Heatmap: Cluster_235 (HCCA)

View as: (view raw or zlog-transformed)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are normalized against highest expression of the row)

Gene	CCAP211/11P,High light	CCAP211/11P,Low light	CPCC90,BBM,72h,Autotrophy	CPCC90,BBM,97h,Mixotrophy	CPCC90,BBM,98h,Mixotrophy	CPCC90,BBM,120h,Mixotrophy	CPCC90,BBM,144h,Heterotrophy	NJ-7,20C	NJ-7,4C	UTEX259,20C	UTEX259,4C
Transcript_contig_1023 (1023)	0.76	0.92	0.1	0.09	0.14	0.27	0.21	1.0	0.06	0.32	0.2
Transcript_contig_10982 (10982)	0.69	1.0	0.09	0.12	0.2	0.44	0.15	0.75	0.26	0.3	0.24
Transcript_contig_11023 (11023)	0.62	1.0	0.18	0.25	0.39	0.35	0.15	0.57	0.11	0.24	0.11
Transcript_contig_1198 (1198)	0.75	1.0	0.16	0.27	0.26	0.25	0.23	0.99	0.14	0.63	0.41
Transcript_contig_12034 (12034)	0.68	0.97	0.08	0.1	0.17	0.21	0.14	1.0	0.02	0.22	0.08
Transcript_contig_1329 (1329)	0.86	1.0	0.23	0.59	0.56	0.56	0.44	0.63	0.18	0.49	0.38
Transcript_contig_1872 (1872)	0.61	1.0	0.41	0.3	0.3	0.3	0.19	0.75	0.05	0.11	0.07
Transcript_contig_3889 (3889)	0.76	1.0	0.15	0.29	0.33	0.54	0.27	0.57	0.18	0.67	0.34
Transcript_contig_4203 (4203)	1.0	1.0	0.28	0.31	0.21	0.64	0.27	0.53	0.22	0.62	0.28
Transcript_contig_438 (438)	0.87	1.0	0.22	0.31	0.34	0.39	0.39	0.5	0.1	0.44	0.22
Transcript_contig_4536 (4536)	0.72	1.0	0.18	0.2	0.32	0.35	0.19	0.85	0.08	0.73	0.36
Transcript_contig_4593 (4593)	0.64	0.87	0.1	0.46	0.26	0.55	0.31	1.0	0.18	0.68	0.36
Transcript_contig_4709 (4709)	0.86	1.0	0.18	0.35	0.63	0.44	0.27	0.64	0.15	0.46	0.35
Transcript_contig_5306 (5306)	0.68	1.0	0.26	0.36	0.56	0.46	0.12	0.87	0.14	0.38	0.28
Transcript_contig_53781 (53781)	0.81	1.0	0.39	0.18	0.07	0.37	0.32	0.68	0.11	0.41	0.21
Transcript_contig_54348 (54348)	0.74	1.0	0.13	0.26	0.37	0.17	0.16	0.59	0.06	0.46	0.27
Transcript_contig_54803 (54803)	0.7	1.0	0.09	0.07	0.04	0.27	0.12	0.63	0.08	0.22	0.1
Transcript_contig_55309 (55309)	0.82	1.0	0.06	0.13	0.17	0.25	0.17	0.87	0.07	0.46	0.21
Transcript_contig_55342 (55342)	0.65	1.0	0.18	0.21	0.18	0.18	0.14	0.79	0.51	0.0	0.02
Transcript_contig_55356 (55356)	0.87	1.0	0.22	0.3	0.31	0.27	0.2	0.57	0.19	0.57	0.39
Transcript_contig_55689 (55689)	0.83	1.0	0.27	0.32	0.43	0.52	0.41	0.8	0.22	0.83	0.35
Transcript_contig_55737 (55737)	0.67	1.0	0.12	0.13	0.27	0.34	0.23	0.75	0.21	0.62	0.51
Transcript_contig_56638 (56638)	0.83	1.0	0.24	0.21	0.22	0.3	0.25	0.91	0.26	0.72	0.47
Transcript_contig_56664 (56664)	0.87	1.0	0.16	0.37	0.52	0.4	0.44	0.66	0.32	0.73	0.45
Transcript_contig_56774 (56774)	0.81	1.0	0.08	0.17	0.26	0.7	0.16	0.59	0.19	0.82	0.35
Transcript_contig_57127 (57127)	0.75	1.0	0.05	0.17	0.25	0.27	0.17	0.42	0.66	0.42	0.29
Transcript_contig_57136 (57136)	0.67	0.9	0.07	0.05	0.04	0.35	0.11	1.0	0.12	0.25	0.12
Transcript_contig_57193 (57193)	0.69	1.0	0.04	0.1	0.13	0.39	0.11	0.72	0.03	0.18	0.07
Transcript_contig_57296 (57296)	0.9	1.0	0.21	0.29	0.5	0.39	0.41	0.69	0.42	0.61	0.45
Transcript_contig_57761 (57761)	0.95	1.0	0.26	0.26	0.48	0.29	0.35	0.7	0.46	0.54	0.35
Transcript_contig_57841 (57841)	0.73	1.0	0.06	0.04	0.09	0.29	0.13	0.94	0.34	0.0	0.03
