Heatmap: Cluster_104 (HCCA)

View as: (view raw or zlog-transformed)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are normalized against highest expression of the row)

Gene	CCAP211/11P,High light	CCAP211/11P,Low light	CPCC90,BBM,72h,Autotrophy	CPCC90,BBM,97h,Mixotrophy	CPCC90,BBM,98h,Mixotrophy	CPCC90,BBM,120h,Mixotrophy	CPCC90,BBM,144h,Heterotrophy	NJ-7,20C	NJ-7,4C	UTEX259,20C	UTEX259,4C
Transcript_contig_10105 (10105)	0.84	0.29	0.8	0.34	0.19	0.46	1.0	0.97	0.0	0.0	0.0
Transcript_contig_10770 (10770)	0.23	0.42	0.22	1.0	0.0	0.06	0.27	0.0	0.3	0.06	0.07
Transcript_contig_11737 (11737)	0.39	0.22	0.33	0.84	0.19	0.48	1.0	0.33	0.0	0.0	0.0
Transcript_contig_11828 (11828)	0.65	0.82	0.37	0.54	0.15	0.47	0.92	1.0	0.0	0.0	0.0
Transcript_contig_12285 (12285)	0.32	0.24	0.49	0.46	0.36	0.21	1.0	0.13	0.03	0.06	0.0
Transcript_contig_12346 (12346)	0.38	0.32	0.0	0.77	0.0	0.52	1.0	0.0	0.0	0.0	0.08
Transcript_contig_1319 (1319)	0.86	0.77	0.16	0.89	0.0	0.09	1.0	0.63	0.0	0.25	0.26
Transcript_contig_13625 (13625)	0.62	0.68	0.0	0.32	0.58	0.29	0.46	1.0	0.0	0.0	0.48
Transcript_contig_14895 (14895)	0.24	0.23	0.31	0.3	0.58	0.11	1.0	0.12	0.0	0.0	0.12
Transcript_contig_15632 (15632)	1.0	0.75	0.0	0.7	0.0	0.0	0.36	0.98	0.0	0.0	0.0
Transcript_contig_15951 (15951)	0.33	0.0	0.72	0.68	0.32	0.0	1.0	0.0	0.0	0.0	0.0
Transcript_contig_17122 (17122)	0.37	0.51	0.12	0.16	0.52	0.3	1.0	0.24	0.0	0.12	0.09
Transcript_contig_18888 (18888)	0.5	0.3	0.46	0.35	0.05	0.23	1.0	0.43	0.1	0.03	0.01
Transcript_contig_19348 (19348)	0.37	0.23	0.39	0.42	0.31	0.17	1.0	0.31	0.0	0.01	0.01
Transcript_contig_19818 (19818)	0.38	0.79	0.43	1.0	0.17	0.25	0.28	0.29	0.0	0.07	0.37
Transcript_contig_22639 (22639)	0.27	0.0	0.75	0.59	0.15	0.36	1.0	0.0	0.0	0.0	0.0
Transcript_contig_23991 (23991)	0.31	0.52	0.14	1.0	0.0	0.0	0.2	0.57	0.0	0.08	0.08
Transcript_contig_2401 (2401)	0.32	0.0	0.44	0.73	0.17	0.34	1.0	0.0	0.0	0.0	0.0
Transcript_contig_2528 (2528)	0.59	0.52	0.53	0.51	0.1	0.05	1.0	0.71	0.0	0.05	0.11
Transcript_contig_26984 (26984)	0.53	0.59	0.42	0.73	0.24	0.3	1.0	0.39	0.0	0.04	0.02
Transcript_contig_30062 (30062)	0.23	0.21	0.77	0.54	0.3	0.0	1.0	0.0	0.0	0.0	0.0
Transcript_contig_3845 (3845)	0.39	0.25	0.35	0.38	0.27	0.11	1.0	0.44	0.3	0.17	0.14
Transcript_contig_4071 (4071)	0.22	0.08	0.08	1.0	0.2	0.34	0.81	0.0	0.0	0.0	0.16
Transcript_contig_4262 (4262)	0.23	0.55	0.65	1.0	0.0	0.0	0.91	0.66	0.0	0.0	0.0
Transcript_contig_4557 (4557)	0.48	0.2	0.53	0.6	0.07	0.13	1.0	0.0	0.0	0.0	0.17
Transcript_contig_4916 (4916)	0.25	0.51	0.48	1.0	0.5	0.4	0.42	0.35	0.06	0.0	0.0
Transcript_contig_5309 (5309)	0.08	0.0	0.15	0.72	0.12	0.29	1.0	0.0	0.07	0.05	0.13
Transcript_contig_5322 (5322)	0.25	0.17	0.49	0.83	0.19	0.7	1.0	0.03	0.15	0.35	0.27
Transcript_contig_53746 (53746)	0.61	0.85	0.17	0.48	0.54	0.42	0.76	1.0	0.3	0.37	0.26
Transcript_contig_5716 (5716)	0.27	0.2	0.43	0.34	0.2	0.1	1.0	0.69	0.0	0.0	0.22
Transcript_contig_5861 (5861)	0.67	0.35	0.37	0.48	0.73	0.1	0.61	1.0	0.11	0.11	0.0
Transcript_contig_59883 (59883)	0.42	0.31	0.38	1.0	0.74	0.16	0.35	0.38	0.0	0.0	0.0
Transcript_contig_60286 (60286)	0.42	0.36	1.0	0.61	0.07	0.07	0.89	0.24	0.0	0.22	0.16
