Heatmap: Cluster_239 (HCCA)

View as: (view raw or zlog-transformed)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are normalized against highest expression of the row)

Gene	CCAP211/11P,High light	CCAP211/11P,Low light	CPCC90,BBM,72h,Autotrophy	CPCC90,BBM,97h,Mixotrophy	CPCC90,BBM,98h,Mixotrophy	CPCC90,BBM,120h,Mixotrophy	CPCC90,BBM,144h,Heterotrophy	NJ-7,20C	NJ-7,4C	UTEX259,20C	UTEX259,4C
Transcript_contig_1608 (1608)	0.67	0.86	0.29	0.34	0.43	0.34	0.43	1.0	0.18	0.31	0.17
Transcript_contig_1950 (1950)	0.58	0.84	0.17	0.21	0.27	0.21	0.31	1.0	0.05	0.17	0.19
Transcript_contig_2003 (2003)	0.48	0.77	0.3	0.25	0.33	0.24	0.48	1.0	0.25	0.4	0.2
Transcript_contig_3654 (3654)	0.71	1.0	0.03	0.06	0.05	0.2	0.07	0.5	0.22	0.07	0.03
Transcript_contig_3655 (3655)	0.68	0.9	0.11	0.21	0.25	0.18	0.21	1.0	0.33	0.16	0.16
Transcript_contig_5054 (5054)	0.83	1.0	0.16	0.24	0.38	0.27	0.25	0.89	0.28	0.49	0.23
Transcript_contig_53747 (53747)	0.56	0.92	0.14	0.17	0.2	0.16	0.29	1.0	0.12	0.16	0.1
Transcript_contig_53922 (53922)	0.77	1.0	0.24	0.31	0.35	0.14	0.33	0.79	0.37	0.38	0.27
Transcript_contig_54403 (54403)	0.79	1.0	0.18	0.36	0.35	0.28	0.38	0.67	0.07	0.38	0.23
Transcript_contig_54528 (54528)	0.51	0.82	0.15	0.23	0.4	0.17	0.29	1.0	0.05	0.12	0.08
Transcript_contig_54619 (54619)	0.77	1.0	0.66	0.49	0.53	0.34	0.46	0.9	0.38	0.55	0.36
Transcript_contig_54906 (54906)	0.83	1.0	0.2	0.33	0.41	0.27	0.49	0.88	0.25	0.35	0.2
Transcript_contig_55 (55)	0.64	0.97	0.44	0.36	0.5	0.35	0.53	1.0	0.12	0.4	0.16
Transcript_contig_55075 (55075)	0.67	0.89	0.27	0.41	0.43	0.28	0.42	1.0	0.08	0.39	0.22
Transcript_contig_55474 (55474)	0.73	1.0	0.13	0.14	0.13	0.31	0.33	0.76	0.14	0.27	0.12
Transcript_contig_55842 (55842)	0.68	0.91	0.14	0.32	0.4	0.18	0.29	1.0	0.11	0.08	0.1
Transcript_contig_55847 (55847)	0.76	1.0	0.28	0.33	0.39	0.3	0.46	0.75	0.12	0.42	0.22
Transcript_contig_56043 (56043)	0.75	1.0	0.51	0.46	0.5	0.39	0.51	0.82	0.08	0.47	0.29
Transcript_contig_56048 (56048)	0.68	0.94	0.12	0.31	0.45	0.15	0.24	1.0	0.1	0.19	0.1
Transcript_contig_56173 (56173)	0.81	1.0	0.12	0.04	0.01	0.12	0.08	0.66	0.37	0.1	0.12
Transcript_contig_56216 (56216)	0.71	0.99	0.21	0.26	0.42	0.14	0.34	1.0	0.0	0.1	0.07
Transcript_contig_56281 (56281)	0.85	1.0	0.23	0.36	0.56	0.31	0.48	0.99	0.33	0.36	0.26
Transcript_contig_56298 (56298)	0.79	1.0	0.25	0.41	0.35	0.34	0.36	0.97	0.31	0.29	0.21
Transcript_contig_56438 (56438)	0.73	1.0	0.18	0.25	0.38	0.3	0.34	0.81	0.08	0.29	0.15
Transcript_contig_5686 (5686)	0.8	1.0	0.39	0.42	0.36	0.28	0.42	0.97	0.19	0.35	0.22
Transcript_contig_56963 (56963)	0.66	1.0	0.22	0.3	0.45	0.25	0.4	0.99	0.02	0.27	0.19
Transcript_contig_57007 (57007)	0.65	0.94	0.23	0.26	0.36	0.25	0.38	1.0	0.07	0.17	0.14
Transcript_contig_57245 (57245)	0.61	0.95	0.06	0.09	0.08	0.24	0.08	1.0	0.07	0.39	0.16
Transcript_contig_58068 (58068)	0.71	1.0	0.28	0.23	0.17	0.25	0.3	0.91	0.31	0.41	0.26
Transcript_contig_58464 (58464)	0.78	1.0	0.13	0.21	0.25	0.18	0.36	0.93	0.11	0.33	0.22
Transcript_contig_58484 (58484)	0.7	1.0	0.2	0.26	0.42	0.24	0.37	0.92	0.13	0.44	0.22
Transcript_contig_58990 (58990)	0.6	1.0	0.11	0.2	0.24	0.21	0.25	0.88	0.29	0.19	0.13
Transcript_contig_59132 (59132)	0.62	0.93	0.17	0.19	0.28	0.19	0.26	1.0	0.02	0.19	0.14
