Heatmap: Cluster_58 (HCCA)

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(Values are log2 transformed ratios of a genes expression in a sample divided by the mean expression level)

Gene
12pM Fe,Midday
12pM Fe,Midnight
58pM Fe,Midday
58pM Fe,Midnight
233pM Fe,Midnight
1160pM Fe,Midday
1160pM Fe,Midnight
High carbon,Dark
High carbon,Light
Low carbon,Dark
Phloroglucinol
Silicon starvation,12h
1.01 -0.04 0.68 -1.07 -1.24 0.27 -2.15 -0.1 0.44 -0.62 0.39 -0.29
1.01 0.63 0.43 -0.57 -0.35 -0.05 -1.64 -0.38 -1.23 -0.36 0.56 -0.16
1.08 0.39 0.34 -0.59 -0.86 0.04 -1.01 -0.23 0.17 -1.72 0.63 -0.41
1.49 0.26 1.07 -0.85 -2.43 -0.7 -3.11 -0.79 -1.77 -1.79 1.62 -2.39
0.96 0.23 0.24 -0.36 -1.01 -0.02 -1.67 0.29 -0.08 -0.92 0.22 0.32
0.8 1.03 -0.39 0.35 -0.26 -0.17 -0.35 -0.12 -1.08 -1.13 0.07 -0.38
0.47 0.17 0.04 -0.3 -0.39 -0.1 -1.01 0.25 -0.02 -0.05 0.23 0.19
1.13 0.34 0.42 -0.34 -1.36 -0.11 -0.81 0.42 -0.17 -3.57 0.55 -0.38
1.09 0.61 -0.14 -0.28 -1.04 -0.45 -1.07 -0.05 -0.46 -1.38 1.09 -0.52
0.45 0.21 -0.18 -0.15 -1.95 -1.22 -1.95 -0.38 -0.42 -1.31 1.85 0.27
0.51 0.98 0.47 0.27 -0.32 -0.07 -0.35 -0.27 -1.7 -0.74 0.19 -0.73
0.6 0.75 0.29 -0.02 -0.76 -0.35 -0.31 -0.03 -1.2 -0.32 0.59 -0.57
1.02 0.36 0.51 -0.04 -0.24 0.41 -0.45 -0.97 -1.55 -1.5 0.69 -0.85
1.37 1.26 0.53 0.12 -0.56 -0.99 -1.71 -0.27 -2.03 -1.14 -0.0 -1.08
0.31 0.84 0.33 0.27 -1.32 -0.44 -0.05 0.02 -0.93 -3.43 1.04 -0.49
1.2 0.14 0.56 -0.55 -1.31 0.03 -1.88 -0.31 -0.76 -0.28 0.77 -0.29
-1.34 1.36 - 0.94 0.51 -5.78 -1.34 0.36 -2.84 -0.64 0.64 0.73
0.57 1.26 -0.01 0.68 -0.47 -0.81 -0.89 -0.37 -1.59 -1.27 0.57 -0.54
1.63 0.02 0.91 -1.59 -1.67 -1.51 -1.09 -0.99 -1.54 -2.08 1.73 -2.87
0.64 0.16 0.19 -0.35 -0.75 -0.32 -0.26 0.21 0.05 -1.5 0.8 -0.17
1.04 0.53 0.75 -0.26 -1.05 -0.48 -1.43 -0.64 -0.74 -2.14 0.29 0.79
0.46 0.24 -0.18 -0.28 -0.23 -0.21 -1.46 -0.15 -0.64 -0.52 1.42 -0.43
1.62 0.38 0.23 -0.5 -1.61 -0.57 -0.85 -0.25 -0.56 -1.67 0.94 -1.21
0.44 -0.06 0.41 -0.59 -0.3 0.03 -1.26 -0.04 0.07 -0.67 0.51 0.44
0.53 1.23 -0.95 0.31 0.61 -1.58 -1.24 0.23 -2.23 -1.01 1.05 -2.22
0.7 0.5 0.02 -0.65 -0.3 -0.17 -1.14 -0.4 -0.63 -0.32 0.63 0.5
0.6 0.24 -0.01 -0.1 -0.49 -0.5 -0.86 -0.2 -0.23 0.04 0.68 0.07
1.07 0.78 0.33 -0.61 -0.73 -0.51 -0.66 -0.07 -1.16 -3.19 1.17 -0.79
