1. Home
  2. Tools
  3. Expression Heatmap
  4. Results

Heatmap: Cluster_6 (HCCA)

View as: (view raw or zlog-transformed)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are normalized against highest expression of the row)

 Transpose table  Download table
Gene
12pM Fe,Midday
12pM Fe,Midnight
58pM Fe,Midday
58pM Fe,Midnight
233pM Fe,Midnight
1160pM Fe,Midday
1160pM Fe,Midnight
High carbon,Dark
High carbon,Light
Low carbon,Dark
Phloroglucinol
Silicon starvation,12h
0.25 0.32 0.24 0.26 0.27 0.3 0.17 0.23 0.16 0.18 1.0 0.4
0.95 0.59 0.73 0.33 0.2 0.42 0.2 0.26 0.24 0.11 1.0 0.24
0.84 0.61 0.57 0.3 0.19 0.4 0.29 0.23 0.2 0.16 1.0 0.44
0.49 0.28 0.3 0.19 0.19 0.29 0.17 0.23 0.27 0.41 1.0 0.62
0.53 0.59 0.31 0.32 0.27 0.22 0.43 0.32 0.18 0.2 1.0 0.29
0.65 0.54 0.58 0.32 0.26 0.43 0.26 0.23 0.2 0.19 1.0 0.58
0.53 0.44 0.52 0.32 0.19 0.36 0.21 0.17 0.22 0.11 1.0 0.41
0.58 0.49 0.49 0.33 0.29 0.43 0.22 0.3 0.24 0.23 1.0 0.41
0.52 0.45 0.44 0.29 0.29 0.45 0.2 0.24 0.25 0.22 1.0 0.84
0.51 0.52 0.26 0.32 0.22 0.12 0.25 0.27 0.06 0.14 1.0 0.14
0.48 0.51 0.21 0.23 0.1 0.05 0.35 0.23 0.1 0.05 1.0 0.1
0.8 0.67 0.36 0.6 0.19 0.16 0.43 0.39 0.13 0.12 1.0 0.16
0.45 0.16 0.24 0.1 0.08 0.13 0.3 0.18 0.14 0.08 1.0 0.09
0.64 0.57 0.39 0.36 0.21 0.34 0.29 0.19 0.16 0.14 1.0 0.26
0.41 0.21 0.34 0.11 0.12 0.28 0.19 0.13 0.11 0.08 1.0 0.52
0.59 0.58 0.49 0.38 0.28 0.39 0.36 0.25 0.23 0.25 1.0 0.21
0.5 0.44 0.33 0.28 0.21 0.25 0.34 0.26 0.23 0.23 1.0 0.31
0.38 0.5 0.31 0.32 0.15 0.22 0.19 0.13 0.07 0.07 1.0 0.06
0.32 0.4 0.44 0.2 0.2 0.33 0.15 0.15 0.18 0.14 1.0 0.5
0.56 0.4 0.48 0.23 0.25 0.48 0.25 0.24 0.28 0.2 1.0 0.46
0.28 0.26 0.26 0.15 0.1 0.19 0.11 0.08 0.07 0.06 1.0 0.03
0.55 0.51 0.52 0.39 0.23 0.41 0.17 0.29 0.27 0.21 1.0 0.38
0.82 0.78 0.61 0.5 0.29 0.38 0.44 0.38 0.35 0.34 1.0 0.32
0.14 0.15 0.09 0.17 0.07 0.11 0.25 0.1 0.13 0.06 1.0 0.16
0.26 0.25 0.24 0.23 0.17 0.24 0.43 0.28 0.27 0.16 1.0 0.42
0.46 0.42 0.32 0.25 0.21 0.31 0.4 0.22 0.22 0.22 1.0 0.22
0.01 0.0 0.0 0.01 0.01 0.0 0.01 0.06 0.07 0.04 1.0 0.29
0.61 0.55 0.6 0.39 0.26 0.39 0.18 0.26 0.26 0.25 1.0 0.54
0.43 0.38 0.38 0.2 0.21 0.26 0.16 0.21 0.22 0.19 1.0 0.48
0.41 0.35 0.23 0.22 0.1 0.15 0.34 0.15 0.13 0.08 1.0 0.17
0.65 0.46 0.4 0.34 0.21 0.25 0.42 0.29 0.27 0.15 1.0 0.32
0.68 0.54 0.62 0.32 0.35 0.31 0.13 0.25 0.24 0.34 1.0 0.6
0.78 0.53 0.66 0.36 0.28 0.48 0.27 0.33 0.29 0.23 1.0 0.25
0.33 0.22 0.23 0.09 0.13 0.15 0.14 0.14 0.11 0.09 1.0 0.21
0.63 0.54 0.69 0.36 0.37 0.54 0.22 0.33 0.29 0.42 1.0 0.34
1.0 0.6 0.72 0.35 0.23 0.55 0.21 0.23 0.18 0.14 0.86 0.29
0.53 0.42 0.47 0.31 0.14 0.2 0.31 0.18 0.14 0.13 1.0 0.25
