Heatmap: Cluster_55 (HCCA)

View as: (view raw or zlog-transformed)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are normalized against highest expression of the row)

Gene	CCAP211/11P,High light	CCAP211/11P,Low light	CPCC90,BBM,72h,Autotrophy	CPCC90,BBM,97h,Mixotrophy	CPCC90,BBM,98h,Mixotrophy	CPCC90,BBM,120h,Mixotrophy	CPCC90,BBM,144h,Heterotrophy	NJ-7,20C	NJ-7,4C	UTEX259,20C	UTEX259,4C
Transcript_contig_13526 (13526)	0.19	0.06	1.0	0.22	0.6	0.61	0.34	0.0	0.0	0.17	0.79
Transcript_contig_13540 (13540)	0.06	0.0	1.0	0.58	0.21	0.47	0.78	0.18	0.25	0.44	0.15
Transcript_contig_14039 (14039)	0.11	0.0	0.25	0.71	1.0	0.54	0.31	0.0	0.0	0.0	0.37
Transcript_contig_1907 (1907)	0.35	0.24	1.0	0.46	0.74	0.88	1.0	0.4	0.0	0.17	0.52
Transcript_contig_224 (224)	0.0	0.0	0.16	0.18	1.0	0.55	0.42	0.0	0.0	0.0	0.31
Transcript_contig_23296 (23296)	0.0	0.0	0.0	0.0	1.0	0.0	0.22	0.0	0.0	0.0	0.0
Transcript_contig_24619 (24619)	0.35	0.59	0.0	0.5	0.49	1.0	0.26	0.42	0.0	0.0	0.81
Transcript_contig_2623 (2623)	0.0	0.0	0.37	0.34	1.0	0.0	0.49	0.0	0.0	0.0	0.24
Transcript_contig_2743 (2743)	0.19	0.0	0.89	0.77	0.3	0.81	0.52	0.0	0.0	0.0	1.0
Transcript_contig_29247 (29247)	0.05	0.3	0.76	0.96	1.0	0.22	0.5	0.3	0.0	0.04	0.04
Transcript_contig_3398 (3398)	0.31	0.42	0.15	0.53	0.85	1.0	0.9	0.19	0.04	0.05	0.92
Transcript_contig_54186 (54186)	0.07	0.0	0.16	0.27	1.0	0.42	0.34	0.0	0.0	0.0	0.29
Transcript_contig_54572 (54572)	0.1	0.14	0.3	0.41	0.85	1.0	0.63	0.2	0.01	0.41	0.66
Transcript_contig_5487 (5487)	0.35	0.2	0.0	0.16	0.0	0.64	0.68	0.0	0.48	0.1	1.0
Transcript_contig_57095 (57095)	0.08	0.0	0.61	0.23	0.24	0.4	0.32	0.0	0.0	0.1	1.0
Transcript_contig_57523 (57523)	0.09	0.02	0.79	0.45	0.3	0.83	0.42	0.04	0.0	0.05	1.0
Transcript_contig_57663 (57663)	0.14	0.09	0.97	1.0	0.54	0.49	0.23	0.0	0.0	0.0	0.23
Transcript_contig_58051 (58051)	0.16	0.0	0.78	0.91	1.0	0.83	0.91	0.0	0.0	0.0	0.63
Transcript_contig_58796 (58796)	0.16	0.07	0.85	0.89	1.0	0.68	0.79	0.08	0.0	0.0	0.33
Transcript_contig_59206 (59206)	0.07	0.0	0.47	0.62	1.0	0.4	0.43	0.0	0.14	0.0	0.23
Transcript_contig_59249 (59249)	0.23	0.29	0.81	1.0	0.61	0.41	0.75	0.41	0.0	0.01	0.29
Transcript_contig_59519 (59519)	0.13	0.0	0.93	1.0	1.0	0.82	0.88	0.01	0.0	0.0	0.57
Transcript_contig_59691 (59691)	0.14	0.0	0.88	0.59	0.56	0.92	0.56	0.0	0.0	0.0	1.0
Transcript_contig_5986 (5986)	0.17	0.0	0.53	0.53	1.0	0.72	0.87	0.0	0.0	0.13	0.78
Transcript_contig_60004 (60004)	0.05	0.0	0.95	0.77	1.0	0.45	0.4	0.0	0.0	0.0	0.19
Transcript_contig_60246 (60246)	0.3	0.31	0.63	1.0	0.99	0.83	0.88	0.51	0.0	0.21	0.16
Transcript_contig_6033 (6033)	0.1	0.01	0.04	1.0	0.84	0.8	0.42	0.0	0.0	0.01	0.75
Transcript_contig_60334 (60334)	0.07	0.0	1.0	0.99	0.46	0.24	0.22	0.0	0.0	0.0	0.35
Transcript_contig_60373 (60373)	0.22	0.15	0.94	0.97	1.0	0.78	0.59	0.26	0.12	0.04	0.22
