Heatmap: Cluster_135 (HCCA)

View as: (view raw or zlog-transformed)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are normalized against highest expression of the row)

Gene	CCAP211/11P,High light	CCAP211/11P,Low light	CPCC90,BBM,72h,Autotrophy	CPCC90,BBM,97h,Mixotrophy	CPCC90,BBM,98h,Mixotrophy	CPCC90,BBM,120h,Mixotrophy	CPCC90,BBM,144h,Heterotrophy	NJ-7,20C	NJ-7,4C	UTEX259,20C	UTEX259,4C
Transcript_contig_10 (10)	0.18	0.1	0.36	0.76	0.4	0.24	1.0	0.0	0.0	0.07	0.02
Transcript_contig_10174 (10174)	0.26	0.0	0.2	0.08	0.84	0.57	1.0	0.0	0.0	0.0	0.09
Transcript_contig_10343 (10343)	0.2	0.02	0.51	0.74	0.39	0.22	1.0	0.06	0.0	0.02	0.0
Transcript_contig_10362 (10362)	0.33	0.07	0.5	0.54	0.54	0.2	1.0	0.0	0.0	0.02	0.03
Transcript_contig_109 (109)	0.43	0.09	0.36	0.43	0.28	0.43	1.0	0.11	0.0	0.0	0.09
Transcript_contig_10924 (10924)	0.29	0.0	0.59	0.37	0.29	0.17	1.0	0.0	0.0	0.0	0.0
Transcript_contig_11260 (11260)	0.26	0.0	1.0	0.3	0.06	0.4	0.65	0.0	0.0	0.1	0.38
Transcript_contig_11701 (11701)	0.24	0.0	0.4	0.43	0.19	0.43	1.0	0.0	0.0	0.03	0.05
Transcript_contig_1185 (1185)	0.19	0.0	0.66	0.8	0.19	0.53	1.0	0.0	0.0	0.0	0.11
Transcript_contig_11936 (11936)	0.25	0.0	0.38	0.51	0.3	0.25	1.0	0.0	0.06	0.02	0.22
Transcript_contig_121 (121)	0.2	0.01	1.0	0.32	0.16	0.28	0.72	0.0	0.0	0.01	0.02
Transcript_contig_12142 (12142)	0.84	0.68	1.0	0.84	0.66	0.52	0.51	0.4	0.0	0.0	0.64
Transcript_contig_12427 (12427)	0.28	0.0	0.09	0.16	0.08	0.32	1.0	0.0	0.0	0.02	0.12
Transcript_contig_12475 (12475)	0.2	0.0	1.0	0.18	0.44	0.34	0.85	0.0	0.0	0.0	0.0
Transcript_contig_1340 (1340)	0.37	0.05	0.29	0.27	0.15	0.56	1.0	0.01	0.01	0.1	0.07
Transcript_contig_13950 (13950)	0.36	0.09	0.23	0.21	0.1	0.31	1.0	0.09	0.0	0.0	0.02
Transcript_contig_14129 (14129)	0.26	0.11	0.61	0.45	0.42	0.22	1.0	0.06	0.0	0.07	0.0
Transcript_contig_15386 (15386)	0.32	0.04	0.17	0.17	0.24	0.26	1.0	0.07	0.0	0.01	0.08
Transcript_contig_17480 (17480)	0.27	0.13	0.9	0.37	0.62	0.43	1.0	0.14	0.05	0.0	0.0
Transcript_contig_18628 (18628)	0.26	0.04	0.25	0.21	0.18	0.36	1.0	0.02	0.0	0.01	0.01
Transcript_contig_19278 (19278)	0.15	0.0	0.26	0.35	0.19	0.67	1.0	0.0	0.0	0.0	0.3
Transcript_contig_2238 (2238)	0.37	0.09	0.64	0.6	0.49	0.37	1.0	0.09	0.03	0.0	0.13
