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Heatmap: Cluster_40 (HCCA)

View as: (view raw or row-normalized)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are log2 transformed ratios of a genes expression in a sample divided by the mean expression level)

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Gene
12pM Fe,Midday
12pM Fe,Midnight
58pM Fe,Midday
58pM Fe,Midnight
233pM Fe,Midnight
1160pM Fe,Midday
1160pM Fe,Midnight
High carbon,Dark
High carbon,Light
Low carbon,Dark
Phloroglucinol
Silicon starvation,12h
0.35 -0.48 0.11 -0.87 -0.18 0.04 -0.9 0.08 0.05 -0.15 -0.57 1.18
0.83 0.1 0.98 -0.1 -0.2 -0.01 -0.8 -0.16 -0.66 -0.85 -1.51 0.45
0.18 0.29 0.23 -0.4 -0.05 -0.12 -0.83 0.17 -0.43 -0.94 -0.38 1.07
0.58 0.36 -0.62 -0.11 0.23 -1.21 -0.19 0.71 -0.16 -0.69 -0.97 0.57
0.24 0.08 0.13 -0.25 0.25 0.02 -0.13 0.18 -0.42 -0.25 -0.7 0.45
-0.25 -0.15 0.2 -0.36 0.05 -0.6 0.19 0.53 0.4 0.09 -0.88 0.16
-0.24 0.0 -0.16 -0.66 -0.09 -0.44 -0.37 -0.28 -0.37 -0.91 -0.92 1.81
-0.86 -0.35 -0.95 -0.32 0.61 -0.51 -0.22 0.06 -0.32 -0.1 -0.53 1.48
-0.39 -0.56 -0.87 -0.68 -0.32 -0.53 -0.59 0.06 0.01 -0.23 -1.05 1.94
0.39 0.27 -0.24 -0.15 0.13 -0.87 -0.08 0.38 0.06 -0.58 -0.38 0.46
0.1 0.32 -0.39 -0.34 0.3 -0.75 -0.43 0.08 -0.25 -0.09 -0.38 0.96
0.19 -1.76 0.06 -1.93 -0.32 -0.53 -1.12 0.38 0.39 -0.66 -0.26 1.69
0.25 0.02 0.04 -0.06 0.28 -0.39 -0.3 0.26 -0.07 -0.31 -0.69 0.52
0.79 -0.16 -0.28 -0.56 0.23 -1.17 -0.87 0.42 -0.11 -1.21 -0.09 1.06
0.32 0.11 0.52 0.11 -0.01 -0.71 -0.42 0.23 -0.2 -0.78 -0.47 0.54
-2.39 -0.26 -3.57 -1.74 -0.57 -2.37 -1.54 0.89 -0.4 -0.37 -2.44 2.54
0.55 -0.17 0.16 -0.06 0.05 -0.28 0.24 0.02 -0.27 -0.73 -1.13 0.7
0.49 0.07 -0.07 -0.4 -0.29 -0.39 -0.92 0.49 -0.01 -0.32 -1.24 1.06
0.59 0.08 0.47 -0.4 0.18 -0.52 -0.77 0.02 -0.61 0.03 -1.21 0.81
0.15 -0.04 0.46 -0.43 -0.09 -0.44 0.02 0.13 0.18 0.3 -0.46 -0.12
0.27 -0.69 0.15 -1.25 0.75 -2.12 -1.34 0.18 -0.13 0.14 -1.22 1.47
0.32 0.02 0.21 -0.16 -0.18 -0.09 -0.23 0.11 0.02 -0.62 -1.08 0.85
0.38 -0.07 0.2 -0.3 0.09 -0.44 -0.81 0.2 -0.17 -0.63 -0.07 0.84
0.55 -0.22 0.49 -0.42 -0.17 -0.2 -1.11 -0.12 -0.33 -0.36 -0.99 1.21
-0.07 0.56 -0.42 -0.29 0.02 -1.03 -0.86 -0.0 -0.15 -0.58 0.03 1.24
0.19 0.34 -0.34 -0.59 0.1 -0.47 -0.61 0.18 -0.01 -1.01 -0.35 1.19
