Heatmap: Cluster_66 (HCCA)

View as: (view raw or zlog-transformed)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are normalized against highest expression of the row)

Gene	CCAP211/11P,High light	CCAP211/11P,Low light	CPCC90,BBM,72h,Autotrophy	CPCC90,BBM,97h,Mixotrophy	CPCC90,BBM,98h,Mixotrophy	CPCC90,BBM,120h,Mixotrophy	CPCC90,BBM,144h,Heterotrophy	NJ-7,20C	NJ-7,4C	UTEX259,20C	UTEX259,4C
Transcript_contig_12112 (12112)	0.19	0.03	0.5	0.06	0.0	0.55	1.0	0.0	0.0	0.14	0.23
Transcript_contig_13616 (13616)	0.04	0.01	0.31	0.11	0.04	0.66	1.0	0.02	0.0	0.28	0.1
Transcript_contig_13764 (13764)	0.11	0.17	0.23	0.09	0.16	0.93	1.0	0.35	0.12	0.69	0.64
Transcript_contig_14930 (14930)	0.05	0.01	0.07	0.19	0.24	0.62	1.0	0.0	0.22	0.53	0.49
Transcript_contig_16812 (16812)	0.08	0.0	0.14	0.16	0.16	0.73	1.0	0.0	0.02	0.52	0.29
Transcript_contig_1814 (1814)	0.02	0.01	0.38	0.08	0.1	0.8	1.0	0.0	0.03	0.69	0.33
Transcript_contig_19760 (19760)	0.06	0.01	0.0	0.01	0.0	0.41	1.0	0.03	0.0	0.49	0.3
Transcript_contig_2114 (2114)	0.05	0.01	0.29	0.18	0.12	0.56	1.0	0.03	0.13	0.4	0.41
Transcript_contig_22287 (22287)	0.08	0.03	0.19	0.28	0.17	0.91	1.0	0.0	0.23	0.45	0.47
Transcript_contig_22353 (22353)	0.08	0.01	0.25	0.14	0.08	0.85	1.0	0.01	0.05	0.47	0.42
Transcript_contig_2236 (2236)	0.24	0.22	0.25	0.21	0.17	0.62	1.0	0.25	0.03	0.09	0.23
Transcript_contig_2422 (2422)	0.18	0.19	0.31	0.19	0.27	0.59	1.0	0.18	0.35	0.17	0.19
Transcript_contig_253 (253)	0.05	0.0	0.0	0.0	0.0	0.95	1.0	0.0	0.0	0.61	0.5
Transcript_contig_28036 (28036)	0.08	0.03	0.0	0.0	0.0	0.34	0.53	0.0	0.23	1.0	0.46
Transcript_contig_3130 (3130)	0.04	0.01	0.22	0.12	0.16	0.65	1.0	0.03	0.23	0.34	0.27
Transcript_contig_4163 (4163)	0.02	0.07	0.26	0.08	0.11	0.67	1.0	0.09	0.03	0.48	0.42
Transcript_contig_4214 (4214)	0.07	0.03	0.38	0.26	0.23	0.55	1.0	0.05	0.01	0.06	0.09
Transcript_contig_4921 (4921)	0.11	0.09	0.47	0.27	0.19	0.58	1.0	0.22	0.0	0.37	0.37
Transcript_contig_53909 (53909)	0.05	0.02	0.25	0.18	0.11	0.71	1.0	0.04	0.22	0.31	0.22
Transcript_contig_53927 (53927)	0.05	0.06	0.4	0.24	0.25	0.67	1.0	0.13	0.19	0.27	0.34
Transcript_contig_54339 (54339)	0.05	0.05	0.17	0.11	0.09	0.85	1.0	0.08	0.15	0.41	0.38
Transcript_contig_54602 (54602)	0.16	0.14	0.34	0.31	0.29	0.59	1.0	0.18	0.41	0.32	0.27
Transcript_contig_54883 (54883)	0.03	0.01	0.43	0.2	0.12	0.79	1.0	0.02	0.15	0.37	0.46
Transcript_contig_54944 (54944)	0.02	0.01	0.28	0.18	0.19	0.63	1.0	0.01	0.06	0.45	0.37
