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Heatmap: Cluster_48 (HCCA)

View as: (view raw or row-normalized)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are log2 transformed ratios of a genes expression in a sample divided by the mean expression level)

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Gene
LS-2,Log,Min. medium,26C,pH7.5
NIES-2168,Log,Glucose,27C,pH6.6
UTEX1230,Log,Acetate,25C,pH7.5
UTEX1230,Log,Min. medium,25C,pH7.5
UTEX1602
UTEX1602,Log,Freshwater,22C,pH5.7
UTEX1602,Log,Freshwater,22C,pH7.1
UTEX1602,Log,Freshwater,22C,pH7.6
UTEX2805
0.62 0.18 -2.94 0.07 0.54 0.23 0.07 -0.0 -1.05
-0.48 -0.05 -4.31 -0.82 1.07 0.71 0.33 -0.03 -0.43
0.03 -0.01 - -0.85 1.31 0.36 0.14 0.08 -0.98
0.14 0.64 -3.3 -1.15 0.66 0.35 0.2 0.32 -0.93
0.61 0.0 -2.11 -0.03 0.32 0.44 0.24 -0.18 -0.73
-0.33 0.01 -0.73 -0.03 0.54 0.68 0.27 0.01 -1.51
-0.89 0.13 -1.62 0.01 0.53 0.83 0.36 0.42 -2.42
-0.27 0.07 -0.65 -0.2 0.44 0.33 0.19 0.21 -0.51
-1.88 0.08 -2.48 -0.13 1.02 0.9 0.29 0.08 -1.29
-0.28 -0.38 -2.83 -0.69 0.82 0.77 0.4 0.09 -0.34
0.52 -0.31 - -0.31 0.47 0.75 0.44 0.09 -1.13
-0.07 0.12 -0.37 -0.08 0.79 0.25 -0.04 -0.14 -1.16
0.37 -0.29 -1.14 -0.3 0.92 0.65 0.14 -0.43 -1.72
0.27 0.15 -1.98 0.11 0.24 0.69 0.24 -0.35 -0.74
-0.71 0.26 -0.86 -0.04 0.81 0.44 0.02 -0.03 -0.86
-0.22 -0.39 -2.21 -0.04 0.97 0.75 0.25 -0.14 -1.14
-0.14 0.77 -1.86 -0.38 0.79 -0.01 -0.18 0.48 -1.53
-0.11 0.11 -2.63 -0.86 0.85 0.37 0.21 0.18 -0.17
-0.34 0.13 -1.52 -0.44 0.77 0.48 0.27 0.21 -0.82
0.04 0.21 -2.51 -0.36 -0.11 0.81 0.29 0.12 -0.2
-0.28 0.19 -1.6 -0.36 0.68 0.56 0.18 0.37 -1.26
-0.33 -0.14 -1.67 -0.78 1.55 0.44 0.1 -0.66 -1.3
-0.89 0.43 -3.38 0.08 0.44 0.92 0.45 -0.03 -1.48
0.25 -0.0 -3.73 -0.32 0.71 0.77 0.36 0.04 -1.77
-0.39 -0.26 -1.88 -0.68 0.93 0.45 0.55 0.04 -0.43
-0.43 0.19 -1.05 -0.07 0.51 0.61 0.25 -0.01 -0.87
0.57 0.0 -2.4 -0.28 0.37 0.34 0.22 -0.25 -0.09
-1.2 0.48 -4.86 -0.48 0.49 0.9 0.54 0.29 -1.09
0.36 -0.11 -3.53 -0.57 0.96 0.58 0.18 -0.28 -0.65
-0.15 0.71 -5.4 -0.84 0.84 0.32 0.1 0.29 -0.89
-0.64 0.21 -2.53 -0.79 1.25 0.4 -0.02 0.0 -0.4
