Heatmap: Cluster_249 (HCCA)

View as: (view raw or zlog-transformed)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are normalized against highest expression of the row)

Gene	CCAP211/11P,High light	CCAP211/11P,Low light	CPCC90,BBM,72h,Autotrophy	CPCC90,BBM,97h,Mixotrophy	CPCC90,BBM,98h,Mixotrophy	CPCC90,BBM,120h,Mixotrophy	CPCC90,BBM,144h,Heterotrophy	NJ-7,20C	NJ-7,4C	UTEX259,20C	UTEX259,4C
Transcript_contig_10056 (10056)	0.87	1.0	0.27	0.16	0.02	0.18	0.48	0.61	0.13	0.1	0.12
Transcript_contig_153 (153)	0.66	1.0	0.37	0.3	0.29	0.14	0.33	0.84	0.02	0.01	0.06
Transcript_contig_2560 (2560)	0.71	0.94	0.26	0.22	0.15	0.19	0.36	1.0	0.21	0.07	0.12
Transcript_contig_27104 (27104)	0.67	0.96	0.26	0.2	0.0	0.17	0.14	1.0	0.05	0.06	0.05
Transcript_contig_3066 (3066)	0.75	1.0	0.59	0.46	0.43	0.17	0.62	0.9	0.03	0.1	0.06
Transcript_contig_4799 (4799)	0.8	1.0	0.29	0.05	0.0	0.05	0.05	0.66	0.06	0.1	0.06
Transcript_contig_53700 (53700)	0.57	0.79	0.52	0.33	0.28	0.25	0.56	1.0	0.02	0.16	0.14
Transcript_contig_54038 (54038)	0.8	1.0	0.5	0.37	0.26	0.3	0.49	0.83	0.13	0.22	0.26
Transcript_contig_54184 (54184)	0.79	0.95	0.49	0.3	0.24	0.18	0.51	1.0	0.08	0.12	0.11
Transcript_contig_54226 (54226)	0.73	1.0	0.17	0.15	0.25	0.35	0.52	0.81	0.07	0.16	0.13
Transcript_contig_54306 (54306)	0.84	1.0	0.72	0.5	0.38	0.35	0.68	0.74	0.07	0.04	0.05
Transcript_contig_5446 (5446)	0.83	1.0	0.26	0.2	0.24	0.2	0.41	0.93	0.0	0.23	0.13
Transcript_contig_54780 (54780)	0.72	0.92	0.26	0.25	0.2	0.18	0.34	1.0	0.24	0.15	0.12
Transcript_contig_55069 (55069)	0.71	1.0	0.28	0.24	0.22	0.19	0.43	0.97	0.41	0.23	0.17
Transcript_contig_55199 (55199)	0.75	1.0	0.37	0.23	0.2	0.2	0.44	0.83	0.07	0.09	0.1
Transcript_contig_55214 (55214)	0.76	1.0	0.22	0.24	0.23	0.27	0.51	0.79	0.12	0.23	0.16
Transcript_contig_55312 (55312)	0.81	1.0	0.4	0.36	0.32	0.29	0.53	0.82	0.9	0.01	0.07
Transcript_contig_55476 (55476)	0.7	1.0	0.22	0.22	0.33	0.26	0.32	0.99	0.08	0.18	0.11
Transcript_contig_56105 (56105)	0.82	1.0	0.34	0.18	0.06	0.15	0.4	0.69	0.14	0.12	0.09
Transcript_contig_56127 (56127)	0.73	1.0	0.18	0.09	0.11	0.14	0.37	0.77	0.24	0.07	0.08
Transcript_contig_56283 (56283)	0.78	1.0	0.23	0.21	0.2	0.24	0.45	0.88	0.03	0.2	0.11
Transcript_contig_56291 (56291)	0.71	1.0	0.27	0.27	0.27	0.3	0.61	0.75	0.05	0.07	0.13
Transcript_contig_56313 (56313)	0.74	1.0	0.31	0.34	0.48	0.23	0.5	0.87	0.25	0.18	0.11
Transcript_contig_56539 (56539)	0.74	1.0	0.39	0.36	0.34	0.35	0.49	0.99	0.15	0.22	0.18
Transcript_contig_56549 (56549)	0.69	1.0	0.27	0.23	0.15	0.13	0.28	0.68	0.07	0.05	0.09
Transcript_contig_56566 (56566)	0.68	1.0	0.28	0.2	0.13	0.2	0.49	0.69	0.04	0.12	0.04
Transcript_contig_56645 (56645)	0.72	1.0	0.11	0.2	0.22	0.2	0.36	0.96	0.34	0.17	0.11
Transcript_contig_56707 (56707)	0.75	1.0	0.12	0.27	0.36	0.15	0.3	0.71	0.01	0.11	0.12
Transcript_contig_57144 (57144)	0.72	1.0	0.15	0.17	0.25	0.2	0.4	0.93	0.13	0.22	0.09
Transcript_contig_57618 (57618)	0.98	1.0	0.31	0.24	0.03	0.19	0.31	0.73	0.17	0.17	0.12