Transcript_contig_24359 (24359)	0.25	0.09	0.3	0.39	0.68	0.31	1.0	0.46	0.0	0.0	0.0
Transcript_contig_2481 (2481)	0.1	0.0	0.55	0.35	0.24	0.58	1.0	0.0	0.0	0.0	0.19
Transcript_contig_25822 (25822)	0.07	0.0	0.28	0.4	0.27	0.68	1.0	0.0	0.0	0.0	0.3
Transcript_contig_2784 (2784)	0.13	0.0	1.0	0.72	0.34	0.76	0.48	0.0	0.0	0.0	0.4
Transcript_contig_3104 (3104)	0.24	0.04	1.0	0.17	0.1	0.4	0.77	0.11	0.0	0.0	0.04
Transcript_contig_3206 (3206)	0.33	0.0	0.63	0.57	0.29	0.34	1.0	0.0	0.0	0.0	0.49
Transcript_contig_3501 (3501)	0.11	0.0	0.66	1.0	0.56	0.35	0.8	0.0	0.0	0.0	0.43
Transcript_contig_3752 (3752)	0.29	0.04	0.96	0.5	0.4	0.28	1.0	0.02	0.0	0.03	0.04
Transcript_contig_3856 (3856)	0.23	0.0	0.18	0.26	0.25	0.31	1.0	0.0	0.0	0.04	0.01
Transcript_contig_3963 (3963)	0.09	0.0	0.39	0.36	0.43	0.42	1.0	0.0	0.0	0.0	0.07
Transcript_contig_4020 (4020)	0.28	0.0	0.94	0.68	0.68	0.46	1.0	0.0	0.0	0.01	0.02
Transcript_contig_4133 (4133)	0.22	0.0	0.78	1.0	0.97	0.58	0.81	0.0	0.0	0.0	0.51
Transcript_contig_4407 (4407)	0.22	0.0	0.3	0.62	0.47	0.41	1.0	0.0	0.04	0.0	0.02
Transcript_contig_445 (445)	0.13	0.0	0.85	0.58	0.27	0.38	1.0	0.0	0.0	0.0	0.12
Transcript_contig_4631 (4631)	0.18	0.19	0.85	0.11	0.09	0.45	1.0	0.0	0.0	0.0	0.15
Transcript_contig_4973 (4973)	0.23	0.0	0.61	0.97	0.29	0.73	1.0	0.0	0.0	0.0	0.35
Transcript_contig_5190 (5190)	0.25	0.0	0.82	0.67	0.5	0.08	1.0	0.0	0.0	0.0	0.09
Transcript_contig_54047 (54047)	0.37	0.13	0.61	0.28	0.12	0.56	1.0	0.19	0.34	0.0	0.01
Transcript_contig_54429 (54429)	0.18	0.14	0.53	0.54	0.52	0.5	1.0	0.12	0.07	0.05	0.22
Transcript_contig_54456 (54456)	0.21	0.01	0.55	0.49	0.51	0.34	1.0	0.0	0.0	0.0	0.03
Transcript_contig_5501 (5501)	0.13	0.0	1.0	0.94	0.49	0.53	0.85	0.0	0.0	0.0	0.19
Transcript_contig_55365 (55365)	0.22	0.01	0.61	0.71	0.48	0.52	1.0	0.0	0.0	0.0	0.26
Transcript_contig_55970 (55970)	0.28	0.23	0.9	0.81	0.69	0.49	1.0	0.3	0.0	0.0	0.37
Transcript_contig_57133 (57133)	0.27	0.0	0.69	0.46	0.28	0.52	1.0	0.0	0.0	0.2	0.23
Transcript_contig_5743 (5743)	0.22	0.0	1.0	0.38	0.69	0.16	0.93	0.0	0.0	0.0	0.0
Transcript_contig_57643 (57643)	0.15	0.0	1.0	0.51	0.09	0.84	0.9	0.0	0.0	0.0	0.36
Transcript_contig_58660 (58660)	0.22	0.0	0.7	0.54	0.28	0.36	1.0	0.0	0.0	0.17	0.17
