1. Home
  2. Tools
  3. Expression Heatmap
  4. Results

Heatmap: Cluster_23 (HCCA)

View as: (view raw or row-normalized)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are log2 transformed ratios of a genes expression in a sample divided by the mean expression level)

 Transpose table  Download table
Gene
Light - ZT1
Light - ZT3
Light - ZT5
Light - ZT7
Light - ZT9
Light - ZT11
Light - ZT13
Light - ZT15
Dark - ZT17
Dark - ZT19
Dark - ZT21
Dark - ZT23
Light - ZT25
Nutrient stress - Low nitrogen - 10%
Nutrient stress - Low phosphate - 0%
Nutrient stress - Low sulfate - 2%
Nutrient stress - Low micronutrients - 0%
Nutrient stress - NaCl - 75 mM
Nutrient stress - Mannitol - 100 mM
Nutrient stress - Control
Environmental stress - Prolonged darkness - 72h
Environmental stress - Cold - 4C
Environmental stress - Heat - 37C
Environmental stress - Control
Environmental stress - High light - 150 uE
Environmental stress - Control high light - 40 uE
Cpa|evm.model.tig00000093.163 (tig00000093_g3592.t1)
 1.5 - - 2.32 - 1.38 - - - - - - - - - - - - - 0.99 2.7 - - - 1.69 1.94
Cpa|evm.model.tig00000104.9 (tig00000104_g4819.t1)
 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
Cpa|evm.model.tig00000113.109 (tig00000113_g5690.t1)
 - - - - - - - - - - - 0.86 - - - 0.89 1.95 0.16 - - 3.75 - 1.96 - - -
Cpa|evm.model.tig00000114.63 (tig00021745_g23355.t1)
 - - - - - - - - - - 3.7 - - - - - - - - - 3.7 - - - - -
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 4.7 - - - - -
Cpa|evm.model.tig00000128.13 (tig00000128_g7215.t1)
 - - - - - - - - - - 2.01 - - - - - - - - - 4.46 - - - - -
Cpa|evm.model.tig00000133.21 (tig00000133_g7682.t1)
 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 4.34 - 2.51 - - -
Cpa|evm.model.tig00000133.46 (tig00000133_g7709.t1)
 0.9 - - - - - 1.21 - 1.19 - 1.16 - 1.6 - - - - 1.87 - - 2.76 1.95 - - - -
Cpa|evm.model.tig00000157.77 (tig00000157_g9665.t1)
 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 4.7 - - - - -
Cpa|evm.model.tig00000158.96 (tig00000158_g10203.t1)
 - - 1.58 - 1.7 - 0.91 - -0.3 - -0.41 - - - 1.08 - 1.39 -0.57 -0.5 -0.8 3.09 - - 0.18 - -
Cpa|evm.model.tig00000178.7 (tig00021038_g17585.t1)
 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 4.7 - - - - -
Cpa|evm.model.tig00000180.21 (tig00000180_g13632.t1)
 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 4.7 - - - - -
Cpa|evm.model.tig00000241.65 (tig00000241_g20923.t1)
 - -1.72 -0.86 -1.78 0.81 -0.77 -0.61 0.07 1.02 -0.94 0.43 - -1.96 -2.44 -1.03 -1.87 -1.62 -2.45 1.05 1.58 1.28 0.36 1.16 -0.25 0.29 1.1
Cpa|evm.model.tig00000269.91 (tig00000269_g23746.t1)
 - - - - - - - - - - - - - 2.03 - - - - - 2.81 3.9 - - - - -
- - - - 2.13 - - - - - - - - - - - - - - - 4.22 - - 1.55 - -
Cpa|evm.model.tig00000344.17 (tig00000344_g24298.t1)
 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 3.31 4.01 - - - - -
Cpa|evm.model.tig00000361.45 (tig00000361_g24396.t1)
 -1.67 - - - - - - -1.34 - - -2.98 - - -2.6 0.87 -0.84 0.45 -3.69 - -3.03 2.89 1.63 0.45 2.7 -0.76 1.05
Cpa|evm.model.tig00000361.46 (tig00000361_g24396.t1)
 - - - - - - - - - - - -2.11 - -2.8 1.24 -0.13 0.18 - -2.57 - 3.06 1.63 1.23 2.31 -0.55 0.71
Cpa|evm.model.tig00000361.47 (tig00000361_g24396.t1)
 - - - - - - - - - - - - - - 1.17 - - -2.59 - -2.22 3.21 2.07 -0.47 2.87 0.6 -1.42
Cpa|evm.model.tig00000381.1 (tig00000381_g24523.t1)
 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 4.7 - - - - -
Cpa|evm.model.tig00000396.39 (tig00000396_g24909.t1)