Transcript_contig_54956 (54956)	0.06	0.05	0.36	0.2	0.26	0.48	1.0	0.08	0.23	0.23	0.26
Transcript_contig_55189 (55189)	0.18	0.21	0.28	0.24	0.23	0.92	1.0	0.3	0.54	0.53	0.54
Transcript_contig_55280 (55280)	0.12	0.07	0.28	0.23	0.21	0.91	1.0	0.08	0.79	0.72	0.64
Transcript_contig_55423 (55423)	0.01	0.04	0.18	0.17	0.26	0.55	1.0	0.04	0.06	0.18	0.31
Transcript_contig_55624 (55624)	0.17	0.31	0.29	0.29	0.23	0.7	1.0	0.24	0.21	0.12	0.19
Transcript_contig_55650 (55650)	0.09	0.03	0.33	0.16	0.19	0.67	1.0	0.1	0.16	0.36	0.56
Transcript_contig_55680 (55680)	0.06	0.07	0.43	0.24	0.16	0.72	1.0	0.1	0.17	0.39	0.59
Transcript_contig_55949 (55949)	0.05	0.03	0.33	0.19	0.15	0.8	1.0	0.07	0.16	0.67	0.44
Transcript_contig_55955 (55955)	0.15	0.16	0.37	0.24	0.17	0.71	1.0	0.1	0.38	0.44	0.37
Transcript_contig_56125 (56125)	0.05	0.01	0.43	0.3	0.21	0.62	1.0	0.03	0.23	0.46	0.36
Transcript_contig_56166 (56166)	0.02	0.01	0.23	0.26	0.02	0.52	1.0	0.09	0.26	0.3	0.39
Transcript_contig_56322 (56322)	0.2	0.14	0.18	0.21	0.22	0.69	0.78	0.07	0.02	1.0	0.55
Transcript_contig_56336 (56336)	0.01	0.02	0.35	0.21	0.14	0.53	1.0	0.03	0.06	0.18	0.18
Transcript_contig_56355 (56355)	0.26	0.33	0.25	0.24	0.19	0.66	1.0	0.18	0.25	0.4	0.45
Transcript_contig_56456 (56456)	0.03	0.02	0.13	0.09	0.08	0.71	1.0	0.04	0.09	0.17	0.2
Transcript_contig_56561 (56561)	0.08	0.03	0.38	0.29	0.15	0.68	1.0	0.04	0.14	0.22	0.34
Transcript_contig_56768 (56768)	0.05	0.02	0.42	0.24	0.19	0.61	1.0	0.04	0.47	0.41	0.35
Transcript_contig_56855 (56855)	0.12	0.12	0.26	0.19	0.34	0.62	1.0	0.19	0.45	0.44	0.4
Transcript_contig_57053 (57053)	0.16	0.09	0.39	0.22	0.24	0.81	1.0	0.11	0.88	0.6	0.4
Transcript_contig_57065 (57065)	0.08	0.12	0.24	0.23	0.14	0.62	1.0	0.15	0.29	0.5	0.44
Transcript_contig_57075 (57075)	0.02	0.02	0.25	0.16	0.14	0.74	1.0	0.04	0.08	0.46	0.31
Transcript_contig_57218 (57218)	0.03	0.02	0.41	0.24	0.14	0.59	1.0	0.04	0.01	0.26	0.41
Transcript_contig_57292 (57292)	0.11	0.01	0.17	0.08	0.03	0.62	1.0	0.0	0.24	0.29	0.3
Transcript_contig_57362 (57362)	0.06	0.1	0.42	0.23	0.17	0.81	1.0	0.06	0.2	0.48	0.47
Transcript_contig_57425 (57425)	0.12	0.03	0.48	0.24	0.36	0.45	1.0	0.0	0.3	0.37	0.3
Transcript_contig_57450 (57450)	0.08	0.04	0.37	0.26	0.2	0.68	1.0	0.04	0.06	0.19	0.24
Transcript_contig_57626 (57626)	0.06	0.06	0.29	0.2	0.13	0.65	1.0	0.11	0.25	0.42	0.24
Transcript_contig_57644 (57644)	0.07	0.09	0.44	0.26	0.13	0.55	1.0	0.09	0.12	0.27	0.25
Transcript_contig_57684 (57684)	0.02	0.03	0.35	0.21	0.33	0.52	1.0	0.07	0.07	0.19	0.22
