Heatmap: Cluster_30 (HCCA)

View as: (view raw or zlog-transformed)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are normalized against highest expression of the row)

Gene	CCAP211/11P,High light	CCAP211/11P,Low light	CPCC90,BBM,72h,Autotrophy	CPCC90,BBM,97h,Mixotrophy	CPCC90,BBM,98h,Mixotrophy	CPCC90,BBM,120h,Mixotrophy	CPCC90,BBM,144h,Heterotrophy	NJ-7,20C	NJ-7,4C	UTEX259,20C	UTEX259,4C
Transcript_contig_10317 (10317)	0.55	0.89	0.12	0.12	0.13	0.08	0.03	1.0	0.0	0.03	0.03
Transcript_contig_10385 (10385)	0.73	0.84	0.11	0.15	0.17	0.03	0.28	1.0	0.0	0.01	0.07
Transcript_contig_11054 (11054)	0.72	1.0	0.11	0.09	0.06	0.11	0.32	0.86	0.01	0.06	0.05
Transcript_contig_11365 (11365)	0.59	1.0	0.04	0.13	0.07	0.05	0.1	0.92	0.0	0.05	0.04
Transcript_contig_1545 (1545)	0.72	1.0	0.22	0.15	0.12	0.17	0.27	0.97	0.05	0.17	0.21
Transcript_contig_3299 (3299)	0.74	1.0	0.13	0.25	0.31	0.17	0.41	0.73	0.01	0.1	0.05
Transcript_contig_4105 (4105)	0.42	0.59	0.09	0.13	0.28	0.13	0.15	1.0	0.0	0.0	0.14
Transcript_contig_4185 (4185)	0.64	1.0	0.19	0.35	0.29	0.09	0.32	0.56	0.01	0.12	0.05
Transcript_contig_4620 (4620)	0.61	1.0	0.19	0.12	0.16	0.09	0.11	0.81	0.0	0.07	0.04
Transcript_contig_4659 (4659)	0.84	1.0	0.03	0.18	0.34	0.09	0.24	0.88	0.34	0.12	0.22
Transcript_contig_53749 (53749)	0.79	1.0	0.13	0.23	0.31	0.21	0.49	0.89	0.08	0.15	0.07
Transcript_contig_55708 (55708)	0.68	1.0	0.16	0.31	0.27	0.12	0.34	0.66	0.01	0.05	0.05
Transcript_contig_55764 (55764)	0.61	0.88	0.25	0.22	0.22	0.16	0.32	1.0	0.11	0.08	0.07
Transcript_contig_55810 (55810)	0.65	1.0	0.03	0.12	0.13	0.13	0.12	0.93	0.02	0.16	0.06
Transcript_contig_55812 (55812)	0.62	1.0	0.15	0.1	0.12	0.03	0.13	0.73	0.0	0.0	0.01
Transcript_contig_56918 (56918)	0.68	1.0	0.14	0.18	0.21	0.13	0.35	0.88	0.02	0.08	0.04
Transcript_contig_57495 (57495)	0.63	1.0	0.19	0.14	0.11	0.11	0.24	0.8	0.02	0.15	0.07
Transcript_contig_58566 (58566)	0.81	1.0	0.21	0.28	0.34	0.25	0.45	0.73	0.02	0.21	0.11
Transcript_contig_58648 (58648)	0.75	1.0	0.21	0.18	0.13	0.23	0.24	0.98	0.14	0.01	0.08
Transcript_contig_58847 (58847)	0.66	1.0	0.21	0.28	0.33	0.23	0.45	1.0	0.08	0.11	0.07
Transcript_contig_58965 (58965)	0.81	0.86	0.02	0.1	0.0	0.02	0.12	1.0	0.0	0.0	0.0
Transcript_contig_59587 (59587)	0.58	0.84	0.23	0.18	0.16	0.17	0.3	1.0	0.1	0.11	0.13
Transcript_contig_60258 (60258)	0.68	1.0	0.2	0.37	0.21	0.01	0.27	0.8	0.03	0.01	0.0
Transcript_contig_60780 (60780)	0.48	0.72	0.18	0.12	0.07	0.07	0.12	1.0	0.01	0.01	0.01
Transcript_contig_61798 (61798)	0.55	0.8	0.08	0.2	0.4	0.2	0.15	1.0	0.03	0.17	0.18
Transcript_contig_62149 (62149)	0.61	1.0	0.1	0.17	0.26	0.04	0.08	0.96	0.0	0.0	0.01
Transcript_contig_62163 (62163)	0.59	0.87	0.28	0.23	0.23	0.21	0.26	1.0	0.0	0.0	0.12
Transcript_contig_62537 (62537)	0.8	1.0	0.26	0.29	0.32	0.19	0.45	0.94	0.18	0.12	0.12
Transcript_contig_62964 (62964)	0.4	0.71	0.16	0.14	0.12	0.13	0.15	1.0	0.08	0.0	0.02
Transcript_contig_63227 (63227)	0.63	0.97	0.12	0.12	0.2	0.03	0.14	1.0	0.13	0.12	0.06
Transcript_contig_63863 (63863)	0.62	1.0	0.09	0.17	0.18	0.08	0.16	0.83	0.02	0.1	0.05
