Heatmap: Cluster_69 (HCCA)

View as: (view raw or zlog-transformed)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are normalized against highest expression of the row)

Gene	CCAP211/11P,High light	CCAP211/11P,Low light	CPCC90,BBM,72h,Autotrophy	CPCC90,BBM,97h,Mixotrophy	CPCC90,BBM,98h,Mixotrophy	CPCC90,BBM,120h,Mixotrophy	CPCC90,BBM,144h,Heterotrophy	NJ-7,20C	NJ-7,4C	UTEX259,20C	UTEX259,4C
Transcript_contig_11843 (11843)	0.22	0.0	1.0	0.36	0.68	0.29	0.33	0.0	0.0	0.56	0.27
Transcript_contig_1215 (1215)	0.15	0.17	1.0	0.35	0.12	0.0	0.39	0.11	0.0	0.09	0.18
Transcript_contig_12178 (12178)	0.0	0.0	1.0	0.18	0.0	0.0	0.28	0.0	0.0	0.0	0.0
Transcript_contig_13091 (13091)	0.0	0.0	1.0	0.18	0.29	0.14	0.77	0.0	0.0	0.97	0.54
Transcript_contig_13557 (13557)	0.23	0.15	1.0	0.55	0.33	0.57	0.54	0.2	0.0	0.03	0.24
Transcript_contig_15125 (15125)	0.14	0.0	1.0	0.0	0.0	0.32	0.21	0.0	0.0	0.74	0.0
Transcript_contig_15571 (15571)	0.0	0.0	1.0	0.0	0.54	0.11	0.24	0.0	0.0	0.11	0.19
Transcript_contig_16360 (16360)	0.04	0.02	1.0	0.31	0.12	0.52	0.03	0.03	0.01	0.08	0.42
Transcript_contig_16538 (16538)	0.09	0.3	1.0	0.31	0.27	0.13	0.15	0.32	0.0	0.29	0.15
Transcript_contig_16571 (16571)	0.0	0.0	1.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
Transcript_contig_16721 (16721)	0.78	0.2	1.0	0.0	0.39	0.0	0.0	0.67	0.0	0.75	0.18
Transcript_contig_17868 (17868)	0.38	0.14	1.0	0.21	0.15	0.43	0.58	0.0	0.51	0.86	0.38
Transcript_contig_18678 (18678)	0.36	0.3	1.0	0.73	0.85	0.26	0.18	0.51	0.02	0.51	0.33
Transcript_contig_19794 (19794)	0.0	0.0	1.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.28	0.27
Transcript_contig_19822 (19822)	0.07	0.0	1.0	0.25	0.65	0.29	0.73	0.0	0.0	0.18	0.32
Transcript_contig_23994 (23994)	0.0	0.0	1.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.54
Transcript_contig_24632 (24632)	0.37	0.09	1.0	0.61	0.42	0.14	0.27	0.0	0.0	0.18	0.12
Transcript_contig_27457 (27457)	0.47	0.5	1.0	0.06	0.0	0.5	0.46	0.18	0.0	0.0	0.0
Transcript_contig_3003 (3003)	0.19	0.15	1.0	0.08	0.16	0.07	0.15	0.0	0.0	0.0	0.04
Transcript_contig_31006 (31006)	0.04	0.03	1.0	0.24	0.01	0.13	0.05	0.03	0.0	0.08	0.18
Transcript_contig_31028 (31028)	0.0	0.0	1.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
Transcript_contig_31246 (31246)	0.15	0.0	0.92	1.0	0.39	0.16	0.43	0.0	0.0	0.44	0.15
Transcript_contig_3278 (3278)	0.12	0.1	1.0	0.16	0.06	0.22	0.01	0.1	0.0	0.12	0.33
Transcript_contig_36115 (36115)	0.0	0.0	0.99	0.0	0.0	0.0	0.0	1.0	0.0	0.0	0.0
Transcript_contig_4464 (4464)	0.5	0.69	1.0	0.78	0.25	0.34	0.21	0.61	0.04	0.51	0.47
Transcript_contig_5475 (5475)	0.15	0.0	0.97	0.21	1.0	0.0	0.47	0.0	0.0	0.15	0.0
