Heatmap: Cluster_204 (HCCA)

View as: (view raw or zlog-transformed)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are normalized against highest expression of the row)

Gene	Light - ZT1	Light - ZT3	Light - ZT5	Light - ZT7	Light - ZT9	Light - ZT11	Light - ZT13	Light - ZT15	Dark - ZT17	Dark - ZT19	Dark - ZT21	Dark - ZT23	Light - ZT25	Nutrient stress - Low nitrogen - 10%	Nutrient stress - Low phosphate - 0%	Nutrient stress - Low sulfate - 2%	Nutrient stress - Low micronutrients - 0%	Nutrient stress - NaCl - 75 mM	Nutrient stress - Mannitol - 100 mM	Nutrient stress - Control	Environmental stress - Prolonged darkness - 72h	Environmental stress - Cold - 4C	Environmental stress - Heat - 37C	Environmental stress - Control	Environmental stress - High light - 150 uE	Environmental stress - Control high light - 40 uE
Cpa\|evm.model.tig00000113.93 (tig00000113_g5675.t1)	0.73	0.46	0.55	0.73	0.7	0.72	0.95	1.0	0.79	0.81	0.84	0.84	0.85	0.88	0.4	0.69	0.52	0.79	0.52	0.48	0.11	0.48	0.32	0.35	0.91	0.72
Cpa\|evm.model.tig00000157.48 (tig00000157_g9638.t2)	0.79	0.68	0.6	0.5	0.36	0.42	0.75	0.79	0.75	1.0	0.89	0.8	0.63	0.85	0.66	0.61	0.52	0.81	0.74	0.73	0.0	0.29	0.37	0.3	0.62	0.62
Cpa\|evm.model.tig00000204.91 (tig00000204_g17756.t1)	1.0	0.65	0.49	0.45	0.55	0.71	0.96	0.99	0.91	0.83	0.69	0.53	0.91	0.6	0.48	0.41	0.58	0.44	0.54	0.53	0.07	0.16	0.25	0.32	0.42	0.38
Cpa\|evm.model.tig00000248.50 (tig00000248_g21812.t1)	0.59	0.59	0.62	0.88	0.88	0.73	0.77	0.83	0.78	0.81	1.0	0.96	0.57	0.74	0.48	0.67	0.51	0.6	0.59	0.57	0.01	0.12	0.58	0.63	0.59	0.62
Cpa\|evm.model.tig00000317.7 (tig00000317_g24015.t1)	0.77	0.68	0.72	0.84	0.82	0.89	0.98	0.93	1.0	0.96	0.85	0.79	0.86	0.8	0.63	0.74	0.61	0.7	0.59	0.56	0.08	0.55	0.44	0.42	0.81	0.58
Cpa\|evm.model.tig00000451.19 (tig00000451_g976.t1)	0.7	0.45	0.52	0.52	0.73	0.72	0.95	0.91	0.87	0.76	0.86	1.0	0.91	0.77	0.58	0.7	0.69	0.85	0.79	0.8	0.13	0.12	0.56	0.44	0.78	0.65
Cpa\|evm.model.tig00000553.24 (tig00000553_g2095.t1)	0.67	0.65	0.56	0.54	0.57	0.79	1.0	0.84	0.84	0.68	0.6	0.54	0.76	0.35	0.32	0.41	0.38	0.57	0.49	0.52	0.04	0.3	0.53	0.47	0.38	0.53
Cpa\|evm.model.tig00000632.2 (tig00000632_g2737.t1)	0.79	0.72	0.61	0.46	0.51	0.47	0.76	0.7	0.72	0.8	0.84	0.95	1.0	0.56	0.5	0.49	0.37	0.65	0.44	0.53	0.08	0.19	0.42	0.65	0.53	0.49
