Heatmap: Cluster_222 (HCCA)

View as: (view raw or zlog-transformed)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are normalized against highest expression of the row)

Gene	CCAP211/11P,High light	CCAP211/11P,Low light	CPCC90,BBM,72h,Autotrophy	CPCC90,BBM,97h,Mixotrophy	CPCC90,BBM,98h,Mixotrophy	CPCC90,BBM,120h,Mixotrophy	CPCC90,BBM,144h,Heterotrophy	NJ-7,20C	NJ-7,4C	UTEX259,20C	UTEX259,4C
Transcript_contig_12021 (12021)	0.02	0.02	0.0	0.01	0.01	0.02	0.01	0.0	1.0	0.04	0.04
Transcript_contig_12120 (12120)	0.25	0.09	0.26	0.25	0.2	0.24	0.18	0.01	1.0	0.49	0.35
Transcript_contig_2143 (2143)	0.27	0.25	0.1	0.19	0.28	0.14	0.14	0.2	1.0	0.27	0.21
Transcript_contig_2720 (2720)	0.01	0.0	0.01	0.0	0.01	0.03	0.0	0.0	1.0	0.01	0.05
Transcript_contig_4284 (4284)	0.09	0.03	0.27	0.43	0.48	0.18	0.22	0.02	1.0	0.23	0.13
Transcript_contig_4295 (4295)	0.22	0.01	0.35	0.27	0.27	0.17	0.28	0.01	1.0	0.37	0.36
Transcript_contig_53943 (53943)	0.58	0.36	0.19	0.49	0.61	0.53	0.56	0.47	1.0	0.84	0.68
Transcript_contig_53968 (53968)	0.21	0.15	0.14	0.25	0.31	0.16	0.17	0.12	1.0	0.28	0.22
Transcript_contig_53996 (53996)	0.28	0.21	0.49	0.48	0.73	0.17	0.33	0.24	1.0	0.65	0.45
Transcript_contig_55260 (55260)	0.31	0.22	0.21	0.31	0.49	0.31	0.36	0.26	1.0	0.44	0.41
Transcript_contig_55993 (55993)	0.17	0.06	0.2	0.34	0.3	0.2	0.23	0.08	1.0	0.46	0.35
Transcript_contig_56038 (56038)	0.71	0.8	0.4	1.0	0.57	0.47	0.54	0.68	0.69	0.19	0.27
Transcript_contig_56191 (56191)	0.42	0.31	0.26	0.42	0.53	0.38	0.47	0.26	1.0	0.71	0.52
Transcript_contig_57770 (57770)	0.28	0.15	0.42	0.35	0.62	0.25	0.27	0.09	1.0	0.38	0.38
Transcript_contig_57858 (57858)	0.05	0.03	0.03	0.07	0.1	0.02	0.06	0.03	1.0	0.03	0.03
Transcript_contig_57930 (57930)	0.37	0.16	0.44	0.91	0.45	0.36	0.47	0.03	1.0	0.65	0.41
Transcript_contig_584 (584)	0.12	0.03	0.11	0.24	0.35	0.17	0.17	0.02	1.0	0.23	0.25
Transcript_contig_5841 (5841)	0.5	0.49	0.4	0.6	1.0	0.32	0.29	0.62	0.84	0.81	0.81
Transcript_contig_58579 (58579)	0.09	0.02	0.07	0.15	0.24	0.13	0.08	0.01	1.0	0.39	0.36
Transcript_contig_58585 (58585)	0.17	0.11	0.13	0.44	0.62	0.31	0.19	0.15	1.0	0.51	0.31
Transcript_contig_59634 (59634)	0.05	0.06	0.06	0.04	0.01	0.05	0.03	0.11	1.0	0.04	0.1
Transcript_contig_59695 (59695)	0.26	0.12	0.06	0.62	0.67	0.2	0.44	0.06	1.0	0.18	0.13
Transcript_contig_60363 (60363)	0.17	0.05	0.2	0.36	0.64	0.15	0.16	0.03	1.0	0.45	0.37
Transcript_contig_60581 (60581)	0.09	0.08	0.06	0.22	0.42	0.21	0.27	0.13	1.0	0.16	0.02
Transcript_contig_61078 (61078)	0.05	0.03	0.03	0.01	0.0	0.22	0.0	0.0	1.0	0.07	0.09
