Heatmap: Cluster_162 (HCCA)

View as: (view raw or zlog-transformed)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are normalized against highest expression of the row)

Gene	CCAP211/11P,High light	CCAP211/11P,Low light	CPCC90,BBM,72h,Autotrophy	CPCC90,BBM,97h,Mixotrophy	CPCC90,BBM,98h,Mixotrophy	CPCC90,BBM,120h,Mixotrophy	CPCC90,BBM,144h,Heterotrophy	NJ-7,20C	NJ-7,4C	UTEX259,20C	UTEX259,4C
Transcript_contig_10172 (10172)	0.31	0.28	0.24	0.69	0.74	0.57	0.48	0.11	0.07	1.0	0.63
Transcript_contig_10957 (10957)	0.38	0.25	0.74	0.68	1.0	0.47	0.81	0.27	0.29	0.64	0.38
Transcript_contig_12214 (12214)	0.54	0.56	0.5	0.95	0.96	0.6	0.83	0.86	0.7	1.0	0.69
Transcript_contig_1489 (1489)	0.35	0.4	0.22	0.44	1.0	0.31	0.37	0.48	0.14	0.24	0.17
Transcript_contig_1944 (1944)	0.37	0.38	0.57	0.66	1.0	0.31	0.44	0.32	0.2	0.61	0.29
Transcript_contig_2147 (2147)	0.53	0.65	0.29	0.58	1.0	0.34	0.4	0.66	0.42	0.66	0.44
Transcript_contig_2211 (2211)	0.19	0.12	0.4	0.98	0.61	0.3	0.41	0.05	0.24	1.0	0.71
Transcript_contig_4652 (4652)	0.36	0.39	0.31	0.54	1.0	0.32	0.47	0.36	0.14	0.15	0.24
Transcript_contig_54021 (54021)	0.57	0.69	0.44	0.81	1.0	0.47	0.53	0.66	0.28	0.58	0.4
Transcript_contig_54428 (54428)	0.55	0.57	0.32	0.59	1.0	0.34	0.42	0.59	0.42	0.52	0.4
Transcript_contig_54448 (54448)	0.53	0.56	0.25	0.52	1.0	0.25	0.49	0.58	0.18	0.59	0.39
Transcript_contig_54488 (54488)	0.4	0.25	0.37	0.74	0.91	0.49	0.69	0.34	0.44	1.0	0.82
Transcript_contig_54588 (54588)	0.46	0.5	0.4	0.55	1.0	0.28	0.42	0.57	0.21	0.46	0.36
Transcript_contig_54625 (54625)	0.26	0.13	0.54	0.81	1.0	0.4	0.29	0.06	0.17	0.86	0.59
Transcript_contig_55587 (55587)	0.42	0.42	0.2	0.43	1.0	0.24	0.38	0.47	0.4	0.36	0.27
Transcript_contig_55730 (55730)	0.65	0.78	0.26	0.68	1.0	0.38	0.61	0.92	0.36	0.45	0.3
Transcript_contig_56097 (56097)	0.32	0.29	0.39	0.69	1.0	0.44	0.39	0.2	0.38	0.66	0.45
Transcript_contig_56289 (56289)	0.67	0.7	0.26	0.64	1.0	0.34	0.52	0.7	0.44	0.51	0.4
Transcript_contig_56357 (56357)	0.29	0.27	0.17	0.79	0.78	0.56	0.41	0.23	0.17	1.0	0.57
Transcript_contig_5640 (5640)	0.42	0.33	0.58	0.9	1.0	0.48	0.92	0.19	0.38	0.7	0.46
Transcript_contig_56518 (56518)	0.39	0.54	0.3	0.62	0.69	0.36	0.47	1.0	0.4	0.43	0.26
Transcript_contig_56595 (56595)	0.18	0.26	0.26	0.57	0.66	0.48	0.53	0.38	0.18	1.0	0.43
Transcript_contig_56619 (56619)	0.33	0.47	0.54	0.64	1.0	0.53	0.52	0.45	0.45	0.69	0.44
Transcript_contig_56785 (56785)	0.33	0.41	0.38	0.52	1.0	0.45	0.44	0.66	0.34	0.88	0.49
Transcript_contig_56791 (56791)	0.63	0.68	0.27	0.57	1.0	0.47	0.51	0.59	0.67	0.7	0.51
Transcript_contig_56805 (56805)	0.49	0.53	0.24	0.66	1.0	0.3	0.43	0.58	0.42	0.42	0.33
Transcript_contig_56876 (56876)	0.52	0.6	0.26	0.49	1.0	0.31	0.47	0.63	0.54	0.54	0.35
Transcript_contig_57481 (57481)	0.6	0.74	0.37	0.66	1.0	0.64	0.5	0.84	0.3	0.52	0.44
Transcript_contig_57734 (57734)	0.3	0.28	0.37	0.61	1.0	0.31	0.49	0.49	0.28	0.72	0.66
Transcript_contig_58198 (58198)	0.54	0.69	0.22	0.51	1.0	0.39	0.5	0.69	0.21	0.59	0.31
Transcript_contig_58691 (58691)	0.21	0.09	0.57	1.0	0.79	0.67	0.55	0.03	0.21	0.62	0.52
Transcript_contig_58784 (58784)	0.38	0.37	0.37	0.65	1.0	0.38	0.52	0.6	0.12	0.21	0.14
Transcript_contig_58840 (58840)	0.28	0.18	0.47	0.74	0.8	0.6	0.43	0.22	0.48	1.0	0.7
Transcript_contig_58994 (58994)	0.48	0.56	0.48	0.82	1.0	0.71	0.81	0.36	0.19	0.93	0.61
