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Heatmap: Cluster_69 (HCCA)

View as: (view raw or row-normalized)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are log2 transformed ratios of a genes expression in a sample divided by the mean expression level)

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Gene
12pM Fe,Midday
12pM Fe,Midnight
58pM Fe,Midday
58pM Fe,Midnight
233pM Fe,Midnight
1160pM Fe,Midday
1160pM Fe,Midnight
High carbon,Dark
High carbon,Light
Low carbon,Dark
Phloroglucinol
Silicon starvation,12h
-0.98 0.46 -1.04 0.35 0.84 -1.34 0.21 0.12 -0.48 0.21 -1.44 0.76
0.28 0.96 0.0 0.44 0.1 -0.57 0.18 -0.17 -0.81 -0.6 -1.29 0.11
1.01 0.35 0.36 0.47 -0.19 0.28 -0.1 -0.65 -1.04 -1.7 -1.42 0.28
0.22 0.45 0.29 0.08 0.23 0.35 -0.05 -0.8 -0.35 -1.54 0.01 0.08
0.31 0.39 0.01 -0.02 0.16 0.02 -0.53 -0.44 -0.67 0.11 -0.31 0.46
0.7 0.95 -0.34 0.52 0.05 -0.6 -0.4 -0.67 -1.0 -0.24 -0.63 0.18
1.01 0.12 0.48 -0.13 0.2 0.4 -0.93 -0.58 -1.5 -0.62 -1.48 0.64
-0.06 0.34 -0.47 0.19 0.6 -0.24 -0.12 -0.23 -0.58 0.44 -2.09 0.6
0.18 0.17 0.19 -0.08 0.49 0.11 -0.08 -0.2 -0.14 0.21 -0.83 -0.45
-0.14 0.43 -0.27 0.3 0.61 0.5 -0.37 -0.25 -0.53 -0.18 -2.03 0.38
-4.56 0.75 -3.74 0.59 1.5 -1.3 -0.23 0.61 -0.83 0.57 -3.56 -0.07
0.99 -1.38 -0.15 0.56 1.08 1.53 0.41 -1.6 -2.1 -4.44 -3.07 -2.42
0.61 0.59 0.43 -0.04 0.03 0.22 -0.62 -0.32 -0.31 -0.29 -1.29 -0.04
0.06 0.57 0.22 0.15 -0.22 -0.11 -0.06 0.04 -0.4 -0.52 0.09 -0.14
1.33 0.96 0.33 0.29 0.09 0.58 -1.01 -0.66 -2.17 -1.29 -2.65 -0.81
-1.0 0.69 -1.86 0.33 1.24 -0.69 -0.03 0.15 -0.67 0.06 -1.52 0.33
0.42 0.5 -0.34 0.22 0.22 -0.14 -0.51 -0.09 -0.48 -0.21 -0.96 0.55
-0.25 0.49 0.57 0.43 0.67 -0.52 -0.35 0.02 -0.74 -0.13 -0.54 -0.65
-0.4 0.42 -0.81 0.18 0.87 -0.28 0.34 0.24 -0.58 0.32 -1.11 -0.46
0.07 0.04 -0.47 0.04 0.74 -0.31 0.42 -0.05 -0.56 0.46 -1.52 -0.02
0.73 0.52 0.25 -0.09 -0.07 0.06 -0.75 -0.14 -0.86 -0.48 -0.74 0.49
0.51 -0.66 -0.78 -0.74 0.38 1.15 0.82 0.07 0.12 -1.81 -2.49 -0.18
0.31 0.48 -0.08 0.11 0.5 -1.33 -0.22 -0.07 -1.06 0.26 -1.04 0.64
0.5 0.73 0.47 0.08 0.15 -0.09 0.39 -0.31 -0.89 -1.03 -1.11 -0.28
0.26 0.4 0.38 0.39 0.43 -0.07 0.63 -0.38 -1.48 -0.26 -3.76 -0.01
