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Heatmap: Cluster_88 (HCCA)

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(Values are log2 transformed ratios of a genes expression in a sample divided by the mean expression level)

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Gene
12pM Fe,Midday
12pM Fe,Midnight
58pM Fe,Midday
58pM Fe,Midnight
233pM Fe,Midnight
1160pM Fe,Midday
1160pM Fe,Midnight
High carbon,Dark
High carbon,Light
Low carbon,Dark
Phloroglucinol
Silicon starvation,12h
0.51 0.19 0.34 -0.02 -0.36 0.18 -0.69 -0.04 -0.09 -0.25 -0.17 0.02
0.43 0.6 0.01 0.21 -0.03 0.92 -0.92 -0.11 0.25 -1.2 -0.67 -1.35
0.16 -0.36 0.34 -0.27 -0.08 0.32 -0.93 -0.11 -0.1 0.73 -0.95 0.32
0.6 -0.53 1.1 -1.06 -1.23 0.75 -4.13 -0.44 -0.29 0.66 -2.32 0.73
0.18 0.21 0.16 -0.17 -0.13 -0.07 -0.5 -0.02 -0.03 0.25 -0.1 0.06
0.61 0.14 -0.04 -0.24 0.08 0.77 -1.56 -0.01 -0.09 -0.74 -1.15 0.55
0.5 -0.35 -0.14 -0.34 0.42 0.53 -0.19 -0.05 -0.42 -0.42 -2.85 0.88
1.17 -1.27 1.55 -3.26 -2.57 0.82 -6.48 -0.25 -1.23 0.39 -0.65 0.19
0.01 0.14 -0.99 0.06 0.47 -0.65 -0.79 0.2 0.14 0.04 -0.5 0.81
0.44 -0.29 0.76 -0.84 0.01 1.02 -2.09 0.06 -0.33 0.08 -0.57 -0.4
0.32 0.11 0.08 -0.23 -0.26 -0.18 -0.4 -0.12 -0.23 0.38 -0.37 0.53
0.59 0.0 0.5 -0.64 -0.44 0.24 -0.83 -0.22 -0.02 0.14 -0.08 0.08
1.14 -0.27 0.42 -0.87 -0.96 0.67 -1.4 -0.34 0.23 -0.44 -0.46 0.23
0.55 0.28 0.16 -0.3 -0.72 -0.08 -0.89 0.28 0.5 0.05 -0.83 0.1
1.0 0.12 0.68 -0.59 -0.41 0.09 -1.2 -0.33 -0.17 -0.05 -1.46 0.47
-0.06 0.14 0.03 0.15 -0.13 -0.2 -0.2 -0.07 -0.13 0.58 -0.19 -0.13
0.6 0.07 0.44 -0.51 -0.57 0.24 -1.46 0.05 0.21 0.38 -0.22 -0.32
0.3 0.05 0.01 -0.13 0.15 -0.29 -0.92 -0.29 -0.45 0.95 -1.15 0.5
0.63 0.17 0.59 0.03 -1.38 0.35 -1.15 0.09 -0.18 0.93 -2.55 -0.6
0.43 0.23 0.26 -0.11 -0.25 0.11 -0.72 -0.29 -0.1 0.29 -0.38 0.12
0.41 0.45 0.12 0.04 -0.87 -0.41 -1.21 -0.07 -0.33 0.04 0.35 0.49
1.05 -0.65 0.42 -2.39 -1.88 0.71 -3.95 0.12 0.4 -0.44 -0.12 0.8
0.27 -0.52 0.23 -0.74 -0.27 0.76 -1.5 0.24 0.52 0.75 -1.24 -0.44
0.24 -1.09 -0.17 -1.19 -0.15 1.27 -1.08 -0.11 1.39 -0.62 -0.58 -1.47
1.26 -0.5 0.73 -1.08 -0.81 0.48 -1.45 -0.19 0.18 -0.01 -1.49 0.12
0.53 0.36 0.42 -0.16 -0.3 0.05 -0.6 0.11 -0.16 -0.32 -0.09 -0.3
-0.25 0.12 -0.45 -0.3 0.15 -0.36 -0.91 0.13 0.13 0.56 -0.71 0.88
0.22 0.25 -0.17 0.19 -0.36 -0.07 -0.67 -0.11 0.05 -0.38 -0.37 0.81
