Heatmap: Cluster_94 (HCCA)

View as: (view raw or zlog-transformed)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are normalized against highest expression of the row)

Gene	CCAP211/11P,High light	CCAP211/11P,Low light	CPCC90,BBM,72h,Autotrophy	CPCC90,BBM,97h,Mixotrophy	CPCC90,BBM,98h,Mixotrophy	CPCC90,BBM,120h,Mixotrophy	CPCC90,BBM,144h,Heterotrophy	NJ-7,20C	NJ-7,4C	UTEX259,20C	UTEX259,4C
Transcript_contig_10541 (10541)	0.69	1.0	0.54	0.33	0.15	0.15	0.19	0.8	0.05	0.03	0.11
Transcript_contig_11169 (11169)	0.74	1.0	0.85	0.4	0.02	0.14	0.27	0.72	0.03	0.17	0.13
Transcript_contig_12489 (12489)	0.47	0.56	0.36	0.23	0.0	0.07	0.22	1.0	0.08	0.02	0.04
Transcript_contig_19200 (19200)	0.87	1.0	0.68	0.43	0.49	0.09	0.23	0.72	0.04	0.0	0.04
Transcript_contig_2141 (2141)	0.94	1.0	1.0	0.35	0.0	0.27	0.44	0.67	0.0	0.0	0.13
Transcript_contig_21704 (21704)	0.8	0.94	0.35	0.13	0.2	0.2	0.47	1.0	0.04	0.03	0.02
Transcript_contig_25765 (25765)	0.9	0.87	0.6	0.21	0.0	0.0	0.09	1.0	0.0	0.06	0.17
Transcript_contig_3239 (3239)	0.72	0.71	0.0	0.26	0.0	0.0	0.11	1.0	0.0	0.14	0.13
Transcript_contig_3649 (3649)	0.98	1.0	0.76	0.49	0.02	0.22	0.16	0.75	0.05	0.31	0.3
Transcript_contig_3947 (3947)	0.89	1.0	0.78	0.32	0.05	0.4	0.56	0.32	0.2	0.2	0.24
Transcript_contig_4098 (4098)	0.69	1.0	0.79	0.23	0.2	0.17	0.38	0.93	0.0	0.07	0.05
Transcript_contig_4460 (4460)	0.38	0.53	0.26	0.12	0.0	0.08	0.15	1.0	0.02	0.08	0.02
Transcript_contig_4592 (4592)	0.64	1.0	0.52	0.56	0.36	0.18	0.14	0.46	0.0	0.02	0.07
Transcript_contig_4780 (4780)	0.84	1.0	0.65	0.17	0.4	0.22	0.42	0.75	0.0	0.05	0.05
Transcript_contig_5118 (5118)	0.68	1.0	0.78	0.28	0.0	0.2	0.08	0.7	0.06	0.18	0.13
Transcript_contig_53795 (53795)	0.89	1.0	0.73	0.34	0.08	0.53	0.48	0.62	0.4	0.3	0.2
Transcript_contig_54116 (54116)	0.8	1.0	0.39	0.17	0.01	0.08	0.17	0.53	0.15	0.14	0.1
Transcript_contig_54168 (54168)	0.93	1.0	0.74	0.38	0.14	0.34	0.55	0.63	0.14	0.4	0.33
Transcript_contig_54563 (54563)	0.91	1.0	0.54	0.21	0.09	0.15	0.31	0.68	0.1	0.12	0.1
Transcript_contig_55155 (55155)	0.78	1.0	0.57	0.36	0.2	0.18	0.35	0.62	0.12	0.51	0.27
Transcript_contig_55278 (55278)	0.79	1.0	0.54	0.27	0.01	0.06	0.07	0.53	0.02	0.09	0.06
Transcript_contig_55332 (55332)	0.79	1.0	0.63	0.38	0.01	0.28	0.26	0.67	0.32	0.28	0.17
Transcript_contig_55822 (55822)	0.84	1.0	0.55	0.22	0.07	0.09	0.22	0.55	0.05	0.19	0.13
Transcript_contig_56 (56)	0.56	0.87	0.45	0.23	0.01	0.12	0.32	1.0	0.06	0.13	0.16
Transcript_contig_56079 (56079)	0.73	1.0	0.73	0.45	0.03	0.11	0.28	0.96	0.28	0.43	0.28
Transcript_contig_56134 (56134)	0.68	1.0	0.48	0.54	0.37	0.12	0.4	0.52	0.05	0.18	0.15
Transcript_contig_56226 (56226)	0.82	1.0	0.63	0.36	0.3	0.21	0.45	0.86	0.29	0.25	0.19
Transcript_contig_56579 (56579)	0.86	1.0	0.47	0.2	0.17	0.17	0.17	0.59	0.04	0.13	0.17
Transcript_contig_57320 (57320)	0.78	1.0	0.34	0.11	0.02	0.08	0.16	0.62	0.03	0.05	0.04
