91	0.8	1.0	0.33	0.87	0.33	0.27	0.24	0.17
Transcript_contig_68809 (68809)	0.14	0.0	0.46	0.47	0.67	0.31	1.0	0.01	0.09	0.01	0.05
Transcript_contig_68821 (68821)	0.29	0.17	0.75	0.75	1.0	0.61	0.86	0.09	0.17	0.11	0.09
Transcript_contig_69082 (69082)	0.51	0.4	0.61	0.68	0.41	0.54	1.0	0.31	0.38	0.67	0.37
Transcript_contig_69181 (69181)	0.21	0.07	0.31	1.0	0.87	0.25	0.96	0.05	0.0	0.08	0.05
Transcript_contig_69645 (69645)	0.26	0.25	0.44	0.89	1.0	0.27	0.61	0.21	0.12	0.26	0.17
Transcript_contig_69815 (69815)	0.18	0.02	0.46	0.69	1.0	0.2	0.67	0.0	0.06	0.14	0.12
Transcript_contig_69993 (69993)	0.55	0.45	0.83	1.0	0.8	0.35	0.73	0.24	0.39	0.35	0.23
Transcript_contig_72001 (72001)	0.27	0.06	1.0	0.8	0.96	0.34	0.86	0.09	0.0	0.18	0.12
Transcript_contig_72004 (72004)	0.35	0.05	0.93	0.8	1.0	0.41	0.94	0.12	0.0	0.23	0.06
Transcript_contig_72012 (72012)	0.13	0.07	0.43	0.45	1.0	0.22	0.74	0.06	0.0	0.0	0.01
Transcript_contig_7214 (7214)	0.52	0.35	0.47	0.58	0.88	0.36	1.0	0.27	0.07	0.33	0.21
Transcript_contig_746 (746)	0.22	0.19	0.88	0.98	1.0	0.53	0.83	0.1	0.15	0.28	0.11
Transcript_contig_78152 (78152)	0.55	0.47	0.52	0.99	1.0	0.44	0.79	0.15	0.22	0.03	0.16
Transcript_contig_78153 (78153)	0.53	0.34	0.62	0.86	0.87	0.43	1.0	0.24	0.36	0.5	0.3
Transcript_contig_78265 (78265)	0.34	0.31	0.55	0.85	1.0	0.28	0.5	0.17	0.23	0.23	0.18
Transcript_contig_78308 (78308)	0.26	0.1	0.84	0.9	1.0	0.43	0.87	0.09	0.21	0.2	0.19
Transcript_contig_78616 (78616)	0.21	0.15	0.53	0.75	1.0	0.28	0.66	0.1	0.06	0.17	0.13
Transcript_contig_79110 (79110)	0.32	0.29	0.71	0.96	1.0	0.28	0.59	0.29	0.05	0.05	0.13
Transcript_contig_79173 (79173)	0.22	0.12	0.55	0.69	1.0	0.21	0.61	0.11	0.03	0.22	0.17
Transcript_contig_79216 (79216)	0.36	0.24	0.71	1.0	0.8	0.41	0.72	0.26	0.31	0.27	0.31
Transcript_contig_79382 (79382)	0.67	0.46	0.97	1.0	0.86	0.56	0.83	0.43	0.31	0.29	0.25
Transcript_contig_79404 (79404)	0.37	0.43	0.73	0.87	1.0	0.34	0.89	0.29	0.2	0.17	0.07
Transcript_contig_79489 (79489)	0.18	0.0	0.55	0.63	1.0	0.27	0.95	0.0	0.0	0.06	0.03
Transcript_contig_79514 (79514)	0.5	0.32	0.26	0.66	1.0	0.41	0.86	0.21	0.23	0.35	0.21
Transcript_contig_79621 (79621)	0.22	0.02	0.76	0.86	1.0	0.48	0.9	0.01	0.94	0.17	0.27
Transcript_contig_79796 (79796)	0.26	0.18	1.0	0.72	0.68	0.36	0.95	0.25	0.17	0.08	0.09
Transcript_contig_79798 (79798)	0.18	0.15	0.55	0.65	1.0	0.21	0.48	0.11	0.02	0.13	0.06
Transcript_contig_80184 (80184)	0.41	0.3	1.0	0.8	0.94	0.36	0.79	0.25	0.4	0.36	0.27
Transcript_contig_803 (803)	0.25	0.1	0.35	0.49	1.0	0.22	0.6	0.08	0.06	0.34	0.24
Transcript_contig_81604 (81604)	0.23	0.09	0.9	0.82	0.99	0.59	1.0	0.08	0.31	0.11	0.45
