Heatmap: Cluster_29 (HCCA)

View as: (view raw or zlog-transformed)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are normalized against highest expression of the row)

Gene	CCAP211/11P,High light	CCAP211/11P,Low light	CPCC90,BBM,72h,Autotrophy	CPCC90,BBM,97h,Mixotrophy	CPCC90,BBM,98h,Mixotrophy	CPCC90,BBM,120h,Mixotrophy	CPCC90,BBM,144h,Heterotrophy	NJ-7,20C	NJ-7,4C	UTEX259,20C	UTEX259,4C
Transcript_contig_1027 (1027)	0.36	0.42	1.0	0.53	0.01	0.09	0.19	0.27	0.11	0.2	0.07
Transcript_contig_11129 (11129)	0.69	1.0	0.67	0.47	0.0	0.22	0.39	0.77	0.03	0.05	0.04
Transcript_contig_11343 (11343)	0.71	0.98	0.87	0.47	0.21	0.32	0.33	1.0	0.0	0.16	0.15
Transcript_contig_1703 (1703)	0.91	0.85	1.0	0.53	0.0	0.03	0.07	0.11	0.69	0.21	0.14
Transcript_contig_1731 (1731)	0.77	0.84	1.0	0.83	0.4	0.2	0.52	0.39	0.27	0.22	0.21
Transcript_contig_17618 (17618)	0.94	0.87	0.87	0.69	0.31	0.23	0.45	1.0	0.0	0.14	0.08
Transcript_contig_2010 (2010)	0.78	0.76	0.7	0.56	0.44	0.48	1.0	0.43	0.19	0.19	0.15
Transcript_contig_2418 (2418)	0.7	0.78	1.0	0.87	0.39	0.33	0.81	0.66	0.18	0.43	0.18
Transcript_contig_270 (270)	0.58	1.0	0.47	0.4	0.27	0.29	0.83	0.51	0.17	0.17	0.14
Transcript_contig_2749 (2749)	0.8	0.79	0.56	0.47	0.2	0.39	1.0	0.47	0.2	0.16	0.17
Transcript_contig_2809 (2809)	0.5	0.65	1.0	0.46	0.31	0.33	0.72	0.6	0.07	0.48	0.24
Transcript_contig_3298 (3298)	0.78	0.98	0.36	0.33	0.11	0.33	1.0	0.72	0.22	0.14	0.09
Transcript_contig_3378 (3378)	0.72	0.72	0.52	0.41	0.25	0.49	1.0	0.53	0.05	0.34	0.29
Transcript_contig_3392 (3392)	0.76	0.81	0.44	0.32	0.46	0.39	1.0	0.89	0.91	0.3	0.32
Transcript_contig_401 (401)	0.54	0.48	0.56	0.5	0.39	0.53	1.0	0.22	0.01	0.33	0.25
Transcript_contig_4110 (4110)	0.48	0.71	1.0	0.41	0.11	0.41	0.49	0.8	0.02	0.07	0.11
Transcript_contig_4135 (4135)	0.66	0.78	0.74	0.51	0.28	0.43	1.0	0.56	0.17	0.37	0.16
Transcript_contig_4301 (4301)	0.49	0.44	0.52	0.5	0.45	0.37	1.0	0.39	0.01	0.27	0.16
Transcript_contig_446 (446)	0.39	0.41	1.0	0.45	0.02	0.18	0.25	0.2	0.11	0.23	0.14
Transcript_contig_4604 (4604)	0.46	0.66	0.67	0.37	0.14	0.42	0.54	1.0	0.51	0.26	0.21
Transcript_contig_4809 (4809)	1.0	0.97	0.93	0.92	0.2	0.6	0.49	0.17	0.0	0.23	0.13
Transcript_contig_5234 (5234)	0.3	0.56	0.5	0.2	0.02	0.1	0.2	1.0	0.12	0.06	0.06
Transcript_contig_54004 (54004)	0.97	0.97	0.72	0.44	0.12	0.55	1.0	0.62	0.27	0.5	0.37
