Heatmap: Cluster_137 (HCCA)

View as: (view raw or zlog-transformed)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are normalized against highest expression of the row)

Gene	Light - ZT1	Light - ZT3	Light - ZT5	Light - ZT7	Light - ZT9	Light - ZT11	Light - ZT13	Light - ZT15	Dark - ZT17	Dark - ZT19	Dark - ZT21	Dark - ZT23	Light - ZT25	Nutrient stress - Low nitrogen - 10%	Nutrient stress - Low phosphate - 0%	Nutrient stress - Low sulfate - 2%	Nutrient stress - Low micronutrients - 0%	Nutrient stress - NaCl - 75 mM	Nutrient stress - Mannitol - 100 mM	Nutrient stress - Control	Environmental stress - Prolonged darkness - 72h	Environmental stress - Cold - 4C	Environmental stress - Heat - 37C	Environmental stress - Control	Environmental stress - High light - 150 uE	Environmental stress - Control high light - 40 uE
Cpa\|evm.model.tig00000076.134 (tig00000076_g2428.t1)	0.29	0.24	0.25	0.35	0.37	0.24	0.33	0.34	0.35	0.27	0.33	0.26	0.3	0.27	0.27	0.54	0.12	0.3	0.22	0.14	0.23	1.0	0.38	0.47	0.56	0.41
Cpa\|evm.model.tig00000093.42 (tig00000093_g3478.t1)	0.24	0.19	0.12	0.23	0.16	0.08	0.17	0.2	0.2	0.27	0.22	0.24	0.18	0.22	0.18	0.19	0.12	0.19	0.19	0.09	0.16	1.0	0.22	0.24	0.6	0.32
Cpa\|evm.model.tig00000144.189 (tig00000144_g9185.t1)	0.19	0.23	0.22	0.32	0.31	0.14	0.1	0.09	0.06	0.07	0.08	0.07	0.18	0.25	0.17	0.26	0.15	0.13	0.16	0.08	0.28	1.0	0.2	0.17	0.25	0.23
Cpa\|evm.model.tig00000178.21 (tig00000178_g12732.t1)	0.02	0.05	0.13	0.09	0.11	0.17	0.21	0.2	0.26	0.2	0.19	0.25	0.08	0.12	0.07	0.07	0.15	0.1	0.09	0.09	0.05	1.0	0.12	0.08	0.28	0.17
Cpa\|evm.model.tig00000178.37 (tig00000178_g12745.t1)	0.65	0.67	0.46	0.61	0.55	0.32	0.45	0.56	0.49	0.52	0.64	0.53	0.65	0.43	0.19	0.3	0.23	0.43	0.24	0.17	0.12	0.83	0.3	0.53	1.0	0.62
Cpa\|evm.model.tig00000246.5 (tig00000246_g21498.t1)	0.26	0.23	0.28	0.33	0.24	0.23	0.18	0.2	0.19	0.14	0.19	0.21	0.24	0.18	0.08	0.1	0.17	0.11	0.11	0.09	0.07	0.51	0.04	0.21	1.0	0.48
Cpa\|evm.model.tig00000246.6 (tig00000246_g21498.t1)	0.34	0.33	0.33	0.44	0.35	0.21	0.23	0.27	0.23	0.23	0.32	0.33	0.33	0.27	0.11	0.17	0.24	0.24	0.19	0.14	0.08	0.67	0.07	0.25	1.0	0.56
Cpa\|evm.model.tig00000246.7 (tig00000246_g21498.t1)	0.34	0.34	0.24	0.47	0.36	0.17	0.25	0.3	0.23	0.24	0.35	0.31	0.33	0.28	0.11	0.17	0.25	0.29	0.2	0.15	0.11	0.8	0.08	0.25	1.0	0.47
Cpa\|evm.model.tig00000361.30 (tig00000361_g24382.t1)	0.9	0.64	0.63	0.66	0.49	0.38	0.53	0.65	0.51	0.59	0.61	0.64	0.91	0.5	0.39	0.51	0.49	0.49	0.44	0.45	0.18	1.0	0.34	0.36	0.99	0.7