Transcript_contig_81949 (81949)	0.48	0.31	0.45	0.48	0.43	0.53	1.0	0.21	0.03	0.27	0.2
Transcript_contig_82017 (82017)	0.33	0.24	0.28	1.0	0.95	0.33	0.91	0.27	0.0	0.14	0.08
Transcript_contig_82024 (82024)	0.29	0.22	0.42	0.67	1.0	0.37	0.84	0.19	0.38	0.28	0.17
Transcript_contig_82336 (82336)	0.51	0.46	0.72	0.65	0.96	0.47	1.0	0.28	0.11	0.37	0.28
Transcript_contig_82476 (82476)	0.48	0.35	1.0	0.79	0.69	0.41	1.0	0.68	0.3	0.33	0.27
Transcript_contig_82832 (82832)	0.23	0.16	0.45	0.65	1.0	0.35	0.57	0.05	0.4	0.2	0.18
Transcript_contig_85079 (85079)	0.2	0.0	0.96	0.93	1.0	0.36	0.89	0.01	0.78	0.15	0.16
Transcript_contig_8895 (8895)	0.46	0.31	0.49	0.76	1.0	0.32	0.75	0.08	0.38	0.13	0.14
Transcript_contig_89138 (89138)	0.49	0.37	0.74	0.89	1.0	0.28	0.82	0.18	0.09	0.14	0.1
Transcript_contig_89226 (89226)	0.57	0.47	0.62	0.67	0.54	0.51	1.0	0.41	0.78	0.41	0.35
Transcript_contig_89364 (89364)	0.35	0.25	0.58	0.64	0.98	0.42	0.51	0.36	1.0	0.29	0.4
Transcript_contig_89372 (89372)	0.41	0.3	0.48	0.58	0.69	0.36	1.0	0.22	0.02	0.08	0.09
Transcript_contig_89447 (89447)	0.5	0.27	0.6	0.79	0.88	0.52	1.0	0.25	0.3	0.3	0.24
Transcript_contig_89480 (89480)	0.47	0.42	0.69	0.81	1.0	0.45	0.87	0.41	0.51	0.39	0.25
Transcript_contig_89647 (89647)	0.55	0.47	0.56	0.76	0.66	0.35	1.0	0.27	0.0	0.35	0.13
Transcript_contig_89661 (89661)	0.58	0.48	0.71	0.88	0.8	0.44	1.0	0.39	0.28	0.31	0.26
Transcript_contig_89747 (89747)	0.53	0.37	0.83	0.94	0.94	0.41	1.0	0.21	0.07	0.3	0.14
Transcript_contig_89767 (89767)	0.42	0.34	0.31	0.51	1.0	0.3	0.59	0.17	0.26	0.44	0.31
Transcript_contig_89846 (89846)	0.35	0.3	0.39	0.48	1.0	0.37	0.69	0.25	0.21	0.22	0.11
Transcript_contig_89983 (89983)	0.43	0.25	0.64	0.72	0.66	0.48	1.0	0.26	0.04	0.18	0.21
Transcript_contig_90027 (90027)	0.54	0.43	0.74	0.63	0.54	0.42	1.0	0.49	0.41	0.3	0.26
Transcript_contig_90064 (90064)	0.42	0.25	0.39	0.53	0.46	0.36	1.0	0.16	0.01	0.26	0.14
Transcript_contig_90510 (90510)	0.28	0.2	1.0	0.84	0.9	0.39	0.93	0.18	0.03	0.27	0.14
Transcript_contig_90698 (90698)	0.25	0.1	1.0	0.8	0.95	0.44	0.85	0.06	0.22	0.26	0.19
Transcript_contig_90840 (90840)	0.42	0.65	0.62	0.88	1.0	0.36	0.75	0.2	0.14	0.12	0.2
Transcript_contig_91066 (91066)	0.09	0.03	0.35	0.56	1.0	0.2	0.5	0.01	0.01	0.2	0.11
Transcript_contig_9204 (9204)	0.45	0.34	0.72	0.58	1.0	0.3	0.86	0.17	0.18	0.19	0.12
Transcript_contig_935 (935)	0.51	0.47	0.71	0.71	0.61	0.5	1.0	0.5	0.4	0.28	0.36
Transcript_contig_943 (943)	0.23	0.18	0.88	0.87	0.92	0.25	0.58	0.12	1.0	0.16	0.2

Details

Expression values normalized per gene (using the maximum value, Green cells indicate low expression and red high. (Dark gray cells indicate missing values)