Transcript_contig_57699 (57699)	0.65	1.0	0.31	0.23	0.21	0.19	0.25	0.57	0.03	0.07	0.07
Transcript_contig_58195 (58195)	0.81	1.0	0.43	0.33	0.29	0.27	0.49	0.84	0.08	0.24	0.16
Transcript_contig_58325 (58325)	0.74	1.0	0.19	0.18	0.18	0.25	0.38	0.92	0.41	0.18	0.11
Transcript_contig_59089 (59089)	0.7	1.0	0.31	0.18	0.19	0.18	0.3	0.9	0.0	0.08	0.12
Transcript_contig_59181 (59181)	0.83	1.0	0.69	0.44	0.46	0.31	0.75	0.94	0.19	0.16	0.19
Transcript_contig_59228 (59228)	0.77	1.0	0.42	0.43	0.31	0.26	0.49	0.87	0.17	0.15	0.11
Transcript_contig_59241 (59241)	0.82	1.0	0.4	0.47	0.46	0.36	0.61	0.81	0.26	0.1	0.14
Transcript_contig_59804 (59804)	0.85	1.0	0.44	0.14	0.02	0.18	0.47	0.9	0.04	0.06	0.05
Transcript_contig_60147 (60147)	0.75	1.0	0.46	0.34	0.27	0.24	0.42	0.77	0.55	0.06	0.07
Transcript_contig_60747 (60747)	0.65	1.0	0.28	0.17	0.12	0.19	0.44	0.75	0.0	0.0	0.06
Transcript_contig_60878 (60878)	0.73	1.0	0.5	0.35	0.33	0.25	0.65	0.82	0.03	0.09	0.06
Transcript_contig_62211 (62211)	0.72	1.0	0.04	0.15	0.0	0.11	0.15	0.8	0.06	0.07	0.02
Transcript_contig_62251 (62251)	0.61	1.0	0.33	0.06	0.09	0.16	0.46	0.88	0.11	0.08	0.12
Transcript_contig_78627 (78627)	0.7	0.98	0.2	0.2	0.27	0.11	0.31	1.0	0.1	0.17	0.17
Transcript_contig_78652 (78652)	0.84	1.0	0.61	0.38	0.23	0.28	0.58	0.76	0.12	0.25	0.19
Transcript_contig_7896 (7896)	0.73	1.0	0.46	0.23	0.2	0.25	0.46	0.58	0.15	0.11	0.08
Transcript_contig_78980 (78980)	0.82	1.0	0.45	0.38	0.28	0.24	0.72	0.83	0.08	0.12	0.14
Transcript_contig_79140 (79140)	0.74	0.96	0.34	0.41	0.47	0.33	0.61	1.0	0.13	0.15	0.1
Transcript_contig_79855 (79855)	0.67	1.0	0.25	0.21	0.33	0.17	0.25	0.83	0.05	0.03	0.03
Transcript_contig_80237 (80237)	0.75	1.0	0.23	0.26	0.19	0.27	0.43	0.77	0.06	0.2	0.16
Transcript_contig_80389 (80389)	0.69	1.0	0.32	0.28	0.26	0.34	0.53	0.85	0.79	0.0	0.06
Transcript_contig_806 (806)	0.99	1.0	0.43	0.39	0.34	0.32	0.7	0.87	0.26	0.13	0.16
Transcript_contig_80737 (80737)	0.79	1.0	0.12	0.2	0.05	0.19	0.22	0.65	0.0	0.12	0.07
Transcript_contig_82081 (82081)	0.67	1.0	0.43	0.34	0.23	0.24	0.62	0.73	0.23	0.15	0.12
Transcript_contig_83515 (83515)	0.74	1.0	0.3	0.16	0.31	0.35	0.7	0.58	0.04	0.13	0.09
Transcript_contig_89205 (89205)	0.77	1.0	0.33	0.28	0.27	0.19	0.42	0.86	0.19	0.11	0.07
Transcript_contig_89413 (89413)	0.61	1.0	0.24	0.3	0.19	0.2	0.57	0.91	0.13	0.07	0.08
Transcript_contig_89525 (89525)	0.54	0.79	0.35	0.36	0.33	0.24	0.37	1.0	0.09	0.06	0.08
Transcript_contig_89548 (89548)	0.72	1.0	0.18	0.25	0.33	0.18	0.34	0.93	0.25	0.08	0.11
Transcript_contig_89549 (89549)	0.79	1.0	0.27	0.3	0.3	0.32	0.66	0.75	0.13	0.28	0.17
Transcript_contig_89572 (89572)	0.76	1.0	0.27	0.17	0.1	0.21	0.41	0.91	0.37	0.17	0.14
Transcript_contig_90331 (90331)	0.71	0.92	0.46	0.26	0.15	0.2	0.46	1.0	0.0	0.02	0.03

Details

Expression values normalized per gene (using the maximum value, Green cells indicate low expression and red high. (Dark gray cells indicate missing values)