Cpa\|evm.model.tig00000361.35 (tig00000361_g24385.t1)	0.41	0.24	0.27	0.26	0.32	0.31	0.32	0.29	0.18	0.23	0.25	0.32	0.5	0.29	0.3	0.31	0.33	0.37	0.28	0.32	0.3	1.0	0.39	0.25	0.4	0.42
Cpa\|evm.model.tig00000403.65 (tig00000403_g324.t1)	0.53	0.45	0.44	0.44	0.38	0.23	0.25	0.27	0.22	0.21	0.28	0.29	0.49	0.35	0.55	0.41	0.37	0.58	0.46	0.24	0.37	0.99	0.38	0.65	1.0	0.66
Cpa\|evm.model.tig00000449.14 (tig00000449_g940.t1)	0.29	0.15	0.18	0.2	0.17	0.15	0.15	0.18	0.12	0.14	0.16	0.12	0.22	0.24	0.18	0.25	0.14	0.21	0.18	0.16	0.19	1.0	0.25	0.24	0.33	0.35
Cpa\|evm.model.tig00000507.13 (tig00000507_g1765.t1)	0.65	0.43	0.33	0.36	0.34	0.27	0.37	0.38	0.28	0.32	0.34	0.36	0.74	0.28	0.21	0.29	0.28	0.36	0.22	0.25	0.1	0.73	0.26	0.28	1.0	0.49
Cpa\|evm.model.tig00000624.17 (tig00000624_g2659.t1)	0.01	0.0	0.0	0.01	0.01	0.0	0.0	0.01	0.01	0.0	0.01	0.01	0.0	0.0	0.01	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.17	1.0	0.03	0.07	0.14	0.03
Cpa\|evm.model.tig00000655.44 (tig00000655_g2869.t1)	0.33	0.4	0.29	0.46	0.45	0.34	0.34	0.33	0.28	0.26	0.3	0.31	0.43	0.23	0.14	0.26	0.15	0.23	0.16	0.16	0.04	0.76	0.31	0.23	1.0	0.55
Cpa\|evm.model.tig00000823.13 (tig00000823_g4541.t1)	0.66	0.65	0.73	0.69	0.57	0.5	0.43	0.54	0.43	0.38	0.42	0.55	0.61	0.32	0.42	0.55	0.57	0.56	0.45	0.4	0.85	1.0	0.49	0.88	0.77	0.79
Cpa\|evm.model.tig00000849.41 (tig00000849_g4780.t1)	0.08	0.03	0.04	0.06	0.07	0.07	0.06	0.07	0.07	0.06	0.08	0.04	0.06	0.06	0.06	0.05	0.05	0.1	0.1	0.04	0.04	1.0	0.19	0.1	0.24	0.11
Cpa\|evm.model.tig00000912.43 (tig00000912_g5448.t1)	0.25	0.1	0.07	0.13	0.07	0.19	0.11	0.14	0.14	0.18	0.12	0.1	0.2	0.01	0.03	0.06	0.02	0.06	0.02	0.06	0.06	1.0	0.2	0.08	0.43	0.13
Cpa\|evm.model.tig00001000.3 (tig00001000_g6164.t1)	0.15	0.0	0.04	0.3	0.12	0.1	0.1	0.13	0.19	0.21	0.14	0.1	0.12	0.01	0.02	0.02	0.0	0.13	0.02	0.03	0.04	1.0	0.4	0.06	0.88	0.24
Cpa\|evm.model.tig00001094.12 (tig00001094_g6983.t1)	0.23	0.24	0.25	0.27	0.28	0.22	0.2	0.19	0.15	0.15	0.17	0.18	0.19	0.2	0.14	0.18	0.14	0.22	0.17	0.15	0.11	1.0	0.24	0.17	0.4	0.32
Cpa\|evm.model.tig00001127.28 (tig00001127_g7161.t1)	0.22	0.06	0.05	0.3	0.12	0.03	0.09	0.16	0.1	0.11	0.16	0.07	0.03	0.02	0.05	0.02	0.03	0.09	0.06	0.03	0.02	1.0	0.07	0.35	0.94	0.43
Cpa\|evm.model.tig00001181.32 (tig00001181_g7445.t1)	0.25	0.33	0.32	0.39	0.35	0.24	0.28	0.32	0.3	0.31	0.35	0.28	0.2	0.21	0.17	0.3	0.17	0.37	0.27	0.19	0.17	1.0	0.44	0.5	0.5	0.51
