Heatmap: Cluster_205 (HCCA)

View as: (view raw or zlog-transformed)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are normalized against highest expression of the row)

Gene	CCAP211/11P,High light	CCAP211/11P,Low light	CPCC90,BBM,72h,Autotrophy	CPCC90,BBM,97h,Mixotrophy	CPCC90,BBM,98h,Mixotrophy	CPCC90,BBM,120h,Mixotrophy	CPCC90,BBM,144h,Heterotrophy	NJ-7,20C	NJ-7,4C	UTEX259,20C	UTEX259,4C
Transcript_contig_1020 (1020)	0.83	0.92	0.49	0.62	0.69	0.53	0.85	0.82	0.16	1.0	0.57
Transcript_contig_1156 (1156)	0.7	1.0	0.28	0.44	0.63	0.83	0.48	0.99	0.0	0.41	0.66
Transcript_contig_1441 (1441)	0.7	0.98	0.49	0.23	0.37	0.2	0.38	1.0	0.04	0.43	0.16
Transcript_contig_15378 (15378)	0.83	1.0	0.29	0.16	0.01	0.15	0.47	0.36	0.09	0.53	0.19
Transcript_contig_1725 (1725)	0.59	0.67	0.53	0.41	0.68	0.23	0.21	1.0	0.31	0.35	0.35
Transcript_contig_188 (188)	0.61	1.0	0.14	0.14	0.08	0.23	0.15	0.77	0.03	0.42	0.23
Transcript_contig_2040 (2040)	0.88	1.0	0.18	0.27	0.29	0.38	0.33	0.61	0.25	0.97	0.51
Transcript_contig_2353 (2353)	0.8	1.0	0.15	0.14	0.12	0.12	0.22	0.89	0.12	0.78	0.56
Transcript_contig_2357 (2357)	0.92	1.0	0.44	0.33	0.07	0.47	0.34	0.45	0.79	0.76	0.46
Transcript_contig_2769 (2769)	0.85	1.0	0.24	0.45	0.34	0.44	0.32	0.6	0.01	0.81	0.41
Transcript_contig_3103 (3103)	0.87	1.0	0.24	0.19	0.14	0.25	0.47	0.44	0.02	0.26	0.24
Transcript_contig_3420 (3420)	0.89	1.0	0.28	0.25	0.23	0.2	0.42	0.31	0.04	0.92	0.33
Transcript_contig_4062 (4062)	0.83	1.0	0.45	0.54	0.34	0.79	0.57	0.71	0.01	0.25	0.78
Transcript_contig_55168 (55168)	0.73	0.96	0.55	0.37	0.29	0.15	0.47	1.0	0.07	0.17	0.21
Transcript_contig_55465 (55465)	0.7	1.0	0.3	0.32	0.25	0.3	0.37	0.38	0.09	0.71	0.47
Transcript_contig_55554 (55554)	0.86	1.0	0.64	0.48	0.42	0.35	0.72	1.0	0.2	0.47	0.39
Transcript_contig_55623 (55623)	0.88	1.0	0.18	0.08	0.02	0.48	0.61	0.72	0.54	0.92	0.91
Transcript_contig_55706 (55706)	0.72	0.93	0.09	0.06	0.07	0.62	0.66	0.97	0.17	1.0	0.75
Transcript_contig_5578 (5578)	0.86	0.91	1.0	0.68	0.42	0.79	0.96	0.93	0.16	0.43	0.76
Transcript_contig_55840 (55840)	0.82	0.99	0.5	0.66	0.51	0.36	0.65	1.0	0.03	0.3	0.32
Transcript_contig_55924 (55924)	0.85	1.0	0.38	0.27	0.18	0.4	0.29	0.69	0.52	0.93	0.76
Transcript_contig_56087 (56087)	0.93	1.0	0.72	0.52	0.37	0.37	0.36	0.69	0.22	0.26	0.44
Transcript_contig_56331 (56331)	0.97	1.0	0.14	0.19	0.23	0.28	0.27	0.47	0.19	0.83	0.47