Transcript_contig_60644 (60644)	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.23	0.0	0.0	1.0	0.66
Transcript_contig_6066 (6066)	0.12	0.0	0.31	0.8	1.0	0.43	0.46	0.0	0.0	0.17	0.3
Transcript_contig_60798 (60798)	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.4	0.62	0.0	0.0	0.0	1.0
Transcript_contig_61442 (61442)	0.07	0.0	0.7	0.18	1.0	0.54	0.58	0.0	0.0	0.0	0.6
Transcript_contig_61826 (61826)	0.15	0.0	0.81	0.84	0.89	0.66	1.0	0.0	0.0	0.0	0.56
Transcript_contig_61962 (61962)	0.07	0.0	0.85	0.85	0.18	1.0	0.62	0.0	0.0	0.09	0.9
Transcript_contig_62008 (62008)	0.0	0.0	0.0	0.0	0.17	0.83	0.0	0.0	0.4	0.0	1.0
Transcript_contig_62052 (62052)	0.21	0.0	0.53	0.72	1.0	0.63	0.82	0.0	0.0	0.22	0.42
Transcript_contig_6213 (6213)	0.28	0.13	0.08	0.18	0.05	0.47	0.33	0.25	0.28	0.0	1.0
Transcript_contig_62147 (62147)	0.16	0.0	0.74	0.24	1.0	0.56	0.49	0.0	0.0	0.0	0.47
Transcript_contig_62250 (62250)	0.0	0.22	0.37	0.42	1.0	0.99	0.23	0.0	0.0	0.0	0.71
Transcript_contig_62262 (62262)	0.5	0.0	0.66	1.0	0.97	0.67	0.78	0.0	0.0	0.0	0.53
Transcript_contig_62397 (62397)	0.19	0.04	0.47	0.61	0.86	1.0	0.78	0.0	0.0	0.23	0.59
Transcript_contig_62805 (62805)	0.27	0.0	0.47	0.27	0.55	0.74	1.0	0.0	0.21	0.0	0.46
Transcript_contig_62923 (62923)	0.0	0.0	0.26	0.24	1.0	0.0	0.15	0.0	0.0	0.0	0.0
Transcript_contig_62997 (62997)	0.0	0.0	0.0	0.0	0.21	0.43	0.0	0.0	0.0	0.1	1.0
Transcript_contig_6327 (6327)	0.0	0.0	0.23	0.65	0.8	0.22	0.31	0.0	0.0	0.38	1.0
Transcript_contig_66145 (66145)	0.07	0.0	0.69	0.79	1.0	0.31	0.64	0.0	0.0	0.01	0.22
Transcript_contig_68069 (68069)	0.08	0.0	0.56	0.51	1.0	0.41	0.48	0.0	0.0	0.0	0.23
Transcript_contig_68075 (68075)	0.43	0.09	0.68	0.87	0.0	0.26	1.0	0.0	0.0	0.0	0.58
Transcript_contig_68171 (68171)	0.2	0.21	0.09	0.55	1.0	0.59	0.28	0.0	0.0	0.0	0.79
Transcript_contig_68388 (68388)	0.13	0.07	1.0	0.21	0.24	0.72	0.3	0.0	0.06	0.13	0.7
Transcript_contig_68445 (68445)	0.13	0.0	0.51	0.6	0.97	1.0	0.64	0.0	0.0	0.03	0.77
Transcript_contig_68577 (68577)	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	1.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.9
Transcript_contig_68630 (68630)	0.23	0.2	0.65	0.4	0.0	1.0	0.63	0.43	0.0	0.03	0.49
Transcript_contig_68904 (68904)	0.05	0.0	0.34	0.87	0.66	0.61	1.0	0.0	0.0	0.0	0.36
Transcript_contig_69137 (69137)	0.0	0.0	0.09	0.0	1.0	0.21	0.58	0.0	0.0	0.0	0.22
Transcript_contig_69542 (69542)	0.03	0.0	0.14	0.37	1.0	0.46	0.26	0.0	0.0	0.0	0.29
Transcript_contig_70768 (70768)	0.43	0.16	0.94	1.0	0.85	0.71	0.72	0.04	0.02	0.25	0.63
Transcript_contig_71244 (71244)	0.15	0.0	0.91	0.79	0.63	0.79	0.82	0.0	0.0	0.14	1.0
Transcript_contig_71846 (71846)	0.17	0.23	0.51	1.0	0.37	0.8	0.65	0.19	0.0	0.25	0.24
Transcript_contig_72104 (72104)	0.13	0.0	0.35	0.76	1.0	0.58	0.92	0.0	0.0	0.0	0.32
