Heatmap: Cluster_41 (HCCA)

View as: (view raw or zlog-transformed)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are normalized against highest expression of the row)

Gene	CCAP211/11P,High light	CCAP211/11P,Low light	CPCC90,BBM,72h,Autotrophy	CPCC90,BBM,97h,Mixotrophy	CPCC90,BBM,98h,Mixotrophy	CPCC90,BBM,120h,Mixotrophy	CPCC90,BBM,144h,Heterotrophy	NJ-7,20C	NJ-7,4C	UTEX259,20C	UTEX259,4C
Transcript_contig_11758 (11758)	0.17	0.26	0.05	0.07	0.03	0.12	0.04	0.38	0.0	1.0	0.5
Transcript_contig_11959 (11959)	0.38	0.26	0.12	0.3	0.22	0.16	0.34	0.28	0.04	1.0	0.51
Transcript_contig_12139 (12139)	0.11	0.12	0.02	0.01	0.04	0.52	0.04	0.03	0.0	1.0	0.35
Transcript_contig_1250 (1250)	0.44	0.55	0.04	0.04	0.13	0.48	0.02	0.66	0.05	1.0	0.53
Transcript_contig_1287 (1287)	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.35	0.01	0.0	0.0	1.0	0.82
Transcript_contig_14429 (14429)	0.43	0.46	0.19	0.31	0.49	1.0	0.21	0.17	0.01	0.98	0.97
Transcript_contig_1466 (1466)	0.25	0.44	0.21	0.29	0.17	0.19	0.28	0.44	0.18	1.0	0.71
Transcript_contig_1592 (1592)	0.11	0.09	0.29	0.34	0.16	0.37	0.15	0.04	0.0	1.0	0.58
Transcript_contig_1794 (1794)	0.2	0.23	0.04	0.14	0.26	0.23	0.12	0.11	0.2	1.0	0.53
Transcript_contig_18650 (18650)	0.45	0.67	0.0	0.0	0.0	0.62	0.11	0.5	0.0	1.0	0.72
Transcript_contig_19726 (19726)	0.06	0.0	0.37	0.31	0.74	1.0	0.23	0.0	0.0	0.94	0.27
Transcript_contig_2046 (2046)	0.21	0.24	0.08	0.29	0.55	0.43	0.27	0.2	0.0	1.0	0.4
Transcript_contig_2069 (2069)	0.15	0.17	0.06	0.26	0.15	1.0	0.13	0.14	0.4	0.96	0.78
Transcript_contig_2086 (2086)	0.4	0.52	0.18	0.25	0.27	0.32	0.19	0.17	0.15	1.0	0.57
Transcript_contig_21231 (21231)	0.04	0.03	0.0	0.01	0.0	1.0	0.31	0.0	0.58	0.92	0.34
Transcript_contig_2302 (2302)	0.7	0.71	0.12	0.24	0.11	0.62	0.3	0.13	0.03	1.0	0.32
Transcript_contig_2373 (2373)	0.46	0.58	0.14	0.21	0.23	0.55	0.14	0.16	0.6	1.0	0.82
Transcript_contig_2470 (2470)	0.26	0.31	0.13	0.23	0.13	0.74	0.31	0.11	0.13	1.0	0.52
Transcript_contig_2613 (2613)	0.01	0.0	0.03	0.06	0.02	0.12	0.01	0.0	0.0	1.0	0.6
Transcript_contig_3025 (3025)	0.89	0.93	0.34	0.32	0.32	0.81	0.45	0.7	0.51	1.0	0.95
Transcript_contig_3152 (3152)	0.3	0.3	0.23	0.36	0.28	0.52	0.34	0.2	0.44	1.0	0.62
Transcript_contig_3316 (3316)	0.25	0.41	0.07	0.22	0.17	0.4	0.27	0.15	0.0	1.0	0.53
Transcript_contig_3904 (3904)	0.24	0.3	0.24	0.32	0.38	0.29	0.31	0.23	0.12	1.0	0.61