Transcript_contig_54078 (54078)	0.74	0.7	0.7	0.78	0.55	0.42	1.0	0.35	0.09	0.4	0.24
Transcript_contig_54205 (54205)	0.83	1.0	0.81	0.54	0.3	0.49	0.81	0.82	0.15	0.24	0.29
Transcript_contig_54415 (54415)	1.0	0.87	0.61	0.72	0.62	0.44	0.99	0.44	0.23	0.39	0.27
Transcript_contig_54438 (54438)	0.43	0.42	1.0	0.57	0.22	0.31	0.69	0.22	0.04	0.26	0.17
Transcript_contig_54540 (54540)	0.61	0.81	0.6	0.51	0.36	0.29	0.76	1.0	0.1	0.12	0.09
Transcript_contig_54544 (54544)	0.84	0.81	0.73	0.5	0.25	0.33	1.0	0.7	0.26	0.17	0.11
Transcript_contig_54567 (54567)	0.56	0.66	1.0	0.75	0.35	0.32	0.59	0.66	0.5	0.15	0.19
Transcript_contig_54759 (54759)	0.3	0.34	1.0	0.48	0.08	0.12	0.32	0.29	0.08	0.13	0.1
Transcript_contig_54806 (54806)	0.77	0.86	1.0	0.51	0.05	0.47	0.61	0.6	0.45	0.26	0.46
Transcript_contig_54843 (54843)	0.68	0.78	0.84	0.67	0.58	0.59	0.95	1.0	0.19	0.23	0.27
Transcript_contig_54904 (54904)	0.87	0.84	0.95	0.65	0.41	0.48	1.0	0.53	0.88	0.53	0.41
Transcript_contig_55038 (55038)	0.81	0.78	0.58	0.47	0.53	0.38	1.0	0.97	0.35	0.26	0.22
Transcript_contig_55042 (55042)	0.51	0.44	1.0	0.49	0.34	0.34	0.78	0.28	0.48	0.16	0.19
Transcript_contig_55181 (55181)	0.42	0.5	1.0	0.5	0.05	0.15	0.31	0.34	0.22	0.23	0.16
Transcript_contig_55211 (55211)	0.76	0.85	0.44	0.47	0.51	0.45	1.0	0.66	0.18	0.35	0.31
Transcript_contig_55348 (55348)	0.82	1.0	0.53	0.5	0.21	0.31	0.76	0.64	0.2	0.34	0.35
Transcript_contig_55353 (55353)	0.81	0.85	0.77	0.81	0.46	0.45	1.0	0.77	0.27	0.31	0.26
Transcript_contig_55396 (55396)	0.94	1.0	0.85	0.81	0.6	0.32	0.76	0.95	0.33	0.25	0.19
Transcript_contig_55430 (55430)	0.56	0.51	0.94	0.82	1.0	0.36	0.67	0.4	0.27	0.56	0.5
Transcript_contig_55503 (55503)	0.44	0.71	0.64	0.39	0.2	0.15	0.38	1.0	0.25	0.18	0.14
Transcript_contig_55519 (55519)	0.81	0.96	0.81	0.65	0.8	0.41	0.88	1.0	0.27	0.32	0.21
Transcript_contig_55671 (55671)	0.44	0.51	1.0	0.44	0.2	0.18	0.53	0.51	0.08	0.34	0.18
Transcript_contig_55710 (55710)	0.88	1.0	0.65	0.62	0.78	0.52	0.89	0.77	0.25	0.24	0.35
Transcript_contig_55720 (55720)	0.35	0.46	1.0	0.69	0.35	0.22	0.36	0.3	0.04	0.12	0.15
Transcript_contig_55724 (55724)	0.51	0.71	0.8	0.56	0.45	0.48	1.0	0.55	0.2	0.22	0.18
Transcript_contig_56042 (56042)	0.41	0.39	1.0	0.39	0.0	0.07	0.06	0.04	0.05	0.02	0.1
Transcript_contig_56384 (56384)	0.91	1.0	0.99	0.74	0.39	0.36	0.94	0.83	0.25	0.22	0.15
