Heatmap: Cluster_183 (HCCA)

View as: (view raw or zlog-transformed)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are normalized against highest expression of the row)

Gene	CCAP211/11P,High light	CCAP211/11P,Low light	CPCC90,BBM,72h,Autotrophy	CPCC90,BBM,97h,Mixotrophy	CPCC90,BBM,98h,Mixotrophy	CPCC90,BBM,120h,Mixotrophy	CPCC90,BBM,144h,Heterotrophy	NJ-7,20C	NJ-7,4C	UTEX259,20C	UTEX259,4C
Transcript_contig_10044 (10044)	0.59	1.0	0.56	0.27	0.23	0.53	0.69	0.6	0.04	0.34	0.21
Transcript_contig_14699 (14699)	0.89	1.0	0.24	0.2	0.36	0.52	0.97	0.57	0.79	0.89	0.75
Transcript_contig_2068 (2068)	0.73	1.0	0.55	0.34	0.36	0.21	0.37	0.56	0.23	0.6	0.3
Transcript_contig_2764 (2764)	0.29	0.66	0.5	0.61	0.71	0.42	0.29	1.0	0.09	0.9	0.44
Transcript_contig_3245 (3245)	0.27	0.05	0.0	0.02	0.0	0.07	1.0	0.0	0.09	0.07	0.02
Transcript_contig_4759 (4759)	0.57	0.59	0.37	0.39	0.45	1.0	0.69	0.5	0.38	0.69	0.35
Transcript_contig_53814 (53814)	0.45	0.44	0.17	0.33	0.37	1.0	0.98	0.51	0.2	0.73	0.44
Transcript_contig_53826 (53826)	0.35	0.33	0.21	0.37	0.25	1.0	0.64	0.24	0.18	0.19	0.14
Transcript_contig_54193 (54193)	0.53	0.69	0.19	0.43	0.36	1.0	0.44	0.49	0.28	0.54	0.36
Transcript_contig_54607 (54607)	0.55	0.76	0.23	0.59	0.58	0.26	0.17	1.0	0.06	0.6	0.22
Transcript_contig_55266 (55266)	0.59	0.34	0.23	0.23	0.18	0.51	0.8	0.27	1.0	0.57	0.54
Transcript_contig_55816 (55816)	0.61	0.64	0.26	0.34	0.33	0.67	0.32	0.57	0.56	1.0	0.59
Transcript_contig_56021 (56021)	0.76	0.89	0.41	0.75	0.79	1.0	0.61	0.69	0.61	0.56	0.28
Transcript_contig_56115 (56115)	0.7	0.68	0.31	0.68	1.0	0.95	0.61	0.51	0.52	0.46	0.37
Transcript_contig_56138 (56138)	0.68	0.86	0.45	0.65	1.0	0.72	0.49	0.75	0.79	0.51	0.33
Transcript_contig_56273 (56273)	0.6	0.6	0.44	0.7	0.7	1.0	0.76	0.62	0.16	0.56	0.28
Transcript_contig_56589 (56589)	0.7	0.91	0.37	0.31	0.14	0.91	1.0	0.54	0.33	0.5	0.25
Transcript_contig_56719 (56719)	0.56	0.6	0.03	0.12	0.13	0.37	0.44	0.47	0.63	1.0	0.48
Transcript_contig_56722 (56722)	0.52	0.66	0.51	0.72	1.0	0.63	0.45	0.24	0.37	0.48	0.36
Transcript_contig_57183 (57183)	0.45	0.58	0.14	0.41	0.36	1.0	0.4	0.44	0.15	0.5	0.19
Transcript_contig_57445 (57445)	0.62	0.89	0.36	0.71	1.0	0.95	0.76	0.59	0.02	0.78	0.41
Transcript_contig_57863 (57863)	0.79	1.0	0.76	1.0	0.67	0.85	0.74	0.8	0.47	0.64	0.55
Transcript_contig_58216 (58216)	0.54	0.9	0.17	0.56	0.73	0.94	0.8	0.96	0.16	1.0	0.48
Transcript_contig_58597 (58597)	0.59	0.54	0.34	0.37	0.14	0.8	1.0	0.26	0.24	0.44	0.22
Transcript_contig_593 (593)	0.8	1.0	0.99	0.92	0.41	0.84	0.81	0.36	0.01	0.95	0.72
Transcript_contig_59443 (59443)	0.92	1.0	0.08	0.3	0.27	0.5	0.73	0.74	0.06	0.58	0.18
Transcript_contig_59578 (59578)	0.43	0.5	0.14	0.15	0.11	0.38	0.26	0.44	0.36	1.0	0.53
Transcript_contig_59827 (59827)	0.78	1.0	0.29	0.64	0.85	0.78	0.61	0.55	0.79	0.46	0.38
Transcript_contig_60305 (60305)	0.77	1.0	0.49	0.83	0.61	0.83	0.65	0.62	0.37	0.66	0.47
Transcript_contig_60395 (60395)	0.8	0.99	0.23	0.47	1.0	0.71	0.66	0.43	0.39	0.71	0.43
Transcript_contig_60510 (60510)	0.81	1.0	0.22	0.76	0.7	0.58	0.38	0.68	0.52	0.32	0.41
Transcript_contig_60919 (60919)	0.44	1.0	0.62	0.28	0.35	0.29	0.67	0.9	0.0	0.64	0.37
Transcript_contig_61309 (61309)	0.86	0.93	0.36	0.63	0.61	1.0	0.7	0.75	0.16	0.87	0.53
Transcript_contig_61764 (61764)	0.75	0.86	0.21	0.31	0.44	0.92	1.0	0.84	0.93	0.72	0.43
