Heatmap: Cluster_94 (HCCA)

View as: (view raw or zlog-transformed)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are normalized against highest expression of the row)

Gene	Light - ZT1	Light - ZT3	Light - ZT5	Light - ZT7	Light - ZT9	Light - ZT11	Light - ZT13	Light - ZT15	Dark - ZT17	Dark - ZT19	Dark - ZT21	Dark - ZT23	Light - ZT25	Nutrient stress - Low nitrogen - 10%	Nutrient stress - Low phosphate - 0%	Nutrient stress - Low sulfate - 2%	Nutrient stress - Low micronutrients - 0%	Nutrient stress - NaCl - 75 mM	Nutrient stress - Mannitol - 100 mM	Nutrient stress - Control	Environmental stress - Prolonged darkness - 72h	Environmental stress - Cold - 4C	Environmental stress - Heat - 37C	Environmental stress - Control	Environmental stress - High light - 150 uE	Environmental stress - Control high light - 40 uE
Cpa\|evm.model.tig00000042.13 (tig00000042_g15400.t3)	0.73	0.56	0.44	0.48	0.5	0.53	0.62	0.69	0.47	0.5	0.55	0.5	0.61	1.0	0.4	0.69	0.33	0.7	0.72	0.42	0.09	0.59	0.77	0.79	0.78	1.0
Cpa\|evm.model.tig00000042.246 (tig00000042_g15648.t1)	0.53	0.47	0.47	0.5	0.55	0.48	0.65	0.6	0.63	0.67	0.58	0.59	0.6	0.81	0.61	0.77	0.53	0.81	0.74	0.57	0.23	1.0	0.65	0.56	0.71	0.66
Cpa\|evm.model.tig00000076.97 (tig00000076_g2395.t1)	0.88	0.33	0.28	0.28	0.37	0.5	0.68	0.69	0.61	0.51	0.45	0.43	0.96	0.46	0.58	0.56	0.34	0.57	0.52	0.28	0.24	1.0	0.69	0.51	0.52	0.36
Cpa\|evm.model.tig00000093.197 (tig00000093_g3621.t1)	0.59	0.48	0.46	0.46	0.43	0.37	0.58	0.53	0.45	0.44	0.43	0.41	0.52	0.5	0.49	0.47	0.45	0.66	0.52	0.49	0.05	1.0	0.23	0.39	0.63	0.58
Cpa\|evm.model.tig00000113.74 (tig00000113_g5653.t1)	0.8	0.6	0.65	0.73	0.83	0.77	0.79	0.76	0.74	0.71	0.8	0.78	0.88	0.89	0.7	0.92	0.69	0.67	0.65	0.59	0.43	1.0	0.75	0.66	0.81	0.81
Cpa\|evm.model.tig00000203.28 (tig00000203_g17135.t1)	0.84	0.49	0.47	0.38	0.31	0.3	0.5	0.55	0.47	0.66	0.71	0.9	1.0	0.76	0.8	0.73	0.62	0.84	0.69	0.74	0.39	0.93	0.58	0.62	0.62	0.97
Cpa\|evm.model.tig00000219.57 (tig00000219_g19494.t1)	0.75	0.74	0.7	0.75	0.74	0.59	0.65	0.54	0.59	0.6	0.52	0.48	0.65	0.92	0.69	1.0	0.5	0.73	0.7	0.46	0.15	0.98	0.5	0.51	0.85	0.73
Cpa\|evm.model.tig00000241.121 (tig00000241_g20987.t1)	0.85	0.5	0.34	0.27	0.24	0.17	0.23	0.18	0.17	0.2	0.2	0.29	1.0	0.33	0.26	0.33	0.39	0.38	0.28	0.25	0.48	0.89	0.21	0.66	0.59	0.67
