Heatmap: Cluster_152 (HCCA)

View as: (view raw or zlog-transformed)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are normalized against highest expression of the row)

Gene	CCAP211/11P,High light	CCAP211/11P,Low light	CPCC90,BBM,72h,Autotrophy	CPCC90,BBM,97h,Mixotrophy	CPCC90,BBM,98h,Mixotrophy	CPCC90,BBM,120h,Mixotrophy	CPCC90,BBM,144h,Heterotrophy	NJ-7,20C	NJ-7,4C	UTEX259,20C	UTEX259,4C
Transcript_contig_1419 (1419)	0.2	0.28	0.13	0.7	1.0	0.23	0.35	0.32	0.1	0.25	0.19
Transcript_contig_15946 (15946)	0.03	0.0	0.56	0.76	0.75	0.28	0.33	0.0	0.0	1.0	0.76
Transcript_contig_22575 (22575)	0.07	0.01	0.5	0.71	1.0	0.43	0.24	0.05	0.0	0.59	0.34
Transcript_contig_28182 (28182)	0.09	0.0	0.59	0.95	1.0	0.64	0.62	0.0	0.11	0.59	0.46
Transcript_contig_3145 (3145)	0.37	0.37	0.45	0.85	1.0	0.34	0.55	0.42	0.33	0.31	0.25
Transcript_contig_3174 (3174)	0.06	0.02	0.11	0.59	0.7	0.56	0.13	0.03	0.12	1.0	0.73
Transcript_contig_3255 (3255)	0.1	0.06	0.36	0.5	1.0	0.34	0.21	0.08	0.07	0.5	0.34
Transcript_contig_53755 (53755)	0.15	0.18	0.11	0.36	1.0	0.14	0.15	0.17	0.08	0.23	0.18
Transcript_contig_54127 (54127)	0.5	0.48	0.44	0.66	1.0	0.49	0.58	0.42	0.24	0.8	0.48
Transcript_contig_54136 (54136)	0.19	0.14	0.35	0.69	1.0	0.34	0.29	0.12	0.19	0.41	0.32
Transcript_contig_54146 (54146)	0.12	0.1	0.22	0.72	1.0	0.43	0.24	0.08	0.19	0.61	0.4
Transcript_contig_54311 (54311)	0.49	0.43	0.78	0.84	1.0	0.56	0.8	0.45	0.24	0.58	0.48
Transcript_contig_54362 (54362)	0.26	0.23	0.35	0.71	1.0	0.31	0.41	0.25	0.18	0.38	0.3
Transcript_contig_54459 (54459)	0.11	0.12	0.16	0.6	1.0	0.12	0.06	0.13	0.06	0.32	0.25
Transcript_contig_54474 (54474)	0.24	0.28	0.28	0.52	1.0	0.25	0.35	0.33	0.08	0.28	0.18
Transcript_contig_54491 (54491)	0.49	0.4	0.26	1.0	0.84	0.58	0.79	0.27	0.04	0.42	0.46
Transcript_contig_54589 (54589)	0.33	0.27	0.32	0.57	1.0	0.34	0.42	0.32	0.23	0.48	0.4
Transcript_contig_54703 (54703)	0.17	0.17	0.27	0.79	1.0	0.21	0.29	0.16	0.01	0.36	0.2
Transcript_contig_54730 (54730)	0.52	0.61	0.37	0.63	1.0	0.34	0.46	0.71	0.43	0.56	0.37
Transcript_contig_54752 (54752)	0.27	0.28	0.24	0.6	1.0	0.25	0.26	0.31	0.16	0.46	0.34
Transcript_contig_54936 (54936)	0.12	0.13	0.13	0.56	1.0	0.47	0.18	0.1	0.04	0.47	0.31
Transcript_contig_54979 (54979)	0.58	0.83	0.36	0.53	1.0	0.42	0.42	0.64	0.05	0.68	0.44
Transcript_contig_55138 (55138)	0.44	0.47	0.32	0.6	1.0	0.34	0.45	0.41	0.24	0.46	0.31
Transcript_contig_55160 (55160)	0.17	0.12	0.11	0.48	1.0	0.16	0.16	0.05	0.14	0.37	0.27
Transcript_contig_55318 (55318)	0.38	0.33	0.44	0.72	1.0	0.27	0.28	0.22	0.09	0.35	0.24
Transcript_contig_55331 (55331)	0.38	0.37	0.28	0.68	1.0	0.39	0.46	0.27	0.2	0.69	0.46