Transcript_contig_61276 (61276)	0.18	0.17	0.07	0.55	0.48	0.24	0.25	0.23	1.0	0.12	0.12
Transcript_contig_61301 (61301)	0.4	0.35	0.4	0.45	0.79	0.22	0.3	0.38	1.0	0.55	0.51
Transcript_contig_61501 (61501)	0.18	0.08	0.15	0.29	0.4	0.22	0.24	0.08	1.0	0.35	0.28
Transcript_contig_62107 (62107)	0.5	0.36	0.27	0.67	0.93	0.65	0.3	0.43	0.62	1.0	0.71
Transcript_contig_64651 (64651)	0.13	0.21	0.0	0.11	0.21	0.14	0.1	0.17	1.0	0.18	0.21
Transcript_contig_66267 (66267)	0.29	0.22	0.27	0.36	0.6	0.26	0.23	0.21	1.0	0.58	0.44
Transcript_contig_6631 (6631)	0.15	0.18	0.08	0.09	0.16	0.1	0.15	0.06	1.0	0.01	0.16
Transcript_contig_67503 (67503)	0.2	0.1	0.34	0.55	0.51	0.28	0.26	0.08	1.0	0.61	0.51
Transcript_contig_67610 (67610)	0.34	0.23	0.23	0.81	0.9	0.21	0.44	0.14	1.0	0.93	0.56
Transcript_contig_67737 (67737)	0.41	0.27	0.24	0.53	0.79	0.53	0.44	0.33	1.0	0.72	0.72
Transcript_contig_67869 (67869)	0.03	0.0	0.05	0.06	0.04	0.01	0.02	0.0	1.0	0.07	0.03
Transcript_contig_68160 (68160)	0.16	0.05	0.13	0.09	0.1	0.03	0.05	0.07	1.0	0.51	0.16
Transcript_contig_68309 (68309)	0.03	0.04	0.01	0.01	0.05	0.09	0.01	0.06	1.0	0.34	0.24
Transcript_contig_68401 (68401)	0.54	0.6	0.15	0.74	0.56	0.19	0.31	0.62	1.0	0.12	0.14
Transcript_contig_6848 (6848)	0.06	0.06	0.01	0.02	0.0	0.05	0.03	0.05	1.0	0.12	0.08
Transcript_contig_68771 (68771)	0.43	0.07	0.5	0.7	1.0	0.34	0.22	0.03	0.47	0.91	0.92
Transcript_contig_70649 (70649)	0.2	0.09	0.13	0.16	0.14	0.17	0.31	0.11	1.0	0.6	0.3
Transcript_contig_70655 (70655)	0.38	0.23	0.36	0.44	0.49	0.42	0.44	0.18	1.0	0.71	0.54
Transcript_contig_70958 (70958)	0.27	0.04	0.26	0.56	0.72	0.1	0.25	0.02	1.0	0.75	0.49
Transcript_contig_78863 (78863)	0.31	0.21	0.19	0.68	0.59	0.42	0.57	0.22	1.0	0.5	0.32
Transcript_contig_79142 (79142)	0.11	0.04	0.03	0.28	0.26	0.08	0.17	0.02	1.0	0.1	0.09
Transcript_contig_80390 (80390)	0.03	0.0	0.19	0.07	0.05	0.06	0.04	0.0	1.0	0.14	0.16
Transcript_contig_80595 (80595)	0.35	0.23	0.51	0.52	0.42	0.37	0.55	0.07	1.0	0.67	0.51
Transcript_contig_82015 (82015)	0.47	0.36	0.22	0.53	0.52	0.5	0.38	0.24	1.0	0.93	0.85
Transcript_contig_82039 (82039)	0.22	0.19	0.2	0.25	0.19	0.19	0.2	0.13	1.0	0.38	0.31
Transcript_contig_83225 (83225)	0.27	0.23	0.24	0.47	0.24	0.31	0.4	0.34	1.0	0.53	0.26
Transcript_contig_889 (889)	0.59	0.66	0.34	0.67	0.56	0.25	0.55	0.49	1.0	0.11	0.15
Transcript_contig_89492 (89492)	0.43	0.25	0.38	0.51	0.62	0.54	0.32	0.32	1.0	0.74	0.61

Details

Expression values normalized per gene (using the maximum value, Green cells indicate low expression and red high. (Dark gray cells indicate missing values)