Transcript_contig_58692 (58692)	0.27	0.0	0.68	0.46	0.99	0.28	1.0	0.0	0.0	0.0	0.08
Transcript_contig_59269 (59269)	0.22	0.0	0.82	0.35	0.17	0.28	1.0	0.0	0.0	0.0	0.01
Transcript_contig_59774 (59774)	0.22	0.0	0.51	0.62	0.56	0.5	1.0	0.0	0.0	0.16	0.2
Transcript_contig_59902 (59902)	0.18	0.0	0.39	0.5	0.39	0.43	1.0	0.0	0.0	0.0	0.03
Transcript_contig_59983 (59983)	0.28	0.01	0.72	0.58	1.0	0.28	0.82	0.0	0.0	0.0	0.0
Transcript_contig_60244 (60244)	0.21	0.0	0.26	0.15	0.21	0.65	1.0	0.0	0.57	0.03	0.51
Transcript_contig_60341 (60341)	0.12	0.0	0.77	0.56	0.57	0.78	1.0	0.0	0.0	0.0	0.27
Transcript_contig_60489 (60489)	0.14	0.0	0.51	1.0	0.42	0.55	0.78	0.0	0.0	0.0	0.41
Transcript_contig_60633 (60633)	0.26	0.0	0.17	0.25	0.46	0.49	1.0	0.0	0.0	0.0	0.17
Transcript_contig_60645 (60645)	0.23	0.0	0.54	0.56	0.74	0.58	1.0	0.0	0.01	0.03	0.13
Transcript_contig_61027 (61027)	0.21	0.04	0.25	0.64	0.17	0.27	1.0	0.14	0.0	0.0	0.04
Transcript_contig_6120 (6120)	0.36	0.29	0.78	0.64	0.49	0.4	1.0	0.39	0.0	0.26	0.6
Transcript_contig_61318 (61318)	0.23	0.0	0.51	0.81	0.78	0.42	1.0	0.0	0.06	0.0	0.21
Transcript_contig_61386 (61386)	0.25	0.0	0.38	0.48	0.3	0.47	1.0	0.0	0.0	0.0	0.06
Transcript_contig_61514 (61514)	0.22	0.19	0.59	0.65	0.61	0.26	1.0	0.13	0.0	0.08	0.37
Transcript_contig_61950 (61950)	0.19	0.0	0.79	0.61	0.45	0.43	1.0	0.0	0.0	0.15	0.39
Transcript_contig_62218 (62218)	0.15	0.0	0.99	0.5	0.19	0.58	1.0	0.0	0.0	0.0	0.03
Transcript_contig_6306 (6306)	0.19	0.13	0.87	0.53	0.46	0.32	1.0	0.17	0.0	0.03	0.01
Transcript_contig_6339 (6339)	0.36	0.16	0.54	0.42	0.45	0.44	1.0	0.24	0.0	0.06	0.09
Transcript_contig_65298 (65298)	0.19	0.0	0.71	0.1	0.33	0.55	1.0	0.0	0.0	0.0	0.18
Transcript_contig_66114 (66114)	0.19	0.0	1.0	0.48	0.54	0.38	0.88	0.0	0.0	0.0	0.2
Transcript_contig_66142 (66142)	0.28	0.01	0.27	0.19	0.07	0.4	1.0	0.04	0.07	0.0	0.05
Transcript_contig_67495 (67495)	0.13	0.0	0.59	1.0	0.57	0.49	0.86	0.0	0.0	0.01	0.21
Transcript_contig_67751 (67751)	0.18	0.0	0.67	0.37	0.09	0.52	1.0	0.07	0.0	0.0	0.13
Transcript_contig_67981 (67981)	0.26	0.21	0.29	0.39	0.48	0.37	1.0	0.29	0.0	0.08	0.36
Transcript_contig_68398 (68398)	0.27	0.23	0.38	0.74	0.26	0.7	1.0	0.39	0.0	0.0	0.44