0.61 0.19 -0.31 -0.69 0.26 -0.08 -0.91 0.5 0.17 -0.38 -1.59 0.68
-0.32 -0.3 -0.36 -0.59 0.39 -0.21 0.01 0.32 0.04 -0.27 -0.38 0.92
0.32 0.0 0.02 -1.3 0.33 -0.56 -2.21 0.1 -0.35 -0.38 -1.31 1.66
0.29 0.37 0.53 0.01 0.17 -0.33 -0.55 0.21 -0.51 -0.42 -1.23 0.49
0.5 -0.15 0.19 -0.6 -0.04 -0.61 -0.39 -0.04 -0.0 -0.71 -0.32 1.08
0.11 -0.18 -0.13 -0.46 -0.35 -0.76 -0.93 0.26 -0.15 -0.16 -0.22 1.41
-0.45 -0.61 -0.01 -0.31 0.36 -0.14 -0.07 0.09 0.05 -1.37 -0.91 1.41
0.41 0.08 -0.13 -0.47 0.14 -0.5 -1.33 0.15 -0.38 -0.54 -0.91 1.41
0.69 -0.21 0.34 -0.49 -0.21 -0.6 -0.67 0.4 -0.24 -0.05 -0.9 0.79
1.09 -0.1 -0.11 -0.77 -0.11 -0.85 -0.6 0.32 0.03 0.08 -1.49 0.66
0.65 0.41 0.43 0.06 -0.0 0.03 -0.65 -0.04 -0.5 -1.01 -1.59 0.62
0.42 -0.07 0.27 -0.11 0.22 -0.07 0.11 0.01 -0.4 -0.65 -1.3 0.65
0.25 0.17 -0.13 -0.08 0.44 -0.54 -0.3 0.23 -0.72 0.13 -0.87 0.64
-0.12 0.13 -0.18 -0.17 0.2 -1.01 -0.63 0.36 0.1 0.44 -0.85 0.74
-0.14 0.06 -0.15 -0.21 0.22 -0.7 -0.56 0.05 -0.61 -0.41 -1.27 1.57
0.78 -0.12 0.01 -0.34 0.11 -0.4 -0.31 -0.18 -0.13 0.26 -1.49 0.65
-0.0 0.0 -0.42 -0.65 -0.01 -0.47 -0.77 0.04 -0.34 -0.54 -0.8 1.69
0.5 0.26 0.12 -0.29 0.02 -0.55 -0.11 0.09 0.23 -0.48 -1.15 0.55
0.51 0.52 0.34 -0.04 0.55 -0.22 -0.69 0.18 -0.89 -0.59 -1.63 0.37
1.09 -1.46 0.46 -1.58 0.05 -1.31 -2.35 -0.28 -1.01 0.81 -0.2 1.15
0.59 0.09 0.38 -0.52 0.04 -0.73 -0.55 0.2 -0.08 -0.01 -0.73 0.51
0.31 -0.06 0.18 -0.34 0.18 -0.54 0.1 0.34 0.35 -0.15 -0.72 -0.08
0.06 -0.22 0.06 -0.4 0.16 -0.36 -1.04 -0.06 -0.0 0.3 -0.38 0.97
0.69 0.07 0.12 -0.52 -0.17 -0.72 -0.71 0.14 0.08 -1.15 -0.74 1.16
0.51 -0.09 0.24 -0.84 0.07 -0.05 -0.93 0.34 -0.36 -0.43 -1.02 1.05
0.33 0.43 0.34 0.08 0.33 -0.27 -1.15 0.27 -0.62 -0.68 -2.19 0.88
0.39 0.28 0.21 -0.08 0.01 -0.26 -0.19 0.14 -0.24 -0.65 -0.06 0.14
-0.52 -0.03 -0.11 -0.33 0.74 -0.76 -0.52 -0.11 -0.74 0.09 -0.9 1.33
-0.18 0.47 -0.19 -0.32 0.67 -0.72 -0.44 0.8 -0.4 -0.08 -2.63 0.6
0.52 -0.02 0.07 -0.64 -0.12 -0.55 -0.65 0.09 -0.1 -0.54 -0.0 0.98
0.34 -0.16 -0.27 -0.49 -0.02 -0.4 -0.77 0.34 0.0 0.08 -0.5 0.95
0.33 -0.14 -0.11 -0.5 0.19 -0.26 -0.46 0.14 -0.09 -0.35 -0.39 0.93
0.45 0.4 -0.14 0.11 0.1 -1.11 -0.35 0.54 -0.18 -0.72 -1.76 0.83
0.59 0.24 0.28 -0.62 -0.11 -0.39 0.1 -0.1 -0.27 -0.63 -1.65 0.96
-0.23 -0.22 -0.01 -0.06 0.06 -0.0 -0.59 -0.31 -0.25 -1.11 -0.33 1.45