Cpa\|evm.model.tig00000632.7 (tig00000632_g2742.t1)	0.58	0.6	0.8	0.89	0.83	0.75	0.96	1.0	0.54	0.56	0.44	0.29	0.35	0.83	0.44	0.68	0.67	0.5	0.55	0.64	0.01	0.27	0.02	0.03	0.55	0.43
Cpa\|evm.model.tig00000741.16 (tig00000741_g3831.t1)	1.0	0.77	0.57	0.58	0.21	0.4	0.59	0.83	0.71	0.69	0.7	0.74	0.94	0.6	0.29	0.55	0.31	0.55	0.35	0.44	0.03	0.21	0.21	0.4	0.7	0.63
Cpa\|evm.model.tig00000882.13 (tig00000882_g5258.t1)	0.71	0.56	0.55	0.62	0.63	0.64	1.0	0.99	0.84	0.82	0.92	0.91	0.8	0.75	0.72	0.74	0.51	0.75	0.75	0.49	0.11	0.3	0.68	0.81	0.94	0.78
Cpa\|evm.model.tig00001085.17 (tig00001085_g6957.t1)	0.85	0.75	0.83	0.71	0.6	0.42	0.61	0.75	0.59	0.59	0.6	0.65	1.0	0.31	0.35	0.32	0.31	0.49	0.45	0.41	0.06	0.24	0.27	0.4	0.5	0.69
Cpa\|evm.model.tig00001154.13 (tig00001154_g7276.t1)	0.92	0.65	0.71	0.62	0.54	0.5	0.77	0.87	0.76	0.83	0.86	0.96	1.0	0.79	0.78	0.8	0.79	0.66	0.65	0.68	0.16	0.29	0.35	0.4	0.39	0.44
Cpa\|evm.model.tig00001164.8 (tig00001164_g7398.t1)	0.64	0.49	0.55	0.59	0.58	0.45	0.67	0.7	0.58	0.71	0.71	0.83	0.75	0.59	0.4	0.5	0.56	1.0	0.73	0.67	0.07	0.9	0.35	0.36	0.78	0.9
Cpa\|evm.model.tig00001302.3 (tig00001302_g8087.t1)	0.76	0.54	0.6	0.6	0.79	0.85	1.0	0.94	0.7	0.69	0.52	0.42	0.61	0.73	0.6	0.79	0.57	0.6	0.64	0.66	0.07	0.26	0.4	0.21	0.43	0.41
Cpa\|evm.model.tig00001339.19 (tig00001339_g8274.t1)	0.88	0.62	0.74	0.77	0.9	0.71	0.98	0.87	0.93	1.0	0.91	0.89	0.8	0.87	0.69	0.82	0.68	0.66	0.7	0.7	0.07	0.17	0.47	0.41	0.5	0.55
Cpa\|evm.model.tig00001388.1 (tig00001388_g8571.t1)	0.54	0.39	0.45	0.63	0.69	0.62	1.0	0.81	0.62	0.72	0.79	0.76	0.67	0.66	0.48	0.6	0.53	0.73	0.5	0.6	0.2	0.58	0.68	0.63	0.83	0.69
Cpa\|evm.model.tig00001487.12 (tig00001487_g8941.t1)	1.0	0.87	0.68	0.56	0.43	0.46	0.73	0.84	0.88	0.95	0.99	0.87	0.88	0.58	0.51	0.78	0.52	0.79	0.83	0.49	0.01	0.14	0.51	0.49	0.25	0.34
Cpa\|evm.model.tig00020510.92 (tig00020510_g9874.t1)	0.73	0.72	0.67	0.69	0.87	1.0	0.9	0.92	0.95	0.71	0.78	0.77	0.58	0.49	0.5	0.63	0.52	0.63	0.66	0.68	0.09	0.31	0.51	0.73	0.35	0.54
Cpa\|evm.model.tig00020553.58 (tig00020553_g10548.t1)	0.15	0.47	0.82	0.92	0.88	0.83	1.0	0.95	0.87	0.71	0.44	0.31	0.17	0.85	0.51	0.92	0.73	0.66	0.57	0.71	0.0	0.23	0.06	0.07	0.48	0.31