Transcript_contig_61842 (61842)	0.77	1.0	0.61	0.72	0.93	0.82	0.79	0.9	0.12	0.6	0.38
Transcript_contig_62180 (62180)	0.9	1.0	0.08	0.22	0.2	0.74	0.85	0.61	0.02	0.98	0.32
Transcript_contig_62882 (62882)	0.46	0.52	0.37	0.6	0.6	1.0	0.68	0.22	0.08	0.6	0.21
Transcript_contig_63236 (63236)	0.29	0.4	0.51	0.23	0.47	0.19	0.32	0.39	0.09	1.0	0.17
Transcript_contig_6350 (6350)	0.36	0.07	0.05	0.29	0.09	1.0	0.67	0.05	0.41	0.47	0.37
Transcript_contig_6552 (6552)	0.58	1.0	0.27	0.15	0.08	0.24	0.23	0.55	0.09	0.66	0.18
Transcript_contig_66227 (66227)	0.79	1.0	0.3	0.26	0.18	0.66	0.63	0.71	0.19	0.45	0.57
Transcript_contig_6628 (6628)	0.74	0.84	0.49	0.4	0.51	0.75	0.88	0.52	1.0	0.89	0.7
Transcript_contig_6745 (6745)	1.0	1.0	0.34	0.28	0.12	0.82	0.92	0.43	0.5	0.66	0.52
Transcript_contig_68165 (68165)	0.65	1.0	0.17	0.64	0.62	0.54	0.26	0.87	0.54	0.39	0.33
Transcript_contig_69653 (69653)	0.83	1.0	0.45	0.54	0.76	0.8	0.54	0.49	0.0	0.53	0.39
Transcript_contig_70101 (70101)	0.44	0.44	0.1	0.32	0.25	0.4	0.29	0.33	0.03	1.0	0.55
Transcript_contig_72657 (72657)	0.87	1.0	0.48	0.41	0.73	0.49	0.69	0.48	0.76	0.53	0.55
Transcript_contig_78085 (78085)	0.98	1.0	0.17	0.36	0.38	0.64	0.73	0.5	0.2	0.56	0.35
Transcript_contig_78177 (78177)	0.82	0.87	0.35	0.66	0.84	1.0	0.95	0.69	0.42	0.61	0.35
Transcript_contig_785 (785)	0.62	0.61	0.48	0.37	0.43	0.89	0.64	0.62	0.57	1.0	0.53
Transcript_contig_78935 (78935)	0.45	0.45	0.1	0.19	0.32	0.31	0.45	0.27	0.37	1.0	0.41
Transcript_contig_78940 (78940)	0.52	0.6	0.46	0.39	0.32	1.0	0.68	0.53	0.94	0.87	0.44
Transcript_contig_80640 (80640)	0.41	0.69	0.17	0.28	0.17	0.25	0.3	0.53	0.0	1.0	0.64
Transcript_contig_80724 (80724)	0.46	0.65	0.09	0.11	0.16	0.13	0.22	0.46	0.0	1.0	0.57
Transcript_contig_80824 (80824)	0.3	0.6	0.26	0.13	0.22	0.23	0.41	0.05	0.03	1.0	0.39
Transcript_contig_82057 (82057)	0.78	1.0	0.33	0.64	0.46	0.59	0.6	0.57	0.05	0.77	0.31
Transcript_contig_82121 (82121)	0.46	0.47	0.34	0.39	0.49	1.0	0.56	0.34	0.28	0.49	0.33
Transcript_contig_82267 (82267)	0.62	0.87	0.32	0.72	0.61	0.58	0.43	0.31	0.02	1.0	0.37
Transcript_contig_83780 (83780)	0.68	1.0	0.14	0.63	0.66	0.61	0.54	0.1	0.0	0.97	0.55
Transcript_contig_8808 (8808)	0.76	1.0	0.32	0.3	0.2	0.24	0.33	0.71	0.09	0.54	0.66
Transcript_contig_89243 (89243)	0.83	0.79	0.06	0.21	0.23	0.54	0.67	0.41	0.17	1.0	0.45
Transcript_contig_89423 (89423)	0.68	0.64	0.25	0.36	0.5	0.86	0.84	0.79	0.64	1.0	0.64
Transcript_contig_89467 (89467)	0.53	0.11	0.09	0.15	0.13	0.74	1.0	0.11	0.27	0.99	0.6
Transcript_contig_89564 (89564)	0.58	0.6	0.19	0.23	0.25	0.58	0.5	0.45	0.67	1.0	0.68
Transcript_contig_89574 (89574)	0.59	0.63	0.4	0.21	0.1	0.78	0.38	0.57	0.97	1.0	0.48
Transcript_contig_89714 (89714)	0.48	0.8	0.21	0.47	0.69	0.44	0.38	1.0	0.13	0.54	0.45
Transcript_contig_89891 (89891)	0.53	0.46	0.41	0.59	0.44	1.0	1.0	0.22	0.44	0.56	0.25
Transcript_contig_89898 (89898)	0.95	1.0	0.09	0.28	0.38	0.45	0.67	0.72	0.1	0.4	0.2
Transcript_contig_90203 (90203)	0.13	0.0	0.01	0.01	0.01	1.0	0.52	0.0	0.08	0.13	0.1
Transcript_contig_90846 (90846)	0.64	0.77	0.13	0.33	0.31	0.59	0.57	0.52	0.23	1.0	0.99

Details

Expression values normalized per gene (using the maximum value, Green cells indicate low expression and red high. (Dark gray cells indicate missing values)