0.54 0.52 0.44 0.32 0.1 0.32 0.17 0.14 0.1 0.09 1.0 0.21
0.61 0.5 0.59 0.36 0.31 0.43 0.23 0.28 0.22 0.26 1.0 0.51
0.86 0.58 0.42 0.42 0.19 0.19 0.4 0.4 0.17 0.2 1.0 0.24
0.66 0.59 0.82 0.33 0.35 0.46 0.28 0.31 0.25 0.24 1.0 0.52
0.48 0.71 0.34 0.44 0.35 0.22 0.22 0.27 0.15 0.2 1.0 0.21
0.59 0.56 0.54 0.41 0.27 0.37 0.2 0.21 0.22 0.21 1.0 0.54
0.46 0.43 0.47 0.25 0.22 0.39 0.13 0.26 0.2 0.22 1.0 0.44
0.6 0.62 0.34 0.31 0.3 0.29 0.37 0.25 0.15 0.18 1.0 0.31
0.35 0.19 0.14 0.13 0.1 0.17 0.11 0.11 0.12 0.13 1.0 0.12
0.46 0.29 0.23 0.13 0.07 0.13 0.15 0.12 0.06 0.14 1.0 0.07
0.01 0.0 0.0 0.02 0.0 0.0 0.01 0.11 0.08 0.0 1.0 0.01
0.59 0.35 0.5 0.23 0.2 0.42 0.14 0.21 0.19 0.18 1.0 0.34
0.67 0.42 0.64 0.2 0.22 0.48 0.13 0.19 0.18 0.16 1.0 0.28
0.62 0.23 0.36 0.15 0.09 0.31 0.17 0.17 0.17 0.14 1.0 0.15
0.64 0.35 0.61 0.2 0.18 0.5 0.12 0.21 0.23 0.22 1.0 0.36
0.84 1.0 0.49 0.56 0.47 0.47 0.3 0.41 0.24 0.27 0.89 0.77
0.44 0.27 0.25 0.19 0.06 0.13 0.23 0.18 0.13 0.09 1.0 0.17
0.91 0.67 0.54 0.43 0.88 0.43 0.47 0.4 0.33 0.24 1.0 0.81
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.02 0.0 1.0 0.0
0.28 0.39 0.19 0.23 0.18 0.14 0.35 0.37 0.14 0.18 1.0 0.23
0.39 0.46 0.49 0.3 0.25 0.34 0.22 0.2 0.17 0.17 1.0 0.46
0.43 0.34 0.16 0.19 0.09 0.13 0.14 0.18 0.09 0.06 1.0 0.09
0.85 0.8 0.47 0.5 0.52 0.33 0.55 0.48 0.28 0.33 1.0 0.61
0.03 0.03 0.03 0.03 0.02 0.03 0.14 0.05 0.07 0.04 1.0 0.14
0.67 0.68 0.41 0.34 0.2 0.36 0.26 0.23 0.18 0.18 1.0 0.56
0.25 0.33 0.17 0.31 0.32 0.28 0.25 0.23 0.17 0.19 1.0 0.15
0.78 0.73 0.38 0.49 0.13 0.05 0.49 0.39 0.2 0.1 1.0 0.06
0.01 0.01 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.01 0.0 1.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.01 0.0 1.0 0.08
0.06 0.03 0.04 0.01 0.01 0.05 0.01 0.04 0.05 0.03 1.0 0.06
0.45 0.47 0.42 0.3 0.13 0.31 0.11 0.11 0.11 0.09 1.0 0.31
0.58 0.6 0.28 0.34 0.26 0.21 0.42 0.24 0.17 0.21 1.0 0.14
0.91 0.61 0.67 0.36 0.32 0.46 0.21 0.28 0.22 0.19 1.0 0.25
0.78 0.54 0.37 0.39 0.33 0.42 0.43 0.29 0.26 0.24 1.0 0.35
0.62 0.44 0.58 0.23 0.27 0.55 0.14 0.19 0.21 0.21 1.0 0.65
0.36 0.33 0.34 0.22 0.11 0.19 0.31 0.29 0.29 0.15 1.0 0.26
0.59 0.46 0.38 0.37 0.19 0.3 0.19 0.28 0.22 0.22 1.0 0.25
0.28 0.31 0.29 0.19 0.24 0.25 0.2 0.19 0.13 0.1 1.0 0.17
0.38 0.3 0.3 0.22 0.13 0.19 0.21 0.25 0.17 0.11 1.0 0.1
0.83 0.86 0.8 0.55 0.47 0.51 0.54 0.53 0.27 0.51 1.0 0.6
0.66 0.66 0.55 0.48 0.25 0.42 0.25 0.23 0.19 0.26 1.0 0.47
0.42 0.28 0.21 0.1 0.14 0.19 0.05 0.13 0.1 0.06 1.0 0.28
0.41 0.16 0.28 0.14 0.14 0.17 0.07 0.14 0.18 0.11 1.0 0.24
0.32 0.3 0.25 0.28 0.15 0.22 0.39 0.22 0.18 0.1 1.0 0.21
0.75 0.76 0.32 0.33 0.16 0.16 0.26 0.23 0.14 0.16 1.0 0.25
