1. Home
  2. Tools
  3. Expression Heatmap
  4. Results

Heatmap: Cluster_60 (HCCA)

View as: (view raw or row-normalized)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are log2 transformed ratios of a genes expression in a sample divided by the mean expression level)

 Transpose table  Download table
Gene
Light - ZT1
Light - ZT3
Light - ZT5
Light - ZT7
Light - ZT9
Light - ZT11
Light - ZT13
Light - ZT15
Dark - ZT17
Dark - ZT19
Dark - ZT21
Dark - ZT23
Light - ZT25
Nutrient stress - Low nitrogen - 10%
Nutrient stress - Low phosphate - 0%
Nutrient stress - Low sulfate - 2%
Nutrient stress - Low micronutrients - 0%
Nutrient stress - NaCl - 75 mM
Nutrient stress - Mannitol - 100 mM
Nutrient stress - Control
Environmental stress - Prolonged darkness - 72h
Environmental stress - Cold - 4C
Environmental stress - Heat - 37C
Environmental stress - Control
Environmental stress - High light - 150 uE
Environmental stress - Control high light - 40 uE
Cpa|evm.model.tig00000025.66 (tig00000025_g7966.t1)
 - 1.96 - - - - - - - 1.77 - - - 1.24 - - - - - 1.44 - - 3.77 - - -
Cpa|evm.model.tig00000057.132 (tig00000057_g157.t1)
 - - - - - - 1.46 1.47 - 2.36 - 1.54 - 1.8 - - - - 1.38 2.67 - - - - - -
Cpa|evm.model.tig00000057.150 (tig00021586_g22684.t1)
 - 2.66 - - 1.01 - - 2.74 0.25 0.09 2.79 - - - - - - - - - - - - - 0.85 -
Cpa|evm.model.tig00000057.54 (tig00000057_g74.t1)
 0.58 - - 0.52 - - - 1.65 - - - 0.53 - - - 1.91 - - - - - 2.66 2.37 - -0.17 1.26
Cpa|evm.model.tig00000114.48 (tig00000114_g6053.t1)
 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 4.7 - - - - - -
Cpa|evm.model.tig00000139.6 (tig00020693_g13046.t1)
 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
Cpa|evm.model.tig00000145.43 (tig00020849_g14661.t1)
 - 3.8 - - - - - - - - - - - - - - - - 3.59 - - - - - - -
Cpa|evm.model.tig00000178.3 (tig00000178_g12708.t1)
 0.44 2.46 1.56 0.62 -1.69 -3.95 -1.47 -0.54 -1.24 -0.45 0.47 -0.01 0.62 0.15 -1.24 -0.44 -1.1 -0.98 -2.2 -1.09 -4.15 -0.05 -0.69 -1.48 -0.17 0.41
Cpa|evm.model.tig00000178.4 (tig00000178_g12708.t1)
 0.62 2.35 1.37 0.76 -2.18 - -2.27 -0.88 -1.05 -0.62 0.58 0.15 0.92 0.2 -1.03 -1.29 -2.15 -2.18 -0.98 -1.85 -2.27 0.6 -0.49 -1.57 0.61 -0.15
Cpa|evm.model.tig00000189.58 (tig00021531_g22181.t1)
 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 4.2 - - 2.92 - - -
Cpa|evm.model.tig00000215.66 (tig00001049_g6676.t1)
 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
Cpa|evm.model.tig00000219.48 (tig00000219_g19487.t1)
 -0.56 - - -0.3 - 1.24 - 1.64 -0.13 - - - - 0.39 -0.5 - 1.47 0.79 - - - 1.35 2.75 - -0.87 0.83
Cpa|evm.model.tig00000248.29 (tig00000248_g21796.t1)
 - - - - - - - - - - - - - - - 2.82 - - 2.85 3.55 - - - - - -
Cpa|evm.model.tig00000248.78 (tig00000248_g21839.t1)
 - 4.7 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
Cpa|evm.model.tig00000339.4 (tig00021290_g19988.t1)
 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 4.7 - - - - - -
Cpa|evm.model.tig00000342.67 (tig00000443_g769.t1)
 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
Cpa|evm.model.tig00000381.18 (tig00000381_g24545.t1)
 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 4.7 - - -
Cpa|evm.model.tig00000382.31 (tig00000382_g24563.t1)
