Heatmap: Cluster_198 (HCCA)

View as: (view raw or zlog-transformed)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are normalized against highest expression of the row)

Gene	CCAP211/11P,High light	CCAP211/11P,Low light	CPCC90,BBM,72h,Autotrophy	CPCC90,BBM,97h,Mixotrophy	CPCC90,BBM,98h,Mixotrophy	CPCC90,BBM,120h,Mixotrophy	CPCC90,BBM,144h,Heterotrophy	NJ-7,20C	NJ-7,4C	UTEX259,20C	UTEX259,4C
Transcript_contig_1251 (1251)	0.54	0.62	0.28	0.53	0.67	0.5	0.54	0.74	0.03	1.0	0.66
Transcript_contig_1537 (1537)	0.47	0.51	0.19	0.36	0.4	0.57	0.51	0.26	0.61	1.0	0.56
Transcript_contig_1761 (1761)	0.6	0.63	0.96	0.75	0.43	0.54	0.57	0.41	0.26	1.0	0.65
Transcript_contig_22596 (22596)	0.29	0.19	0.59	0.56	0.69	0.4	0.63	0.53	0.0	0.73	1.0
Transcript_contig_2658 (2658)	0.92	1.0	0.49	0.29	0.23	0.3	0.48	0.26	0.68	0.85	0.54
Transcript_contig_2790 (2790)	0.29	0.17	0.89	0.87	0.21	1.0	0.86	0.09	0.06	0.56	0.47
Transcript_contig_31 (31)	0.55	0.55	1.0	0.38	0.16	0.62	0.73	0.23	0.17	0.95	0.85
Transcript_contig_3645 (3645)	0.5	0.37	0.42	0.4	0.58	0.32	0.69	0.2	0.1	1.0	0.57
Transcript_contig_3651 (3651)	1.0	0.85	0.35	0.28	0.11	0.4	0.68	0.1	0.11	0.41	0.28
Transcript_contig_4215 (4215)	0.14	0.12	0.54	0.26	0.08	0.74	0.83	0.07	0.24	1.0	0.89
Transcript_contig_4308 (4308)	0.98	1.0	0.95	0.52	0.01	0.27	0.38	0.29	0.16	0.52	0.41
Transcript_contig_4848 (4848)	0.87	0.85	0.98	0.9	0.45	0.39	1.0	0.56	0.48	0.18	0.23
Transcript_contig_53856 (53856)	0.72	0.8	1.0	0.8	0.36	0.73	0.64	0.39	0.54	0.7	0.53
Transcript_contig_56017 (56017)	0.64	0.63	1.0	0.71	0.42	0.55	0.85	0.44	0.52	0.89	0.51
Transcript_contig_56210 (56210)	1.0	0.86	0.56	0.34	0.07	0.29	0.23	0.18	0.62	0.69	0.34
Transcript_contig_56358 (56358)	0.67	0.82	1.0	0.76	0.16	0.54	0.57	0.29	0.52	0.47	0.51
Transcript_contig_57036 (57036)	0.66	0.72	0.91	0.91	0.81	0.98	1.0	0.47	0.48	0.97	0.71
Transcript_contig_57341 (57341)	0.26	0.14	1.0	0.83	0.4	0.6	0.6	0.15	0.18	0.89	0.51
Transcript_contig_57394 (57394)	0.96	1.0	0.98	0.49	0.26	0.72	0.75	0.59	0.41	0.83	0.59
Transcript_contig_57894 (57894)	0.59	0.63	0.54	0.47	0.37	0.19	0.38	0.46	0.17	1.0	0.56
Transcript_contig_57949 (57949)	0.31	0.34	0.71	0.74	0.48	0.28	0.62	0.28	0.0	1.0	0.5
Transcript_contig_58385 (58385)	0.86	0.92	1.0	0.63	0.29	0.24	0.44	0.26	0.09	0.67	0.43
Transcript_contig_58456 (58456)	0.33	0.56	0.58	0.4	0.03	0.31	0.15	0.25	0.02	1.0	0.63
Transcript_contig_58461 (58461)	0.85	0.81	0.55	0.53	0.32	0.43	0.69	0.35	0.75	1.0	0.44
Transcript_contig_59054 (59054)	0.51	0.63	0.98	0.64	0.35	0.44	0.5	0.41	0.01	1.0	0.58