Transcript_contig_55486 (55486)	0.07	0.06	0.05	0.55	1.0	0.19	0.11	0.04	0.07	0.34	0.22
Transcript_contig_55716 (55716)	0.52	0.62	0.46	0.82	1.0	0.46	0.55	0.63	0.36	0.56	0.45
Transcript_contig_55726 (55726)	0.35	0.5	0.46	0.72	1.0	0.27	0.44	0.48	0.03	0.32	0.18
Transcript_contig_55777 (55777)	0.06	0.03	0.05	0.44	0.69	0.46	0.13	0.02	0.02	1.0	0.65
Transcript_contig_55856 (55856)	0.26	0.34	0.24	0.95	1.0	0.57	0.55	0.46	0.08	0.66	0.48
Transcript_contig_55899 (55899)	0.19	0.12	0.23	0.64	1.0	0.27	0.22	0.14	0.2	0.4	0.33
Transcript_contig_55926 (55926)	0.15	0.1	0.24	0.56	1.0	0.23	0.28	0.13	0.2	0.33	0.25
Transcript_contig_55935 (55935)	0.21	0.17	0.24	0.5	1.0	0.3	0.38	0.21	0.13	0.38	0.26
Transcript_contig_55947 (55947)	0.7	0.85	0.3	0.76	1.0	0.41	0.42	0.57	0.26	0.59	0.54
Transcript_contig_55956 (55956)	0.26	0.21	0.18	0.54	1.0	0.3	0.26	0.25	0.35	0.63	0.53
Transcript_contig_55961 (55961)	0.43	0.42	0.56	0.97	1.0	0.51	0.66	0.37	0.21	0.69	0.51
Transcript_contig_56008 (56008)	0.15	0.14	0.25	0.52	1.0	0.2	0.23	0.21	0.13	0.34	0.25
Transcript_contig_56059 (56059)	0.46	0.69	0.77	1.0	0.75	0.53	0.44	0.65	0.19	0.36	0.26
Transcript_contig_56072 (56072)	0.44	0.34	0.29	0.65	1.0	0.36	0.64	0.3	0.15	0.43	0.34
Transcript_contig_56077 (56077)	0.38	0.4	0.23	0.66	1.0	0.41	0.33	0.16	0.13	0.25	0.18
Transcript_contig_56101 (56101)	0.09	0.05	0.03	0.56	1.0	0.16	0.13	0.05	0.11	0.24	0.19
Transcript_contig_56392 (56392)	0.14	0.12	0.2	0.55	0.73	0.64	0.36	0.1	0.0	1.0	0.56
Transcript_contig_56529 (56529)	0.17	0.1	0.1	0.5	1.0	0.17	0.2	0.07	0.1	0.42	0.31
Transcript_contig_56548 (56548)	0.31	0.25	0.27	0.49	1.0	0.26	0.43	0.28	0.32	0.33	0.28
Transcript_contig_56625 (56625)	0.65	0.78	0.52	0.75	1.0	0.53	0.67	0.8	0.44	0.86	0.6
Transcript_contig_56771 (56771)	0.46	0.39	0.31	0.65	1.0	0.36	0.65	0.31	0.16	0.45	0.3
Transcript_contig_56847 (56847)	0.17	0.1	0.17	0.57	1.0	0.27	0.32	0.07	0.13	0.3	0.25
Transcript_contig_56965 (56965)	0.29	0.36	0.22	0.54	1.0	0.3	0.34	0.43	0.13	0.53	0.26
Transcript_contig_56985 (56985)	0.14	0.08	0.16	0.6	1.0	0.14	0.21	0.03	0.07	0.36	0.2
Transcript_contig_57035 (57035)	0.34	0.37	0.32	0.73	1.0	0.75	0.51	0.36	0.22	0.65	0.46
Transcript_contig_57152 (57152)	0.03	0.02	0.07	0.38	0.69	0.42	0.07	0.02	0.04	1.0	0.68
Transcript_contig_57331 (57331)	0.2	0.2	0.4	0.69	1.0	0.8	0.22	0.2	0.09	0.67	0.41
Transcript_contig_57369 (57369)	0.49	0.62	0.22	0.59	1.0	0.41	0.4	0.51	0.06	0.52	0.35
Transcript_contig_57546 (57546)	0.16	0.11	0.16	0.73	0.97	0.6	0.34	0.08	0.03	1.0	0.64
Transcript_contig_57596 (57596)	0.28	0.29	0.34	0.68	1.0	0.29	0.32	0.25	0.16	0.39	0.31
Transcript_contig_57624 (57624)	0.03	0.01	0.1	0.59	1.0	0.26	0.12	0.01	0.03	0.33	0.22