Transcript_contig_4145 (4145)	0.63	1.0	0.37	0.4	0.25	0.77	0.28	0.41	0.15	0.48	0.46
Transcript_contig_4528 (4528)	0.4	0.31	0.41	0.56	0.56	0.45	0.52	0.11	0.26	1.0	0.78
Transcript_contig_4575 (4575)	0.41	0.72	0.11	0.33	0.29	0.56	0.28	0.55	0.0	1.0	0.53
Transcript_contig_5104 (5104)	0.34	0.33	0.3	0.41	0.26	0.53	0.41	0.15	0.02	1.0	0.33
Transcript_contig_54035 (54035)	0.32	0.5	0.1	0.31	0.41	0.67	0.25	0.45	0.03	1.0	0.6
Transcript_contig_54223 (54223)	0.31	0.36	0.15	0.58	0.69	0.7	0.43	0.23	0.02	1.0	0.5
Transcript_contig_54236 (54236)	0.19	0.35	0.06	0.05	0.03	0.29	0.18	0.19	0.03	1.0	0.52
Transcript_contig_54251 (54251)	0.43	0.47	0.2	0.25	0.38	0.14	0.23	0.56	0.2	1.0	0.54
Transcript_contig_54660 (54660)	0.18	0.13	0.06	0.12	0.2	0.16	0.08	0.09	0.18	1.0	0.53
Transcript_contig_548 (548)	0.39	0.42	0.13	0.17	0.15	0.79	0.19	0.19	0.08	1.0	0.53
Transcript_contig_54985 (54985)	0.5	0.63	0.18	0.61	0.78	0.58	0.35	0.6	0.24	1.0	0.65
Transcript_contig_55127 (55127)	0.34	0.49	0.23	0.32	0.53	0.45	0.3	0.33	0.01	1.0	0.49
Transcript_contig_55715 (55715)	0.34	0.22	0.16	0.13	0.12	0.36	0.32	0.12	0.27	1.0	0.58
Transcript_contig_55745 (55745)	0.59	0.55	0.13	0.05	0.03	0.54	0.33	0.28	1.0	0.78	0.97
Transcript_contig_5589 (5589)	0.28	0.31	0.16	0.27	0.22	0.26	0.29	0.11	0.11	1.0	0.46
Transcript_contig_55952 (55952)	0.36	0.38	0.26	0.35	0.33	0.24	0.32	0.23	0.08	1.0	0.62
Transcript_contig_56400 (56400)	0.41	0.48	0.19	0.34	0.37	0.43	0.33	0.51	0.25	1.0	0.61
Transcript_contig_5643 (5643)	0.46	0.58	0.13	0.37	0.35	0.61	0.37	0.23	0.0	1.0	0.51
Transcript_contig_56500 (56500)	0.27	0.35	0.21	0.28	0.23	0.3	0.19	0.18	0.03	1.0	0.58
Transcript_contig_56505 (56505)	0.23	0.3	0.17	0.26	0.25	0.3	0.24	0.11	0.01	1.0	0.46
Transcript_contig_56530 (56530)	0.46	0.49	0.3	0.53	0.49	0.81	0.53	0.14	0.06	1.0	0.63
Transcript_contig_56671 (56671)	0.61	0.55	0.03	0.02	0.01	0.86	0.89	0.16	0.18	1.0	0.76
Transcript_contig_56724 (56724)	1.0	0.85	0.14	0.05	0.01	0.8	0.3	0.08	0.67	0.86	0.59
Transcript_contig_56835 (56835)	0.32	0.3	0.44	0.22	0.16	0.59	0.37	0.21	0.22	1.0	0.47
Transcript_contig_56919 (56919)	0.3	0.46	0.08	0.17	0.21	0.26	0.19	0.34	0.08	1.0	0.63
Transcript_contig_57174 (57174)	0.04	0.0	0.01	0.01	0.0	0.47	0.09	0.0	0.25	1.0	0.86
Transcript_contig_57248 (57248)	0.44	0.49	0.14	0.07	0.02	0.52	0.3	0.37	0.01	1.0	0.95