Transcript_contig_57820 (57820)	0.77	1.0	0.47	0.3	0.5	0.15	0.33	0.67	0.15	0.19	0.17
Transcript_contig_57910 (57910)	0.72	1.0	0.44	0.35	0.0	0.15	0.23	0.36	0.04	0.03	0.02
Transcript_contig_58017 (58017)	0.85	1.0	0.85	0.37	0.13	0.29	0.56	0.49	0.14	0.33	0.21
Transcript_contig_58220 (58220)	0.84	1.0	0.44	0.2	0.0	0.01	0.01	0.65	0.2	0.16	0.12
Transcript_contig_58272 (58272)	0.74	0.86	1.0	0.32	0.02	0.08	0.29	0.81	0.29	0.27	0.24
Transcript_contig_58663 (58663)	0.86	1.0	0.47	0.45	0.25	0.13	0.41	0.82	0.08	0.22	0.25
Transcript_contig_58684 (58684)	0.83	0.99	0.62	0.51	0.28	0.3	0.41	1.0	0.04	0.34	0.26
Transcript_contig_58859 (58859)	0.76	1.0	0.29	0.33	0.12	0.15	0.22	0.64	0.0	0.15	0.16
Transcript_contig_58968 (58968)	0.48	0.7	0.61	0.28	0.02	0.06	0.17	1.0	0.04	0.2	0.11
Transcript_contig_59164 (59164)	0.74	1.0	0.73	0.38	0.06	0.16	0.37	0.7	0.08	0.38	0.23
Transcript_contig_59186 (59186)	0.76	1.0	0.43	0.27	0.15	0.16	0.15	0.63	0.06	0.38	0.28
Transcript_contig_59510 (59510)	0.86	1.0	0.56	0.32	0.05	0.21	0.3	0.63	0.64	0.16	0.22
Transcript_contig_59637 (59637)	0.81	1.0	0.56	0.41	0.32	0.15	0.37	0.89	0.06	0.11	0.07
Transcript_contig_59702 (59702)	0.96	1.0	0.58	0.28	0.14	0.13	0.24	0.37	0.1	0.21	0.17
Transcript_contig_59784 (59784)	0.69	0.81	0.11	0.12	0.15	0.11	0.31	1.0	0.02	0.14	0.1
Transcript_contig_59837 (59837)	0.75	1.0	0.67	0.74	0.27	0.18	0.38	0.55	0.08	0.11	0.08
Transcript_contig_60114 (60114)	0.68	1.0	0.27	0.15	0.01	0.03	0.07	0.76	0.01	0.1	0.07
Transcript_contig_60181 (60181)	0.75	0.97	1.0	0.31	0.04	0.12	0.26	0.77	0.12	0.3	0.12
Transcript_contig_60481 (60481)	0.87	1.0	0.7	0.32	0.14	0.21	0.28	0.76	0.28	0.22	0.12
Transcript_contig_60857 (60857)	0.81	1.0	0.66	0.27	0.0	0.04	0.05	0.66	0.31	0.08	0.12
Transcript_contig_60907 (60907)	0.82	1.0	0.39	0.28	0.05	0.16	0.2	0.92	0.06	0.3	0.17
Transcript_contig_61247 (61247)	0.9	1.0	0.73	0.31	0.05	0.14	0.38	0.43	0.51	0.23	0.14
Transcript_contig_62065 (62065)	0.9	1.0	0.52	0.24	0.02	0.14	0.29	0.43	0.29	0.18	0.16
Transcript_contig_6228 (6228)	0.85	1.0	0.76	0.37	0.0	0.17	0.14	0.48	0.05	0.06	0.04
Transcript_contig_63141 (63141)	0.79	1.0	0.85	0.28	0.04	0.13	0.18	0.72	0.0	0.02	0.01
Transcript_contig_63508 (63508)	0.78	1.0	0.38	0.34	0.22	0.27	0.41	0.76	0.0	0.0	0.0
Transcript_contig_6436 (6436)	0.66	0.95	1.0	0.42	0.29	0.11	0.32	0.33	0.0	0.09	0.02
Transcript_contig_660 (660)	0.61	0.91	0.51	0.31	0.03	0.09	0.22	1.0	0.04	0.09	0.08
Transcript_contig_66214 (66214)	0.85	0.99	1.0	0.38	0.03	0.22	0.6	0.69	0.45	0.0	0.04
Transcript_contig_66298 (66298)	0.74	0.96	0.58	0.22	0.1	0.1	0.15	1.0	0.0	0.0	0.0
Transcript_contig_67566 (67566)	1.0	0.89	0.42	0.5	0.0	0.03	0.27	0.68	0.25	0.22	0.27
Transcript_contig_67646 (67646)	0.69	0.93	0.55	0.39	0.1	0.1	0.1	1.0	0.54	0.28	0.15
Transcript_contig_67704 (67704)	0.71	1.0	0.41	0.46	0.03	0.17	0.48	0.93	0.1	0.08	0.12