Transcript_contig_59906 (59906)	0.44	0.57	0.28	0.24	0.27	0.24	0.34	0.59	0.75	1.0	0.44
Transcript_contig_60063 (60063)	0.5	0.41	0.64	0.74	0.55	0.6	0.66	0.11	0.27	1.0	0.51
Transcript_contig_60065 (60065)	0.48	0.29	0.41	0.41	0.45	0.27	0.33	0.12	0.16	1.0	0.89
Transcript_contig_60111 (60111)	0.19	0.38	0.66	0.86	0.76	0.37	0.56	0.02	0.08	1.0	0.45
Transcript_contig_614 (614)	0.36	0.42	1.0	0.62	0.45	0.48	0.71	0.67	0.0	0.67	0.42
Transcript_contig_62123 (62123)	0.64	0.49	0.97	0.47	0.23	0.4	0.53	0.19	1.0	0.17	0.2
Transcript_contig_63015 (63015)	0.61	1.0	0.32	0.32	0.55	0.84	0.58	0.41	0.12	1.0	0.57
Transcript_contig_68912 (68912)	0.87	0.83	1.0	0.64	0.18	0.45	0.71	0.26	0.53	0.18	0.14
Transcript_contig_69262 (69262)	0.91	0.75	0.7	0.63	0.49	0.57	0.78	0.35	0.6	1.0	0.56
Transcript_contig_6979 (6979)	0.18	0.25	0.87	0.33	0.66	0.25	0.41	0.3	0.05	1.0	0.55
Transcript_contig_7026 (7026)	0.87	0.72	0.14	0.34	0.58	0.34	0.26	0.32	0.6	1.0	0.57
Transcript_contig_78333 (78333)	0.55	0.52	0.46	0.51	0.29	0.68	0.71	0.24	0.55	1.0	0.68
Transcript_contig_78349 (78349)	0.25	0.28	1.0	0.69	0.26	0.57	0.49	0.16	0.09	0.98	0.48
Transcript_contig_78566 (78566)	0.41	0.43	1.0	0.82	0.33	0.56	0.64	0.24	0.02	0.62	0.37
Transcript_contig_79220 (79220)	0.26	0.24	0.54	0.41	0.22	0.38	0.52	0.25	0.49	1.0	0.6
Transcript_contig_79810 (79810)	0.58	0.58	0.28	0.58	0.44	0.55	0.46	0.36	0.33	1.0	0.53
Transcript_contig_80618 (80618)	0.54	0.72	0.56	0.33	0.03	0.45	0.37	0.28	0.06	1.0	0.5
Transcript_contig_81214 (81214)	0.31	0.44	1.0	0.31	0.49	0.28	0.63	0.2	0.0	0.61	0.31
Transcript_contig_82304 (82304)	0.66	0.72	0.36	0.57	0.4	0.4	0.52	0.17	0.29	1.0	0.58
Transcript_contig_89128 (89128)	0.48	0.53	0.75	0.74	0.4	0.96	0.73	0.23	0.22	1.0	0.59
Transcript_contig_89186 (89186)	0.41	0.27	1.0	0.53	0.09	0.69	0.78	0.16	0.21	0.73	0.49
Transcript_contig_89818 (89818)	0.74	0.57	0.83	0.57	0.34	0.4	0.55	0.19	0.42	1.0	0.48
Transcript_contig_90156 (90156)	0.38	0.53	0.83	0.99	0.49	0.64	1.0	0.15	0.14	0.97	0.55
Transcript_contig_90207 (90207)	0.34	0.49	0.34	0.58	0.55	0.94	0.6	0.1	0.07	1.0	0.65
Transcript_contig_90384 (90384)	0.86	0.79	0.26	0.47	0.51	0.48	0.64	0.27	0.19	1.0	0.42
Transcript_contig_90405 (90405)	0.12	0.18	0.18	0.13	0.23	0.14	0.53	0.09	0.0	1.0	0.94
Transcript_contig_90419 (90419)	0.31	0.74	0.33	0.12	0.61	0.49	0.64	1.0	0.0	0.46	0.58
Transcript_contig_91081 (91081)	0.7	0.74	0.93	0.99	0.32	0.91	1.0	0.99	0.0	0.87	0.52

Details

Expression values normalized per gene (using the maximum value, Green cells indicate low expression and red high. (Dark gray cells indicate missing values)