 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 3.67 0.5 - - 1.66 3.12
Cpa|evm.model.tig00000449.8 (tig00020531_g10012.t1)
 - - -1.97 -0.89 -2.07 -0.24 - -1.76 0.4 -0.03 -1.96 -1.88 0.05 - -2.05 0.45 - -0.04 - -0.62 2.92 1.54 1.11 -0.36 0.97 0.45
Cpa|evm.model.tig00000459.73 (tig00000459_g1141.t1)
 - - - - 0.22 0.22 - - 0.31 - 1.31 1.43 - - - - - 0.9 - - 3.5 - -0.06 - 1.66 -
Cpa|evm.model.tig00000459.87 (tig00020604_g11845.t1)
 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 4.7 - - - - -
Cpa|evm.model.tig00000480.39 (tig00000480_g1307.t1)
 0.06 -3.46 - -1.59 -1.28 -1.74 -1.05 -1.2 -1.19 -0.93 -1.67 -1.11 0.02 -2.68 -1.94 -3.15 -4.43 -1.23 -2.1 -2.4 3.5 0.4 1.47 1.26 -1.13 -1.2
Cpa|evm.model.tig00000480.5 (tig00000404_g414.t1)
 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 3.6 3.79 - - - -
Cpa|evm.model.tig00000734.2 (tig00000663_g3008.t1)
 - - - - - - - -1.56 - - - -1.49 - - - - - -3.91 - - 4.63 - - -0.97 - -
Cpa|evm.model.tig00000743.20 (tig00000743_g3874.t1)
 - - - - - - - - - - - 3.69 - - 2.5 - - - - - 2.9 - - - - -
Cpa|evm.model.tig00000767.16 (tig00000767_g3959.t1)
 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 4.7 - - - - -
Cpa|evm.model.tig00000788.26 (tig00000788_g4084.t1)
 - - - - - - - - - - - - 2.37 - - - - - 1.97 - 4.08 - - - - -
Cpa|evm.model.tig00000829.41 (tig00000829_g4683.t1)
 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 3.96 3.39 - - - -
Cpa|evm.model.tig00000836.4 (tig00000857_g4939.t1)
 - - - - - - - - - - - - - - - - - 2.0 - - 4.46 - - - - -
Cpa|evm.model.tig00000836.5 (tig00000857_g4939.t1)
 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 4.7 - - - - -
Cpa|evm.model.tig00000836.6 (tig00000836_g4689.t1)
 - - - - - - - - - - - - - - - - 2.33 - - - 4.39 - - - - -
Cpa|evm.model.tig00001038.11 (tig00000227_g19859.t1)
 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 4.13 3.09 - - - - -
Cpa|evm.model.tig00001038.2 (tig00001038_g6512.t1)
 - - - - - - - - 1.72 - - 1.83 - - - - - - - - 4.26 - - - - -
Cpa|evm.model.tig00001307.10 (tig00001307_g8125.t1)
 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 4.58 - 1.01 - - -
Cpa|evm.model.tig00001409.9 (tig00021168_g19121.t1)
 0.04 0.59 - - - 1.48 - 0.55 - 0.23 - - 1.78 - - 1.48 - 1.64 0.27 1.96 0.94 - - - -0.33 -0.16
Cpa|evm.model.tig00020509.12 (tig00020509_g9752.t1)
 - - - - - - - - - - - 3.59 - - - - - - - - 3.81 - - - - -
- - - - - - - 1.91 - - 1.71 - - - - - - 0.95 - 2.61 3.03 1.45 - - - -
Cpa|evm.model.tig00020538.34 (tig00020538_g10339.t1)
 - - 1.43 1.51 - - - - - - - - - - - - - - - - 4.35 - - - - -
Cpa|evm.model.tig00020539.17 (tig00020539_g10407.t1)
 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 4.7 - - - - -
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 4.33 - - - 2.55 -
Cpa|evm.model.tig00020553.80 (tig00020553_g10570.t1)
 - -1.71 - -1.21 -1.39 -1.04 - -1.26 -1.3 - - - - 1.06 0.1 - -0.18 1.59 -1.64 0.7 3.43 - 0.61 1.2 - -
Cpa|evm.model.tig00020571.14 (tig00020571_g11487.t1)
 0.13 0.91 - 0.62 0.11 -1.37 -1.42 -1.6 0.55 -0.72 0.87 - -1.18 - -1.71 - 1.44 -2.37 - -0.78 2.33 0.32 0.86 -0.33 0.33 0.06
- - - - - - - - - 3.05 - - - - - - - - - - 4.15 - - - - -
Cpa|evm.model.tig00020616.26 (tig00020616_g12263.t1)
 - 0.91 - - - - - - - 0.66 - - - 0.61 1.69 - - 0.63 - 1.55 3.42 - - - - 1.36
Cpa|evm.model.tig00020629.71 (tig00020629_g12399.t1)
 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 4.7 - - - - -
Cpa|evm.model.tig00020693.12 (tig00021012_g17010.t1)
 - - - - - 0.61 - - - - - 0.69 1.0 - - 2.08 - 1.91 0.53 - 3.24 - - - -0.01 0.02