Transcript_contig_57421 (57421)	0.36	0.44	0.0	0.01	0.0	0.2	0.04	0.31	0.04	1.0	0.6
Transcript_contig_57527 (57527)	0.37	0.42	0.16	0.09	0.06	0.6	0.47	0.4	1.0	0.65	0.73
Transcript_contig_57708 (57708)	0.16	0.21	0.12	0.32	0.31	0.28	0.21	0.16	0.02	1.0	0.52
Transcript_contig_58322 (58322)	0.44	0.59	0.2	0.36	0.25	0.49	0.27	0.46	0.21	1.0	0.63
Transcript_contig_58427 (58427)	0.44	0.43	0.34	0.49	0.66	0.87	0.77	0.27	0.15	1.0	0.67
Transcript_contig_58546 (58546)	0.29	0.39	0.21	0.32	0.37	0.3	0.17	0.43	0.04	1.0	0.69
Transcript_contig_58558 (58558)	0.63	0.54	0.01	0.01	0.01	0.3	0.1	0.02	0.36	1.0	0.78
Transcript_contig_5856 (5856)	0.14	0.14	0.17	0.52	0.32	1.0	0.31	0.15	0.0	0.77	0.35
Transcript_contig_58760 (58760)	0.18	0.26	0.15	0.23	0.27	0.38	0.14	0.31	0.02	1.0	0.61
Transcript_contig_58986 (58986)	0.05	0.0	0.03	0.03	0.03	0.1	0.03	0.0	0.21	1.0	0.45
Transcript_contig_5920 (5920)	0.27	0.36	0.06	0.24	0.21	0.53	0.19	0.23	0.0	1.0	0.44
Transcript_contig_59214 (59214)	0.1	0.28	0.27	0.56	0.8	0.59	0.42	0.11	0.06	1.0	0.62
Transcript_contig_59324 (59324)	0.84	0.78	0.38	0.66	0.4	1.0	0.72	0.66	0.52	0.93	1.0
Transcript_contig_59391 (59391)	0.39	0.69	0.14	0.18	0.06	0.73	0.14	0.42	0.03	1.0	0.53
Transcript_contig_59412 (59412)	0.42	0.61	0.14	0.21	0.29	0.35	0.24	0.89	0.21	1.0	0.73
Transcript_contig_59454 (59454)	0.36	0.55	0.4	0.47	0.69	0.68	0.58	0.58	0.03	1.0	0.48
Transcript_contig_59560 (59560)	0.05	0.01	0.0	0.0	0.0	0.25	0.0	0.0	0.02	1.0	0.92
Transcript_contig_59905 (59905)	0.43	0.27	0.34	0.57	0.44	0.75	0.61	0.29	0.69	1.0	0.58
Transcript_contig_59920 (59920)	0.35	0.46	0.23	0.22	0.13	0.31	0.14	0.38	0.68	1.0	0.57
Transcript_contig_59955 (59955)	0.27	0.37	0.11	0.26	0.39	0.51	0.14	0.24	0.01	1.0	0.61
Transcript_contig_60039 (60039)	0.08	0.08	0.18	0.13	0.07	0.53	0.59	0.11	0.21	1.0	0.57
Transcript_contig_60064 (60064)	0.24	0.25	0.09	0.07	0.04	0.41	0.13	0.25	0.04	1.0	0.46
Transcript_contig_60177 (60177)	0.26	0.31	0.42	0.21	0.02	1.0	0.12	0.19	0.3	0.73	0.42
Transcript_contig_60384 (60384)	0.32	0.39	0.44	0.34	0.41	0.28	0.22	0.31	0.08	1.0	0.47
Transcript_contig_60684 (60684)	0.22	0.28	0.16	0.24	0.39	0.49	0.29	0.12	0.13	1.0	0.5
Transcript_contig_60743 (60743)	0.19	0.2	0.35	0.34	0.37	0.79	0.44	0.05	0.07	1.0	0.53
Transcript_contig_60761 (60761)	0.53	0.34	0.01	0.03	0.0	0.41	0.33	0.0	0.05	1.0	0.9
Transcript_contig_6085 (6085)	0.04	0.03	0.0	0.0	0.0	0.53	0.04	0.03	0.02	1.0	0.34