Transcript_contig_57642 (57642)	0.07	0.04	0.51	0.82	1.0	0.4	0.29	0.03	0.03	0.65	0.41
Transcript_contig_57652 (57652)	0.37	0.42	0.25	0.53	1.0	0.26	0.31	0.39	0.23	0.33	0.28
Transcript_contig_57824 (57824)	0.09	0.08	0.21	0.55	1.0	0.31	0.2	0.08	0.05	0.55	0.33
Transcript_contig_58062 (58062)	0.35	0.47	0.14	0.53	1.0	0.37	0.3	0.64	0.23	0.56	0.4
Transcript_contig_58163 (58163)	0.09	0.04	0.08	0.56	1.0	0.29	0.22	0.05	0.1	0.5	0.38
Transcript_contig_58249 (58249)	0.16	0.18	0.13	0.76	1.0	0.19	0.16	0.22	0.06	0.4	0.29
Transcript_contig_58341 (58341)	0.32	0.34	0.16	0.63	1.0	0.35	0.48	0.27	0.1	0.5	0.27
Transcript_contig_58682 (58682)	0.49	0.46	0.32	0.7	1.0	0.49	0.8	0.44	0.07	0.37	0.27
Transcript_contig_58759 (58759)	0.3	0.39	0.52	0.84	1.0	0.51	0.5	0.43	0.5	0.64	0.57
Transcript_contig_58779 (58779)	0.38	0.3	0.27	0.59	1.0	0.5	0.31	0.34	0.28	0.82	0.57
Transcript_contig_58810 (58810)	0.46	0.47	0.39	0.65	1.0	0.38	0.58	0.53	0.32	0.51	0.41
Transcript_contig_58828 (58828)	0.26	0.15	0.41	0.74	1.0	0.27	0.46	0.19	0.08	0.47	0.31
Transcript_contig_59112 (59112)	0.02	0.01	0.03	0.47	1.0	0.21	0.04	0.01	0.02	0.46	0.31
Transcript_contig_59165 (59165)	0.18	0.19	0.38	0.63	1.0	0.09	0.39	0.14	0.0	0.29	0.11
Transcript_contig_59292 (59292)	0.02	0.01	0.14	0.47	1.0	0.22	0.08	0.02	0.02	0.37	0.31
Transcript_contig_60021 (60021)	0.13	0.09	0.15	0.62	1.0	0.21	0.25	0.11	0.16	0.28	0.18
Transcript_contig_60199 (60199)	0.3	0.35	0.36	0.56	1.0	0.24	0.4	0.38	0.11	0.25	0.18
Transcript_contig_60200 (60200)	0.16	0.21	0.11	0.59	1.0	0.34	0.2	0.19	0.04	0.56	0.34
Transcript_contig_60269 (60269)	0.58	0.56	0.31	0.53	1.0	0.3	0.52	0.29	0.27	0.67	0.49
Transcript_contig_61308 (61308)	0.08	0.06	0.22	0.33	1.0	0.06	0.09	0.07	0.04	0.14	0.12
Transcript_contig_61431 (61431)	0.14	0.13	0.12	0.65	1.0	0.36	0.32	0.17	0.02	0.65	0.38
Transcript_contig_62069 (62069)	0.39	0.57	0.42	0.45	1.0	0.31	0.34	0.62	0.14	0.36	0.32
Transcript_contig_62118 (62118)	0.1	0.17	0.23	0.57	0.88	0.81	0.15	0.05	0.19	1.0	0.76
Transcript_contig_65064 (65064)	0.03	0.01	0.27	0.57	0.54	0.66	0.14	0.0	0.01	1.0	0.59
Transcript_contig_652 (652)	0.32	0.2	0.71	0.6	1.0	0.51	0.5	0.29	0.0	0.1	0.27
Transcript_contig_66109 (66109)	0.28	0.34	0.12	0.52	1.0	0.26	0.24	0.38	0.19	0.32	0.21
Transcript_contig_67456 (67456)	0.1	0.04	0.29	1.0	0.96	0.38	0.43	0.03	0.02	0.28	0.22
Transcript_contig_67463 (67463)	0.4	0.38	0.48	0.48	1.0	0.31	0.47	0.46	0.21	0.57	0.4
Transcript_contig_69118 (69118)	0.23	0.31	0.16	0.48	0.9	0.35	0.23	0.36	0.05	1.0	0.62
Transcript_contig_69943 (69943)	0.17	0.19	0.26	0.65	0.64	0.59	0.44	0.1	0.03	1.0	0.59