Cpa\|evm.model.tig00001355.13 (tig00001355_g8351.t1)	0.16	0.37	0.29	0.3	0.11	0.09	0.15	0.14	0.18	0.25	0.37	0.32	0.18	0.17	0.15	0.29	0.19	0.27	0.18	0.12	0.09	1.0	0.38	0.22	0.45	0.3
Cpa\|evm.model.tig00001366.3 (tig00001366_g8378.t1)	0.15	0.14	0.22	0.37	0.35	0.23	0.07	0.1	0.13	0.1	0.13	0.14	0.14	0.12	0.03	0.21	0.09	0.11	0.09	0.07	0.05	1.0	0.27	0.43	0.41	0.31
Cpa\|evm.model.tig00001415.17 (tig00001415_g8685.t1)	0.07	0.03	0.04	0.15	0.12	0.05	0.02	0.03	0.01	0.02	0.03	0.02	0.07	0.03	0.01	0.02	0.02	0.01	0.0	0.0	0.02	1.0	0.06	0.04	0.35	0.1
Cpa\|evm.model.tig00001493.11 (tig00001493_g8986.t1)	0.16	0.21	0.22	0.39	0.53	0.04	0.26	0.11	0.04	0.15	0.11	0.2	0.11	0.08	0.02	0.01	0.02	0.02	0.0	0.03	0.04	0.37	0.12	0.18	1.0	0.63
Cpa\|evm.model.tig00020553.111 (tig00020553_g10597.t1)	0.77	0.57	0.61	0.65	0.44	0.26	0.33	0.51	0.34	0.43	0.58	0.84	0.83	0.28	0.22	0.18	0.28	0.31	0.29	0.26	0.1	0.99	0.3	0.37	1.0	0.61
Cpa\|evm.model.tig00020556.37 (tig00020556_g11005.t1)	0.12	0.13	0.05	0.4	0.2	0.16	0.11	0.25	0.29	0.18	0.32	0.23	0.23	0.05	0.03	0.03	0.02	0.16	0.03	0.04	0.02	1.0	0.15	0.12	0.78	0.27
Cpa\|evm.model.tig00020556.8 (tig00020556_g10979.t1)	0.47	0.42	0.34	0.49	0.41	0.23	0.31	0.37	0.35	0.44	0.55	0.51	0.56	0.34	0.18	0.31	0.31	0.34	0.22	0.2	0.12	0.8	0.31	0.39	1.0	0.48
Cpa\|evm.model.tig00020563.68 (tig00020563_g11243.t1)	0.1	0.16	0.08	0.36	0.31	0.14	0.19	0.31	0.39	0.45	0.47	0.36	0.13	0.11	0.09	0.05	0.04	0.18	0.07	0.05	0.08	0.97	0.27	0.89	1.0	0.68
Cpa\|evm.model.tig00020572.36 (tig00020572_g11556.t1)	0.35	0.34	0.33	0.45	0.5	0.34	0.42	0.42	0.41	0.32	0.43	0.44	0.4	0.33	0.19	0.4	0.18	0.31	0.22	0.17	0.06	0.9	0.52	0.57	1.0	0.55
Cpa\|evm.model.tig00020629.37 (tig00020629_g12359.t1)	0.05	0.09	0.11	0.17	0.18	0.14	0.14	0.15	0.12	0.1	0.13	0.1	0.05	0.15	0.17	0.17	0.09	0.23	0.18	0.08	0.12	1.0	0.29	0.17	0.28	0.24
Cpa\|evm.model.tig00020704.35 (tig00020704_g13177.t1)	0.34	0.31	0.35	0.47	0.46	0.42	0.46	0.47	0.37	0.47	0.43	0.4	0.35	0.44	0.22	0.29	0.28	0.34	0.3	0.2	0.1	0.82	0.52	0.42	1.0	0.43
Cpa\|evm.model.tig00020816.20 (tig00020816_g14105.t1)	0.31	0.14	0.16	0.29	0.22	0.19	0.22	0.32	0.28	0.3	0.34	0.26	0.27	0.1	0.06	0.12	0.05	0.12	0.04	0.06	0.2	0.74	0.27	0.7	1.0	0.43
Cpa\|evm.model.tig00020816.69 (tig00020816_g14157.t1)	0.42	0.42	0.44	0.45	0.32	0.24	0.25	0.27	0.27	0.25	0.32	0.4	0.37	0.48	0.57	0.32	0.55	0.39	0.39	0.41	0.55	1.0	0.43	0.67	0.72	0.67
Cpa\|evm.model.tig00020816.89 (tig00020816_g14180.t1)	0.4	0.38	0.38	0.38	0.27	0.15	0.18	0.19	0.15	0.23	0.23	0.3	0.37	0.32	0.47	0.29	0.35	0.45	0.29	0.31	0.31	1.0	0.49	0.66	0.76	0.65
