Heatmap: Cluster_168 (HCCA)

View as: (view raw or zlog-transformed)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are normalized against highest expression of the row)

Gene	CCAP211/11P,High light	CCAP211/11P,Low light	CPCC90,BBM,72h,Autotrophy	CPCC90,BBM,97h,Mixotrophy	CPCC90,BBM,98h,Mixotrophy	CPCC90,BBM,120h,Mixotrophy	CPCC90,BBM,144h,Heterotrophy	NJ-7,20C	NJ-7,4C	UTEX259,20C	UTEX259,4C
Transcript_contig_126 (126)	0.76	0.96	0.42	0.35	0.34	0.49	0.44	0.93	1.0	0.35	0.42
Transcript_contig_1330 (1330)	0.55	0.84	0.15	0.23	0.37	0.33	0.33	1.0	0.07	0.33	0.2
Transcript_contig_1644 (1644)	0.57	1.0	0.1	0.13	0.13	0.15	0.16	1.0	0.04	0.2	0.11
Transcript_contig_194 (194)	0.54	0.89	0.02	0.04	0.04	0.11	0.1	1.0	0.01	0.4	0.13
Transcript_contig_1983 (1983)	0.48	0.85	0.02	0.03	0.04	0.12	0.08	1.0	0.0	0.21	0.1
Transcript_contig_2746 (2746)	0.48	0.84	0.1	0.18	0.2	0.19	0.31	1.0	0.13	0.35	0.17
Transcript_contig_3998 (3998)	0.57	0.89	0.08	0.18	0.24	0.21	0.19	1.0	0.25	0.31	0.16
Transcript_contig_474 (474)	0.61	0.88	0.19	0.21	0.34	0.22	0.3	1.0	0.18	0.42	0.19
Transcript_contig_5092 (5092)	0.51	1.0	0.1	0.11	0.11	0.08	0.12	0.98	0.07	0.33	0.24
Transcript_contig_5108 (5108)	0.68	1.0	0.12	0.16	0.21	0.21	0.23	1.0	0.29	0.47	0.26
Transcript_contig_53739 (53739)	0.59	0.92	0.07	0.13	0.22	0.12	0.17	1.0	0.03	0.36	0.12
Transcript_contig_53839 (53839)	0.5	0.97	0.05	0.06	0.13	0.11	0.04	1.0	0.07	0.3	0.11
Transcript_contig_53904 (53904)	0.59	1.0	0.27	0.27	0.15	0.22	0.16	0.92	0.34	0.39	0.2
Transcript_contig_53934 (53934)	0.57	0.92	0.05	0.15	0.24	0.24	0.4	1.0	0.01	0.18	0.09
Transcript_contig_53976 (53976)	0.5	0.86	0.1	0.08	0.1	0.37	0.36	1.0	0.05	0.19	0.13
Transcript_contig_54243 (54243)	0.62	1.0	0.11	0.24	0.37	0.22	0.34	0.9	0.02	0.4	0.18
Transcript_contig_54303 (54303)	0.59	0.94	0.08	0.07	0.09	0.08	0.09	1.0	0.03	0.42	0.14
Transcript_contig_54368 (54368)	0.57	0.92	0.21	0.22	0.21	0.14	0.22	1.0	0.0	0.2	0.12
Transcript_contig_54382 (54382)	0.46	0.8	0.06	0.12	0.24	0.1	0.13	1.0	0.04	0.21	0.09
Transcript_contig_54389 (54389)	0.6	1.0	0.21	0.14	0.09	0.16	0.31	0.82	0.03	0.31	0.15
Transcript_contig_54396 (54396)	0.48	0.82	0.14	0.18	0.28	0.21	0.21	1.0	0.08	0.34	0.2
Transcript_contig_55193 (55193)	0.64	0.92	0.24	0.24	0.31	0.28	0.3	1.0	0.04	0.45	0.17
Transcript_contig_55417 (55417)	0.66	0.93	0.14	0.14	0.16	0.47	0.41	1.0	0.32	0.59	0.36
Transcript_contig_55639 (55639)	0.61	1.0	0.12	0.15	0.17	0.1	0.14	0.85	0.09	0.45	0.17