Cpa\|evm.model.tig00000361.31 (tig00000361_g24382.t1)	0.68	0.56	0.56	0.51	0.39	0.22	0.43	0.5	0.36	0.5	0.45	0.5	0.67	0.6	0.43	0.65	0.6	0.67	0.43	0.58	0.12	1.0	0.27	0.37	0.95	0.68
Cpa\|evm.model.tig00000383.84 (tig00000383_g24695.t1)	0.84	0.55	0.49	0.59	0.67	0.7	0.72	0.76	0.68	0.57	0.66	0.53	0.51	0.76	0.6	0.65	0.5	0.82	1.0	0.58	0.2	0.92	0.64	0.8	0.87	0.98
Cpa\|evm.model.tig00000492.74 (tig00000492_g1465.t1)	0.36	0.59	0.34	0.37	0.42	0.18	0.39	0.33	0.2	0.37	0.28	0.36	0.38	0.97	0.81	0.72	0.63	0.71	1.0	0.57	0.12	0.92	0.28	0.4	0.39	0.87
Cpa\|evm.model.tig00000498.72 (tig00000498_g1649.t1)	0.88	0.62	0.59	0.68	0.77	0.74	0.82	0.76	0.74	0.72	0.77	0.83	0.98	0.72	0.6	0.75	0.59	0.59	0.51	0.48	0.5	1.0	0.98	0.8	0.8	0.73
Cpa\|evm.model.tig00000523.22 (tig00000523_g1841.t1)	0.66	0.37	0.28	0.3	0.29	0.27	0.41	0.41	0.23	0.22	0.23	0.26	0.61	0.43	0.59	0.56	0.41	0.53	0.49	0.33	0.22	1.0	0.41	0.32	0.45	0.3
Cpa\|evm.model.tig00000663.43 (tig00000663_g2975.t1)	0.8	0.73	0.66	0.71	0.77	0.85	0.72	0.73	0.77	0.68	0.65	0.7	0.73	0.83	0.84	0.77	0.71	0.97	1.0	0.66	0.2	0.85	0.78	0.53	0.85	0.85
Cpa\|evm.model.tig00000718.70 (tig00000718_g3742.t1)	0.47	0.39	0.35	0.41	0.41	0.36	0.47	0.5	0.35	0.28	0.23	0.2	0.5	0.15	0.64	0.38	0.35	0.61	0.48	0.4	0.38	1.0	0.38	0.25	0.37	0.3
Cpa\|evm.model.tig00000792.57 (tig00000792_g4208.t1)	1.0	0.79	0.64	0.51	0.45	0.38	0.52	0.55	0.56	0.62	0.64	0.68	0.86	0.66	0.66	0.51	0.64	0.69	0.56	0.63	0.39	0.93	0.5	0.57	0.68	0.69
Cpa\|evm.model.tig00000851.26 (tig00000851_g4911.t1)	0.41	0.52	0.48	0.53	0.65	0.72	0.62	0.59	0.56	0.5	0.57	0.46	0.4	0.56	0.37	0.61	0.45	0.4	0.5	0.52	0.06	0.58	0.6	0.61	0.72	1.0
Cpa\|evm.model.tig00001003.10 (tig00001003_g6268.t1)	0.88	0.41	0.3	0.31	0.4	0.29	0.38	0.42	0.27	0.34	0.38	0.38	0.82	0.08	0.12	0.06	0.1	0.28	0.24	0.16	0.13	1.0	0.35	0.1	0.44	0.21
Cpa\|evm.model.tig00001003.11 (tig00001003_g6268.t1)	0.8	0.45	0.3	0.3	0.21	0.21	0.34	0.21	0.2	0.22	0.19	0.25	0.59	0.12	0.09	0.07	0.12	0.27	0.3	0.19	0.25	1.0	0.57	0.11	0.34	0.33
Cpa\|evm.model.tig00001003.39 (tig00001003_g6293.t1)	0.71	0.57	0.51	0.43	0.39	0.41	0.43	0.41	0.38	0.44	0.38	0.38	0.68	0.97	0.81	0.78	0.66	1.0	0.96	0.63	0.13	0.87	0.39	0.4	0.69	0.77
Cpa\|evm.model.tig00001003.40 (tig00001003_g6293.t1)	0.68	0.53	0.51	0.47	0.38	0.28	0.45	0.46	0.35	0.42	0.37	0.43	0.7	0.97	0.69	0.74	0.66	1.0	0.73	0.53	0.14	0.81	0.36	0.34	0.69	0.8