Transcript_contig_56360 (56360)	0.89	0.85	1.0	0.37	0.04	0.33	0.69	0.81	0.38	0.5	0.45
Transcript_contig_56726 (56726)	0.81	0.99	0.25	0.24	0.19	0.62	0.56	0.59	0.33	1.0	0.69
Transcript_contig_57126 (57126)	0.55	0.83	0.26	0.1	0.07	0.79	0.78	1.0	0.29	0.72	0.71
Transcript_contig_57731 (57731)	1.0	0.95	0.36	0.3	0.16	0.25	0.55	0.46	0.02	0.27	0.27
Transcript_contig_57745 (57745)	0.91	1.0	0.45	0.49	0.54	0.31	0.46	0.69	0.23	0.68	0.53
Transcript_contig_57836 (57836)	0.8	1.0	0.32	0.34	0.3	0.49	0.49	0.64	0.26	0.92	0.51
Transcript_contig_58317 (58317)	0.74	1.0	0.56	0.67	0.63	0.62	0.64	0.75	0.37	0.71	0.55
Transcript_contig_58425 (58425)	0.81	1.0	0.35	0.35	0.44	0.52	0.22	0.76	0.11	0.99	0.61
Transcript_contig_58548 (58548)	0.88	1.0	0.65	0.39	0.2	0.34	0.74	0.66	0.17	0.7	0.45
Transcript_contig_58677 (58677)	0.57	0.72	0.1	0.24	0.12	0.39	0.17	0.58	0.17	1.0	0.52
Transcript_contig_58816 (58816)	0.55	0.73	0.64	0.66	0.54	0.6	0.35	0.77	0.36	1.0	0.72
Transcript_contig_58886 (58886)	0.63	0.87	0.65	0.51	0.48	0.36	0.66	0.42	0.23	1.0	0.42
Transcript_contig_58963 (58963)	0.79	0.86	0.79	0.9	1.0	0.62	0.66	0.93	0.22	0.85	0.53
Transcript_contig_5901 (5901)	0.76	1.0	0.34	0.31	0.53	0.31	0.28	0.76	0.02	0.23	0.5
Transcript_contig_59016 (59016)	0.57	0.71	0.18	0.3	0.28	0.37	0.31	1.0	0.06	0.47	0.39
Transcript_contig_59246 (59246)	0.68	0.93	0.58	0.61	0.53	0.58	0.65	1.0	0.01	0.73	0.69
Transcript_contig_59392 (59392)	0.41	0.8	0.12	0.26	0.29	0.16	0.19	1.0	0.01	0.06	0.23
Transcript_contig_59520 (59520)	0.9	1.0	0.72	0.46	0.18	0.38	0.47	0.68	0.43	0.5	0.52
Transcript_contig_59721 (59721)	0.96	1.0	0.44	0.31	0.23	0.28	0.28	0.64	0.47	0.54	0.45
Transcript_contig_59841 (59841)	0.66	0.98	0.66	0.78	0.62	0.87	0.41	0.64	0.31	0.8	1.0
Transcript_contig_60074 (60074)	0.73	0.93	0.44	0.4	0.36	0.45	0.6	1.0	0.0	0.25	0.29
Transcript_contig_60171 (60171)	0.91	1.0	0.06	0.3	0.57	0.75	0.52	0.72	0.04	0.89	0.56
Transcript_contig_60295 (60295)	0.67	0.82	0.29	0.39	0.34	0.23	0.38	1.0	0.47	0.75	0.5
Transcript_contig_60303 (60303)	1.0	0.97	0.49	0.43	0.89	0.5	0.4	0.54	0.18	0.87	0.84
Transcript_contig_60368 (60368)	0.77	1.0	0.68	0.55	0.43	0.79	0.71	0.69	0.18	0.45	0.82
Transcript_contig_60636 (60636)	0.51	0.7	0.25	0.18	0.07	0.44	0.33	1.0	0.16	0.83	0.36
Transcript_contig_60867 (60867)	0.82	1.0	0.32	0.66	0.48	0.63	0.78	0.51	0.05	0.94	0.45
Transcript_contig_61902 (61902)	0.59	0.97	0.03	0.04	0.02	0.14	0.0	1.0	0.0	0.1	0.15