Transcript_contig_72715 (72715)	0.25	0.21	0.56	1.0	0.14	0.46	0.75	0.25	0.5	0.23	0.25
Transcript_contig_72728 (72728)	0.03	0.0	0.13	1.0	0.6	0.44	0.41	0.0	0.0	0.0	0.45
Transcript_contig_73345 (73345)	0.24	0.17	0.35	0.53	0.73	1.0	0.56	0.52	0.0	0.03	0.84
Transcript_contig_79064 (79064)	0.12	0.0	0.78	0.51	1.0	0.62	0.69	0.0	0.0	0.0	0.4
Transcript_contig_79101 (79101)	0.07	0.0	1.0	0.67	0.86	0.41	0.32	0.0	0.0	0.0	0.26
Transcript_contig_79126 (79126)	0.27	0.23	0.65	0.75	1.0	0.59	0.68	0.33	0.0	0.07	0.41
Transcript_contig_79288 (79288)	0.11	0.0	0.94	1.0	0.74	0.66	0.55	0.0	0.0	0.01	0.56
Transcript_contig_79314 (79314)	0.05	0.0	0.54	0.78	0.77	1.0	0.6	0.0	0.0	0.0	0.9
Transcript_contig_79364 (79364)	0.08	0.0	0.62	0.85	0.6	1.0	0.62	0.0	0.0	0.0	0.7
Transcript_contig_79377 (79377)	0.07	0.0	0.98	0.94	1.0	0.72	0.87	0.0	0.0	0.04	0.97
Transcript_contig_79421 (79421)	0.05	0.0	1.0	0.88	0.88	0.69	0.51	0.0	0.0	0.04	0.64
Transcript_contig_79748 (79748)	0.12	0.0	0.12	0.28	0.14	0.59	0.36	0.0	0.0	0.12	1.0
Transcript_contig_80393 (80393)	0.09	0.0	0.4	0.5	1.0	0.61	0.4	0.0	0.0	0.0	0.39
Transcript_contig_80448 (80448)	0.06	0.0	0.81	0.45	1.0	0.6	0.5	0.0	0.0	0.0	0.16
Transcript_contig_80594 (80594)	0.1	0.0	0.81	0.63	1.0	0.58	0.6	0.0	0.0	0.0	0.24
Transcript_contig_80723 (80723)	0.18	0.01	0.64	0.61	1.0	0.81	0.67	0.0	0.0	0.19	0.65
Transcript_contig_80753 (80753)	0.04	0.02	1.0	0.72	0.91	0.85	0.79	0.13	0.13	0.39	0.64
Transcript_contig_81292 (81292)	0.07	0.0	0.2	0.61	1.0	0.34	0.37	0.0	0.0	0.22	0.13
Transcript_contig_81567 (81567)	0.09	0.0	0.44	0.58	1.0	0.57	0.39	0.0	0.0	0.0	0.13
Transcript_contig_81941 (81941)	0.08	0.0	0.29	0.76	1.0	0.56	0.57	0.0	0.0	0.0	0.24
Transcript_contig_82082 (82082)	0.16	0.0	0.47	0.75	0.32	0.86	0.79	0.0	0.0	0.19	1.0
Transcript_contig_82408 (82408)	0.14	0.04	0.5	0.63	1.0	0.56	0.79	0.02	0.05	0.14	0.32
Transcript_contig_82636 (82636)	0.09	0.0	0.6	0.71	1.0	0.4	0.81	0.0	0.0	0.0	0.32
Transcript_contig_83356 (83356)	0.0	0.0	0.49	0.42	1.0	0.88	0.0	0.25	0.0	0.14	0.71
Transcript_contig_83682 (83682)	0.0	0.0	0.37	0.27	0.97	1.0	0.18	0.0	0.0	0.0	0.47
Transcript_contig_84866 (84866)	0.11	0.0	0.0	0.0	0.0	0.47	1.0	0.0	0.0	0.0	0.79
Transcript_contig_89966 (89966)	0.1	0.09	0.62	0.71	0.0	0.48	0.56	0.0	0.0	0.0	1.0
Transcript_contig_90360 (90360)	0.22	0.0	0.62	1.0	0.57	0.96	0.97	0.0	0.23	0.0	0.8
Transcript_contig_90660 (90660)	0.39	0.39	0.75	1.0	0.72	0.65	0.69	0.35	0.06	0.12	0.48
Transcript_contig_90875 (90875)	0.12	0.0	0.38	0.58	0.71	0.41	1.0	0.0	0.05	0.08	0.2
Transcript_contig_91316 (91316)	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	1.0

Details

Expression values normalized per gene (using the maximum value, Green cells indicate low expression and red high. (Dark gray cells indicate missing values)