Transcript_contig_55705 (55705)	0.57	1.0	0.19	0.26	0.27	0.32	0.41	0.95	0.15	0.41	0.28
Transcript_contig_55942 (55942)	0.44	0.79	0.08	0.09	0.2	0.13	0.15	1.0	0.04	0.17	0.08
Transcript_contig_55989 (55989)	0.57	1.0	0.25	0.18	0.24	0.25	0.28	1.0	0.09	0.31	0.16
Transcript_contig_56046 (56046)	0.51	0.81	0.12	0.13	0.18	0.13	0.15	1.0	0.21	0.22	0.16
Transcript_contig_56675 (56675)	0.34	0.7	0.04	0.03	0.05	0.1	0.09	1.0	0.06	0.18	0.08
Transcript_contig_56809 (56809)	0.52	0.91	0.06	0.09	0.15	0.12	0.15	1.0	0.03	0.28	0.09
Transcript_contig_56843 (56843)	0.53	0.88	0.08	0.1	0.17	0.13	0.15	1.0	0.21	0.24	0.15
Transcript_contig_56894 (56894)	0.57	0.86	0.14	0.19	0.26	0.23	0.29	1.0	0.23	0.3	0.18
Transcript_contig_57119 (57119)	0.54	0.85	0.23	0.2	0.3	0.18	0.23	1.0	0.13	0.24	0.14
Transcript_contig_57135 (57135)	0.46	0.78	0.12	0.11	0.09	0.44	0.43	1.0	0.05	0.34	0.19
Transcript_contig_57483 (57483)	0.69	1.0	0.29	0.28	0.25	0.63	0.47	0.94	0.8	0.42	0.37
Transcript_contig_57535 (57535)	0.5	0.88	0.13	0.18	0.26	0.16	0.21	1.0	0.01	0.39	0.22
Transcript_contig_58114 (58114)	0.46	0.81	0.05	0.05	0.12	0.21	0.26	1.0	0.01	0.34	0.17
Transcript_contig_58153 (58153)	0.49	0.8	0.1	0.15	0.27	0.22	0.24	1.0	0.08	0.34	0.17
Transcript_contig_58319 (58319)	0.79	1.0	0.14	0.1	0.07	0.48	0.38	0.93	0.08	0.57	0.37
Transcript_contig_58777 (58777)	0.52	0.78	0.08	0.11	0.18	0.17	0.22	1.0	0.05	0.24	0.13
Transcript_contig_59060 (59060)	0.47	0.7	0.11	0.19	0.24	0.24	0.27	1.0	0.09	0.3	0.18
Transcript_contig_59179 (59179)	0.54	0.9	0.16	0.06	0.13	0.2	0.43	1.0	0.13	0.19	0.12
Transcript_contig_59361 (59361)	0.58	1.0	0.11	0.09	0.03	0.05	0.11	0.97	0.05	0.37	0.11
Transcript_contig_59542 (59542)	0.62	1.0	0.09	0.1	0.19	0.16	0.2	0.93	0.15	0.35	0.21
Transcript_contig_59682 (59682)	0.45	0.72	0.09	0.17	0.28	0.25	0.15	1.0	0.06	0.42	0.3
Transcript_contig_59737 (59737)	0.63	0.97	0.11	0.14	0.14	0.29	0.32	1.0	0.13	0.32	0.26
Transcript_contig_598 (598)	0.54	1.0	0.11	0.05	0.01	0.22	0.29	0.7	0.02	0.11	0.12
Transcript_contig_60093 (60093)	0.55	0.84	0.11	0.16	0.25	0.19	0.38	1.0	0.04	0.49	0.18
Transcript_contig_60101 (60101)	0.52	0.91	0.14	0.12	0.1	0.1	0.29	1.0	0.07	0.26	0.12
Transcript_contig_60514 (60514)	0.49	0.84	0.14	0.18	0.34	0.12	0.15	1.0	0.11	0.19	0.12
Transcript_contig_61325 (61325)	0.39	0.74	0.06	0.1	0.15	0.19	0.12	1.0	0.01	0.4	0.19
Transcript_contig_61382 (61382)	0.61	1.0	0.13	0.11	0.1	0.27	0.39	0.89	0.06	0.24	0.13