Cpa\|evm.model.tig00020556.52 (tig00020556_g11023.t1)	0.98	0.61	0.61	0.62	0.66	0.59	0.78	0.8	0.8	0.91	0.89	0.99	0.97	0.77	0.57	0.64	0.82	0.95	0.82	0.91	0.03	0.53	0.39	0.58	1.0	0.87
Cpa\|evm.model.tig00020556.82 (tig00020556_g11048.t1)	0.8	0.59	0.48	0.62	0.8	0.85	0.83	0.86	0.99	0.8	0.92	0.79	0.68	0.63	0.66	0.57	0.52	0.73	0.62	0.48	0.03	0.21	0.78	1.0	0.8	0.59
Cpa\|evm.model.tig00020562.26 (tig00020562_g11152.t1)	0.78	0.83	0.68	0.7	0.68	0.75	0.79	0.8	0.84	0.94	1.0	0.82	0.77	0.76	0.64	0.88	0.51	0.85	0.74	0.5	0.27	0.33	0.76	0.45	0.39	0.49
Cpa\|evm.model.tig00020563.140 (tig00020563_g11344.t1)	0.54	0.77	0.91	0.92	0.91	0.62	0.7	0.78	0.87	0.88	0.94	1.0	0.51	0.95	0.85	0.87	0.75	0.81	0.93	0.6	0.16	0.41	0.66	0.7	0.86	0.63
Cpa\|evm.model.tig00020563.84 (tig00020563_g11268.t1)	0.87	0.62	0.68	0.72	0.9	0.93	0.92	0.89	0.8	0.75	0.78	0.81	1.0	0.79	0.52	0.72	0.53	0.59	0.43	0.59	0.08	0.72	0.49	0.54	0.75	0.72
Cpa\|evm.model.tig00020610.16 (tig00020610_g11954.t1)	0.26	0.64	0.68	0.72	0.91	1.0	0.89	0.78	0.77	0.66	0.49	0.44	0.3	0.38	0.46	0.51	0.5	0.53	0.57	0.56	0.07	0.37	0.58	0.38	0.41	0.33
Cpa\|evm.model.tig00020629.91 (tig00020629_g12412.t1)	0.43	0.25	0.21	0.27	0.43	0.62	0.83	0.88	1.0	0.54	0.5	0.37	0.26	0.09	0.08	0.06	0.16	0.3	0.32	0.27	0.02	0.13	0.28	0.4	0.48	0.14
Cpa\|evm.model.tig00020693.36 (tig00020693_g13047.t1)	0.5	0.56	0.55	0.65	0.71	0.67	0.69	0.76	0.8	0.83	1.0	0.81	0.41	0.58	0.61	0.57	0.62	0.74	0.63	0.6	0.03	0.17	0.44	0.51	0.68	0.53
Cpa\|evm.model.tig00020703.7 (tig00020703_g13109.t1)	0.96	0.8	0.74	0.78	0.67	0.42	0.79	0.82	0.65	0.77	0.8	0.72	1.0	0.59	0.63	0.63	0.63	0.87	0.77	0.78	0.23	0.23	0.48	0.42	0.54	0.5
Cpa\|evm.model.tig00020710.26 (tig00020710_g13258.t1)	0.79	0.44	0.4	0.39	0.68	0.83	0.86	0.83	0.91	0.8	0.7	0.67	0.72	0.24	0.35	0.25	0.48	0.68	0.58	0.56	0.02	0.27	0.28	1.0	0.49	0.45
Cpa\|evm.model.tig00020875.15 (tig00020875_g14892.t1)	0.97	0.89	0.76	0.7	0.61	0.55	0.76	0.9	0.85	0.93	0.97	0.95	1.0	1.0	0.47	0.56	0.46	0.71	0.59	0.52	0.1	0.53	0.38	0.64	0.71	0.85
Cpa\|evm.model.tig00020902.46 (tig00020902_g14998.t1)	0.71	0.55	0.62	0.67	0.62	0.41	0.66	0.64	0.61	0.74	0.73	1.0	0.68	0.63	0.51	0.62	0.34	0.6	0.51	0.51	0.04	0.02	0.43	0.39	0.47	0.62
Cpa\|evm.model.tig00020904.88 (tig00020904_g15216.t1)	0.62	0.46	0.49	0.54	0.7	0.94	1.0	0.91	0.91	0.67	0.76	0.66	0.65	0.26	0.31	0.29	0.55	0.5	0.4	0.57	0.03	0.07	0.45	0.66	0.62	0.5