Transcript_contig_59239 (59239)	0.76	1.0	0.21	0.19	0.21	0.33	0.27	0.88	0.22	0.45	0.21
Transcript_contig_59240 (59240)	0.74	1.0	0.25	0.17	0.15	0.35	0.28	0.84	0.02	0.42	0.27
Transcript_contig_59281 (59281)	0.78	1.0	0.33	0.41	0.39	0.27	0.48	0.92	0.08	0.23	0.14
Transcript_contig_59328 (59328)	0.52	0.79	0.12	0.17	0.28	0.15	0.25	1.0	0.08	0.2	0.13
Transcript_contig_59473 (59473)	0.63	0.92	0.11	0.27	0.3	0.22	0.2	1.0	0.08	0.26	0.16
Transcript_contig_59573 (59573)	0.73	1.0	0.16	0.14	0.1	0.32	0.19	0.9	0.26	0.5	0.22
Transcript_contig_59911 (59911)	0.66	1.0	0.2	0.32	0.35	0.28	0.32	0.92	0.1	0.24	0.14
Transcript_contig_60037 (60037)	0.68	1.0	0.25	0.32	0.32	0.22	0.35	0.83	0.09	0.26	0.16
Transcript_contig_60282 (60282)	0.62	0.92	0.13	0.27	0.44	0.19	0.31	1.0	0.01	0.19	0.13
Transcript_contig_61298 (61298)	0.54	0.92	0.09	0.16	0.25	0.14	0.15	1.0	0.04	0.11	0.09
Transcript_contig_62154 (62154)	0.58	0.87	0.17	0.33	0.35	0.25	0.26	1.0	0.09	0.23	0.21
Transcript_contig_62200 (62200)	0.51	0.77	0.23	0.22	0.28	0.15	0.36	1.0	0.0	0.23	0.14
Transcript_contig_62356 (62356)	0.71	0.92	0.36	0.39	0.38	0.24	0.4	1.0	0.03	0.22	0.17
Transcript_contig_67475 (67475)	0.74	1.0	0.14	0.22	0.22	0.2	0.18	0.76	0.14	0.13	0.07
Transcript_contig_67956 (67956)	0.7	0.86	0.27	0.17	0.2	0.22	0.29	1.0	0.08	0.4	0.18
Transcript_contig_69348 (69348)	0.68	0.95	0.24	0.27	0.32	0.16	0.25	1.0	0.02	0.26	0.17
Transcript_contig_78245 (78245)	0.7	1.0	0.21	0.25	0.29	0.38	0.33	0.83	0.09	0.41	0.23
Transcript_contig_78283 (78283)	0.64	0.9	0.22	0.25	0.41	0.24	0.32	1.0	0.14	0.36	0.23
Transcript_contig_78682 (78682)	0.65	1.0	0.14	0.21	0.21	0.32	0.33	0.77	0.16	0.45	0.21
Transcript_contig_78806 (78806)	0.48	0.81	0.14	0.16	0.17	0.15	0.26	1.0	0.06	0.17	0.12
Transcript_contig_78948 (78948)	0.62	0.98	0.15	0.19	0.33	0.17	0.35	1.0	0.07	0.26	0.18
Transcript_contig_79278 (79278)	0.76	1.0	0.17	0.09	0.09	0.12	0.12	0.57	0.54	0.11	0.08
Transcript_contig_79506 (79506)	0.72	0.86	0.41	0.4	0.43	0.35	0.51	1.0	0.17	0.48	0.31
Transcript_contig_8060 (8060)	0.64	0.93	0.07	0.16	0.27	0.19	0.23	1.0	0.36	0.12	0.12
Transcript_contig_82861 (82861)	0.7	1.0	0.24	0.23	0.31	0.29	0.33	0.59	0.19	0.44	0.29
Transcript_contig_82991 (82991)	0.52	0.8	0.29	0.27	0.26	0.13	0.25	1.0	0.0	0.18	0.1
Transcript_contig_83730 (83730)	0.66	1.0	0.09	0.18	0.11	0.31	0.25	0.74	0.33	0.37	0.18
Transcript_contig_89151 (89151)	0.67	1.0	0.21	0.27	0.31	0.25	0.28	0.97	0.26	0.22	0.14
Transcript_contig_89208 (89208)	0.74	1.0	0.24	0.31	0.36	0.25	0.33	0.86	0.33	0.5	0.33
Transcript_contig_89409 (89409)	0.61	0.96	0.18	0.3	0.38	0.19	0.33	1.0	0.13	0.23	0.14
Transcript_contig_89463 (89463)	0.83	1.0	0.14	0.27	0.36	0.31	0.32	0.91	0.11	0.32	0.2
Transcript_contig_89921 (89921)	0.68	1.0	0.24	0.24	0.26	0.19	0.21	0.77	0.03	0.31	0.19
Transcript_contig_90111 (90111)	0.67	1.0	0.14	0.34	0.31	0.25	0.33	0.59	0.03	0.29	0.16
Transcript_contig_90220 (90220)	0.72	1.0	0.23	0.23	0.25	0.32	0.35	0.89	0.1	0.32	0.21
Transcript_contig_91456 (91456)	0.64	1.0	0.13	0.31	0.39	0.2	0.31	0.89	0.0	0.17	0.1

Details

Expression values normalized per gene (using the maximum value, Green cells indicate low expression and red high. (Dark gray cells indicate missing values)