Transcript_contig_70128 (70128)	0.15	0.09	0.24	0.49	1.0	0.29	0.3	0.16	0.03	0.41	0.28
Transcript_contig_70837 (70837)	0.12	0.11	0.14	0.59	1.0	0.27	0.22	0.17	0.1	0.25	0.2
Transcript_contig_72220 (72220)	0.14	0.0	0.05	1.0	0.96	0.35	0.11	0.0	0.2	0.52	0.48
Transcript_contig_7288 (7288)	0.22	0.22	0.14	0.67	1.0	0.57	0.41	0.17	0.21	0.66	0.51
Transcript_contig_78111 (78111)	0.24	0.2	0.22	0.69	1.0	0.22	0.28	0.16	0.09	0.33	0.24
Transcript_contig_78235 (78235)	0.15	0.08	0.19	0.77	1.0	0.37	0.51	0.13	0.32	0.31	0.22
Transcript_contig_78244 (78244)	0.2	0.16	0.27	0.71	1.0	0.38	0.41	0.21	0.51	0.36	0.27
Transcript_contig_78371 (78371)	0.28	0.39	0.3	0.46	1.0	0.42	0.34	0.39	0.22	0.61	0.37
Transcript_contig_78710 (78710)	0.11	0.11	0.05	0.53	1.0	0.17	0.21	0.11	0.09	0.25	0.18
Transcript_contig_78752 (78752)	0.2	0.07	0.15	0.62	1.0	0.3	0.27	0.07	0.3	0.5	0.45
Transcript_contig_79519 (79519)	0.54	0.6	0.25	0.56	1.0	0.59	0.56	0.75	0.16	0.65	0.42
Transcript_contig_79655 (79655)	0.08	0.09	0.09	0.41	1.0	0.14	0.16	0.13	0.01	0.24	0.15
Transcript_contig_79688 (79688)	0.24	0.29	0.2	0.68	1.0	0.25	0.15	0.25	0.06	0.69	0.38
Transcript_contig_79849 (79849)	0.43	0.56	0.21	0.67	1.0	0.29	0.41	0.29	0.17	0.16	0.11
Transcript_contig_80294 (80294)	0.13	0.07	0.19	0.67	1.0	0.45	0.32	0.04	0.16	0.56	0.34
Transcript_contig_80550 (80550)	0.3	0.36	0.43	0.78	1.0	0.52	0.32	0.45	0.15	0.83	0.49
Transcript_contig_82257 (82257)	0.13	0.13	0.09	0.67	1.0	0.34	0.2	0.12	0.04	0.72	0.42
Transcript_contig_89122 (89122)	0.15	0.17	0.21	0.63	1.0	0.53	0.61	0.22	0.21	0.6	0.47
Transcript_contig_89238 (89238)	0.23	0.25	0.39	0.65	1.0	0.27	0.3	0.27	0.07	0.45	0.31
Transcript_contig_89296 (89296)	0.36	0.33	0.31	0.72	1.0	0.47	0.61	0.3	0.12	0.43	0.3
Transcript_contig_89303 (89303)	0.21	0.21	0.35	0.68	1.0	0.34	0.38	0.29	0.11	0.34	0.23
Transcript_contig_89332 (89332)	0.26	0.24	0.23	0.57	1.0	0.29	0.32	0.29	0.31	0.43	0.35
Transcript_contig_89437 (89437)	0.44	0.35	0.54	0.75	1.0	0.31	0.45	0.21	0.37	0.52	0.37
Transcript_contig_89446 (89446)	0.04	0.05	0.04	0.76	1.0	0.31	0.11	0.07	0.05	0.4	0.25
Transcript_contig_89506 (89506)	0.21	0.2	0.12	0.57	1.0	0.48	0.36	0.16	0.08	0.73	0.48
Transcript_contig_89802 (89802)	0.33	0.35	0.54	0.72	1.0	0.38	0.7	0.3	0.36	0.38	0.29
Transcript_contig_90005 (90005)	0.45	0.42	0.32	0.57	1.0	0.34	0.51	0.43	0.4	0.59	0.42
Transcript_contig_90260 (90260)	0.51	0.85	0.24	0.66	0.96	0.42	0.45	1.0	0.02	0.48	0.57
Transcript_contig_9638 (9638)	0.12	0.1	0.12	0.56	1.0	0.25	0.19	0.11	0.07	0.19	0.14

Details

Expression values normalized per gene (using the maximum value, Green cells indicate low expression and red high. (Dark gray cells indicate missing values)