Transcript_contig_60892 (60892)	0.32	0.35	0.04	0.16	0.25	0.35	0.13	0.43	0.03	1.0	0.59
Transcript_contig_61052 (61052)	0.02	0.02	0.05	0.01	0.0	1.0	0.26	0.0	0.25	0.79	0.35
Transcript_contig_61370 (61370)	0.26	0.24	0.45	0.49	0.53	0.59	0.36	0.16	0.2	1.0	0.63
Transcript_contig_61422 (61422)	0.29	0.36	0.15	0.33	0.27	0.38	0.21	0.17	0.14	1.0	0.48
Transcript_contig_62003 (62003)	0.1	0.05	0.13	0.17	0.13	0.38	0.12	0.01	0.44	1.0	0.67
Transcript_contig_62114 (62114)	0.41	0.54	0.15	0.4	0.61	0.87	0.32	0.8	0.06	1.0	0.62
Transcript_contig_62321 (62321)	0.08	0.08	0.08	0.09	0.08	0.24	0.33	0.08	0.06	1.0	0.61
Transcript_contig_6507 (6507)	0.11	0.14	0.09	0.22	0.24	0.14	0.12	0.07	0.02	1.0	0.56
Transcript_contig_67470 (67470)	0.06	0.03	0.21	0.14	0.05	0.41	0.26	0.03	0.07	1.0	0.44
Transcript_contig_67703 (67703)	0.12	0.12	0.0	0.02	0.08	0.49	0.02	0.17	0.14	1.0	0.45
Transcript_contig_67707 (67707)	0.29	0.42	0.17	0.24	0.33	0.46	0.18	0.45	0.09	1.0	0.43
Transcript_contig_67812 (67812)	0.66	0.7	0.2	0.09	0.01	0.59	0.2	0.51	0.5	0.84	1.0
Transcript_contig_67927 (67927)	0.34	0.45	0.13	0.2	0.19	0.44	0.19	0.44	0.28	1.0	0.63
Transcript_contig_68232 (68232)	0.05	0.07	0.0	0.03	0.01	0.33	0.02	0.1	0.0	1.0	0.46
Transcript_contig_6829 (6829)	0.33	0.34	0.21	0.49	0.43	0.7	0.51	0.12	0.15	1.0	0.43
Transcript_contig_68301 (68301)	0.12	0.33	0.0	0.0	0.0	0.3	0.0	0.14	0.0	1.0	0.44
Transcript_contig_69788 (69788)	0.52	0.56	0.37	0.3	0.25	0.48	0.35	0.16	0.02	1.0	0.4
Transcript_contig_6983 (6983)	0.38	0.55	0.16	0.28	0.44	0.36	0.19	0.38	0.04	1.0	0.62
Transcript_contig_69917 (69917)	0.3	0.25	0.26	0.25	0.3	0.63	0.48	0.33	0.16	1.0	0.62
Transcript_contig_69972 (69972)	0.42	0.68	0.34	0.28	0.26	0.94	0.25	0.27	0.21	1.0	0.65
Transcript_contig_70207 (70207)	0.06	0.04	0.02	0.03	0.13	0.07	0.03	0.0	0.0	1.0	0.39
Transcript_contig_70292 (70292)	0.44	0.53	0.31	0.41	0.6	0.73	0.62	0.22	0.09	1.0	0.42
Transcript_contig_71826 (71826)	0.38	0.37	0.13	0.48	0.43	0.57	0.34	0.19	0.0	1.0	0.51
Transcript_contig_71982 (71982)	0.35	0.29	0.31	0.27	0.56	0.55	0.34	0.09	0.0	1.0	0.67
Transcript_contig_72002 (72002)	0.0	0.0	0.0	0.0	0.01	0.41	0.0	0.0	0.0	1.0	0.51
Transcript_contig_72138 (72138)	0.0	0.03	0.0	0.13	0.25	0.47	0.01	0.0	0.0	1.0	0.51
Transcript_contig_732 (732)	0.28	0.32	0.11	0.14	0.06	0.33	0.22	0.17	0.2	1.0	0.43