Cpa\|evm.model.tig00001065.22 (tig00001065_g6723.t1)	0.68	0.57	0.56	0.52	0.53	0.55	0.66	0.65	0.52	0.55	0.48	0.43	0.71	0.63	0.58	0.63	0.46	0.77	0.53	0.49	0.28	1.0	0.22	0.42	0.53	0.48
Cpa\|evm.model.tig00001094.21 (tig00001094_g6992.t1)	0.63	0.34	0.33	0.42	0.3	0.25	0.33	0.43	0.29	0.29	0.38	0.47	0.98	0.57	0.8	0.55	0.29	0.34	0.24	0.23	0.47	1.0	0.35	0.41	0.68	0.6
Cpa\|evm.model.tig00001181.20 (tig00001181_g7434.t1)	0.8	0.75	0.64	0.54	0.56	0.53	0.57	0.52	0.46	0.46	0.42	0.44	0.62	0.85	0.75	0.87	0.61	0.75	0.66	0.58	0.17	1.0	0.41	0.5	0.76	0.79
Cpa\|evm.model.tig00001224.5 (tig00001224_g7628.t1)	0.77	0.37	0.21	0.55	0.54	0.3	0.31	0.45	0.3	0.27	0.39	0.27	0.37	0.37	0.44	0.43	0.36	0.47	0.34	0.28	0.05	0.59	0.46	0.39	1.0	0.66
Cpa\|evm.model.tig00001336.1 (tig00001336_g8219.t1)	0.52	0.49	0.36	0.41	0.32	0.31	0.51	0.47	0.38	0.39	0.35	0.34	0.58	1.0	0.36	0.76	0.47	0.91	0.48	0.48	0.13	0.88	0.43	0.49	0.58	0.55
Cpa\|evm.model.tig00001336.2 (tig00001336_g8219.t1)	0.53	0.5	0.41	0.39	0.38	0.39	0.45	0.43	0.35	0.4	0.35	0.32	0.54	1.0	0.45	0.82	0.51	0.76	0.61	0.55	0.1	0.6	0.34	0.35	0.51	0.43
Cpa\|evm.model.tig00001339.2 (tig00001339_g8257.t1)	0.81	0.59	0.62	0.68	0.63	0.51	0.68	0.74	0.62	0.62	0.6	0.58	0.82	0.65	0.74	0.73	0.58	0.7	0.61	0.57	0.17	1.0	0.47	0.41	0.76	0.78
Cpa\|evm.model.tig00001366.14 (tig00001366_g8389.t1)	0.64	0.43	0.52	0.53	0.36	0.35	0.51	0.59	0.39	0.35	0.34	0.34	0.67	0.42	0.58	0.81	0.34	0.63	0.5	0.37	0.22	1.0	0.26	0.3	0.56	0.5
Cpa\|evm.model.tig00001388.8 (tig00001388_g8578.t1)	0.77	0.48	0.49	0.56	0.53	0.48	0.59	0.62	0.48	0.52	0.53	0.56	0.77	0.81	0.66	0.87	0.63	0.96	0.73	0.49	0.32	0.89	0.66	0.91	0.81	1.0
Cpa\|evm.model.tig00001408.7 (tig00001408_g8602.t1)	0.61	0.53	0.55	0.63	0.67	0.53	0.7	0.7	0.58	0.62	0.57	0.53	0.58	0.76	0.67	0.91	0.63	0.97	0.85	0.69	0.23	1.0	0.45	0.48	0.68	0.71
Cpa\|evm.model.tig00001537.1 (tig00001537_g9294.t1)	0.8	0.66	0.73	0.7	0.56	0.49	0.62	0.69	0.54	0.63	0.63	0.63	0.8	0.85	0.65	0.75	0.57	0.59	0.54	0.52	0.18	0.86	0.44	0.55	0.78	1.0
Cpa\|evm.model.tig00001542.8 (tig00001542_g9317.t1)	1.0	0.44	0.19	0.13	0.22	0.35	0.62	0.55	0.36	0.35	0.28	0.25	0.88	0.45	0.41	0.35	0.42	0.5	0.51	0.35	0.03	0.78	0.74	0.3	0.39	0.29
Cpa\|evm.model.tig00020557.17 (tig00020557_g11118.t1)	1.0	0.54	0.63	0.59	0.68	0.75	0.82	0.77	0.74	0.67	0.57	0.54	0.98	0.61	0.71	0.7	0.72	0.88	0.93	0.8	0.36	0.77	0.84	0.59	0.66	0.79