Transcript_contig_59309 (59309)	0.56	0.61	0.2	0.54	1.0	0.33	0.42	0.77	0.43	0.51	0.38
Transcript_contig_59339 (59339)	0.43	0.4	0.47	0.81	1.0	0.57	0.54	0.29	0.26	0.79	0.54
Transcript_contig_59592 (59592)	0.29	0.26	0.1	0.69	0.97	0.63	0.46	0.12	0.0	1.0	0.47
Transcript_contig_59603 (59603)	0.56	0.76	0.37	0.63	1.0	0.44	0.54	0.82	0.1	0.46	0.34
Transcript_contig_59694 (59694)	0.58	0.69	0.4	0.64	1.0	0.36	0.43	0.8	0.25	0.51	0.44
Transcript_contig_59791 (59791)	0.41	0.53	0.22	0.49	1.0	0.34	0.32	0.59	0.13	0.3	0.24
Transcript_contig_60193 (60193)	0.48	0.61	0.23	0.4	1.0	0.24	0.34	0.55	0.29	0.44	0.31
Transcript_contig_60498 (60498)	0.34	0.26	0.51	0.8	0.7	0.5	0.58	0.1	0.11	1.0	0.63
Transcript_contig_61243 (61243)	0.51	0.66	0.26	0.49	1.0	0.46	0.45	0.91	0.37	0.7	0.42
Transcript_contig_61312 (61312)	0.73	0.79	0.24	0.58	1.0	0.38	0.54	0.65	0.58	0.52	0.35
Transcript_contig_61504 (61504)	0.64	0.72	0.39	0.68	1.0	0.68	0.45	0.8	0.39	0.58	0.57
Transcript_contig_61557 (61557)	0.64	0.64	0.26	0.64	1.0	0.41	0.58	0.72	0.52	0.55	0.45
Transcript_contig_61729 (61729)	0.44	0.62	0.34	0.63	1.0	0.37	0.39	0.79	0.18	0.34	0.25
Transcript_contig_61792 (61792)	0.9	0.93	0.11	0.74	1.0	0.76	0.75	0.97	0.76	0.9	0.69
Transcript_contig_61876 (61876)	0.51	0.67	0.17	0.42	1.0	0.25	0.27	0.74	0.37	0.48	0.33
Transcript_contig_62068 (62068)	0.26	0.26	0.36	0.51	1.0	0.38	0.44	0.35	0.09	0.8	0.51
Transcript_contig_62160 (62160)	0.43	0.5	0.5	0.68	1.0	0.55	0.52	0.63	0.09	0.79	0.31
Transcript_contig_638 (638)	0.28	0.18	0.56	1.0	0.75	0.42	0.42	0.17	0.24	0.79	0.45
Transcript_contig_69186 (69186)	0.54	0.55	0.23	0.38	1.0	0.38	0.43	0.73	0.53	0.75	0.51
Transcript_contig_69491 (69491)	0.37	0.43	0.26	0.57	1.0	0.45	0.65	0.35	0.02	0.65	0.5
Transcript_contig_71862 (71862)	0.3	0.37	0.41	0.55	1.0	0.48	0.55	0.33	0.06	0.66	0.39
Transcript_contig_78054 (78054)	0.38	0.43	0.2	0.52	1.0	0.53	0.48	0.45	0.6	0.83	0.49
Transcript_contig_78282 (78282)	0.65	0.82	0.26	0.68	1.0	0.54	0.65	0.78	0.28	0.65	0.35
Transcript_contig_78311 (78311)	0.52	0.62	0.23	0.46	1.0	0.32	0.42	0.34	0.23	0.63	0.34
Transcript_contig_78388 (78388)	0.53	0.64	0.42	0.61	1.0	0.4	0.56	0.76	0.25	0.41	0.3
Transcript_contig_78472 (78472)	0.39	0.35	0.67	0.81	1.0	0.46	0.68	0.4	0.77	0.76	0.5
Transcript_contig_78681 (78681)	0.45	0.46	0.3	0.51	1.0	0.25	0.44	0.46	0.41	0.37	0.28
Transcript_contig_79386 (79386)	0.33	0.48	0.32	0.72	1.0	0.71	0.38	0.77	0.26	0.72	0.59
Transcript_contig_79521 (79521)	0.25	0.26	0.22	0.53	1.0	0.33	0.37	0.21	0.2	0.41	0.25
Transcript_contig_83333 (83333)	0.41	0.45	0.56	0.7	1.0	0.73	0.81	0.56	0.08	0.99	0.73
Transcript_contig_89346 (89346)	0.4	0.41	0.11	0.82	0.99	0.57	0.45	0.31	0.11	1.0	0.68
Transcript_contig_89505 (89505)	0.22	0.37	0.31	0.65	1.0	0.72	0.38	0.49	0.37	0.76	0.56
Transcript_contig_89674 (89674)	0.37	0.48	0.43	0.77	0.83	0.51	0.44	0.64	0.18	1.0	0.66
Transcript_contig_89929 (89929)	0.26	0.32	0.7	0.9	0.86	0.41	0.5	0.28	0.05	1.0	0.45
Transcript_contig_90157 (90157)	0.3	0.28	0.48	0.76	0.94	0.58	0.39	0.19	0.25	1.0	0.73
Transcript_contig_9190 (9190)	0.34	0.29	0.36	0.72	1.0	0.49	0.59	0.28	0.06	0.91	0.66

Details

Expression values normalized per gene (using the maximum value, Green cells indicate low expression and red high. (Dark gray cells indicate missing values)