Transcript_contig_67952 (67952)	0.65	0.83	0.22	0.11	0.04	0.08	0.42	1.0	0.04	0.03	0.06
Transcript_contig_68499 (68499)	0.46	0.92	0.25	0.11	0.15	0.0	0.4	1.0	0.0	0.0	0.0
Transcript_contig_68896 (68896)	0.67	0.79	0.39	0.17	0.06	0.09	0.27	1.0	0.0	0.14	0.04
Transcript_contig_69365 (69365)	0.92	1.0	0.41	0.18	0.07	0.16	0.34	0.55	0.17	0.13	0.14
Transcript_contig_7480 (7480)	0.75	0.81	0.88	0.86	0.52	0.16	0.37	1.0	0.0	0.09	0.0
Transcript_contig_78571 (78571)	0.72	1.0	0.3	0.15	0.01	0.02	0.09	0.79	0.05	0.01	0.01
Transcript_contig_78654 (78654)	0.72	1.0	0.42	0.19	0.01	0.05	0.15	0.72	0.03	0.01	0.01
Transcript_contig_78781 (78781)	0.85	1.0	0.78	0.36	0.22	0.24	0.55	0.62	0.31	0.26	0.24
Transcript_contig_78854 (78854)	0.75	1.0	0.42	0.17	0.0	0.01	0.01	0.6	0.17	0.1	0.08
Transcript_contig_79420 (79420)	0.74	0.98	0.75	0.53	0.19	0.21	0.42	1.0	0.01	0.21	0.3
Transcript_contig_79617 (79617)	0.9	0.83	1.0	0.22	0.17	0.19	0.2	0.27	0.21	0.34	0.25
Transcript_contig_79962 (79962)	0.62	0.91	0.94	1.0	0.57	0.11	0.37	0.76	0.0	0.1	0.09
Transcript_contig_80005 (80005)	0.77	1.0	0.51	0.24	0.04	0.11	0.23	0.81	0.26	0.0	0.02
Transcript_contig_80088 (80088)	0.89	1.0	0.43	0.22	0.12	0.11	0.25	0.6	0.15	0.1	0.09
Transcript_contig_80479 (80479)	0.76	1.0	0.52	0.34	0.01	0.04	0.26	0.87	0.0	0.02	0.01
Transcript_contig_80561 (80561)	0.85	1.0	0.21	0.25	0.22	0.14	0.25	0.59	0.15	0.1	0.12
Transcript_contig_81010 (81010)	0.84	1.0	0.69	0.35	0.38	0.2	0.42	0.94	0.14	0.26	0.22
Transcript_contig_81344 (81344)	0.76	0.94	0.6	0.52	0.29	0.18	0.25	1.0	0.03	0.15	0.08
Transcript_contig_81994 (81994)	0.64	0.84	0.83	0.29	0.11	0.08	0.17	1.0	0.24	0.35	0.26
Transcript_contig_82508 (82508)	0.79	1.0	0.55	0.29	0.05	0.18	0.4	0.8	0.32	0.21	0.17
Transcript_contig_83287 (83287)	0.68	0.82	0.65	0.33	0.28	0.22	0.3	1.0	0.02	0.05	0.01
Transcript_contig_8376 (8376)	0.7	1.0	0.69	0.38	0.03	0.13	0.29	0.84	0.06	0.28	0.15
Transcript_contig_8806 (8806)	0.87	1.0	0.42	0.22	0.08	0.16	0.38	0.83	0.19	0.37	0.16
Transcript_contig_89284 (89284)	0.76	1.0	0.64	0.34	0.01	0.09	0.1	0.89	0.33	0.31	0.24
Transcript_contig_89472 (89472)	0.75	1.0	0.45	0.22	0.05	0.2	0.27	0.69	0.05	0.34	0.19
Transcript_contig_89782 (89782)	0.82	1.0	0.51	0.35	0.04	0.29	0.55	0.67	0.25	0.15	0.19
Transcript_contig_90023 (90023)	0.89	1.0	0.45	0.32	0.23	0.15	0.37	0.5	0.24	0.11	0.1
Transcript_contig_90160 (90160)	0.74	1.0	0.37	0.24	0.1	0.17	0.3	0.8	0.08	0.25	0.22
Transcript_contig_90652 (90652)	0.76	1.0	0.66	0.29	0.16	0.27	0.33	0.67	0.04	0.3	0.23
Transcript_contig_91481 (91481)	0.68	1.0	0.53	0.35	0.1	0.3	0.33	0.42	0.25	0.16	0.11
Transcript_contig_926 (926)	0.84	0.9	1.0	0.2	0.09	0.03	0.22	0.63	0.19	0.23	0.25
Transcript_contig_991 (991)	0.8	1.0	0.98	0.23	0.05	0.16	0.4	0.55	0.51	0.0	0.04

Details

Expression values normalized per gene (using the maximum value, Green cells indicate low expression and red high. (Dark gray cells indicate missing values)