Transcript_contig_56781 (56781)	0.78	1.0	0.77	0.48	0.24	0.48	0.99	0.64	0.21	0.25	0.2
Transcript_contig_56858 (56858)	0.64	0.63	0.7	0.5	0.27	0.4	1.0	0.44	0.1	0.19	0.16
Transcript_contig_56895 (56895)	0.89	0.91	0.61	0.66	0.3	0.37	1.0	0.55	0.5	0.24	0.19
Transcript_contig_56950 (56950)	0.56	0.68	1.0	0.67	0.22	0.27	0.47	0.75	0.25	0.35	0.26
Transcript_contig_56986 (56986)	0.54	0.5	1.0	0.5	0.1	0.21	0.42	0.31	0.39	0.09	0.08
Transcript_contig_57073 (57073)	0.98	0.93	0.89	0.91	0.53	0.38	1.0	0.44	0.43	0.31	0.2
Transcript_contig_57111 (57111)	0.53	0.67	0.86	0.85	0.58	0.42	1.0	0.34	0.07	0.23	0.29
Transcript_contig_57124 (57124)	0.57	0.99	1.0	0.57	0.16	0.29	0.66	0.77	0.14	0.39	0.26
Transcript_contig_57275 (57275)	0.4	0.43	1.0	0.54	0.35	0.18	0.29	0.3	0.44	0.17	0.27
Transcript_contig_57513 (57513)	1.0	0.98	0.52	0.5	0.16	0.55	1.0	0.63	0.31	0.25	0.3
Transcript_contig_57551 (57551)	0.77	0.89	0.79	0.63	0.5	0.48	1.0	0.6	0.48	0.22	0.3
Transcript_contig_57771 (57771)	0.61	0.68	0.44	0.27	0.33	0.37	1.0	0.79	0.16	0.08	0.09
Transcript_contig_58117 (58117)	0.44	0.53	0.96	0.55	0.38	0.33	1.0	0.39	0.17	0.09	0.16
Transcript_contig_58148 (58148)	0.79	1.0	0.64	0.44	0.28	0.5	0.88	0.9	0.37	0.41	0.34
Transcript_contig_58234 (58234)	0.5	0.52	0.96	0.53	0.2	0.41	1.0	0.27	0.27	0.32	0.26
Transcript_contig_58271 (58271)	0.5	0.46	1.0	0.74	0.67	0.38	0.87	0.41	0.37	0.25	0.27
Transcript_contig_58285 (58285)	0.56	0.54	1.0	0.63	0.34	0.27	0.61	0.32	0.03	0.18	0.13
Transcript_contig_58336 (58336)	0.68	0.83	0.63	0.71	0.45	0.24	0.65	1.0	0.19	0.08	0.08
Transcript_contig_58340 (58340)	0.75	0.81	0.68	0.72	0.57	0.35	1.0	0.6	0.23	0.24	0.22
Transcript_contig_58417 (58417)	0.32	0.59	0.53	0.16	0.19	0.14	0.33	1.0	0.11	0.13	0.08
Transcript_contig_58430 (58430)	0.49	0.55	1.0	0.48	0.19	0.23	0.49	0.49	0.4	0.18	0.21
Transcript_contig_58790 (58790)	0.46	0.43	0.63	0.56	0.45	0.48	0.75	0.57	1.0	0.27	0.42
Transcript_contig_58818 (58818)	0.76	0.74	0.89	0.57	0.43	0.59	1.0	0.76	0.66	0.3	0.53
Transcript_contig_58935 (58935)	0.47	0.68	0.81	0.5	0.22	0.37	0.68	1.0	0.11	0.16	0.19
Transcript_contig_59331 (59331)	0.59	0.67	1.0	0.46	0.21	0.36	0.7	0.58	0.04	0.16	0.16
Transcript_contig_59388 (59388)	0.58	0.65	0.57	0.4	0.33	0.48	1.0	0.68	0.0	0.21	0.16
Transcript_contig_59420 (59420)	0.32	0.29	1.0	0.42	0.06	0.23	0.41	0.18	0.02	0.05	0.1