-0.03 0.23 0.09 0.17 0.66 -0.19 0.37 -0.06 -0.95 -0.14 -2.5 0.43
0.4 0.34 0.02 0.59 0.26 -0.3 -0.08 -0.45 -1.2 -0.29 -1.19 0.6
-0.73 0.32 -0.19 -0.32 0.7 1.06 -0.66 -0.53 -0.0 -0.38 -2.98 0.63
-0.17 0.29 -0.69 0.04 0.21 -0.03 0.49 -0.35 -0.33 -0.17 -0.51 0.61
0.43 0.44 0.64 0.13 0.06 0.07 0.7 -0.57 -1.45 -1.49 -1.02 0.06
0.29 0.38 0.72 0.07 0.15 0.31 0.68 -0.71 -1.29 -1.21 -0.74 -0.35
0.38 0.6 -0.46 0.42 0.23 -0.17 -0.68 -0.15 -0.59 0.2 -1.08 0.31
-0.82 0.55 -0.94 0.25 0.59 0.62 0.19 -0.03 -0.65 -0.1 -1.12 0.09
0.31 0.57 -0.26 0.33 0.29 -0.19 -0.15 -0.55 -1.02 -0.12 -0.78 0.59
0.37 0.18 0.17 0.04 0.28 0.01 -0.45 -0.35 -0.51 0.06 -0.59 0.33
-1.87 0.9 -2.37 0.65 0.86 -0.54 -0.4 0.13 -0.49 0.15 -0.19 0.05
0.25 0.25 0.22 0.06 0.98 0.56 0.61 -0.16 -0.18 -0.77 -4.61 -4.66
0.34 1.19 0.27 0.67 0.56 -1.36 -0.12 -0.98 -1.31 -1.55 -2.01 0.46
-0.13 0.1 -0.81 -0.14 1.14 1.33 -0.68 -0.37 -0.07 -0.45 -2.54 -0.81
-0.72 0.72 -0.97 0.36 0.78 -0.41 -0.61 -0.03 -0.84 -0.09 -1.28 0.96
-0.32 0.3 -0.74 0.06 0.62 -0.69 -0.46 0.07 -0.41 0.51 -1.22 0.84
-0.15 -0.15 -0.86 -0.1 0.66 0.36 -0.2 -0.41 -0.48 0.59 -1.91 0.8
0.27 0.58 0.43 0.03 0.11 -0.24 -0.3 -0.57 -0.9 -0.51 -0.22 0.51
0.55 0.59 0.2 0.37 -0.19 -0.24 -0.43 -0.42 -0.98 -0.71 -1.43 0.91
0.34 -0.11 0.38 -0.4 0.1 0.35 -0.37 -0.26 -0.41 0.55 -1.7 0.34
0.82 0.23 0.33 0.08 0.82 0.48 0.13 -0.55 -1.5 -0.71 -1.69 -0.87
1.15 0.47 0.32 0.39 0.53 0.11 0.38 -1.01 -1.45 -0.67 -2.56 -1.48
-5.18 1.22 - 1.48 0.94 -2.83 -0.23 0.64 -2.8 1.0 -2.86 -3.29
-0.33 0.75 -1.33 0.35 0.6 -0.64 -0.31 -0.14 -0.66 0.26 -1.75 0.89
0.27 0.53 0.75 0.52 0.64 0.63 -0.96 -0.08 -1.11 -0.46 -4.76 -1.19
-0.53 0.48 -0.29 0.29 0.59 -0.4 -0.28 -0.2 -1.03 0.05 -1.24 0.98
0.4 0.29 0.08 -0.06 0.02 -0.11 -0.02 -0.02 -0.43 -0.27 -0.48 0.31
1.26 0.52 0.81 0.36 -0.17 0.44 -0.27 -2.75 -1.34 -6.0 -3.61 0.49
0.32 0.69 -0.11 0.09 0.63 0.68 -0.91 -0.96 -0.56 0.07 -1.48 -0.21
0.53 0.4 0.33 0.12 0.08 0.19 0.01 -0.48 -0.62 -0.59 -1.42 0.36
0.44 0.5 -0.18 0.28 0.08 0.5 -0.18 -0.02 -0.39 -0.78 -2.49 0.33
0.34 0.29 0.27 -0.28 0.05 0.08 -0.32 -0.16 -0.25 0.89 -0.77 -1.3
0.18 0.21 0.19 -0.0 0.23 0.01 0.32 -0.05 -0.69 -0.05 -0.68 -0.05