0.64 0.66 -0.18 0.06 -0.92 -0.78 -0.65 0.43 -0.74 -1.75 0.57 0.56
0.48 0.15 0.37 -0.2 -0.14 -0.13 -0.87 -0.41 -0.24 -0.71 0.1 0.76
1.16 0.12 0.32 -0.25 -0.89 -0.93 -1.03 0.03 -0.54 -0.65 0.91 -0.31
0.82 0.3 0.51 -0.1 -0.45 -0.31 -0.84 -0.03 -0.43 -1.64 0.88 -0.6
0.78 1.06 0.09 0.54 -0.52 -0.65 -0.13 0.05 -1.05 -2.15 0.54 -2.04
0.24 0.35 0.19 -0.08 -0.56 -0.12 -0.77 -0.05 -0.31 -0.25 0.47 0.36
0.86 0.55 -0.1 -0.2 -0.77 -0.79 -0.72 -0.38 -0.95 -1.09 1.31 -0.14
0.88 -0.12 0.82 -0.24 -0.96 0.26 -1.52 -0.05 -0.85 -0.54 0.88 -0.95
1.06 1.53 -0.0 0.09 -1.09 -0.83 -1.6 -0.08 -1.14 -1.89 0.32 -0.58
1.17 -0.35 1.15 -0.9 -1.06 0.58 -1.77 -0.82 -0.66 -0.89 0.95 -1.88
1.01 0.85 0.02 0.64 -0.47 -0.6 -0.69 0.16 -1.51 -1.04 0.32 -1.28
0.39 0.62 -0.18 0.03 -0.13 -0.58 -1.17 0.18 -0.27 -0.4 0.57 0.04
0.78 0.04 0.04 -1.24 -1.14 -0.45 -1.94 -0.33 -1.4 -1.53 1.73 0.6
0.78 -0.03 0.16 -0.4 -0.28 -0.19 -0.95 -0.16 -0.45 -0.43 0.48 0.52
0.8 1.01 0.06 0.45 -0.6 -0.6 -1.16 -0.17 -0.96 -1.25 0.22 0.11
0.66 0.29 -0.02 -0.31 -0.78 -0.41 -0.87 0.13 0.06 -0.24 0.76 -0.23
0.2 0.17 -0.13 -0.05 -0.75 -0.58 -0.8 0.46 -0.46 -0.42 1.47 -1.35
1.1 1.05 0.47 0.26 -0.43 -0.8 -1.15 -0.14 -1.27 -0.85 0.42 -2.16
0.48 0.25 0.08 -0.81 -0.27 -0.54 -1.06 0.09 -0.74 -0.34 1.01 0.41
0.87 0.59 0.13 0.0 -0.36 -0.27 -0.35 -0.18 -1.04 -0.83 -0.17 0.45
0.77 0.18 0.1 -0.54 -0.16 -0.18 -1.46 0.02 -0.04 -0.5 0.16 0.54
0.52 0.39 -0.1 -0.4 -0.29 -0.28 -1.0 -0.23 -0.71 -0.8 1.11 0.31
0.99 0.31 0.37 -0.34 -0.67 -0.58 -1.44 0.19 0.06 -0.95 0.76 -0.66
0.18 0.14 -0.48 -0.99 -0.76 -0.33 0.01 0.33 0.7 -0.18 1.04 -1.59
0.92 0.35 0.25 -0.79 -0.26 0.1 -0.83 -0.42 -1.2 -0.92 1.21 -0.83
0.11 0.29 0.01 -0.21 -0.15 -0.17 -0.63 -0.03 -0.57 -0.4 0.97 0.04
0.65 -0.2 -0.35 -0.66 -1.61 -0.63 -1.58 -0.05 -0.25 -0.27 1.3 0.79
0.18 0.11 0.36 -0.29 -0.27 -0.0 -1.51 -0.06 -0.43 -0.99 0.84 0.6
0.66 0.2 0.66 -0.21 -0.58 -0.12 -0.74 -0.21 -0.52 -1.07 0.39 0.38
0.64 0.22 0.86 -0.11 -1.37 -0.29 -0.93 0.09 -0.11 -0.83 0.25 0.1
0.25 -0.0 -0.08 -0.57 -0.44 -0.12 -1.17 0.27 0.11 -0.59 0.05 1.08
0.3 0.05 -0.17 -0.66 -0.23 -0.11 -1.42 0.06 0.05 -0.54 0.47 0.93
0.79 1.25 0.33 0.22 -0.99 -2.11 -1.05 0.16 -1.94 -1.56 1.29 -3.76
0.75 0.18 0.32 -0.48 -0.63 -0.32 -0.8 -0.11 -0.72 -1.39 1.14 0.11