Cpa\|evm.model.tig00021017.7 (tig00021017_g17181.t1)	0.74	0.69	0.77	0.81	0.74	0.64	0.77	0.77	0.63	0.87	0.82	0.8	0.97	0.68	0.45	0.69	1.0	0.71	0.53	0.56	0.12	0.46	0.48	0.5	0.9	0.91
Cpa\|evm.model.tig00021036.119 (tig00021036_g17404.t1)	0.76	0.54	0.57	0.73	0.69	0.71	0.82	0.95	0.95	1.0	0.7	0.81	0.93	0.58	0.46	0.78	0.6	0.75	0.67	0.51	0.02	0.22	0.31	0.37	0.55	0.58
Cpa\|evm.model.tig00021127.5 (tig00021127_g18681.t1)	0.89	0.61	0.59	0.73	0.76	0.68	0.95	1.0	0.87	0.84	0.8	0.59	0.75	0.57	0.45	0.32	0.52	0.68	0.64	0.63	0.21	0.11	0.35	0.43	0.48	0.47
Cpa\|evm.model.tig00021135.27 (tig00021135_g18949.t1)	0.68	0.76	0.85	0.92	0.86	0.85	1.0	0.97	0.96	0.81	0.82	0.81	0.92	0.8	0.44	0.77	0.49	0.62	0.43	0.58	0.03	0.62	0.27	0.39	0.53	0.48
Cpa\|evm.model.tig00021221.12 (tig00021221_g19354.t1)	0.71	0.64	0.63	0.78	0.85	0.75	0.89	0.91	0.93	1.0	0.96	0.91	0.71	0.76	0.68	0.74	0.59	0.77	0.73	0.65	0.06	0.42	0.4	0.91	0.94	0.66
Cpa\|evm.model.tig00021221.7 (tig00021221_g19348.t1)	0.96	0.61	0.55	0.58	0.79	0.85	1.0	0.97	0.98	0.86	0.86	0.68	0.93	0.83	0.56	0.67	0.55	0.72	0.72	0.71	0.04	0.36	0.53	0.54	0.68	0.56
Cpa\|evm.model.tig00021351.17 (tig00021351_g20671.t1)	0.72	0.4	0.42	0.56	0.81	1.0	0.96	0.93	0.63	0.69	0.68	0.59	0.71	0.27	0.22	0.21	0.36	0.38	0.37	0.33	0.05	0.52	0.17	0.54	0.59	0.33
Cpa\|evm.model.tig00021582.18 (tig00021582_g22615.t1)	0.71	0.46	0.51	0.71	0.86	0.7	0.83	0.88	0.98	1.0	0.94	1.0	0.69	0.91	0.64	0.72	0.43	0.51	0.52	0.46	0.06	0.46	0.61	0.83	0.6	0.73
Cpa\|evm.model.tig00021623.12 (tig00021623_g23012.t1)	0.84	0.62	0.67	0.67	0.49	0.41	0.63	0.79	0.67	0.7	0.7	0.57	1.0	0.42	0.36	0.32	0.45	0.43	0.5	0.52	0.0	0.04	0.13	0.2	0.53	0.42
Cpa\|evm.model.tig00021742.21 (tig00021742_g23333.t1)	0.64	0.67	0.51	0.55	0.84	0.78	1.0	0.77	0.83	0.75	0.76	0.65	0.47	0.45	0.51	0.49	0.57	0.67	0.56	0.79	0.02	0.21	0.41	0.37	0.31	0.51
Cpa\|evm.model.tig00022075.14 (tig00022075_g23577.t1)	0.62	0.78	0.54	0.73	0.93	0.87	0.99	0.87	1.0	0.81	0.68	0.55	0.41	0.55	0.56	0.53	0.5	0.6	0.69	0.7	0.03	0.39	0.66	0.38	0.43	0.53

Details

Expression values normalized per gene (using the maximum value, Green cells indicate low expression and red high. (Dark gray cells indicate missing values)