Transcript_contig_57746 (57746)	0.11	0.23	0.26	0.17	0.13	0.47	1.0	0.22	0.34	0.32	0.36
Transcript_contig_57765 (57765)	0.12	0.03	0.31	0.27	0.08	0.68	1.0	0.02	0.12	0.35	0.28
Transcript_contig_57772 (57772)	0.07	0.11	0.2	0.21	0.22	0.56	1.0	0.15	0.52	0.49	0.37
Transcript_contig_57783 (57783)	0.02	0.01	0.35	0.22	0.12	0.6	1.0	0.01	0.16	0.28	0.21
Transcript_contig_57805 (57805)	0.03	0.03	0.3	0.17	0.12	0.78	1.0	0.03	0.19	0.46	0.42
Transcript_contig_57835 (57835)	0.01	0.0	0.36	0.3	0.16	0.68	1.0	0.0	0.06	0.3	0.32
Transcript_contig_57926 (57926)	0.04	0.03	0.35	0.08	0.23	0.8	1.0	0.0	0.02	0.47	0.92
Transcript_contig_58005 (58005)	0.1	0.09	0.17	0.12	0.11	1.0	0.97	0.14	0.41	0.76	0.35
Transcript_contig_58028 (58028)	0.02	0.02	0.21	0.12	0.32	0.65	1.0	0.06	0.12	0.17	0.23
Transcript_contig_58181 (58181)	0.05	0.04	0.36	0.15	0.22	0.66	1.0	0.07	0.62	0.46	0.35
Transcript_contig_58185 (58185)	0.04	0.06	0.37	0.16	0.34	0.82	1.0	0.08	0.04	0.89	0.67
Transcript_contig_58400 (58400)	0.26	0.29	0.36	0.26	0.2	0.48	1.0	0.06	0.06	0.34	0.34
Transcript_contig_58416 (58416)	0.11	0.07	0.3	0.22	0.2	1.0	0.93	0.07	0.41	0.56	0.47
Transcript_contig_58574 (58574)	0.14	0.36	0.23	0.32	0.2	0.64	1.0	0.37	0.32	0.33	0.34
Transcript_contig_58628 (58628)	0.17	0.11	0.47	0.25	0.15	0.74	1.0	0.13	0.67	0.55	0.52
Transcript_contig_58632 (58632)	0.03	0.02	0.46	0.11	0.3	0.61	1.0	0.0	0.06	0.19	0.26
Transcript_contig_58835 (58835)	0.07	0.04	0.37	0.19	0.12	0.79	1.0	0.04	0.38	0.43	0.48
Transcript_contig_59265 (59265)	0.08	0.08	0.34	0.14	0.15	0.68	1.0	0.07	0.21	0.37	0.4
Transcript_contig_59594 (59594)	0.07	0.13	0.27	0.24	0.13	0.75	1.0	0.17	0.06	0.41	0.33
Transcript_contig_59726 (59726)	0.01	0.02	0.47	0.22	0.18	0.65	1.0	0.03	0.05	0.18	0.28
Transcript_contig_59744 (59744)	0.04	0.07	0.22	0.17	0.17	0.58	1.0	0.13	0.06	0.27	0.28
Transcript_contig_60121 (60121)	0.19	0.06	0.37	0.21	0.14	0.72	1.0	0.09	0.39	0.65	0.57
Transcript_contig_60263 (60263)	0.22	0.17	0.3	0.23	0.17	0.63	0.67	0.16	0.42	1.0	0.79
Transcript_contig_60279 (60279)	0.06	0.09	0.26	0.22	0.16	0.72	1.0	0.06	0.15	0.22	0.23
Transcript_contig_60407 (60407)	0.06	0.03	0.46	0.35	0.26	0.65	1.0	0.0	0.0	0.34	0.4
Transcript_contig_60588 (60588)	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.36	1.0	0.0	0.0	0.0	0.33
Transcript_contig_60716 (60716)	0.03	0.04	0.42	0.21	0.46	0.39	1.0	0.0	0.15	0.2	0.28
Transcript_contig_61126 (61126)	0.06	0.01	0.23	0.13	0.08	0.75	1.0	0.0	0.1	0.62	0.5