1.42 0.73 0.51 -0.56 -1.19 -0.3 -1.92 -0.76 -1.06 -2.86 1.3 -1.42
0.69 -2.15 -0.1 -1.77 -2.69 -0.7 -3.16 0.39 -0.77 0.01 1.95 0.35
0.58 0.79 0.18 0.46 0.05 -0.41 -0.13 -0.19 -0.58 -1.47 -0.27 -0.27
1.59 -1.55 0.72 -2.57 -2.85 -0.29 -1.8 -0.45 -0.13 -3.13 1.7 -0.81
0.24 -0.16 0.31 -0.77 -0.35 0.17 -1.27 0.02 -0.35 -0.53 1.38 -0.53
0.6 0.31 -0.28 -0.22 -0.76 -1.11 -0.81 -0.02 -0.55 -0.16 1.09 0.32
0.41 -0.06 0.13 -0.66 -0.58 -0.32 -0.92 -0.13 -0.28 -0.3 1.12 0.35
0.2 0.37 0.2 -0.05 -0.05 -0.24 -0.77 0.15 -0.21 -0.67 0.59 -0.1
-1.88 -0.96 -2.06 -1.0 -1.81 -4.43 -1.87 1.26 -0.11 -0.18 2.3 -0.47
0.46 0.1 0.04 -0.07 -0.36 -0.1 -0.43 0.09 0.02 -0.83 0.13 0.47
0.9 0.26 0.39 -0.43 -0.87 0.04 -1.13 -0.22 -0.35 -0.82 0.39 0.41
0.39 0.74 0.07 0.36 -0.25 -0.87 -0.45 -0.04 -1.04 -0.8 0.03 0.6
1.02 0.28 0.58 0.15 -0.76 -0.04 -0.76 -0.62 -0.41 -1.12 0.44 -0.36
1.17 0.53 0.41 -0.22 -0.4 -0.11 -1.11 -0.74 -1.15 -1.16 0.26 0.36
0.48 0.32 0.19 -0.02 -0.05 -0.11 -0.6 -0.24 -0.52 -1.0 0.9 -0.4
0.98 0.28 0.13 -0.32 -0.59 -0.06 -0.94 -0.11 -0.26 -0.66 0.32 0.2
0.62 0.78 -0.03 -0.48 -0.7 -0.84 -1.62 -0.23 -1.2 -0.58 1.5 -0.38
0.6 1.02 -0.49 0.72 -0.2 -1.04 -0.41 -0.09 -1.24 -1.08 0.44 -0.35
0.84 0.96 -0.41 0.4 -0.94 -2.28 -1.04 0.19 -1.51 -1.91 1.14 0.02
0.68 0.62 0.17 0.12 -0.26 -0.36 -0.64 -0.28 -0.92 -1.16 0.89 -0.45
0.71 0.06 -0.05 -0.56 -0.6 -0.25 -1.06 -0.11 -0.27 -0.91 0.83 0.7
1.4 0.94 0.13 0.11 -1.82 -0.44 -1.68 -0.03 -0.76 -0.36 0.49 -2.46
1.11 1.03 0.46 -0.01 -0.96 -0.54 -0.91 -0.51 -1.06 -0.74 0.46 -0.92
0.57 0.46 0.45 -0.1 -0.48 0.03 -0.89 -0.24 -0.63 -0.36 0.38 -0.02
-0.34 1.43 -1.51 0.68 -2.2 -1.89 -4.7 -0.39 -3.07 -2.44 1.48 1.13
0.54 -0.2 -0.07 -0.78 -1.59 -0.34 -0.45 0.11 -0.09 -0.93 1.09 0.7
0.61 -0.05 0.41 -0.78 -0.63 -0.22 -0.55 -0.1 0.04 -0.79 1.01 -0.23
0.29 0.26 -0.19 -0.18 -0.31 -0.2 -0.87 0.07 -0.57 -0.62 1.19 -0.09
0.43 -0.01 -0.03 -0.53 -0.88 -0.1 -1.6 0.14 0.02 -0.98 1.25 0.25
1.38 0.39 0.54 -0.29 -1.16 -0.26 -1.3 -0.04 -0.75 -1.96 0.7 -0.55
0.92 0.37 -0.41 -0.5 -0.96 -0.8 -0.32 0.43 -0.3 -1.12 1.24 -1.09
0.73 0.64 0.36 -0.01 -0.51 -0.57 -1.13 -0.33 -1.35 -0.27 0.36 0.46
0.63 -0.07 1.02 -0.15 -1.3 0.07 -1.08 -0.42 -0.54 -2.13 1.21 -0.58
1.31 -0.36 1.86 -1.4 -3.39 -0.8 -2.6 -1.16 -1.44 -2.1 1.39 -2.24
1.05 0.25 0.03 -0.09 -1.23 -0.41 -0.86 0.5 -0.3 -1.93 1.03 -0.93