Cpa|evm.model.tig00020801.60 (tig00020801_g13944.t1)
 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 4.7 - - - - -
- - - - - - - - 2.56 - - - - - - - - - - - 4.33 - - - - -
Cpa|evm.model.tig00020830.81 (tig00020830_g14464.t1)
 - -0.99 - - - - - -0.91 - 0.36 - - - - - - -0.9 -0.87 -1.2 - 3.84 - - 1.68 1.45 0.88
Cpa|evm.model.tig00020848.85 (tig00000385_g24750.t1)
 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 4.7 - - - - -
Cpa|evm.model.tig00020855.13 (tig00020824_g14272.t1)
 - - - - - - 1.46 - - - - - - 0.67 - - 1.23 - 1.18 - 3.9 - 1.11 - - -
Cpa|evm.model.tig00020875.6 (tig00000093_g3456.t1)
 - - - - - - - 2.95 - - - - - - - - - - - - 4.19 - - - - -
Cpa|evm.model.tig00020943.59 (tig00020943_g16302.t1)
 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 4.7 - - - - -
Cpa|evm.model.tig00020952.3 (tig00020531_g10039.t1)
 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
Cpa|evm.model.tig00021012.13 (tig00021012_g16995.t1)
 - - 0.66 - - - - 0.55 - - - 2.33 - - - - 0.89 - - - 3.5 0.4 1.78 - - -
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 4.7 - - - - -
Cpa|evm.model.tig00021036.14 (tig00021036_g17283.t1)
 - - -0.2 0.88 - -0.18 0.81 - -0.21 - - - - - - - - -0.79 1.45 1.21 3.6 -0.45 -0.57 - - -0.7
Cpa|evm.model.tig00021070.92 (tig00021070_g17899.t1)
 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 4.7 - - - - -
Cpa|evm.model.tig00021072.10 (tig00021072_g17967.t1)
 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 4.45 - 2.05 - - -
Cpa|evm.model.tig00021072.13 (tig00021072_g17970.t1)
 -0.34 - - - - - - -0.14 - 0.88 - - 0.4 0.32 - - - -0.57 - -0.41 4.08 -0.43 -0.41 - - -
Cpa|evm.model.tig00021072.8 (tig00000743_g3850.t1)
 - - - - - - - - - - - - 3.16 - - - - - - - 4.09 - - - - -
Cpa|evm.model.tig00021096.7 (tig00021096_g18129.t1)
 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 4.7 - - - - -
Cpa|evm.model.tig00021108.75 (tig00021762_g23465.t1)
 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 4.7 - - - - -
Cpa|evm.model.tig00021257.2 (tig00000405_g430.t1)
 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 4.7 - - - - -
Cpa|evm.model.tig00021326.50 (tig00021326_g20316.t1)
 - - - - - - - - 1.36 - - - - - - - - - - - 3.2 3.44 0.72 - - 0.8
Cpa|evm.model.tig00021439.6 (tig00020509_g9743.t2)
 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 4.7 - - - - -
Cpa|evm.model.tig00021537.22 (tig00021537_g22278.t1)
 -3.25 -6.02 -3.2 -3.23 -3.1 -2.53 -6.26 -3.07 -1.93 -1.75 -2.63 -2.4 -3.86 -0.77 0.29 -0.95 -1.76 0.44 -0.22 -3.54 3.31 2.4 -0.63 1.31 -1.31 -0.77
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 4.7 - - - - -
Cpa|evm.model.tig00021692.1 (tig00021692_g23131.t1)
 - - - - - - - - - - - - - - - 1.66 - 0.14 2.26 - 3.39 2.39 0.31 - - -
Cpa|evm.model.tig00021720.25 (tig00001250_g7793.t1)
 - - 1.95 - - -0.46 - - - - - - - 1.88 -0.72 - - - - 2.74 1.71 2.32 - - - 1.11
Cpa|evm.model.tig00021758.15 (tig00021758_g23409.t1)
 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 4.7 - - - - -
Cpa|evm.model.tig00021761.14 (tig00021761_g23451.t1)
 - - - - - 1.23 - - - - - - - - - - - - - - 3.47 3.65 - - - -
Cpa|evm.model.tig00021762.8 (tig00021762_g23464.t1)
 - - - - - 3.81 - - - - - - - - - - - - - - 3.58 - - - - -

Details

Dark gray cells indicate values where the raw expression is zero (cannot be log-transformed). Blue cells indicate samples where the expression of the gene is below average and red cells indicate the gene is expressed above average in the sample. White cells are average.