Transcript_contig_62082 (62082)	0.77	0.88	0.72	0.96	0.83	0.59	1.0	0.4	0.07	0.55	0.47
Transcript_contig_63768 (63768)	0.76	0.8	0.27	0.19	0.24	0.17	0.22	0.41	0.38	1.0	0.68
Transcript_contig_68953 (68953)	0.64	0.9	0.02	0.04	0.02	0.56	0.4	0.43	0.02	1.0	0.28
Transcript_contig_69170 (69170)	0.68	1.0	0.17	0.19	0.2	0.08	0.17	0.54	0.11	0.2	0.12
Transcript_contig_69197 (69197)	0.6	1.0	0.06	0.19	0.37	0.94	0.43	0.99	0.05	0.56	0.69
Transcript_contig_69202 (69202)	0.63	0.92	0.43	0.41	0.36	0.63	0.33	1.0	0.04	0.62	0.45
Transcript_contig_69553 (69553)	0.27	0.73	0.11	0.56	0.21	0.81	0.48	0.22	0.0	1.0	0.44
Transcript_contig_69597 (69597)	0.54	0.76	0.29	0.25	0.09	0.18	0.05	0.07	0.1	1.0	0.62
Transcript_contig_69714 (69714)	0.95	1.0	0.0	0.0	0.0	0.32	0.11	0.41	0.0	0.59	0.1
Transcript_contig_70367 (70367)	0.74	0.97	0.23	0.33	0.32	0.73	0.62	0.68	1.0	0.43	0.42
Transcript_contig_78158 (78158)	0.66	0.69	0.39	0.41	0.46	0.52	0.36	0.8	0.33	1.0	0.6
Transcript_contig_78580 (78580)	0.85	1.0	0.82	0.57	0.45	0.43	0.7	0.65	0.97	0.56	0.4
Transcript_contig_78598 (78598)	0.88	0.95	0.73	0.82	0.62	0.59	0.81	1.0	0.31	0.49	0.79
Transcript_contig_78686 (78686)	0.74	0.9	0.93	1.0	0.95	0.55	0.56	0.83	0.31	0.87	0.48
Transcript_contig_78919 (78919)	0.64	1.0	0.32	0.32	0.18	0.16	0.28	0.49	0.0	0.63	0.39
Transcript_contig_78962 (78962)	0.63	1.0	0.41	0.39	0.37	0.42	0.47	0.59	0.9	0.98	0.34
Transcript_contig_79111 (79111)	0.83	0.85	0.15	0.22	0.18	0.04	0.11	1.0	0.0	0.35	0.32
Transcript_contig_79133 (79133)	0.4	0.64	0.25	0.23	0.11	0.36	0.28	1.0	0.0	0.11	0.39
Transcript_contig_79151 (79151)	0.73	1.0	0.5	0.31	0.29	0.16	0.38	0.78	0.09	0.46	0.17
Transcript_contig_79411 (79411)	0.78	1.0	0.24	0.2	0.19	0.42	0.34	0.79	0.14	0.59	0.35
Transcript_contig_79991 (79991)	0.42	0.59	0.28	0.38	0.34	0.85	0.42	0.51	0.09	1.0	0.87
Transcript_contig_83316 (83316)	0.67	0.71	0.62	0.72	0.32	0.76	0.51	0.57	0.75	1.0	0.26
Transcript_contig_89502 (89502)	0.65	0.85	0.59	0.34	0.01	0.31	0.3	1.0	0.0	0.32	0.32
Transcript_contig_89612 (89612)	0.83	1.0	0.63	0.78	0.65	0.57	0.51	0.85	0.02	0.77	0.44
Transcript_contig_89810 (89810)	0.8	1.0	0.48	0.37	0.5	0.2	0.4	0.94	0.4	0.35	0.21
Transcript_contig_90110 (90110)	0.79	1.0	0.3	0.45	0.6	0.47	0.53	0.99	0.25	0.31	0.4

Details

Expression values normalized per gene (using the maximum value, Green cells indicate low expression and red high. (Dark gray cells indicate missing values)