Transcript_contig_5636 (5636)	0.38	0.48	0.55	0.27	0.21	0.32	1.0	0.37	0.0	0.0	0.1
Transcript_contig_56409 (56409)	0.09	0.11	1.0	0.28	0.05	0.37	0.02	0.13	0.03	0.05	0.33
Transcript_contig_56788 (56788)	0.04	0.02	1.0	0.33	0.04	0.13	0.01	0.01	0.0	0.01	0.13
Transcript_contig_57928 (57928)	0.09	0.07	1.0	0.25	0.1	0.24	0.08	0.1	0.01	0.14	0.38
Transcript_contig_58633 (58633)	0.05	0.01	1.0	0.38	0.13	0.38	0.04	0.01	0.01	0.04	0.27
Transcript_contig_5870 (5870)	0.0	0.0	1.0	0.0	0.0	0.0	0.1	0.0	0.0	0.19	0.09
Transcript_contig_5943 (5943)	0.05	0.01	1.0	0.59	0.2	0.13	0.08	0.01	0.01	0.11	0.15
Transcript_contig_60112 (60112)	0.08	0.06	1.0	0.19	0.06	0.12	0.01	0.02	0.0	0.08	0.19
Transcript_contig_60904 (60904)	0.13	0.0	1.0	0.06	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.37	0.06
Transcript_contig_60960 (60960)	0.07	0.07	1.0	0.08	0.04	0.03	0.01	0.03	0.0	0.02	0.19
Transcript_contig_61096 (61096)	0.07	0.0	1.0	0.41	0.36	0.27	0.42	0.0	0.0	0.09	0.17
Transcript_contig_61113 (61113)	0.0	0.0	1.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
Transcript_contig_61582 (61582)	0.04	0.03	1.0	0.32	0.13	0.17	0.03	0.01	0.0	0.03	0.14
Transcript_contig_63094 (63094)	0.0	0.0	1.0	0.29	0.0	0.32	0.13	0.0	0.0	0.78	0.33
Transcript_contig_63687 (63687)	0.09	0.01	1.0	0.16	0.0	0.18	0.04	0.03	0.0	0.02	0.31
Transcript_contig_65165 (65165)	0.0	0.0	1.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
Transcript_contig_65296 (65296)	0.06	0.16	1.0	0.08	0.0	0.0	0.0	0.29	0.0	0.04	0.14
Transcript_contig_65551 (65551)	0.0	0.0	1.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
Transcript_contig_65838 (65838)	0.01	0.07	1.0	0.32	0.15	0.12	0.11	0.03	0.0	0.12	0.3
Transcript_contig_66369 (66369)	0.27	0.0	1.0	0.68	0.67	0.2	0.49	0.0	0.0	0.36	0.38
Transcript_contig_66459 (66459)	0.0	0.0	0.66	0.07	0.11	0.71	0.64	0.0	0.0	1.0	0.31
Transcript_contig_67531 (67531)	0.07	0.05	1.0	0.21	0.09	0.07	0.02	0.04	0.0	0.04	0.06
Transcript_contig_68031 (68031)	0.02	0.0	1.0	0.25	0.04	0.19	0.03	0.0	0.0	0.0	0.13
Transcript_contig_68032 (68032)	0.04	0.0	1.0	0.23	0.06	0.2	0.03	0.0	0.02	0.01	0.16
Transcript_contig_68411 (68411)	0.19	0.11	1.0	0.51	0.07	0.35	0.42	0.0	0.46	0.34	0.06
Transcript_contig_68683 (68683)	0.0	0.09	1.0	0.0	0.0	0.0	0.17	0.0	0.0	0.0	0.0
Transcript_contig_69766 (69766)	0.13	0.04	1.0	0.15	0.05	0.37	0.02	0.0	0.0	0.23	0.92
Transcript_contig_70215 (70215)	0.31	0.12	1.0	0.31	0.11	0.11	0.04	0.15	0.03	0.05	0.29
Transcript_contig_71858 (71858)	0.17	0.2	1.0	0.63	0.17	0.43	0.5	0.04	0.11	0.16	0.12
Transcript_contig_72065 (72065)	0.0	0.0	1.0	0.41	0.0	0.25	0.27	0.0	0.0	0.0	0.0
Transcript_contig_72825 (72825)	0.14	0.0	1.0	0.43	0.0	0.0	0.21	0.0	0.0	0.19	0.36