Transcript_contig_59743 (59743)	0.54	0.48	0.99	0.75	0.57	0.41	1.0	0.52	0.62	0.19	0.23
Transcript_contig_59782 (59782)	0.56	0.62	0.69	0.34	0.4	0.52	1.0	0.49	0.11	0.3	0.22
Transcript_contig_59844 (59844)	0.26	0.27	1.0	0.4	0.0	0.08	0.21	0.2	0.08	0.06	0.05
Transcript_contig_59973 (59973)	0.5	0.49	1.0	0.57	0.6	0.4	0.59	0.36	0.31	0.41	0.46
Transcript_contig_60153 (60153)	0.53	0.53	1.0	0.67	0.34	0.25	0.56	0.52	0.06	0.2	0.14
Transcript_contig_60381 (60381)	0.65	0.72	0.8	0.64	0.49	0.52	1.0	0.55	0.0	0.21	0.18
Transcript_contig_60419 (60419)	0.98	0.97	0.93	1.0	0.49	0.46	0.95	0.66	0.29	0.14	0.15
Transcript_contig_60463 (60463)	0.68	0.78	1.0	0.23	0.03	0.18	0.42	0.13	0.0	0.06	0.06
Transcript_contig_60650 (60650)	0.72	0.88	0.65	0.68	0.23	0.44	1.0	0.58	0.18	0.3	0.25
Transcript_contig_60685 (60685)	0.75	0.84	0.89	0.68	0.64	0.64	1.0	0.86	0.07	0.22	0.19
Transcript_contig_61513 (61513)	0.75	0.81	1.0	0.58	0.27	0.4	0.75	0.68	0.09	0.09	0.09
Transcript_contig_61791 (61791)	0.47	0.48	1.0	0.58	0.19	0.22	0.47	0.59	0.01	0.36	0.27
Transcript_contig_61987 (61987)	0.17	0.24	1.0	0.35	0.02	0.09	0.21	0.08	0.0	0.02	0.11
Transcript_contig_62050 (62050)	0.52	0.71	1.0	0.53	0.15	0.43	0.72	0.51	0.01	0.47	0.32
Transcript_contig_62125 (62125)	0.45	0.59	1.0	0.54	0.24	0.21	0.47	0.7	0.51	0.24	0.16
Transcript_contig_62429 (62429)	0.59	0.56	1.0	0.68	0.43	0.33	0.63	0.32	0.05	0.2	0.18
Transcript_contig_62509 (62509)	0.84	0.68	0.75	0.62	0.46	0.44	1.0	0.42	0.39	0.16	0.18
Transcript_contig_63584 (63584)	0.76	0.59	1.0	0.72	0.41	0.35	0.85	0.26	0.04	0.26	0.19
Transcript_contig_6485 (6485)	0.65	1.0	0.81	0.36	0.2	0.47	0.55	0.65	0.35	0.44	0.35
Transcript_contig_66164 (66164)	0.65	0.76	0.92	0.77	0.68	0.51	1.0	0.74	0.04	0.27	0.23
Transcript_contig_6635 (6635)	0.68	0.53	0.23	0.67	0.36	0.44	1.0	0.87	0.0	0.05	0.08
Transcript_contig_67489 (67489)	0.9	1.0	0.67	0.55	0.38	0.56	0.97	0.66	0.35	0.49	0.33
Transcript_contig_67595 (67595)	0.36	0.56	0.88	0.48	0.1	0.1	0.5	1.0	0.0	0.07	0.1
Transcript_contig_67652 (67652)	0.52	0.73	0.95	0.38	0.14	0.2	0.5	1.0	0.02	0.0	0.0
Transcript_contig_68002 (68002)	0.64	0.66	1.0	0.5	0.37	0.56	0.89	0.46	0.13	0.35	0.31
Transcript_contig_69540 (69540)	0.39	0.54	1.0	0.47	0.02	0.13	0.22	0.43	0.21	0.15	0.1
Transcript_contig_69612 (69612)	0.55	0.53	1.0	0.57	0.19	0.18	0.53	0.3	0.07	0.15	0.11
Transcript_contig_70380 (70380)	0.3	0.45	1.0	0.28	0.01	0.1	0.12	0.62	0.0	0.07	0.11