Transcript_contig_7606 (7606)	0.13	0.01	0.02	0.05	0.03	0.62	0.19	0.01	0.14	1.0	0.39
Transcript_contig_78138 (78138)	0.27	0.22	0.16	0.26	0.37	0.5	0.26	0.21	0.31	1.0	0.58
Transcript_contig_78422 (78422)	0.18	0.13	0.15	0.36	0.2	1.0	0.31	0.03	0.04	0.57	0.37
Transcript_contig_78550 (78550)	0.28	0.27	0.31	0.33	0.44	0.49	0.32	0.22	0.07	1.0	0.35
Transcript_contig_78753 (78753)	0.44	0.61	0.2	0.36	0.44	0.65	0.48	0.42	0.35	1.0	0.48
Transcript_contig_78876 (78876)	0.2	0.28	0.08	0.14	0.2	0.2	0.14	0.21	0.03	1.0	0.55
Transcript_contig_78886 (78886)	0.53	0.58	0.73	0.57	0.49	0.62	0.52	0.19	0.63	1.0	0.5
Transcript_contig_79040 (79040)	0.04	0.05	0.03	0.26	0.3	0.43	0.06	0.02	0.01	1.0	0.59
Transcript_contig_79253 (79253)	0.36	0.35	0.6	0.67	0.57	1.0	0.54	0.16	0.06	0.95	0.48
Transcript_contig_79345 (79345)	0.49	0.7	0.2	0.39	0.53	0.52	0.4	0.62	0.06	1.0	0.69
Transcript_contig_80176 (80176)	0.39	0.47	0.21	0.2	0.22	0.24	0.14	0.72	0.38	1.0	0.64
Transcript_contig_80232 (80232)	0.34	0.36	0.06	0.06	0.16	0.07	0.06	0.29	0.0	1.0	0.74
Transcript_contig_80267 (80267)	0.06	0.0	0.02	0.01	0.0	0.88	0.16	0.0	0.06	1.0	0.4
Transcript_contig_80271 (80271)	0.29	0.47	0.12	0.16	0.2	0.44	0.11	0.55	0.01	1.0	0.62
Transcript_contig_80317 (80317)	0.24	0.16	0.26	0.3	0.29	0.78	0.44	0.19	0.34	1.0	0.67
Transcript_contig_80353 (80353)	0.01	0.01	0.02	0.02	0.01	0.49	0.01	0.01	0.0	1.0	0.6
Transcript_contig_80633 (80633)	0.25	0.24	0.0	0.12	0.21	0.39	0.07	0.19	0.0	1.0	0.46
Transcript_contig_80653 (80653)	0.46	0.47	0.0	0.0	0.0	0.44	0.05	0.1	0.0	1.0	0.2
Transcript_contig_80745 (80745)	0.22	0.22	0.38	0.46	0.4	0.94	0.38	0.37	0.32	1.0	0.61
Transcript_contig_80843 (80843)	0.24	0.06	0.34	0.3	1.0	0.93	0.32	0.08	0.12	0.82	0.46
Transcript_contig_81242 (81242)	0.1	0.08	0.0	0.0	0.21	0.05	0.07	0.08	0.0	1.0	0.47
Transcript_contig_81355 (81355)	0.32	0.3	0.26	0.32	0.27	0.66	0.28	0.03	0.09	1.0	0.58
Transcript_contig_81362 (81362)	0.06	0.05	0.08	0.17	0.16	0.27	0.14	0.12	0.07	1.0	0.53
Transcript_contig_81633 (81633)	0.32	0.3	0.14	0.27	0.23	0.53	0.4	0.12	0.26	1.0	0.53
Transcript_contig_81688 (81688)	0.05	0.01	0.02	0.01	0.0	0.37	0.01	0.0	0.41	1.0	0.9
Transcript_contig_81742 (81742)	0.09	0.0	0.02	0.02	0.01	0.3	0.07	0.0	0.05	1.0	0.57
Transcript_contig_81974 (81974)	0.32	0.29	0.07	0.19	0.27	0.23	0.3	0.41	0.09	1.0	0.61
Transcript_contig_82031 (82031)	0.19	0.22	0.09	0.17	0.13	0.67	0.13	0.06	0.0	1.0	0.6