Transcript_contig_68432 (68432)	0.16	0.0	0.51	0.55	0.34	0.58	1.0	0.0	0.0	0.0	0.39
Transcript_contig_68436 (68436)	0.27	0.0	0.73	0.4	0.16	0.46	1.0	0.0	0.0	0.0	0.25
Transcript_contig_68604 (68604)	0.28	0.02	0.55	0.62	0.33	0.62	1.0	0.0	0.0	0.01	0.3
Transcript_contig_68810 (68810)	0.24	0.01	1.0	0.72	0.43	0.45	0.92	0.04	0.27	0.11	0.32
Transcript_contig_68833 (68833)	0.27	0.0	0.38	0.37	0.08	0.52	1.0	0.0	0.0	0.0	0.3
Transcript_contig_68845 (68845)	0.27	0.0	0.99	0.52	0.14	0.79	1.0	0.0	0.0	0.0	0.33
Transcript_contig_69311 (69311)	0.23	0.09	1.0	0.67	0.55	0.61	0.61	0.0	0.0	0.04	0.5
Transcript_contig_69514 (69514)	0.36	0.06	0.1	1.0	0.61	0.39	0.92	0.0	0.0	0.0	0.56
Transcript_contig_69599 (69599)	0.25	0.02	0.55	0.41	0.39	0.39	1.0	0.06	0.0	0.0	0.04
Transcript_contig_69741 (69741)	0.29	0.12	0.66	0.61	0.31	0.99	1.0	0.25	0.07	0.1	0.56
Transcript_contig_70083 (70083)	0.3	0.14	0.76	0.41	0.31	0.59	1.0	0.05	0.0	0.0	0.22
Transcript_contig_70149 (70149)	0.28	0.0	0.73	0.34	0.12	0.36	1.0	0.0	0.0	0.0	0.11
Transcript_contig_70585 (70585)	0.27	0.11	0.67	0.64	0.35	0.98	1.0	0.21	0.06	0.24	0.62
Transcript_contig_70980 (70980)	0.1	0.0	0.31	0.28	0.23	0.6	1.0	0.0	0.0	0.06	0.29
Transcript_contig_71420 (71420)	0.39	0.04	0.2	0.44	0.15	0.35	1.0	0.0	0.0	0.1	0.22
Transcript_contig_72051 (72051)	0.49	0.44	0.87	0.67	1.0	0.95	0.58	0.44	0.0	0.02	0.66
Transcript_contig_72248 (72248)	0.27	0.2	0.26	0.73	0.5	0.74	1.0	0.0	0.7	0.0	0.25
Transcript_contig_72317 (72317)	0.42	0.12	0.42	0.4	0.17	0.35	1.0	0.08	0.0	0.08	0.05
Transcript_contig_72606 (72606)	0.61	0.27	0.61	0.79	0.45	0.27	1.0	0.18	0.0	0.23	0.17
Transcript_contig_73375 (73375)	0.23	0.03	0.28	0.48	0.48	0.42	1.0	0.03	0.0	0.12	0.08
Transcript_contig_7656 (7656)	0.15	0.0	0.64	0.41	0.35	0.44	1.0	0.0	0.0	0.0	0.17
Transcript_contig_7667 (7667)	0.2	0.06	1.0	0.38	0.0	0.66	0.55	0.0	0.0	0.0	0.14
Transcript_contig_7751 (7751)	0.47	0.1	0.54	0.49	0.34	0.34	1.0	0.38	0.0	0.0	0.0
Transcript_contig_78256 (78256)	0.19	0.01	0.65	1.0	0.96	0.42	0.91	0.0	0.0	0.02	0.28
Transcript_contig_78495 (78495)	0.51	0.23	0.64	0.33	0.07	0.29	1.0	0.15	0.01	0.02	0.03
Transcript_contig_78899 (78899)	0.27	0.09	0.66	0.6	0.39	0.91	1.0	0.16	0.1	0.08	0.45
Transcript_contig_78927 (78927)	0.24	0.12	0.66	0.67	0.43	0.81	1.0	0.27	0.15	0.2	0.47