Transcript_contig_61734 (61734)	0.51	0.88	0.15	0.16	0.17	0.1	0.16	1.0	0.0	0.22	0.11
Transcript_contig_61802 (61802)	0.67	1.0	0.01	0.01	0.0	0.02	0.02	0.93	0.04	0.31	0.11
Transcript_contig_61847 (61847)	0.58	0.86	0.22	0.26	0.29	0.2	0.3	1.0	0.16	0.27	0.15
Transcript_contig_62175 (62175)	0.46	0.77	0.19	0.18	0.16	0.21	0.18	1.0	0.07	0.19	0.14
Transcript_contig_62418 (62418)	0.5	0.77	0.05	0.09	0.06	0.11	0.11	1.0	0.1	0.27	0.12
Transcript_contig_653 (653)	0.55	0.9	0.1	0.15	0.22	0.21	0.3	1.0	0.06	0.25	0.13
Transcript_contig_69096 (69096)	0.63	1.0	0.13	0.11	0.1	0.16	0.13	0.95	0.13	0.5	0.23
Transcript_contig_78122 (78122)	0.48	0.92	0.03	0.07	0.16	0.18	0.1	1.0	0.39	0.3	0.12
Transcript_contig_78228 (78228)	0.45	0.81	0.09	0.11	0.26	0.16	0.05	1.0	0.0	0.42	0.14
Transcript_contig_78335 (78335)	0.63	0.99	0.11	0.07	0.06	0.29	0.38	1.0	0.08	0.15	0.1
Transcript_contig_7836 (7836)	0.6	0.96	0.08	0.25	0.39	0.34	0.25	1.0	0.35	0.5	0.32
Transcript_contig_78373 (78373)	0.63	1.0	0.08	0.15	0.15	0.18	0.19	0.97	0.1	0.44	0.23
Transcript_contig_79081 (79081)	0.43	0.77	0.1	0.17	0.24	0.3	0.34	1.0	0.18	0.22	0.18
Transcript_contig_79143 (79143)	0.47	0.78	0.12	0.23	0.36	0.32	0.4	1.0	0.23	0.21	0.2
Transcript_contig_79650 (79650)	0.4	0.63	0.23	0.09	0.07	0.24	0.31	1.0	0.0	0.11	0.04
Transcript_contig_79832 (79832)	0.31	0.63	0.09	0.07	0.08	0.25	0.28	1.0	0.15	0.16	0.15
Transcript_contig_80195 (80195)	0.5	0.93	0.01	0.02	0.03	0.1	0.04	1.0	0.03	0.3	0.07
Transcript_contig_81939 (81939)	0.55	0.98	0.09	0.06	0.08	0.3	0.39	1.0	0.09	0.14	0.1
Transcript_contig_82993 (82993)	0.56	1.0	0.05	0.05	0.06	0.24	0.24	0.95	0.1	0.2	0.15
Transcript_contig_83060 (83060)	0.53	0.84	0.05	0.06	0.28	0.13	0.22	1.0	0.0	0.36	0.14
Transcript_contig_89181 (89181)	0.5	0.8	0.08	0.13	0.23	0.1	0.09	1.0	0.07	0.32	0.16
Transcript_contig_89638 (89638)	0.5	0.85	0.04	0.07	0.13	0.12	0.13	1.0	0.03	0.24	0.12
Transcript_contig_89730 (89730)	0.59	0.92	0.2	0.29	0.33	0.23	0.25	1.0	0.33	0.54	0.27
Transcript_contig_89962 (89962)	0.54	0.82	0.13	0.15	0.24	0.16	0.26	1.0	0.15	0.23	0.12
Transcript_contig_90610 (90610)	0.53	0.94	0.1	0.13	0.3	0.07	0.07	1.0	0.03	0.21	0.07
Transcript_contig_90811 (90811)	0.69	1.0	0.15	0.13	0.14	0.36	0.37	0.87	0.06	0.58	0.31

Details

Expression values normalized per gene (using the maximum value, Green cells indicate low expression and red high. (Dark gray cells indicate missing values)