0.57 -0.01 -0.05 0.26 0.23 0.52 -0.48 -0.19 -0.33 0.19 -2.89 0.13
0.78 0.31 0.28 0.3 0.1 0.37 -0.18 -0.04 -0.89 -0.38 -1.6 -0.45
-0.53 1.11 -0.48 0.34 -0.66 0.04 -2.63 0.04 -0.45 0.19 -1.77 1.1
0.75 0.39 0.72 0.18 0.48 0.01 0.35 -0.57 -0.91 -0.97 -1.23 -1.29
0.4 0.41 -0.13 0.26 0.03 0.06 0.08 0.06 -0.48 -0.35 -1.01 0.1
0.42 -0.64 -0.09 -0.61 0.84 0.26 0.05 -0.41 -0.08 -0.5 -0.83 0.52
0.86 0.58 0.3 0.35 0.54 0.2 -0.57 -0.56 -1.14 -0.94 -1.84 -0.04
0.27 0.07 0.36 -0.09 -0.0 0.22 0.05 -0.1 -0.07 0.1 -1.12 -0.15
0.57 0.86 -0.0 0.74 0.1 -0.06 -1.07 -0.4 -1.17 -2.13 -1.97 0.88
0.59 0.42 0.21 0.13 -0.07 0.04 0.59 -0.15 -0.04 -1.07 -3.71 -0.02
-0.67 0.6 -0.41 0.22 0.69 -0.6 -0.5 0.22 -0.47 0.35 -2.08 0.65
0.79 0.2 0.15 -0.05 -0.03 0.1 -0.57 -0.1 -0.43 -0.89 -0.64 0.54
0.58 0.93 0.05 -0.01 -0.11 -0.26 -1.46 -0.19 -0.76 -0.72 -1.9 1.07
0.42 0.2 0.14 0.3 -0.39 0.82 0.08 -0.68 -0.65 -0.86 -0.39 0.01
-0.4 -0.01 -0.68 -0.04 0.52 0.18 0.07 0.06 -0.25 -0.24 -0.95 0.83
-0.06 -0.94 0.45 0.55 -0.25 1.32 -0.23 -1.05 -1.65 -2.31 0.67 -0.13
- - - - - 3.58 - - - - - -
-0.52 0.73 0.86 0.61 0.75 -1.58 -0.04 -0.5 -1.36 -1.48 -0.85 0.37
-1.01 0.99 -1.16 0.23 1.28 -2.07 -0.27 0.12 -0.44 0.1 -1.19 0.09
-1.62 -0.25 -1.22 -0.12 0.66 -0.89 -0.3 0.12 -0.45 0.08 -0.39 1.55
- - - - - 2.43 - - 2.72 - - -
-0.42 0.16 -0.94 0.15 -0.15 0.07 0.77 0.12 -0.29 0.12 -1.74 0.63
0.3 0.57 -0.24 0.12 0.22 -0.79 -0.42 -0.1 -0.32 0.13 -0.76 0.53
0.57 -0.17 0.21 -0.45 -0.15 -0.19 -0.22 -0.21 -0.39 1.01 -0.6 -0.33
-0.87 0.46 -2.05 0.54 0.58 -3.45 -0.56 0.27 -0.62 0.27 -2.44 1.53
0.13 0.03 0.25 -0.18 -0.11 0.05 -0.01 -0.09 -0.18 0.51 -1.29 0.27
0.66 -0.95 -0.09 -0.57 -0.06 1.61 0.18 -0.68 0.46 -2.14 -2.11 -0.54
0.63 -0.06 0.56 -0.22 0.09 -0.06 1.07 -0.39 -0.97 -0.71 -0.7 -0.87
0.0 0.21 -0.48 0.28 0.49 0.22 0.56 0.01 -0.22 -0.37 -3.05 0.15
0.1 0.34 0.32 0.09 0.13 -0.25 -0.4 -0.06 -0.67 0.69 -0.44 -0.48

Details

Dark gray cells indicate values where the raw expression is zero (cannot be log-transformed). Blue cells indicate samples where the expression of the gene is below average and red cells indicate the gene is expressed above average in the sample. White cells are average.