0.65 0.56 0.24 0.46 0.12 0.25 0.31 0.19 0.09 0.08 1.0 0.18
0.3 0.32 0.19 0.19 0.28 0.23 0.37 0.26 0.21 0.14 1.0 0.22
0.57 0.33 0.53 0.24 0.17 0.33 0.16 0.21 0.22 0.17 1.0 0.4
0.37 0.28 0.3 0.2 0.22 0.25 0.21 0.15 0.15 0.11 1.0 0.2
0.27 0.19 0.22 0.12 0.1 0.16 0.13 0.16 0.18 0.06 1.0 0.25
0.02 0.02 0.03 0.05 0.02 0.0 0.04 0.15 0.07 0.13 1.0 0.0
0.58 0.66 0.51 0.46 0.31 0.44 0.27 0.27 0.22 0.18 1.0 0.58
0.4 0.34 0.34 0.2 0.21 0.29 0.1 0.23 0.23 0.27 1.0 0.62
0.27 0.24 0.17 0.17 0.07 0.16 0.36 0.25 0.24 0.16 1.0 0.15
0.38 0.27 0.27 0.2 0.19 0.23 0.23 0.21 0.19 0.09 1.0 0.35
0.51 0.35 0.37 0.26 0.29 0.34 0.26 0.28 0.28 0.32 1.0 0.42
0.6 0.51 0.43 0.33 0.18 0.28 0.16 0.28 0.2 0.18 1.0 0.56
0.04 0.11 0.08 0.03 0.01 0.04 0.08 0.09 0.08 0.05 1.0 0.49
0.28 0.18 0.09 0.08 0.05 0.1 0.28 0.16 0.15 0.05 1.0 0.05
0.67 0.47 0.46 0.33 0.28 0.4 0.21 0.22 0.19 0.23 1.0 0.53
0.59 0.42 0.54 0.37 0.26 0.49 0.18 0.22 0.21 0.21 1.0 0.32
0.44 0.45 0.27 0.26 0.2 0.29 0.15 0.14 0.15 0.13 1.0 0.18
0.21 0.28 0.08 0.24 0.08 0.13 0.29 0.15 0.1 0.05 1.0 0.16
0.99 1.0 0.58 0.57 0.46 0.42 0.38 0.48 0.31 0.46 0.85 0.57
0.69 0.49 0.69 0.25 0.23 0.48 0.16 0.24 0.23 0.21 1.0 0.53
0.42 0.33 0.32 0.19 0.16 0.33 0.19 0.16 0.15 0.1 1.0 0.57
0.12 0.11 0.06 0.05 0.04 0.06 0.03 0.06 0.02 0.01 1.0 0.0
0.1 0.01 0.03 0.03 0.03 0.01 0.02 0.1 0.05 0.19 1.0 0.12
0.75 0.6 0.58 0.46 0.27 0.42 0.26 0.34 0.26 0.41 1.0 0.72
0.0 0.0 0.0 0.0 0.03 0.0 0.0 0.1 0.06 0.09 1.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.01 0.0 1.0 0.0
0.49 0.42 0.22 0.21 0.11 0.16 0.32 0.22 0.16 0.13 1.0 0.55
0.19 0.18 0.16 0.13 0.09 0.18 0.25 0.13 0.16 0.33 1.0 0.25
0.28 0.2 0.2 0.11 0.08 0.18 0.25 0.15 0.19 0.15 1.0 0.25
0.4 0.26 0.21 0.16 0.13 0.15 0.21 0.18 0.14 0.11 1.0 0.09
0.68 0.37 0.77 0.25 0.15 0.42 0.1 0.16 0.11 0.1 1.0 0.15
0.01 0.02 0.01 0.02 0.02 0.02 0.16 0.04 0.07 0.02 1.0 0.03
0.01 0.02 0.01 0.02 0.03 0.02 0.2 0.04 0.07 0.04 1.0 0.05
0.08 0.06 0.01 0.02 0.01 0.01 0.1 0.05 0.05 0.01 1.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 1.0 0.02
0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.04 1.0 0.16
0.0 0.03 0.0 0.04 0.03 0.0 0.01 0.07 0.07 0.24 1.0 0.12
0.0 0.03 0.0 0.03 0.06 0.01 0.01 0.05 0.03 0.35 1.0 0.34
0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 1.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 1.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.01 0.0 0.03 0.0 1.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.01 0.0 0.0 1.0 0.0

Details

Expression values normalized per gene (using the maximum value, Green cells indicate low expression and red high. (Dark gray cells indicate missing values)