0.6 -0.03 0.08 -0.57 -0.3 -0.51 -0.71 0.11 -0.17 -0.04 -1.08 1.16
0.18 -0.41 -0.07 -0.87 -0.25 -0.61 -0.57 0.28 0.39 -0.25 -0.1 1.1
0.61 0.34 0.1 -0.11 -0.03 -0.23 -0.67 0.25 0.06 -0.82 -1.12 0.59
0.19 0.26 -0.2 -0.34 -0.05 -0.21 0.04 -0.02 -0.02 -0.22 -1.23 0.91
0.53 0.07 -0.13 -0.54 0.14 -0.24 -0.46 0.14 0.04 -0.17 -0.84 0.72
0.2 0.05 0.17 -0.3 0.0 -0.46 0.04 0.3 -0.02 0.03 -1.16 0.52
0.6 0.4 0.14 0.09 0.57 -0.36 -0.18 0.02 -0.61 -1.51 -0.96 0.4
0.02 0.18 -0.3 -0.34 0.33 -0.54 -0.3 0.26 -0.31 -0.58 -0.07 0.9
0.24 0.72 -0.12 0.1 0.41 -0.81 -0.28 0.24 -0.45 -0.33 -0.43 -0.01
0.09 0.05 0.11 -0.61 0.53 -1.4 -0.97 0.88 -0.05 0.03 -2.7 0.9
0.48 0.17 0.06 -0.55 -0.19 -0.61 -0.96 0.54 0.34 -0.06 -0.95 0.6
0.37 -0.26 -0.07 -0.55 -0.08 -0.47 -0.53 0.53 0.47 -0.39 -0.89 0.8
0.37 -0.03 -0.23 -0.56 -0.48 -0.57 -1.63 0.28 0.06 -0.77 -0.27 1.49
-0.1 -0.41 -0.13 -0.43 -0.67 -0.86 0.11 0.92 0.66 0.63 -1.65 0.08
0.79 0.06 0.34 -0.36 -0.27 -0.62 -0.54 -0.09 0.17 -0.92 -0.75 0.88
-0.56 1.01 -1.03 0.66 0.55 -2.93 0.56 0.7 -0.4 -0.57 -0.62 -1.11
0.54 0.32 1.23 -0.06 -0.19 -0.32 -0.79 -0.02 -0.62 -0.62 -1.7 0.19
0.36 0.34 0.24 -0.15 -0.06 -0.69 -0.45 0.02 -0.59 -0.76 -0.21 0.94
0.08 0.35 0.64 -0.01 0.28 -0.61 -0.52 0.41 -0.44 -0.51 -1.24 0.45
0.29 0.33 0.11 -0.25 0.17 -0.18 -0.22 0.16 -0.17 -0.52 -0.62 0.46
0.17 0.1 0.13 -0.39 -0.07 -0.46 -0.65 0.25 -0.09 -0.23 -0.11 0.79
-0.09 -0.32 0.22 -0.33 -0.11 -0.43 -0.48 0.1 0.21 0.32 -0.85 0.92
-0.24 0.1 -0.09 -0.13 -0.01 -0.95 -0.7 0.3 0.06 0.41 -0.46 0.82
0.42 0.07 0.24 -0.5 -0.05 0.05 -0.86 0.07 -0.19 -0.44 -1.44 1.09
-0.33 -0.64 0.02 -0.58 0.03 -0.65 -0.54 0.07 -0.15 0.59 -0.74 1.31
0.32 0.2 0.43 -0.65 0.19 -0.42 -1.18 -0.23 -0.63 -0.36 -0.75 1.27
0.71 0.24 0.48 -0.15 0.13 -0.53 -0.47 0.26 -0.66 -0.32 -1.19 0.38
-0.34 -0.2 -0.31 -0.69 -0.1 -0.7 -0.61 0.4 -0.14 -0.49 -0.16 1.53
0.19 0.21 0.69 -0.22 0.44 -0.36 -0.39 0.37 -0.37 -1.43 -0.76 0.38
0.28 -0.1 0.07 -0.51 -0.19 -0.33 -0.26 0.41 0.17 -0.29 -0.66 0.77
0.05 -0.34 -0.01 -0.8 -0.4 -0.5 -0.59 0.23 0.17 0.03 -1.7 1.52

Details

Dark gray cells indicate values where the raw expression is zero (cannot be log-transformed). Blue cells indicate samples where the expression of the gene is below average and red cells indicate the gene is expressed above average in the sample. White cells are average.