Cpa\|evm.model.tig00020927.64 (tig00020927_g15997.t1)	0.13	0.17	0.17	0.15	0.12	0.11	0.18	0.16	0.15	0.13	0.12	0.13	0.14	0.18	0.1	0.21	0.1	0.21	0.25	0.1	0.22	1.0	0.3	0.15	0.22	0.27
Cpa\|evm.model.tig00020934.1 (tig00020934_g16072.t1)	0.07	0.08	0.13	0.16	0.14	0.08	0.07	0.06	0.04	0.06	0.07	0.06	0.05	0.08	0.06	0.12	0.03	0.12	0.08	0.08	0.12	1.0	0.15	0.25	0.54	0.42
Cpa\|evm.model.tig00021013.36 (tig00021013_g17081.t1)	0.12	0.04	0.03	0.16	0.15	0.07	0.11	0.13	0.16	0.17	0.21	0.16	0.11	0.05	0.02	0.05	0.03	0.04	0.02	0.0	0.14	1.0	0.17	0.13	0.4	0.14
Cpa\|evm.model.tig00021038.76 (tig00021038_g17566.t1)	0.25	0.15	0.11	0.26	0.23	0.15	0.18	0.21	0.24	0.23	0.27	0.24	0.2	0.23	0.16	0.2	0.13	0.2	0.15	0.12	0.2	1.0	0.46	0.32	0.73	0.39
Cpa\|evm.model.tig00021070.42 (tig00000310_g23978.t1)	0.47	0.35	0.44	0.49	0.41	0.39	0.38	0.46	0.49	0.29	0.48	0.42	0.43	0.33	0.23	0.39	0.22	0.33	0.29	0.22	0.13	0.65	0.36	0.29	1.0	0.69
Cpa\|evm.model.tig00021096.8 (tig00021096_g18130.t1)	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	1.0	0.0	0.0	0.0	0.0
Cpa\|evm.model.tig00021135.33 (tig00021135_g18952.t1)	0.26	0.15	0.15	0.14	0.08	0.04	0.03	0.04	0.03	0.03	0.05	0.11	0.32	0.18	0.14	0.12	0.09	0.07	0.05	0.04	0.14	1.0	0.21	0.17	0.14	0.16
Cpa\|evm.model.tig00021137.20 (tig00021137_g18985.t1)	0.29	0.37	0.45	0.67	0.58	0.26	0.22	0.25	0.14	0.26	0.3	0.26	0.29	0.21	0.1	0.21	0.19	0.23	0.18	0.22	0.12	1.0	0.38	0.47	0.7	0.58
Cpa\|evm.model.tig00021254.30 (tig00021254_g19710.t1)	0.1	0.06	0.04	0.21	0.11	0.02	0.11	0.12	0.2	0.09	0.24	0.13	0.0	0.06	0.04	0.05	0.03	0.19	0.05	0.02	0.02	1.0	0.11	0.23	0.57	0.27
Cpa\|evm.model.tig00021339.24 (tig00021339_g20402.t1)	0.19	0.25	0.27	0.32	0.28	0.16	0.19	0.22	0.14	0.14	0.13	0.14	0.17	0.24	0.16	0.27	0.09	0.2	0.18	0.12	0.33	1.0	0.17	0.22	0.29	0.48
Cpa\|evm.model.tig00021348.36 (tig00021348_g20539.t1)	0.22	0.18	0.22	0.2	0.11	0.05	0.08	0.14	0.06	0.08	0.07	0.06	0.16	0.07	0.08	0.17	0.04	0.17	0.16	0.13	0.2	1.0	0.06	0.12	0.16	0.38
Cpa\|evm.model.tig00021537.49 (tig00021537_g22301.t1)	0.24	0.35	0.36	0.43	0.39	0.23	0.17	0.16	0.11	0.12	0.14	0.17	0.26	0.11	0.09	0.13	0.19	0.41	0.12	0.16	0.17	1.0	0.32	0.2	0.76	0.48
Cpa\|evm.model.tig00021796.11	0.1	0.03	0.02	0.16	0.13	0.05	0.05	0.14	0.15	0.13	0.15	0.08	0.01	0.03	0.03	0.04	0.03	0.06	0.05	0.01	0.13	0.68	0.3	0.69	1.0	0.46

Details

Expression values normalized per gene (using the maximum value, Green cells indicate low expression and red high. (Dark gray cells indicate missing values)