 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
Cpa|evm.model.tig00000430.37 (tig00000430_g621.t1)
 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 4.7 - - - - - -
Cpa|evm.model.tig00000443.9 (tig00000382_g24597.t1)
 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 4.7 - - - - - -
- 3.93 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 3.42 - - -
Cpa|evm.model.tig00000475.3 (tig00000475_g1228.t1)
 - -2.12 - - - - - -2.48 - -1.45 -1.42 - - 1.5 -1.47 0.58 1.29 0.86 0.84 3.42 0.94 - -0.04 -2.47 -1.99 -2.95
Cpa|evm.model.tig00000488.18 (tig00000292_g23864.t1)
 - 4.7 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
Cpa|evm.model.tig00000555.11 (tig00000555_g2140.t1)
 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 4.7 - - - - - -
Cpa|evm.model.tig00000595.3 (tig00020564_g11417.t1)
 - 3.81 - - - 3.58 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
Cpa|evm.model.tig00000681.22 (tig00000681_g3070.t1)
 - - - - - - - - - - - - - - 2.11 - - 0.69 - 2.71 0.84 - 2.94 - - 2.02
Cpa|evm.model.tig00000823.3 (tig00020939_g16052.t1)
 - - - - - - 1.22 2.23 1.06 0.9 - 1.11 - - - 1.0 - - - 3.44 - - - - - -
Cpa|evm.model.tig00000842.42 (tig00000842_g4860.t1)
 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 4.7 - - - - - -
Cpa|evm.model.tig00000944.47 (tig00020611_g12109.t1)
 1.15 - 1.39 2.24 - - - - 2.29 1.08 1.13 - - - 1.08 - - - - 1.78 - 0.77 - - - -
Cpa|evm.model.tig00000983.1 (tig00021589_g22745.t1)
 0.63 2.94 1.58 -0.58 1.05 -0.64 -0.45 - -0.61 -0.74 - -0.56 1.38 -0.82 -0.91 1.26 - 0.18 -1.01 - - - - - - -
Cpa|evm.model.tig00001006.2 (tig00021680_g23058.t1)
 - 4.7 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
Cpa|evm.model.tig00001049.24 (tig00001049_g6671.t1)
 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 4.7 - - - - - -
Cpa|evm.model.tig00001049.29 (tig00001049_g6676.t1)
 - 4.16 3.02 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
Cpa|evm.model.tig00001057.15 (tig00001057_g6694.t1)
 - - - - - - - - - 1.42 - - - 1.3 - - - - - - - - 3.58 - 3.15 -
Cpa|evm.model.tig00001220.2 (tig00001220_g7617.t1)
 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 4.7 - - - - - -
Cpa|evm.model.tig00001264.7 (tig00001128_g7195.t1)
 - 4.7 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
Cpa|evm.model.tig00020510.64 (tig00020510_g9844.t1)
 - - - - - -1.21 - - - - -1.5 - - 1.79 1.45 1.24 -0.25 -1.1 2.37 2.5 - -0.71 -0.84 1.17 - 0.12
Cpa|evm.model.tig00020510.82 (tig00000404_g426.t1)
 - - - - - - - - - 2.01 - - - - - - - 1.91 - - - - 3.68 - 2.44 -
Cpa|evm.model.tig00020539.4 (tig00020539_g10395.t1)
 - 2.09 - - - - - 2.16 1.99 - - - - - - 2.09 - - - 3.18 - - - - - -
Cpa|evm.model.tig00020675.116 (tig00020553_g10705.t2)
 - - - 1.17 - - - - - - - - - - - - - - - 2.3 0.15 2.7 2.43 - - 2.55
Cpa|evm.model.tig00020675.26 (tig00020675_g12608.t1)
 - 3.74 - - - - - - - - - - - - - - - - - - 3.66 - - - - -
Cpa|evm.model.tig00020734.31 (tig00020734_g13591.t1)
 - - - - - - - - - - - - - -1.08 - - -2.46 - - 4.66 -3.41 - - - - -
Cpa|evm.model.tig00020786.1 (tig00020786_g13707.t1)
 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
Cpa|evm.model.tig00020816.125 (tig00020553_g10741.t1)