-0.25 -0.12 -1.78 -0.51 0.99 0.58 0.2 -0.25 -0.37
-0.34 0.09 -0.74 -0.02 0.4 0.61 0.36 -0.11 -0.97
-0.04 0.08 -1.29 -0.1 0.87 0.54 0.11 0.09 -2.24
-1.68 0.26 -1.81 -0.05 0.65 0.8 0.4 0.31 -1.43
-0.59 0.78 -2.13 -0.37 0.82 0.28 -0.08 0.33 -1.23
-2.16 1.04 -4.24 -0.31 1.06 0.64 0.26 -0.13 -3.34
0.36 0.19 -2.47 -0.51 0.6 0.31 0.12 -0.16 -0.06
-0.3 0.21 -1.42 -0.42 0.54 0.24 0.22 0.24 -0.11
1.08 -0.18 -2.06 0.15 -0.08 0.24 0.08 -0.55 -0.35
-0.09 -0.15 -2.67 -1.13 1.18 0.29 0.24 0.49 -1.07
-0.12 0.5 -2.4 -0.59 0.93 0.21 -0.09 0.25 -0.67
-0.43 0.19 -2.46 -0.51 0.95 0.51 0.23 0.05 -0.57
0.25 0.11 -1.39 -0.52 0.82 0.25 0.07 0.1 -0.81
-0.52 0.09 -1.8 -0.01 0.63 0.56 0.26 0.0 -0.44
-1.76 0.17 -3.61 -0.87 1.36 0.75 0.17 0.0 -0.79
0.49 0.41 -1.92 0.17 -0.5 0.7 0.24 -0.24 -0.93
-0.25 -0.52 -4.15 -0.66 1.0 0.63 0.58 0.22 -0.82
0.41 -0.2 -2.5 -0.63 1.42 0.04 -0.15 -0.28 -0.87
0.8 0.12 -1.5 0.05 0.2 0.45 0.05 -0.66 -0.73
0.17 0.34 -2.15 -0.6 0.86 0.01 -0.24 0.16 -0.1
-0.82 0.24 -0.9 -0.01 0.85 0.4 0.08 -0.0 -0.87
-0.45 0.79 -1.43 -0.14 0.81 0.07 -0.06 0.08 -1.17
-1.6 1.02 -9.26 -0.96 1.23 0.29 -0.11 0.56 -2.79
0.29 0.1 -4.79 -0.75 0.72 0.51 0.22 -0.05 -0.19
0.17 0.19 -1.74 -0.87 0.28 0.52 0.4 0.37 -0.65
0.16 0.07 -3.05 -1.04 0.5 0.62 0.37 0.25 -0.34
0.28 -0.51 -4.8 -1.04 1.35 0.64 0.21 -0.25 -1.15
0.19 -0.4 -4.3 -0.91 1.39 0.38 0.22 -0.1 -1.03
-0.01 -0.39 -3.89 -1.6 1.11 0.43 0.43 0.45 -0.68
-0.02 0.37 -8.73 0.0 0.6 0.83 0.3 0.18 -4.08
0.26 0.03 -1.51 -0.39 0.53 0.52 0.23 -0.11 -0.54
-0.69 0.01 -1.47 0.26 0.5 0.56 0.23 0.43 -1.27
-0.03 0.25 -3.26 -0.66 0.79 0.43 0.31 0.19 -0.64
-0.7 0.23 - -0.13 0.87 0.98 0.52 0.04 -4.48
-0.47 -0.17 -4.27 -1.04 0.87 0.75 0.72 0.36 -1.25
-0.4 0.13 -1.46 -0.46 0.68 0.66 0.34 0.1 -0.89
0.16 -0.31 -3.36 -1.33 0.79 0.7 0.5 0.26 -0.72
0.3 -0.09 - -0.91 1.05 0.34 0.37 0.25 -1.07
-0.62 0.35 -2.65 -0.68 0.38 0.74 0.35 0.46 -0.56
0.47 0.15 -1.35 -0.26 0.17 0.29 0.13 0.12 -0.4
0.49 -0.38 -2.58 -0.48 0.86 0.49 0.4 -0.16 -0.96
-0.57 0.51 -3.56 -0.71 0.99 0.42 0.17 0.68 -2.65
-0.25 0.21 -2.1 -0.9 1.21 0.02 0.15 0.27 -0.77
-0.65 0.8 -2.12 -0.15 0.9 0.31 -0.15 0.17 -1.46