Transcript_contig_60630 (60630)	0.37	0.33	0.74	0.55	0.25	0.33	1.0	0.11	0.14	0.11	0.07
Transcript_contig_60786 (60786)	1.0	0.95	0.59	0.77	0.0	0.06	0.78	0.94	0.0	0.0	0.08
Transcript_contig_60794 (60794)	0.23	0.0	0.78	0.8	0.31	0.0	1.0	0.0	0.0	0.0	0.0
Transcript_contig_62515 (62515)	0.63	0.45	0.51	0.61	0.51	0.1	1.0	0.64	0.03	0.22	0.22
Transcript_contig_62821 (62821)	0.1	0.07	0.09	0.47	0.26	0.2	1.0	0.0	0.0	0.0	0.0
Transcript_contig_62876 (62876)	0.33	0.15	0.51	0.6	0.21	0.69	1.0	0.2	0.37	0.21	0.08
Transcript_contig_63896 (63896)	0.48	0.6	0.0	0.68	0.0	0.28	0.65	1.0	0.0	0.0	0.5
Transcript_contig_6463 (6463)	0.14	0.07	0.16	0.57	0.36	0.34	1.0	0.11	0.0	0.06	0.03
Transcript_contig_66305 (66305)	0.36	0.36	0.6	1.0	0.76	0.09	0.54	0.3	0.0	0.0	0.0
Transcript_contig_66342 (66342)	0.65	0.69	0.25	0.81	0.1	0.14	0.44	1.0	0.0	0.0	0.0
Transcript_contig_67614 (67614)	0.47	0.5	0.78	0.72	0.28	0.25	1.0	0.52	0.0	0.08	0.12
Transcript_contig_67889 (67889)	1.0	0.64	0.94	0.79	0.33	0.36	0.98	0.89	0.0	0.0	0.16
Transcript_contig_67943 (67943)	0.65	0.37	0.12	0.51	0.51	0.07	1.0	0.6	0.16	0.0	0.0
Transcript_contig_67997 (67997)	0.54	0.3	1.0	0.59	0.0	0.0	0.52	0.0	0.23	0.0	0.0
Transcript_contig_68037 (68037)	0.43	0.54	0.83	1.0	0.13	0.0	0.72	0.53	0.0	0.49	0.23
Transcript_contig_68134 (68134)	0.29	0.7	0.0	1.0	0.0	0.0	0.0	0.56	0.0	0.0	0.0
Transcript_contig_68284 (68284)	0.2	0.03	0.5	0.39	0.14	0.46	1.0	0.03	0.28	0.0	0.02
Transcript_contig_69529 (69529)	0.19	0.21	0.77	0.64	0.33	0.48	1.0	0.33	0.0	0.01	0.0
Transcript_contig_6976 (6976)	0.4	0.38	0.5	0.76	0.67	0.54	1.0	0.15	0.0	0.29	0.22
Transcript_contig_7009 (7009)	0.27	0.28	0.52	0.5	0.23	0.19	1.0	0.16	0.0	0.0	0.05
Transcript_contig_7506 (7506)	0.51	0.4	0.17	0.35	0.55	0.1	0.76	1.0	0.0	0.09	0.05
Transcript_contig_7852 (7852)	0.41	1.0	0.44	0.7	0.21	0.25	0.57	0.89	0.0	0.0	0.0
Transcript_contig_7958 (7958)	0.52	0.41	0.88	0.88	0.26	0.91	1.0	0.66	0.0	0.0	0.0
Transcript_contig_8127 (8127)	0.1	0.28	0.0	0.35	0.0	0.0	0.0	1.0	0.0	0.0	0.0
Transcript_contig_81919 (81919)	0.24	0.2	0.5	1.0	0.46	0.2	0.91	0.0	0.0	0.0	0.03
Transcript_contig_83365 (83365)	0.69	0.72	0.66	1.0	0.15	0.0	0.32	0.8	0.0	0.0	0.0
Transcript_contig_84332 (84332)	0.55	0.76	0.34	0.35	0.55	0.1	1.0	0.99	0.04	0.36	0.24
Transcript_contig_85096 (85096)	0.37	0.1	1.0	0.27	0.29	0.22	0.96	0.0	0.0	0.0	0.0
Transcript_contig_85930 (85930)	0.51	0.57	0.21	0.47	0.32	0.1	0.72	1.0	0.05	0.17	0.18
Transcript_contig_8984 (8984)	0.45	0.11	1.0	0.53	0.0	0.0	0.35	0.45	0.0	0.0	0.07
Transcript_contig_90415 (90415)	0.84	0.48	1.0	0.51	0.0	0.0	0.51	0.0	0.0	0.0	0.0
Transcript_contig_9109 (9109)	0.63	0.88	0.0	0.41	0.0	0.0	1.0	0.0	0.0	0.0	0.0
Transcript_contig_9242 (9242)	1.0	0.49	0.17	0.9	0.07	0.07	0.84	0.34	0.0	0.0	0.0
Transcript_contig_9401 (9401)	0.61	0.31	0.89	0.48	0.26	0.56	1.0	0.45	0.0	0.0	0.0
Transcript_contig_9434 (9434)	0.65	0.21	0.7	0.7	0.27	0.11	0.47	1.0	0.0	0.0	0.0
Transcript_contig_9788 (9788)	0.52	0.42	0.82	1.0	0.2	0.39	0.98	0.55	0.48	0.0	0.05

Details

Expression values normalized per gene (using the maximum value, Green cells indicate low expression and red high. (Dark gray cells indicate missing values)