Transcript_contig_7117 (7117)	0.86	0.66	1.0	0.58	0.13	0.32	0.84	0.35	0.0	0.12	0.03
Transcript_contig_78249 (78249)	0.97	0.99	0.63	0.57	0.33	0.41	1.0	0.61	0.4	0.32	0.24
Transcript_contig_78316 (78316)	0.47	0.48	1.0	0.69	0.64	0.39	0.77	0.52	0.41	0.23	0.26
Transcript_contig_78339 (78339)	0.69	0.96	1.0	1.0	0.53	0.41	0.61	0.58	0.29	0.3	0.35
Transcript_contig_78356 (78356)	0.59	0.57	1.0	0.57	0.3	0.39	0.88	0.64	0.9	0.21	0.24
Transcript_contig_78414 (78414)	0.92	1.0	0.67	0.76	0.48	0.5	0.95	0.53	0.21	0.28	0.24
Transcript_contig_78485 (78485)	0.84	0.8	0.71	0.6	0.53	0.49	1.0	0.57	0.08	0.15	0.17
Transcript_contig_78488 (78488)	0.62	0.7	1.0	0.57	0.19	0.36	0.81	0.52	0.23	0.33	0.23
Transcript_contig_78505 (78505)	0.51	0.45	1.0	0.6	0.17	0.42	0.63	0.13	0.15	0.09	0.08
Transcript_contig_78572 (78572)	0.53	0.65	1.0	0.3	0.02	0.35	0.38	0.3	0.08	0.11	0.19
Transcript_contig_78599 (78599)	0.42	0.54	1.0	0.56	0.26	0.34	0.58	0.69	0.17	0.33	0.22
Transcript_contig_78728 (78728)	0.58	0.63	1.0	0.72	0.34	0.35	0.6	0.4	0.06	0.34	0.14
Transcript_contig_78759 (78759)	0.77	0.85	1.0	0.74	0.88	0.39	0.66	0.48	0.23	0.28	0.17
Transcript_contig_78778 (78778)	0.67	0.71	0.52	0.46	0.57	0.45	1.0	0.71	0.68	0.17	0.14
Transcript_contig_78782 (78782)	0.79	0.95	0.78	0.5	0.58	0.56	1.0	0.52	0.29	0.55	0.27
Transcript_contig_78799 (78799)	0.62	0.56	0.74	0.5	0.25	0.51	1.0	0.37	0.35	0.38	0.31
Transcript_contig_78831 (78831)	0.4	0.49	0.31	0.44	0.33	0.36	1.0	0.33	0.09	0.02	0.07
Transcript_contig_79197 (79197)	0.65	0.78	1.0	0.62	0.27	0.33	0.67	0.72	0.13	0.41	0.28
Transcript_contig_79255 (79255)	0.74	0.78	0.88	0.52	0.24	0.35	1.0	0.67	0.09	0.14	0.09
Transcript_contig_79272 (79272)	0.27	0.31	1.0	0.44	0.03	0.11	0.23	0.24	0.17	0.13	0.09
Transcript_contig_79285 (79285)	0.73	0.87	0.41	0.43	0.2	0.32	1.0	0.76	0.05	0.13	0.08
Transcript_contig_79326 (79326)	0.78	0.79	1.0	0.72	0.1	0.42	0.87	0.4	0.03	0.14	0.39
Transcript_contig_79412 (79412)	0.79	0.61	0.68	0.59	0.54	0.49	1.0	0.37	0.09	0.16	0.27
Transcript_contig_79429 (79429)	0.79	0.85	1.0	0.75	0.71	0.46	0.98	0.36	0.06	0.25	0.17
Transcript_contig_79507 (79507)	0.79	0.81	0.98	0.46	0.03	0.28	1.0	0.59	0.95	0.23	0.2
Transcript_contig_79548 (79548)	0.4	0.52	1.0	0.53	0.13	0.25	0.56	0.35	0.15	0.17	0.21
Transcript_contig_7969 (7969)	0.69	0.62	0.61	0.72	0.26	0.27	1.0	0.41	0.0	0.16	0.23