Transcript_contig_61173 (61173)	0.06	0.02	0.26	0.11	0.12	0.72	1.0	0.0	0.17	0.43	0.74
Transcript_contig_61524 (61524)	0.02	0.03	0.44	0.22	0.11	0.7	1.0	0.05	0.08	0.23	0.36
Transcript_contig_61571 (61571)	0.02	0.0	0.29	0.16	0.18	0.85	1.0	0.01	0.32	0.61	0.54
Transcript_contig_61581 (61581)	0.06	0.02	0.28	0.23	0.43	0.6	1.0	0.06	0.3	0.53	0.76
Transcript_contig_61679 (61679)	0.03	0.0	0.15	0.48	0.24	0.35	1.0	0.0	0.07	0.53	0.22
Transcript_contig_61823 (61823)	0.09	0.06	0.38	0.29	0.05	0.49	1.0	0.13	0.0	0.05	0.11
Transcript_contig_61848 (61848)	0.15	0.18	0.26	0.26	0.3	0.72	1.0	0.24	0.06	0.23	0.41
Transcript_contig_62019 (62019)	0.14	0.04	0.37	0.19	0.09	0.7	1.0	0.05	0.03	0.71	0.46
Transcript_contig_62196 (62196)	0.04	0.01	0.23	0.11	0.03	0.76	1.0	0.02	0.0	0.47	0.17
Transcript_contig_62221 (62221)	0.12	0.08	0.31	0.25	0.19	0.45	1.0	0.06	0.0	0.13	0.05
Transcript_contig_63941 (63941)	0.09	0.0	0.46	0.17	0.63	0.59	1.0	0.12	0.0	0.54	0.31
Transcript_contig_65119 (65119)	0.01	0.02	0.25	0.19	0.13	0.58	1.0	0.03	0.04	0.08	0.14
Transcript_contig_66319 (66319)	0.18	0.16	0.44	0.45	0.31	0.81	1.0	0.32	0.0	0.55	0.51
Transcript_contig_6803 (6803)	0.08	0.04	0.13	0.06	0.23	0.76	1.0	0.13	0.22	0.82	0.36
Transcript_contig_68778 (68778)	0.07	0.03	0.4	0.33	0.25	0.61	1.0	0.03	0.22	0.38	0.38
Transcript_contig_69132 (69132)	0.02	0.02	0.31	0.22	0.12	0.75	1.0	0.02	0.28	0.37	0.25
Transcript_contig_69481 (69481)	0.13	0.12	0.26	0.2	0.13	0.88	1.0	0.16	0.49	0.58	0.44
Transcript_contig_70124 (70124)	0.08	0.05	0.3	0.31	0.19	0.61	1.0	0.1	0.18	0.23	0.39
Transcript_contig_70379 (70379)	0.02	0.05	0.33	0.19	0.24	0.52	1.0	0.02	0.19	0.24	0.23
Transcript_contig_70681 (70681)	0.01	0.01	0.31	0.27	0.06	0.66	1.0	0.0	0.06	0.47	0.32
Transcript_contig_70875 (70875)	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.8	0.48	0.0	0.0	1.0	0.2
Transcript_contig_71848 (71848)	0.05	0.0	0.25	0.13	0.08	0.65	1.0	0.01	0.0	0.2	0.11
Transcript_contig_72003 (72003)	0.27	0.16	0.13	0.12	0.16	0.77	1.0	0.14	0.07	0.14	0.17
Transcript_contig_78840 (78840)	0.19	0.18	0.35	0.19	0.06	0.73	1.0	0.13	0.05	0.18	0.15
Transcript_contig_78842 (78842)	0.02	0.05	0.3	0.24	0.21	0.91	1.0	0.08	0.03	0.27	0.43
Transcript_contig_78924 (78924)	0.01	0.01	0.49	0.14	0.2	0.62	1.0	0.08	0.43	0.34	0.46
Transcript_contig_78926 (78926)	0.02	0.04	0.19	0.26	0.16	0.49	1.0	0.04	0.0	0.05	0.04
Transcript_contig_7895 (7895)	0.22	0.0	0.01	0.0	0.01	0.51	1.0	0.01	0.02	0.88	0.41
Transcript_contig_78985 (78985)	0.17	0.18	0.24	0.28	0.51	0.6	1.0	0.4	0.3	0.34	0.3