Transcript_contig_66129 (66129)	0.55	0.84	0.23	0.21	0.23	0.18	0.3	1.0	0.17	0.05	0.13
Transcript_contig_67885 (67885)	0.67	1.0	0.17	0.12	0.1	0.12	0.27	0.96	0.02	0.06	0.06
Transcript_contig_67914 (67914)	0.61	1.0	0.05	0.22	0.22	0.12	0.34	0.71	0.0	0.08	0.03
Transcript_contig_68262 (68262)	0.49	0.78	0.17	0.16	0.16	0.07	0.24	1.0	0.0	0.04	0.03
Transcript_contig_68441 (68441)	0.39	0.66	0.07	0.1	0.1	0.06	0.09	1.0	0.23	0.0	0.02
Transcript_contig_685 (685)	0.53	0.98	0.17	0.2	0.1	0.04	0.11	1.0	0.0	0.0	0.02
Transcript_contig_68742 (68742)	0.71	1.0	0.2	0.14	0.07	0.18	0.37	0.9	0.18	0.02	0.07
Transcript_contig_7615 (7615)	0.72	1.0	0.07	0.09	0.17	0.16	0.27	0.99	0.05	0.01	0.14
Transcript_contig_79135 (79135)	0.51	0.82	0.16	0.18	0.29	0.2	0.29	1.0	0.06	0.08	0.1
Transcript_contig_79226 (79226)	0.64	0.83	0.15	0.18	0.22	0.14	0.31	1.0	0.13	0.08	0.07
Transcript_contig_79246 (79246)	0.61	0.94	0.19	0.15	0.14	0.12	0.15	1.0	0.06	0.0	0.01
Transcript_contig_79287 (79287)	0.64	0.92	0.21	0.22	0.25	0.15	0.36	1.0	0.02	0.06	0.06
Transcript_contig_79443 (79443)	0.54	0.78	0.26	0.13	0.03	0.19	0.24	1.0	0.17	0.01	0.09
Transcript_contig_79479 (79479)	0.71	1.0	0.4	0.22	0.32	0.19	0.34	0.95	0.01	0.0	0.11
Transcript_contig_79573 (79573)	0.49	0.8	0.1	0.12	0.15	0.06	0.16	1.0	0.01	0.0	0.01
Transcript_contig_80174 (80174)	0.62	0.96	0.26	0.27	0.22	0.18	0.32	1.0	0.03	0.02	0.08
Transcript_contig_80424 (80424)	0.56	1.0	0.13	0.18	0.26	0.09	0.21	0.97	0.0	0.0	0.04
Transcript_contig_80608 (80608)	0.77	1.0	0.2	0.22	0.33	0.21	0.36	0.9	0.03	0.11	0.08
Transcript_contig_80945 (80945)	0.61	0.85	0.15	0.19	0.16	0.2	0.14	1.0	0.0	0.1	0.06
Transcript_contig_8242 (8242)	0.65	1.0	0.12	0.24	0.04	0.17	0.15	0.92	0.0	0.0	0.0
Transcript_contig_83016 (83016)	0.71	1.0	0.0	0.0	0.04	0.14	0.19	0.88	0.02	0.19	0.04
Transcript_contig_89340 (89340)	0.71	0.93	0.14	0.2	0.23	0.13	0.34	1.0	0.09	0.11	0.07
Transcript_contig_89348 (89348)	0.58	0.83	0.27	0.24	0.21	0.21	0.33	1.0	0.0	0.0	0.12
Transcript_contig_89386 (89386)	0.79	1.0	0.15	0.25	0.3	0.23	0.46	0.88	0.13	0.17	0.12
Transcript_contig_89785 (89785)	0.69	1.0	0.13	0.2	0.19	0.15	0.37	0.89	0.0	0.0	0.05
Transcript_contig_89892 (89892)	0.64	1.0	0.16	0.15	0.05	0.2	0.3	0.97	0.08	0.0	0.04
Transcript_contig_89943 (89943)	0.46	0.84	0.17	0.11	0.0	0.14	0.1	1.0	0.0	0.02	0.1
Transcript_contig_90069 (90069)	0.68	1.0	0.22	0.25	0.22	0.17	0.24	0.94	0.1	0.0	0.02
Transcript_contig_90173 (90173)	0.68	1.0	0.16	0.19	0.16	0.15	0.21	0.91	0.0	0.0	0.05
Transcript_contig_90226 (90226)	0.67	1.0	0.11	0.27	0.15	0.16	0.3	0.8	0.01	0.1	0.1
Transcript_contig_90299 (90299)	0.59	0.92	0.1	0.21	0.18	0.13	0.26	1.0	0.17	0.1	0.07
Transcript_contig_90464 (90464)	0.56	0.81	0.31	0.3	0.26	0.25	0.3	1.0	0.06	0.02	0.12
Transcript_contig_90617 (90617)	0.65	0.94	0.25	0.26	0.31	0.19	0.26	1.0	0.04	0.0	0.13
Transcript_contig_90877 (90877)	0.62	0.89	0.16	0.23	0.26	0.25	0.21	1.0	0.19	0.05	0.11

Details

Expression values normalized per gene (using the maximum value, Green cells indicate low expression and red high. (Dark gray cells indicate missing values)