Transcript_contig_79 (79)	0.22	0.0	0.93	0.54	0.74	0.53	1.0	0.0	0.0	0.0	0.43
Transcript_contig_79092 (79092)	0.19	0.0	0.6	0.52	1.0	0.46	0.75	0.0	0.0	0.03	0.4
Transcript_contig_79284 (79284)	0.22	0.0	0.77	0.98	0.94	0.75	1.0	0.0	0.0	0.0	0.34
Transcript_contig_79355 (79355)	0.4	0.13	0.13	0.33	0.37	0.31	1.0	0.09	0.29	0.19	0.17
Transcript_contig_79547 (79547)	0.12	0.0	0.75	0.85	0.64	0.68	1.0	0.0	0.0	0.0	0.43
Transcript_contig_79682 (79682)	0.34	0.0	0.39	0.47	0.45	0.27	1.0	0.0	0.0	0.0	0.02
Transcript_contig_79928 (79928)	0.26	0.0	0.79	0.48	0.3	0.32	1.0	0.0	0.0	0.0	0.07
Transcript_contig_79939 (79939)	0.24	0.0	0.7	0.47	0.27	0.38	1.0	0.0	0.0	0.0	0.15
Transcript_contig_79966 (79966)	0.3	0.0	0.59	0.33	0.18	0.33	1.0	0.0	0.0	0.0	0.08
Transcript_contig_80069 (80069)	0.26	0.03	0.58	0.42	0.24	0.35	1.0	0.04	0.0	0.08	0.05
Transcript_contig_80406 (80406)	0.38	0.4	0.7	0.65	0.6	1.0	0.55	0.63	0.0	0.19	0.45
Transcript_contig_80421 (80421)	0.25	0.0	1.0	0.53	0.48	0.63	0.89	0.0	0.0	0.0	0.29
Transcript_contig_80472 (80472)	0.13	0.01	0.68	1.0	0.84	0.5	0.74	0.0	0.0	0.0	0.3
Transcript_contig_80569 (80569)	0.19	0.0	0.45	0.45	0.6	0.44	1.0	0.0	0.0	0.0	0.02
Transcript_contig_80727 (80727)	0.33	0.22	0.53	0.75	0.52	0.52	1.0	0.0	0.39	0.03	0.21
Transcript_contig_80850 (80850)	0.19	0.0	0.44	0.3	0.43	0.63	1.0	0.0	0.0	0.0	0.26
Transcript_contig_81264 (81264)	0.31	0.0	0.63	0.68	0.51	0.42	1.0	0.0	0.0	0.0	0.04
Transcript_contig_81313 (81313)	0.35	0.0	1.0	0.93	0.51	0.29	0.9	0.0	0.0	0.0	0.19
Transcript_contig_81390 (81390)	0.31	0.01	0.64	0.24	0.45	0.22	1.0	0.0	0.0	0.0	0.19
Transcript_contig_81564 (81564)	0.27	0.11	0.76	0.93	0.64	0.81	1.0	0.11	0.05	0.1	0.67
Transcript_contig_81621 (81621)	0.18	0.0	0.48	0.63	0.39	0.39	1.0	0.0	0.0	0.0	0.14
Transcript_contig_81683 (81683)	0.23	0.0	0.7	0.82	0.81	0.84	1.0	0.0	0.0	0.05	0.18
Transcript_contig_81873 (81873)	0.27	0.0	0.54	0.34	0.18	0.36	1.0	0.0	0.0	0.0	0.13
Transcript_contig_81887 (81887)	0.18	0.04	1.0	0.83	0.68	0.37	0.64	0.05	0.03	0.04	0.2
Transcript_contig_81952 (81952)	0.38	0.09	0.98	0.61	0.68	0.81	1.0	0.15	0.01	0.0	0.17
Transcript_contig_82104 (82104)	0.24	0.04	0.3	0.18	0.19	0.35	1.0	0.06	0.02	0.12	0.07