0.76 0.66 0.2 -0.1 0.05 -0.05 -1.35 0.15 0.12 -1.0 -0.93 0.03
0.49 -0.13 0.38 -0.37 -0.57 0.12 -1.69 -0.01 -0.0 -0.16 0.62 0.15
1.0 -0.05 0.33 -0.71 -0.41 0.28 -1.33 0.08 0.38 0.05 -0.77 -0.26
0.82 -0.46 0.82 -0.59 -0.1 0.53 -1.15 -0.42 -0.31 -0.19 -0.67 0.25
0.52 -0.32 0.01 -0.62 -0.54 0.52 -0.98 -0.0 0.45 -0.68 -1.5 1.09
0.05 0.05 0.11 0.12 -0.25 0.18 -0.23 -0.4 -0.56 0.0 -0.66 0.9
0.27 -0.45 0.05 -0.37 -0.07 0.76 -0.58 0.06 0.45 -0.73 -1.01 0.51
0.14 -0.46 0.01 -1.21 -0.93 1.17 -2.89 0.21 0.48 0.65 -0.27 -0.19
1.4 -1.02 0.64 -1.72 -1.62 1.15 -3.14 -0.59 0.77 -0.98 -2.35 0.35
0.94 -0.09 0.63 -0.43 -1.01 0.37 -1.86 -0.0 0.0 -0.05 0.06 -0.39
0.78 -1.3 1.1 -1.66 -0.99 0.81 -2.47 0.12 0.53 -0.58 -0.63 0.18
0.89 -0.26 0.72 -0.96 -0.62 0.53 -0.49 -0.16 0.1 -0.8 -0.61 0.2
0.62 0.22 0.4 -0.45 -0.66 0.23 -1.39 -0.61 -0.21 0.72 -0.29 0.11
0.45 0.28 -0.2 -0.55 -0.13 -0.21 -0.63 0.34 0.3 -0.41 -0.25 0.45
1.5 -0.52 0.65 -1.45 -1.49 0.55 -2.73 -0.21 0.01 -1.12 -0.21 0.46
0.77 0.32 0.17 -0.48 -0.57 0.03 -1.36 -0.17 -0.05 -0.25 -0.33 0.72
0.47 0.26 -0.27 -0.46 0.36 0.17 -0.41 0.06 0.1 -0.32 -0.99 0.35
0.4 0.01 0.15 -0.62 -0.26 -0.01 -0.67 0.18 0.32 -0.08 -0.12 0.28
0.47 -0.2 -0.64 -0.49 -0.07 -0.5 -1.41 0.11 -0.04 0.43 -0.08 1.01
0.85 0.26 -0.46 -0.79 -1.26 -0.29 -1.63 0.34 0.45 0.37 -1.84 0.95
0.68 0.03 0.38 -0.96 -1.14 0.12 -1.19 -0.1 0.05 0.68 -0.1 0.1
0.55 -0.03 0.03 -0.51 -0.34 0.04 -1.09 0.06 0.3 0.29 -1.36 0.73
0.12 -0.06 -0.12 -0.42 -0.16 -0.16 -0.57 -0.01 0.2 0.45 0.06 0.35
0.34 0.18 -0.08 -0.38 -0.03 0.37 -1.56 0.29 0.76 -0.29 -0.92 0.02
0.28 0.01 0.07 -0.26 -0.0 0.08 -1.02 -0.07 -0.03 0.31 -0.7 0.64
0.29 -0.05 0.05 -0.46 -0.08 0.05 -1.14 0.14 -0.03 0.18 0.27 0.26
-0.23 -0.14 -0.27 0.31 -0.18 0.06 -0.01 0.15 0.17 0.31 -0.19 -0.16
0.75 -0.46 0.47 -0.62 -0.7 0.62 -0.98 -0.12 0.52 0.24 -0.42 -0.71
0.98 0.36 0.73 -0.32 0.13 0.36 -0.54 -0.28 -0.31 -1.69 -2.22 0.09
0.77 -1.4 -0.37 -1.41 -0.72 0.92 -1.0 0.06 0.62 0.0 0.09 0.16
0.63 -2.16 0.56 -3.41 -1.43 0.89 -4.42 0.67 1.92 -0.66 -4.19 -1.63
1.15 -0.34 0.89 -1.27 -1.18 0.6 -2.99 -0.32 0.21 -1.04 -0.88 0.73
0.77 -0.18 0.23 -0.34 -1.26 -0.16 -1.71 -0.15 0.04 1.16 -1.94 0.48
0.85 -0.14 0.88 -1.63 -0.88 0.49 -2.37 -0.57 0.42 -0.59 -0.09 0.46
0.92 0.52 0.65 -0.22 -0.58 0.3 -0.8 -0.24 -0.28 -0.11 -1.44 -0.31