Transcript_contig_79465 (79465)	0.05	0.01	0.47	0.25	0.17	0.53	1.0	0.01	0.02	0.21	0.29
Transcript_contig_79503 (79503)	0.15	0.0	0.17	0.18	0.16	0.67	1.0	0.0	0.39	0.89	0.67
Transcript_contig_79676 (79676)	0.01	0.01	0.25	0.13	0.14	0.58	1.0	0.02	0.0	0.16	0.2
Transcript_contig_79772 (79772)	0.13	0.0	0.21	0.17	0.15	0.68	1.0	0.0	0.0	0.07	0.19
Transcript_contig_80718 (80718)	0.0	0.01	0.27	0.22	0.15	0.61	1.0	0.02	0.02	0.22	0.24
Transcript_contig_8165 (8165)	0.08	0.12	0.29	0.22	0.13	0.74	1.0	0.24	0.3	0.46	0.33
Transcript_contig_82175 (82175)	0.2	0.08	0.44	0.3	0.26	0.67	1.0	0.04	0.14	0.68	0.49
Transcript_contig_83167 (83167)	0.05	0.0	0.07	0.14	0.13	0.58	1.0	0.0	0.0	0.28	0.17
Transcript_contig_83236 (83236)	0.2	0.15	0.19	0.41	0.17	0.61	1.0	0.48	0.13	0.72	0.43
Transcript_contig_83982 (83982)	0.01	0.04	0.18	0.16	0.19	0.82	1.0	0.04	0.39	0.09	0.16
Transcript_contig_84613 (84613)	0.1	0.03	0.25	0.35	0.38	0.86	1.0	0.1	0.07	0.65	0.68
Transcript_contig_89193 (89193)	0.13	0.08	0.35	0.3	0.19	0.68	1.0	0.09	0.32	0.48	0.32
Transcript_contig_89424 (89424)	0.07	0.05	0.25	0.18	0.17	0.63	1.0	0.06	0.22	0.28	0.28
Transcript_contig_89723 (89723)	0.27	0.3	0.93	0.44	0.56	0.62	1.0	0.48	0.12	0.54	0.38
Transcript_contig_89854 (89854)	0.12	0.0	0.08	0.03	0.02	0.93	1.0	0.0	0.03	0.88	0.94
Transcript_contig_89859 (89859)	0.07	0.03	0.2	0.11	0.06	0.83	1.0	0.1	0.44	0.72	0.49
Transcript_contig_89918 (89918)	0.1	0.1	0.4	0.27	0.28	0.61	1.0	0.03	0.07	0.61	0.35
Transcript_contig_90085 (90085)	0.08	0.09	0.52	0.27	0.17	0.62	1.0	0.09	0.18	0.15	0.35
Transcript_contig_90089 (90089)	0.02	0.01	0.26	0.19	0.15	0.7	1.0	0.02	0.21	0.35	0.37
Transcript_contig_90122 (90122)	0.17	0.15	0.22	0.35	0.24	0.76	1.0	0.05	0.18	0.89	0.79
Transcript_contig_90388 (90388)	0.0	0.03	0.25	0.14	0.21	0.75	1.0	0.07	0.02	0.3	0.09
Transcript_contig_90439 (90439)	0.09	0.0	0.3	0.1	0.16	0.71	1.0	0.0	0.44	0.33	0.83
Transcript_contig_90731 (90731)	0.24	0.27	0.53	0.35	0.18	0.6	1.0	0.24	0.33	0.64	0.52
Transcript_contig_91089 (91089)	0.04	0.0	0.41	0.1	0.05	0.75	0.85	0.0	0.34	0.48	1.0
Transcript_contig_91132 (91132)	0.23	0.02	0.15	0.39	0.38	0.51	0.64	0.02	0.13	1.0	0.69
Transcript_contig_9313 (9313)	0.28	0.26	0.05	0.04	0.03	0.45	1.0	0.25	0.03	0.06	0.06
Transcript_contig_9533 (9533)	0.03	0.02	0.23	0.11	0.08	0.83	0.81	0.05	0.18	1.0	0.35

Details

Expression values normalized per gene (using the maximum value, Green cells indicate low expression and red high. (Dark gray cells indicate missing values)