Transcript_contig_82684 (82684)	0.33	0.55	0.2	0.36	0.44	0.51	0.2	0.5	0.02	1.0	0.55
Transcript_contig_82707 (82707)	0.41	0.48	0.42	0.61	0.47	0.55	0.29	0.2	0.03	1.0	0.41
Transcript_contig_828 (828)	0.28	0.33	0.04	0.06	0.13	0.34	0.11	0.11	0.38	1.0	0.46
Transcript_contig_8286 (8286)	0.24	0.33	0.08	0.11	0.08	1.0	0.25	0.19	0.01	0.61	0.36
Transcript_contig_83036 (83036)	0.18	0.24	0.19	0.04	0.13	0.52	0.09	0.1	0.14	1.0	0.72
Transcript_contig_83163 (83163)	0.09	0.29	0.22	0.04	0.25	0.21	0.21	0.14	0.0	1.0	0.66
Transcript_contig_83256 (83256)	0.12	0.08	0.15	0.21	0.31	0.06	0.07	0.06	0.06	1.0	0.55
Transcript_contig_83353 (83353)	0.05	0.01	0.02	0.21	0.26	0.41	0.05	0.03	0.05	1.0	0.54
Transcript_contig_83432 (83432)	0.06	0.13	0.02	0.08	0.24	0.38	0.07	0.06	0.11	1.0	0.79
Transcript_contig_840 (840)	0.08	0.35	0.0	0.24	0.15	0.0	0.33	0.26	0.17	1.0	0.98
Transcript_contig_84009 (84009)	0.52	0.52	0.18	0.63	0.48	0.76	0.26	0.32	0.02	1.0	0.6
Transcript_contig_85113 (85113)	0.01	0.0	0.14	0.02	0.0	0.35	0.03	0.0	0.03	1.0	0.45
Transcript_contig_89251 (89251)	0.29	0.31	0.07	0.38	0.25	0.17	0.24	0.24	0.1	1.0	0.57
Transcript_contig_89455 (89455)	0.45	0.52	0.33	0.27	0.28	0.86	0.8	0.34	0.54	1.0	0.71
Transcript_contig_89555 (89555)	0.08	0.1	0.21	0.17	0.07	0.27	0.19	0.06	0.08	1.0	0.62
Transcript_contig_89690 (89690)	0.49	0.6	0.2	0.47	0.81	0.65	0.48	0.52	0.18	1.0	0.57
Transcript_contig_89736 (89736)	0.3	0.27	0.14	0.14	0.24	0.59	0.2	0.02	0.23	1.0	0.41
Transcript_contig_90252 (90252)	0.26	0.23	0.25	0.13	0.14	0.38	0.25	0.17	0.02	1.0	0.55
Transcript_contig_90280 (90280)	0.49	0.47	0.04	0.46	0.18	0.71	0.31	0.3	0.06	1.0	0.5
Transcript_contig_90383 (90383)	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.4	0.0	0.0	0.0	1.0	0.5
Transcript_contig_90507 (90507)	0.01	0.01	0.0	0.02	0.03	0.37	0.0	0.02	0.0	1.0	0.58
Transcript_contig_90644 (90644)	0.24	0.24	0.26	0.29	0.3	0.62	0.39	0.28	0.54	1.0	0.59
Transcript_contig_9228 (9228)	0.36	0.48	0.09	0.29	0.34	0.6	0.28	0.51	0.18	1.0	0.53
Transcript_contig_9641 (9641)	0.27	0.44	0.03	0.03	0.0	0.61	0.02	0.14	0.01	1.0	0.41
Transcript_contig_9881 (9881)	0.18	0.23	0.31	0.5	0.19	0.81	0.31	0.13	0.26	1.0	0.5

Details

Expression values normalized per gene (using the maximum value, Green cells indicate low expression and red high. (Dark gray cells indicate missing values)