-0.73 -0.08 -0.74 -0.05 0.83 0.54 0.27 -0.24 -0.73
-0.63 0.28 -3.13 -0.39 0.23 0.76 0.62 0.38 -0.84
-0.01 0.54 -2.51 -0.61 1.16 0.22 0.04 -0.44 -0.82
-0.05 0.1 -4.45 -0.04 0.68 0.89 0.38 -0.34 -1.34
-0.02 0.14 -1.91 -0.17 0.76 0.63 0.29 -0.19 -1.29
-0.09 0.14 -2.83 -0.2 0.51 0.66 0.43 -0.09 -0.59
-0.16 -0.03 -2.1 -1.0 1.17 0.21 0.23 0.64 -1.93
0.51 -0.05 -1.46 -0.06 0.25 0.31 0.05 -0.18 -0.09
0.41 0.15 -2.0 -0.53 0.1 0.62 0.37 0.16 -0.73
-0.04 0.54 -3.71 -0.51 0.12 0.54 0.42 0.67 -1.64
0.64 -0.09 -3.17 -0.5 0.39 0.57 0.37 -0.1 -0.61
-0.11 0.23 -3.79 -0.51 0.84 0.45 0.17 0.06 -0.32
-0.39 -0.33 -4.15 -0.43 1.12 0.86 0.6 0.01 -2.93
-0.13 -0.13 -3.5 -1.08 0.92 0.49 0.46 0.24 -0.4
0.09 0.07 -0.88 0.02 0.36 0.47 0.2 -0.09 -0.81
0.19 0.02 -1.37 -0.24 0.61 0.33 0.11 -0.18 -0.2
0.11 0.27 -1.04 -0.27 0.9 0.01 -0.28 0.01 -0.52
-0.75 -0.05 -0.62 0.18 0.75 0.4 0.17 0.31 -1.79
-0.16 0.61 -6.39 -1.23 1.31 0.05 -0.02 0.24 -1.11
-0.23 0.0 -2.69 0.07 0.52 0.52 0.32 0.08 -0.38
-0.62 0.18 -1.23 -0.12 0.69 0.66 0.24 0.16 -1.43
-0.05 0.15 -1.5 -0.06 0.14 0.75 0.27 -0.25 -0.36
-0.31 0.12 -1.94 -0.59 0.46 0.63 0.53 0.32 -0.8
0.19 0.26 - -0.33 0.87 0.09 0.04 -0.05 -0.03
-0.44 0.34 -1.73 -0.55 0.63 0.58 0.29 0.44 -1.36
-0.71 0.37 -3.32 -0.12 0.3 0.9 0.5 -0.11 -0.64
0.54 -0.14 -1.5 -0.06 0.54 0.52 0.12 -0.45 -0.7
-0.02 0.09 -1.95 0.32 0.69 0.59 0.13 -0.24 -1.4
-0.4 0.32 - 0.07 0.55 0.78 0.47 0.27 -2.55
0.84 0.24 -1.78 0.04 -0.15 0.44 0.13 -0.69 -0.45
-0.9 0.1 -2.15 -0.68 1.31 0.41 0.12 -0.46 -0.1
-0.24 -0.08 -0.78 -0.01 0.82 0.49 0.12 -0.28 -0.86
0.17 -0.13 - -0.08 1.13 0.64 0.3 -0.42 -1.74
-0.83 0.21 -2.11 -0.22 0.8 0.53 0.46 0.7 -
-0.65 0.8 - -0.24 0.93 0.53 0.11 0.26 -2.61
-0.03 -0.01 -2.3 -0.69 0.86 0.55 0.31 0.04 -0.63
-1.41 0.61 - -0.39 0.47 0.93 0.5 0.7 -
-0.32 -0.32 -1.72 0.16 0.69 0.95 0.43 -0.31 -1.92
-1.76 0.59 -2.91 0.09 0.45 0.95 0.49 0.32 -4.08
-0.18 0.32 -2.82 -0.09 0.56 0.29 0.27 0.5 -1.1
-0.04 -0.15 -2.41 0.04 0.92 0.75 0.2 -0.28 -1.43
-0.17 0.12 -3.34 -0.52 0.88 0.4 0.22 0.28 -0.54
-0.63 0.04 -1.67 -0.09 0.62 0.74 0.4 0.56 -3.67
-1.49 0.49 -1.45 -0.12 0.42 0.83 0.41 0.49 -3.16