Cpa\|evm.model.tig00020629.111 (tig00020629_g12436.t1)	0.5	0.52	0.47	0.43	0.34	0.28	0.45	0.43	0.23	0.27	0.24	0.27	0.47	0.62	0.57	0.51	0.47	0.54	0.63	0.52	0.06	1.0	0.26	0.44	0.51	0.87
Cpa\|evm.model.tig00020684.27 (tig00020684_g12876.t1)	0.54	0.57	0.65	0.69	0.62	0.51	0.6	0.54	0.5	0.51	0.52	0.5	0.65	0.97	0.73	0.86	0.99	1.0	0.88	0.55	0.2	0.88	0.38	0.45	0.78	0.91
Cpa\|evm.model.tig00020713.8 (tig00020713_g13406.t1)	0.46	0.45	0.44	0.61	0.53	0.41	0.52	0.59	0.44	0.45	0.43	0.44	0.47	0.67	0.76	0.83	0.52	0.93	0.73	0.51	0.22	1.0	0.5	0.52	0.79	0.73
Cpa\|evm.model.tig00020723.34 (tig00020723_g13455.t1)	0.69	0.5	0.61	0.69	0.5	0.38	0.56	0.71	0.49	0.54	0.56	0.6	0.79	0.68	0.58	0.61	0.66	0.47	0.49	0.47	0.07	1.0	0.57	0.5	0.93	0.83
Cpa\|evm.model.tig00020825.17 (tig00020825_g14297.t1)	0.64	0.43	0.5	0.51	0.54	0.53	0.58	0.39	0.53	0.59	0.53	0.65	0.53	0.49	0.64	0.71	0.48	0.66	0.72	0.53	0.07	0.71	0.69	0.55	1.0	0.84
Cpa\|evm.model.tig00020927.63 (tig00020927_g15994.t1)	0.73	0.4	0.36	0.39	0.24	0.17	0.33	0.37	0.26	0.3	0.39	0.37	0.83	0.65	0.36	0.66	0.3	0.6	0.43	0.31	0.26	1.0	0.34	0.5	0.62	0.78
Cpa\|evm.model.tig00020960.75 (tig00020960_g16604.t1)	0.51	0.51	0.55	0.52	0.46	0.35	0.56	0.64	0.46	0.63	0.49	0.5	0.38	0.7	0.68	0.6	0.65	0.72	0.65	0.64	0.11	0.97	0.51	0.39	1.0	0.81
Cpa\|evm.model.tig00020964.11 (tig00020964_g16782.t1)	0.98	0.21	0.06	0.08	0.18	0.35	0.61	0.6	0.43	0.32	0.32	0.39	0.81	0.21	0.19	0.14	0.26	0.38	0.34	0.22	0.31	1.0	0.62	0.34	0.47	0.27
Cpa\|evm.model.tig00021094.15 (tig00021094_g18103.t1)	0.46	0.5	0.54	0.47	0.4	0.39	0.51	0.57	0.48	0.48	0.41	0.47	0.47	0.56	0.54	0.45	0.52	0.57	0.63	0.54	0.16	0.67	0.6	0.5	0.82	1.0
Cpa\|evm.model.tig00021098.10 (tig00021098_g18178.t1)	0.81	0.83	0.56	0.49	0.24	0.13	0.22	0.16	0.18	0.28	0.36	0.53	0.75	0.52	0.44	0.43	0.44	0.58	0.57	0.28	0.24	1.0	0.27	0.51	0.67	0.5
Cpa\|evm.model.tig00021098.9 (tig00021098_g18178.t1)	1.0	0.87	0.6	0.72	0.35	0.16	0.21	0.3	0.27	0.34	0.53	0.62	0.88	0.57	0.39	0.49	0.39	0.56	0.54	0.3	0.25	0.93	0.42	0.62	1.0	0.84
Cpa\|evm.model.tig00021108.38 (tig00000663_g2933.t1)	0.61	0.53	0.46	0.55	0.54	0.45	0.47	0.53	0.61	0.69	0.72	0.75	0.66	0.73	0.44	0.74	0.49	0.76	0.6	0.56	0.33	1.0	0.55	0.53	0.71	0.84