Transcript_contig_72987 (72987)	0.08	0.17	0.2	0.36	0.44	0.31	0.83	1.0	0.13	0.08	0.02
Transcript_contig_73030 (73030)	0.0	0.19	1.0	0.0	0.0	0.0	0.16	0.0	0.0	0.0	0.0
Transcript_contig_73258 (73258)	0.64	0.07	1.0	0.52	0.0	0.29	0.72	0.0	0.0	0.0	0.08
Transcript_contig_7477 (7477)	0.0	0.0	1.0	0.0	0.0	0.07	0.22	0.0	0.0	0.07	0.0
Transcript_contig_78163 (78163)	0.05	0.0	1.0	0.3	0.06	0.37	0.03	0.0	0.02	0.01	0.37
Transcript_contig_78290 (78290)	0.18	0.16	1.0	0.33	0.06	0.36	0.03	0.05	0.01	0.09	0.45
Transcript_contig_78705 (78705)	0.1	0.07	1.0	0.51	0.22	0.52	0.13	0.09	0.0	0.04	0.38
Transcript_contig_79474 (79474)	0.0	0.0	1.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
Transcript_contig_79751 (79751)	0.06	0.0	1.0	0.26	0.89	0.0	0.26	0.0	0.0	0.24	0.16
Transcript_contig_79803 (79803)	0.15	0.06	1.0	0.62	0.48	0.35	0.38	0.08	0.14	0.11	0.26
Transcript_contig_80068 (80068)	0.03	0.02	1.0	0.21	0.08	0.2	0.05	0.03	0.05	0.05	0.18
Transcript_contig_82182 (82182)	0.07	0.01	1.0	0.23	0.05	0.36	0.05	0.01	0.08	0.06	0.31
Transcript_contig_82343 (82343)	0.44	0.27	0.45	0.17	0.84	0.2	1.0	0.23	0.0	0.43	0.06
Transcript_contig_83165 (83165)	0.25	0.32	1.0	0.74	0.39	0.39	0.77	0.38	0.0	0.0	0.0
Transcript_contig_83472 (83472)	0.03	0.0	1.0	0.18	0.06	0.05	0.02	0.0	0.0	0.0	0.07
Transcript_contig_83638 (83638)	0.05	0.09	0.76	0.63	0.0	0.07	1.0	0.0	0.51	0.33	0.19
Transcript_contig_8580 (8580)	0.27	0.0	1.0	0.49	0.07	0.2	0.43	0.0	0.08	0.55	0.37
Transcript_contig_8609 (8609)	0.0	0.52	0.99	0.14	0.58	0.0	0.0	1.0	0.0	0.69	0.4
Transcript_contig_86101 (86101)	0.13	0.26	1.0	0.46	0.44	0.7	0.09	0.0	0.0	0.07	0.81
Transcript_contig_8613 (8613)	0.0	0.0	1.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
Transcript_contig_8692 (8692)	0.12	0.05	1.0	0.49	0.25	0.34	0.12	0.05	0.01	0.05	0.31
Transcript_contig_8826 (8826)	0.44	0.17	0.23	0.49	0.89	0.4	0.3	0.0	0.62	1.0	0.48
Transcript_contig_89964 (89964)	0.08	0.01	1.0	0.3	0.07	0.29	0.04	0.01	0.06	0.03	0.24
Transcript_contig_90254 (90254)	0.1	0.0	1.0	0.21	0.3	0.06	0.29	0.0	0.0	0.0	0.0
Transcript_contig_90418 (90418)	0.04	0.0	1.0	0.07	0.0	0.06	0.12	0.0	0.0	0.0	0.0
Transcript_contig_90433 (90433)	0.09	0.09	1.0	0.24	0.72	0.0	0.27	0.29	0.0	0.32	0.0
Transcript_contig_9058 (9058)	0.03	0.0	1.0	0.25	0.0	0.0	0.11	0.0	0.0	0.0	0.0
Transcript_contig_90751 (90751)	0.06	0.0	1.0	0.42	0.19	0.32	0.13	0.0	0.01	0.01	0.28
Transcript_contig_9248 (9248)	0.1	0.04	1.0	0.33	0.07	0.28	0.03	0.02	0.0	0.03	0.21

Details

Expression values normalized per gene (using the maximum value, Green cells indicate low expression and red high. (Dark gray cells indicate missing values)