 1.85 - - - - - - - - - - - - - 3.07 - - - - 3.36 - 1.9 - - - -
Cpa|evm.model.tig00020824.33 (tig00021761_g23450.t1)
 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 4.7 - - - - - -
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - 4.7 - - - - - -
Cpa|evm.model.tig00020912.72 (tig00001206_g7488.t1)
 - - - - - - - - - - - - - - - - 3.49 - - 3.88 - - - - - -
Cpa|evm.model.tig00020934.59 (tig00020934_g16126.t1)
 - 4.7 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
Cpa|evm.model.tig00020951.57 (tig00020951_g16460.t1)
 - - 1.98 - - - - - 1.8 - - - - 1.59 - - - - - 3.96 - - - - - -
Cpa|evm.model.tig00020961.147 (tig00020961_g16767.t1)
 - - - 0.21 -0.16 0.15 0.59 0.16 2.38 1.37 0.07 - - -0.45 - 0.12 - -0.01 - 2.46 - -0.26 - 0.55 - -0.37
Cpa|evm.model.tig00020996.44 (tig00001177_g7376.t1)
 - - - - - - - - - - - - - - - - - 3.26 - - - - 4.04 - - -
Cpa|evm.model.tig00021036.48 (tig00021036_g17322.t1)
 0.74 - - 1.83 - - 0.76 - - 3.1 - - - - - - - 1.08 - - - - 2.87 - 0.13 -
Cpa|evm.model.tig00021036.99 (tig00021036_g17386.t1)
 - 4.7 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
Cpa|evm.model.tig00021038.50 (tig00000093_g3456.t1)
 - 3.2 3.07 - - - - - - - 3.07 - - - - - - - - - - - - - - -
- - - -0.13 2.54 0.04 -0.01 0.91 - - -0.2 1.2 - 1.73 1.7 - - 0.22 - 2.16 - - - - - -
Cpa|evm.model.tig00021144.9 (tig00021587_g22700.t1)
 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 4.7 - - - - - -
Cpa|evm.model.tig00021234.45 (tig00021234_g19422.t1)
 0.36 -0.67 -1.26 -1.02 -1.36 -3.36 -2.26 -1.28 -1.37 -0.64 -0.82 0.04 -0.27 0.81 -1.98 1.04 -1.66 -0.12 -1.22 3.48 -3.36 -2.7 -0.19 -2.77 -1.87 -2.32
Cpa|evm.model.tig00021234.46 (tig00021234_g19425.t1)
 0.11 - - - - - - - - - - - - 1.18 - 2.02 - 0.99 -0.82 3.79 - - 1.15 - - -
Cpa|evm.model.tig00021234.48 (tig00021234_g19431.t1)
 - - - - - - - - - - - - - - - - - 2.23 - 4.41 - - - - - -
Cpa|evm.model.tig00021244.7 (tig00021244_g19565.t1)
 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 4.7 - - - - - -
Cpa|evm.model.tig00021248.16 (tig00021248_g19630.t1)
 - - 3.04 - - - - 3.25 - - 3.05 - - - - - - - - - - - - - - -
Cpa|evm.model.tig00021326.18 (tig00000475_g1233.t1)
 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 4.7 - - - - -
- - - - - -1.1 - - - - - - - 0.63 - 0.85 1.39 1.47 2.21 2.71 0.26 - 0.1 0.5 - 0.98
Cpa|evm.model.tig00021366.3 (tig00021366_g20837.t1)
 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
Cpa|evm.model.tig00021589.45 (tig00021603_g22828.t1)
 - 4.7 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
Cpa|evm.model.tig00021603.9 (tig00000262_g23083.t1)
 - 4.7 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
Cpa|evm.model.tig00021726.22 (tig00021726_g23269.t1)
 - 4.49 - - - - - - - - - - - - - - - 1.8 - - - - - - - -
- 4.7 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
Cpa|evm.model.tig00022075.102 (tig00022075_g23664.t1)
 - 3.19 - - - - - - 3.1 - 3.06 - - - - - - - - - - - - - - -

Details

Dark gray cells indicate values where the raw expression is zero (cannot be log-transformed). Blue cells indicate samples where the expression of the gene is below average and red cells indicate the gene is expressed above average in the sample. White cells are average.