Transcript_contig_58667 (58667)	0.74	1.0	0.05	0.16	0.43	0.16	0.1	0.86	0.0	0.53	0.38
Transcript_contig_58737 (58737)	0.73	1.0	0.0	0.0	0.0	0.24	0.0	0.68	0.02	0.03	0.01
Transcript_contig_58862 (58862)	0.72	1.0	0.1	0.2	0.25	0.25	0.17	0.69	0.18	0.27	0.11
Transcript_contig_58945 (58945)	0.88	1.0	0.27	0.26	0.39	0.4	0.32	0.61	0.3	0.76	0.44
Transcript_contig_59456 (59456)	0.74	1.0	0.06	0.14	0.18	0.36	0.19	0.85	0.42	0.29	0.13
Transcript_contig_59800 (59800)	0.68	1.0	0.18	0.29	0.38	0.37	0.26	0.87	0.06	0.49	0.29
Transcript_contig_59864 (59864)	0.72	0.93	0.13	0.27	0.34	0.39	0.26	1.0	0.21	0.38	0.29
Transcript_contig_59879 (59879)	0.76	0.95	0.14	0.2	0.2	0.4	0.31	1.0	0.11	0.24	0.21
Transcript_contig_61632 (61632)	0.8	1.0	0.12	0.2	0.15	0.08	0.1	0.89	0.12	0.11	0.07
Transcript_contig_62603 (62603)	0.82	1.0	0.18	0.35	0.44	0.3	0.21	0.89	0.29	0.53	0.35
Transcript_contig_63347 (63347)	0.57	1.0	0.02	0.01	0.0	0.25	0.08	0.82	0.0	0.0	0.0
Transcript_contig_67542 (67542)	0.8	1.0	0.4	0.24	0.15	0.46	0.22	0.72	0.18	0.54	0.27
Transcript_contig_68225 (68225)	0.67	0.95	0.26	0.17	0.15	0.37	0.07	1.0	0.25	0.34	0.25
Transcript_contig_69032 (69032)	0.63	1.0	0.15	0.26	0.34	0.4	0.18	0.61	0.06	0.56	0.33
Transcript_contig_69095 (69095)	0.75	0.94	0.22	0.2	0.22	0.16	0.05	1.0	0.38	0.0	0.0
Transcript_contig_69503 (69503)	0.73	1.0	0.11	0.08	0.05	0.18	0.13	0.63	0.09	0.2	0.08
Transcript_contig_70132 (70132)	0.72	1.0	0.16	0.24	0.32	0.44	0.33	0.76	0.06	0.64	0.36
Transcript_contig_70269 (70269)	0.7	0.94	0.08	0.12	0.26	0.17	0.18	1.0	0.13	0.24	0.15
Transcript_contig_78712 (78712)	0.79	1.0	0.08	0.19	0.32	0.35	0.19	0.84	0.14	0.36	0.24
Transcript_contig_79343 (79343)	0.58	0.91	0.19	0.14	0.14	0.31	0.14	1.0	0.5	0.0	0.02
Transcript_contig_79805 (79805)	0.76	1.0	0.24	0.21	0.19	0.22	0.25	0.8	0.13	0.84	0.46
Transcript_contig_8033 (8033)	0.86	1.0	0.08	0.05	0.1	0.33	0.13	0.45	0.48	0.26	0.19
Transcript_contig_80830 (80830)	0.7	1.0	0.14	0.11	0.17	0.25	0.08	0.79	0.0	0.13	0.1
Transcript_contig_81 (81)	0.83	1.0	0.08	0.08	0.24	0.29	0.18	0.34	0.0	0.4	0.28
Transcript_contig_82427 (82427)	0.91	1.0	0.35	0.18	0.05	0.67	0.34	0.5	0.38	0.74	0.37
Transcript_contig_8392 (8392)	0.72	1.0	0.09	0.16	0.21	0.41	0.27	0.74	0.02	0.65	0.32
Transcript_contig_886 (886)	0.67	1.0	0.31	0.3	0.28	0.45	0.31	0.64	0.08	0.83	0.36
Transcript_contig_89203 (89203)	0.84	1.0	0.31	0.48	0.6	0.44	0.38	0.69	0.1	0.73	0.49
Transcript_contig_89396 (89396)	0.75	1.0	0.15	0.27	0.27	0.28	0.34	0.77	0.16	0.73	0.49
Transcript_contig_89519 (89519)	0.91	1.0	0.19	0.29	0.37	0.38	0.33	0.58	0.33	0.57	0.35
Transcript_contig_90342 (90342)	0.87	1.0	0.25	0.3	0.46	0.39	0.28	0.69	0.13	0.72	0.4
Transcript_contig_90832 (90832)	0.46	0.73	0.12	0.16	0.14	0.28	0.21	1.0	0.24	0.1	0.1
Transcript_contig_91207 (91207)	0.41	0.75	0.08	0.18	0.23	0.23	0.07	1.0	0.25	0.07	0.09

Details

Expression values normalized per gene (using the maximum value, Green cells indicate low expression and red high. (Dark gray cells indicate missing values)