0.69 0.59 0.37 -0.48 -0.31 -0.35 -0.88 -0.73 -0.65 -0.69 0.91 -0.0
1.05 -0.36 -1.66 -1.53 -1.76 -0.75 -1.24 -0.06 -0.16 0.31 1.53 0.26
-0.63 0.83 -0.95 -0.04 -0.24 -1.07 -0.32 0.2 -0.83 -0.28 1.23 0.12
0.59 0.15 0.48 -0.35 -0.61 -0.13 -0.8 0.06 -0.11 -0.68 0.32 0.28
1.19 0.55 0.17 0.1 -1.28 -0.73 -0.12 0.1 -0.37 -1.46 0.51 -1.03
0.56 0.81 0.27 0.05 -0.73 -2.51 -1.26 0.44 -0.95 -0.14 1.13 -1.48
0.84 0.9 0.48 0.14 -0.93 -0.26 -1.22 -0.36 -0.88 -0.6 0.26 -0.19
1.05 0.68 0.4 -0.04 -0.44 -0.43 -1.34 0.07 -1.02 -1.54 0.92 -1.41
0.25 0.83 -1.3 0.04 -0.54 -3.17 0.3 0.53 -0.78 -1.8 1.46 -0.94
0.53 -0.02 -1.39 -1.41 -0.58 0.21 -0.56 -0.52 -1.02 -2.09 1.78 0.54
0.74 -0.22 0.64 -0.64 -1.7 -0.38 -0.47 -0.14 -0.2 -1.15 1.1 0.14
1.02 -0.01 0.5 -0.7 -1.09 0.4 -1.45 -0.16 -0.28 -1.34 0.91 -0.3
0.4 0.33 -0.01 -0.02 -0.59 -0.5 0.07 0.23 -0.58 -1.08 0.89 -0.24
0.71 -0.37 -0.05 -1.15 -1.75 -0.23 -0.71 0.14 -0.03 -1.77 1.7 -0.35
0.05 0.15 -0.27 0.18 -0.64 0.24 -0.22 -0.25 -0.2 -1.54 1.16 -0.13
0.29 0.32 0.44 0.18 -0.3 -0.39 -0.58 -0.48 -0.8 -1.1 0.66 0.55
0.58 -0.03 0.06 -0.53 -0.56 0.08 -0.78 -0.24 -0.72 -0.51 1.07 0.29
0.85 0.75 0.18 0.35 -0.53 0.04 -0.53 -0.5 -1.28 -0.88 0.01 0.02
-0.68 -0.71 -1.09 -1.12 -0.8 -1.18 -0.99 0.7 0.22 -0.19 1.52 0.85
0.31 0.05 -0.08 -0.76 -0.32 -0.01 -2.18 0.1 -0.03 -0.2 -0.4 1.32
0.87 0.48 0.6 -0.04 -0.47 0.2 -0.84 -0.16 -0.66 -0.91 0.34 -0.89
-0.17 - -0.35 -0.65 -1.43 -0.78 -2.1 1.0 1.71 - 1.14 0.02
0.73 0.46 -0.03 -0.29 -0.8 -0.57 -0.4 0.05 -0.57 -2.48 1.4 -0.67
1.3 0.35 0.29 -0.67 -2.3 -0.16 -2.31 -0.9 -0.87 - 1.09 0.92
-0.3 -0.07 -0.35 -0.23 0.07 -0.77 -0.27 0.64 0.03 -0.0 0.74 -0.18
0.71 -0.14 0.25 -0.9 -0.71 0.07 -0.81 0.01 0.19 -0.49 0.73 -0.01
-2.24 -1.88 - -2.85 -2.45 -3.26 -1.87 0.88 -0.21 1.12 2.5 -1.73
1.02 0.42 0.14 -0.06 -0.97 -0.51 -0.41 -0.3 -0.68 -1.15 0.35 0.54
0.95 0.48 -0.18 -0.13 -1.49 -1.15 -1.52 -0.16 -0.85 -1.31 0.75 1.13
0.65 -0.38 0.59 -1.28 -1.12 0.19 -2.04 -0.35 -0.45 -1.17 1.65 -0.3
0.81 0.29 -0.15 -0.49 -1.33 -0.65 -2.77 0.35 -1.0 -0.22 1.49 -0.34
0.7 -0.48 0.03 -1.08 -1.53 -0.34 -0.87 -0.19 -0.14 -0.95 1.07 1.06
-0.13 -0.65 -0.41 -0.35 -0.72 -0.07 -0.23 0.54 0.26 -1.31 1.54 -0.91
0.13 0.17 -2.09 -2.57 -1.92 -2.29 -1.6 1.4 -0.0 0.08 1.88 -2.31