-1.14 0.08 -1.56 -0.25 0.77 0.64 0.34 0.16 -0.58
-0.66 0.35 -3.39 -0.27 0.88 0.6 0.17 0.47 -1.69
-1.29 0.42 -2.09 0.02 0.45 0.88 0.36 0.39 -2.34
-0.09 0.23 -5.92 -0.54 1.07 0.94 0.3 -0.14 -4.98
-0.04 0.78 -2.5 -0.4 1.01 0.34 -0.01 0.06 -3.96
0.24 0.02 -1.94 -0.58 0.85 0.16 0.03 -0.16 0.04
-0.34 0.61 -4.38 -0.15 -0.83 0.91 0.47 0.5 -1.04
-0.46 0.5 -2.96 -0.58 0.98 0.45 0.21 0.34 -1.72
0.07 0.24 -3.22 -0.46 0.77 0.59 0.31 0.19 -1.54
-0.9 0.12 -0.51 0.26 0.9 0.54 0.18 -0.47 -1.71
-0.01 -0.03 -1.08 -0.38 0.74 0.18 0.08 0.17 -0.31
-1.01 0.1 -4.28 -0.52 0.55 0.86 0.7 0.14 -0.58
-0.18 -0.22 -3.11 -0.53 1.45 0.16 -0.02 -0.09 -0.57
0.05 -0.31 -4.52 -1.02 1.94 0.17 -0.75 -0.17 -2.4
-0.64 -0.06 -0.91 0.16 0.65 0.69 0.22 -0.27 -0.8
-1.0 -0.0 -2.52 -0.11 0.85 0.67 0.42 0.25 -1.09
-0.16 0.23 -3.55 -0.48 0.71 0.67 0.29 0.18 -0.84
0.05 -0.19 -3.12 -0.89 0.7 0.54 0.29 -0.2 0.33
-0.89 0.5 -2.61 -0.26 1.32 0.23 -0.24 -0.03 -0.87
-0.07 0.09 -0.75 -0.11 0.28 0.54 0.24 0.01 -0.73
-0.86 0.24 -1.77 0.2 0.42 0.59 0.26 0.51 -1.47
-0.24 -0.09 -2.38 -0.7 0.24 0.88 0.54 0.61 -1.3
-1.01 0.12 -2.0 -0.66 1.22 0.51 0.13 -0.36 -0.13
0.25 -0.52 -1.28 -0.73 1.12 0.09 0.15 0.07 -0.52
0.14 -0.17 -2.8 -0.85 1.27 0.54 0.15 -0.05 -1.43
-0.04 0.06 -0.9 -0.2 0.3 0.39 0.19 0.13 -0.32
0.07 0.37 -4.62 -0.37 0.49 0.77 0.41 0.14 -1.73
-1.22 0.44 -7.56 -0.46 0.88 0.67 0.3 0.62 -1.86
-1.71 0.51 -5.67 -0.43 1.13 0.71 0.35 -0.14 -1.0
0.09 0.03 -1.99 0.28 0.41 0.84 0.28 -0.36 -1.62
0.09 0.03 -1.99 0.28 0.41 0.84 0.28 -0.36 -1.62
-0.54 0.2 -2.28 -0.14 0.65 0.76 0.36 0.2 -1.52
-1.0 0.39 -1.67 -0.29 0.63 0.5 0.22 0.6 -1.29
-0.56 0.38 - -0.17 0.94 0.8 0.38 0.1 -3.45
0.04 0.22 -4.37 -0.36 0.51 0.73 0.4 0.06 -0.9
-0.16 0.13 -0.65 0.13 0.02 0.65 0.25 -0.0 -0.97
-0.42 0.92 -2.12 -0.39 0.76 0.06 -0.15 0.27 -0.94
0.24 -0.34 -4.72 -0.4 0.66 1.09 0.62 -0.01 -25.04

Details

Dark gray cells indicate values where the raw expression is zero (cannot be log-transformed). Blue cells indicate samples where the expression of the gene is below average and red cells indicate the gene is expressed above average in the sample. White cells are average.