Cpa\|evm.model.tig00021123.14 (tig00021123_g18496.t1)	0.59	0.54	0.64	0.71	0.69	0.52	0.62	0.57	0.44	0.5	0.49	0.54	0.65	0.89	0.66	0.82	0.61	0.73	0.65	0.54	0.13	1.0	0.36	0.45	0.7	0.76
Cpa\|evm.model.tig00021123.34 (tig00021123_g18517.t2)	0.95	0.7	0.72	0.81	0.88	0.89	0.87	0.79	0.78	0.8	0.81	0.87	0.98	1.0	0.87	0.89	0.65	0.91	0.81	0.64	0.42	0.89	0.87	0.85	1.0	0.95
Cpa\|evm.model.tig00021127.17 (tig00021127_g18693.t1)	0.79	0.57	0.61	0.62	0.71	0.72	0.68	0.57	0.59	0.57	0.58	0.7	0.75	0.82	0.87	0.84	0.57	0.69	0.58	0.67	0.3	0.71	0.7	0.73	0.89	1.0
Cpa\|evm.model.tig00021135.8 (tig00021135_g18929.t1)	0.54	0.35	0.32	0.36	0.42	0.39	0.37	0.37	0.24	0.24	0.26	0.25	0.53	0.56	0.83	0.57	0.33	0.23	0.24	0.22	0.47	1.0	0.45	0.25	0.55	0.45
Cpa\|evm.model.tig00021234.13 (tig00021234_g19387.t1)	0.75	0.43	0.43	0.46	0.39	0.31	0.49	0.52	0.4	0.39	0.37	0.35	0.79	0.65	0.67	0.83	0.49	0.88	0.74	0.45	0.35	1.0	0.47	0.32	0.73	0.68
Cpa\|evm.model.tig00021435.54 (tig00021435_g21435.t1)	1.0	0.44	0.19	0.2	0.33	0.44	0.65	0.58	0.46	0.39	0.34	0.28	0.85	0.11	0.19	0.09	0.36	0.51	0.43	0.29	0.18	0.81	0.66	0.39	0.46	0.31
Cpa\|evm.model.tig00021439.10 (tig00021439_g21487.t1)	0.19	0.15	0.0	0.17	0.16	0.16	0.16	0.23	0.0	0.08	0.08	0.17	0.07	0.94	0.65	0.81	0.35	0.62	0.47	0.36	0.34	1.0	0.58	0.58	0.55	0.76
Cpa\|evm.model.tig00021464.15 (tig00021464_g21721.t1)	0.56	0.46	0.36	0.39	0.51	0.51	0.71	0.63	0.51	0.51	0.44	0.37	0.49	0.63	0.48	0.6	0.43	0.86	0.6	0.41	0.17	1.0	0.31	0.47	0.69	0.66
Cpa\|evm.model.tig00021608.4 (tig00021608_g22837.t1)	1.0	0.7	0.75	0.81	0.82	0.59	0.55	0.55	0.45	0.6	0.59	0.57	0.87	0.63	0.61	0.64	0.55	0.86	0.64	0.53	0.17	0.98	0.58	0.58	0.92	0.9
Cpa\|evm.model.tig00021612.36 (tig00021612_g22879.t1)	0.61	0.46	0.43	0.42	0.47	0.44	0.57	0.56	0.48	0.52	0.49	0.48	0.63	0.62	0.54	0.63	0.61	0.73	0.67	0.6	0.17	1.0	0.44	0.42	0.65	0.68
Cpa\|evm.model.tig00021623.20 (tig00021623_g23019.t1)	0.81	0.65	0.73	0.77	0.67	0.49	0.64	0.7	0.62	0.69	0.71	0.7	0.85	0.81	0.58	0.75	0.64	0.76	0.49	0.63	0.3	0.84	0.6	0.53	0.91	1.0
Cpa\|evm.model.tig00022075.7 (tig00022075_g23570.t1)	0.69	0.39	0.53	0.58	0.44	0.41	0.53	0.6	0.55	0.54	0.48	0.51	0.74	0.48	0.42	0.6	0.4	0.48	0.6	0.43	0.27	1.0	0.49	0.55	0.9	0.79

Details

Expression values normalized per gene (using the maximum value, Green cells indicate low expression and red high. (Dark gray cells indicate missing values)