1.68 1.07 0.5 -0.09 -1.16 -1.56 -0.28 -0.1 -1.6 -1.05 -0.18 -3.43
0.88 0.46 0.34 -0.13 -0.76 -0.14 -1.13 -0.19 -0.43 -0.62 0.1 0.38
-0.16 0.2 -0.32 0.17 -0.04 -1.42 -0.48 0.1 -0.77 -0.76 1.26 0.41
0.72 0.11 0.17 -0.41 -1.57 -0.15 -0.65 -0.19 -0.31 -0.97 1.38 -0.48
0.11 0.36 -0.2 0.03 -0.15 -0.39 -0.69 -0.19 -0.65 -0.92 1.09 0.37
0.25 1.0 -0.19 0.59 -0.9 -0.69 -0.25 0.23 -0.46 - 0.71 -0.15
0.51 0.29 0.15 -0.18 -0.36 -0.12 -0.73 -0.1 -0.4 -0.44 0.56 0.21
0.83 0.41 0.14 -0.34 -1.0 -0.51 -0.41 0.11 -0.55 -1.13 1.14 -0.71
0.79 0.26 0.07 -0.39 -0.82 -0.34 -0.61 -0.34 -0.35 -0.93 0.77 0.52
1.16 0.32 -0.3 -0.39 -1.59 -1.27 -1.07 -0.31 -0.63 -1.04 1.26 0.46
0.52 0.9 -0.04 0.38 -0.31 -0.27 -0.81 -0.28 -1.46 -0.28 0.36 -0.11
0.23 0.38 -0.08 0.02 -0.19 0.04 -0.53 -0.12 -0.5 -0.41 0.55 0.17
0.71 0.57 -0.28 -0.23 -0.27 -0.93 -1.59 0.26 -0.0 -1.22 0.66 0.39
0.6 0.41 0.48 -0.3 -0.24 -0.06 -0.99 0.25 -0.35 -1.07 0.5 -0.36
1.18 0.76 0.31 -0.08 -0.65 -0.63 -1.01 -0.12 -0.9 -1.44 1.02 -2.22
0.81 0.23 0.38 0.07 -0.85 0.22 -0.44 -0.08 -0.43 -1.34 0.55 -0.49
1.95 -0.69 0.02 -2.83 -2.37 0.49 -4.89 0.23 -0.65 -1.91 0.69 0.03
0.94 0.52 -0.13 -0.2 -0.73 -0.79 -0.31 -0.14 -1.4 -0.99 1.31 -0.74
0.45 0.19 -0.11 -0.16 -0.7 -0.49 -0.47 -0.08 -0.3 -0.04 0.78 0.22
0.63 -0.13 0.24 -1.26 -1.57 -0.14 -1.65 -1.26 -1.2 -1.39 1.68 0.95
0.62 0.07 0.27 -0.92 -1.45 -0.75 -1.23 -0.31 -0.44 -1.7 1.46 0.76
0.35 0.11 -0.05 0.13 -0.55 -0.36 -0.73 -0.09 -0.09 -0.34 0.93 -0.07
0.97 0.23 0.33 -0.69 -1.16 -0.16 -1.37 -0.07 -0.11 -1.08 1.03 -0.2
0.32 -0.34 -0.85 -1.75 -1.08 -0.1 -2.03 -0.18 -0.72 0.15 1.55 0.96
0.9 0.21 0.29 -0.28 -0.88 -0.23 -1.62 -0.17 -0.04 -0.53 0.73 -0.02
0.78 0.41 0.14 -0.07 -0.75 -0.01 -1.57 -0.29 -0.14 -0.23 0.4 0.12
0.87 1.23 -0.02 -0.13 0.26 -1.71 -0.99 0.42 -0.69 -0.47 0.01 -2.13
0.04 0.66 0.88 0.23 -0.1 -0.03 -0.75 -0.38 -2.63 0.07 0.42 -0.86
-2.87 -1.02 -2.05 -2.26 -1.55 -2.22 -2.4 1.17 -0.59 1.15 2.12 -0.52
-0.9 2.02 -0.61 0.63 -0.57 -3.91 -2.15 0.28 -1.99 -0.11 0.23 -0.6

Details

Dark gray cells indicate values where the raw expression is zero (cannot be log-transformed). Blue cells indicate samples where the expression of the gene is below average and red cells indicate the gene is expressed above average in the sample. White cells are average.