Transcript_contig_82220 (82220)	0.15	0.0	0.62	0.5	0.24	0.18	1.0	0.0	0.0	0.0	0.27
Transcript_contig_82223 (82223)	0.16	0.0	0.81	0.46	0.45	0.56	1.0	0.0	0.0	0.17	0.43
Transcript_contig_83239 (83239)	0.19	0.0	0.08	0.18	0.27	0.35	1.0	0.0	0.0	0.0	0.02
Transcript_contig_83779 (83779)	0.4	0.29	0.43	0.65	0.27	0.33	1.0	0.16	0.0	0.15	0.06
Transcript_contig_84059 (84059)	0.35	0.21	0.59	0.7	0.62	0.82	1.0	0.2	0.4	0.0	0.24
Transcript_contig_85978 (85978)	0.2	0.0	1.0	0.51	0.18	0.57	0.69	0.0	0.0	0.0	0.52
Transcript_contig_89634 (89634)	0.1	0.0	0.9	1.0	0.74	0.63	0.89	0.0	0.0	0.0	0.35
Transcript_contig_89698 (89698)	0.24	0.0	1.0	0.47	0.12	0.34	0.96	0.0	0.0	0.0	0.06
Transcript_contig_89765 (89765)	0.22	0.0	0.31	0.39	0.59	0.43	1.0	0.0	0.0	0.0	0.11
Transcript_contig_89787 (89787)	0.29	0.04	0.68	0.33	0.28	0.59	1.0	0.05	0.87	0.08	0.11
Transcript_contig_89875 (89875)	0.35	0.2	0.48	0.7	0.82	0.6	1.0	0.25	0.08	0.12	0.29
Transcript_contig_89988 (89988)	0.22	0.02	1.0	0.92	0.87	0.54	0.92	0.0	0.0	0.0	0.35
Transcript_contig_90020 (90020)	0.15	0.0	0.88	0.6	0.7	0.59	1.0	0.0	0.0	0.0	0.33
Transcript_contig_90035 (90035)	0.22	0.0	0.57	0.62	0.84	0.43	1.0	0.0	0.0	0.0	0.08
Transcript_contig_90049 (90049)	0.33	0.0	0.55	0.38	0.08	0.26	1.0	0.0	0.0	0.0	0.03
Transcript_contig_90087 (90087)	0.23	0.01	0.9	0.43	0.11	0.33	1.0	0.0	0.0	0.0	0.06
Transcript_contig_90144 (90144)	0.07	0.0	0.33	0.34	0.24	0.62	1.0	0.0	0.0	0.0	0.07
Transcript_contig_90376 (90376)	0.22	0.0	0.56	0.46	0.54	0.6	1.0	0.0	0.0	0.0	0.07
Transcript_contig_90524 (90524)	0.35	0.18	0.4	0.34	0.3	0.4	1.0	0.1	0.45	0.11	0.16
Transcript_contig_90595 (90595)	0.27	0.0	0.53	0.53	0.9	0.4	1.0	0.0	0.0	0.0	0.13
Transcript_contig_90615 (90615)	0.23	0.0	0.8	0.41	0.21	0.39	1.0	0.0	0.0	0.0	0.27
Transcript_contig_90661 (90661)	0.22	0.06	0.7	0.7	0.5	0.65	1.0	0.08	0.04	0.0	0.27
Transcript_contig_90880 (90880)	0.24	0.0	1.0	0.85	0.65	0.76	0.91	0.0	0.0	0.0	0.21
Transcript_contig_9301 (9301)	0.33	0.16	0.27	0.23	0.38	0.49	1.0	0.11	0.0	0.03	0.08
Transcript_contig_9497 (9497)	0.36	0.24	0.51	1.0	0.47	0.43	0.86	0.21	0.0	0.23	0.64

Details

Expression values normalized per gene (using the maximum value, Green cells indicate low expression and red high. (Dark gray cells indicate missing values)