Transcript_contig_7975 (7975)	0.58	0.44	0.33	0.42	0.27	0.39	1.0	0.12	0.08	0.34	0.22
Transcript_contig_79841 (79841)	0.61	0.66	0.59	0.69	0.41	0.37	1.0	0.4	0.02	0.09	0.09
Transcript_contig_80211 (80211)	0.58	0.53	1.0	0.52	0.19	0.47	1.0	0.56	0.49	0.24	0.21
Transcript_contig_80219 (80219)	0.62	1.0	0.99	0.82	0.85	0.45	0.69	0.73	0.05	0.27	0.34
Transcript_contig_80255 (80255)	0.73	0.72	0.55	0.77	0.63	0.43	1.0	0.68	0.0	0.34	0.13
Transcript_contig_80358 (80358)	0.94	1.0	0.5	0.51	0.3	0.45	0.83	0.58	0.14	0.48	0.31
Transcript_contig_81254 (81254)	0.54	0.82	1.0	0.4	0.09	0.23	0.73	0.84	0.0	0.08	0.06
Transcript_contig_82185 (82185)	0.56	0.73	1.0	0.5	0.01	0.22	0.42	0.36	0.08	0.22	0.18
Transcript_contig_82208 (82208)	0.81	0.91	0.61	0.47	0.24	0.26	0.98	1.0	0.12	0.22	0.17
Transcript_contig_82483 (82483)	0.72	0.85	0.61	0.53	0.52	0.57	1.0	0.75	0.33	0.2	0.25
Transcript_contig_83178 (83178)	0.68	0.84	0.67	0.41	0.19	0.25	0.71	1.0	0.24	0.13	0.15
Transcript_contig_83202 (83202)	0.81	1.0	0.72	0.61	0.52	0.37	0.85	0.96	0.46	0.2	0.17
Transcript_contig_8753 (8753)	0.72	0.56	0.48	0.58	0.36	0.55	1.0	0.42	0.07	0.2	0.26
Transcript_contig_89143 (89143)	0.64	0.58	0.93	0.43	0.13	0.45	1.0	0.59	0.54	0.2	0.15
Transcript_contig_89336 (89336)	0.76	0.77	0.68	0.61	0.35	0.39	1.0	0.51	0.25	0.36	0.22
Transcript_contig_89449 (89449)	0.6	0.56	1.0	0.61	0.32	0.47	0.85	0.56	0.68	0.24	0.26
Transcript_contig_89573 (89573)	0.82	0.99	0.96	0.47	0.25	0.53	1.0	0.82	0.32	0.29	0.24
Transcript_contig_89641 (89641)	0.83	0.89	0.86	0.69	0.44	0.52	1.0	0.53	0.35	0.61	0.32
Transcript_contig_89651 (89651)	0.4	0.42	1.0	0.37	0.04	0.25	0.35	0.25	0.03	0.07	0.15
Transcript_contig_89899 (89899)	0.75	0.87	0.89	0.43	0.16	0.5	1.0	0.66	0.24	0.13	0.14
Transcript_contig_90009 (90009)	0.4	0.37	1.0	0.5	0.18	0.5	0.95	0.38	0.04	0.17	0.18
Transcript_contig_90316 (90316)	0.76	0.99	0.48	0.57	0.49	0.66	1.0	0.36	0.68	0.49	0.33
Transcript_contig_90466 (90466)	0.87	1.0	0.79	0.8	0.6	0.44	0.95	0.87	0.21	0.35	0.3
Transcript_contig_90515 (90515)	0.72	1.0	0.62	0.56	0.19	0.29	0.62	0.54	0.0	0.24	0.18
Transcript_contig_959 (959)	0.9	1.0	0.77	0.87	0.8	0.35	0.85	0.37	0.17	0.32	0.25

Details

Expression values normalized per gene (using the maximum value, Green cells indicate low expression and red high. (Dark gray cells indicate missing values)