0.35 0.05 0.43 -0.18 -0.18 -0.06 -0.68 -0.27 -0.07 0.8 -0.88 -0.11
0.93 -0.81 0.54 -0.26 -0.87 -0.1 -0.98 0.2 0.47 -0.69 -0.01 0.15
0.85 0.37 0.52 -0.14 -0.09 0.12 -1.5 -0.03 -0.29 0.01 -0.62 -0.45
1.12 -0.87 0.89 -2.03 -0.19 0.58 -2.3 -0.02 0.11 -0.29 -1.16 0.36
0.38 0.06 -0.06 -0.46 -0.72 -0.25 -0.79 0.12 0.07 1.12 -0.22 -0.36
-1.36 -0.6 -0.6 -1.54 -0.38 1.36 -3.09 0.72 0.63 1.24 -1.15 -0.99
-0.51 -0.6 -0.56 -1.39 -0.98 1.55 -3.27 0.78 0.47 1.16 -1.46 -1.63
0.6 -0.35 0.08 -1.0 -0.67 0.54 -2.18 -0.15 -0.41 0.66 -1.83 1.22
0.33 0.29 0.03 0.11 -0.06 -0.14 -0.14 -0.1 0.03 0.13 -0.42 -0.24
0.99 -0.87 1.07 -2.34 -1.95 0.54 -3.99 0.11 0.43 -0.0 -1.51 0.69
-0.01 0.08 0.2 -0.09 0.13 -0.21 -0.34 -0.01 -0.11 0.72 -0.54 -0.22
0.5 -0.64 0.99 -0.73 -1.71 1.0 -2.06 0.13 0.8 -0.79 -0.77 -0.32
0.1 0.22 0.06 -0.15 -0.05 -0.34 -0.71 -0.02 0.14 -0.62 -0.97 1.14
0.29 0.23 0.46 -0.3 0.06 0.1 -0.64 -0.09 0.02 -0.06 -0.82 0.24
0.32 0.24 -0.2 -0.34 0.5 0.56 -0.84 0.24 0.4 -0.62 -2.51 0.18
-0.39 -1.06 0.58 -1.53 0.77 1.24 -4.76 -0.03 -0.88 0.41 -1.61 0.72
0.68 -0.26 0.07 -0.56 -0.35 -0.15 -0.75 0.04 0.07 0.39 -0.22 0.38
0.89 0.47 0.71 -0.34 -1.09 0.3 -1.33 -0.36 -0.25 0.69 -2.42 -0.31
-0.19 0.04 -0.04 0.25 0.18 -0.1 0.08 0.16 0.1 0.08 -0.21 -0.53
0.54 0.07 0.19 -0.37 -0.0 0.36 -1.2 0.21 -0.1 -0.29 -0.24 0.15
0.38 -0.52 0.24 -0.79 0.48 0.81 -1.03 -0.09 -0.27 0.36 -1.46 0.25
0.45 0.11 0.42 -0.95 -0.84 0.09 -2.31 -0.27 0.08 -0.87 -0.24 1.38
0.67 0.0 0.5 -0.52 -0.56 0.1 -0.98 -0.01 0.05 -0.21 -0.43 0.48
1.24 -0.66 0.89 -1.07 -1.07 0.99 -2.97 -0.34 0.4 -0.59 -0.39 -0.84
0.46 -0.03 0.5 -0.07 -0.62 -0.01 -0.87 -0.29 -0.2 0.12 -0.24 0.55
-0.1 -0.81 0.26 -0.25 -1.54 1.72 -1.42 -0.81 0.8 1.09 -6.81 -
0.35 0.14 0.11 -0.21 -0.46 0.11 -0.78 -0.1 0.14 0.4 -1.01 0.53
0.44 -0.62 -0.06 -0.04 -0.6 -0.43 -1.25 0.37 0.42 1.04 -1.26 0.18
0.42 -0.27 0.63 -0.91 -0.07 0.54 -1.95 -0.16 -0.26 0.27 -1.32 0.82
-0.08 0.03 0.0 0.11 0.06 -0.1 0.2 0.12 0.13 0.06 -0.32 -0.3
0.78 -1.91 1.24 -4.69 -3.88 0.66 -6.59 -0.25 -0.16 0.86 -1.26 1.0
0.6 -0.11 0.69 -0.35 -0.58 0.21 -0.93 -0.07 0.09 -0.26 -0.78 0.47
0.52 0.01 0.71 -0.81 -0.36 0.28 -0.7 -0.25 -0.02 -0.03 -1.22 0.6
-0.04 0.01 -0.45 -0.35 -0.21 -0.7 -0.59 0.11 0.03 0.79 -0.06 0.66
1.13 -0.12 0.86 -0.34 -0.67 -0.07 -1.03 -0.2 0.21 0.06 -0.31 -1.58
0.87 0.05 0.5 -0.57 -0.21 0.28 -1.16 -0.53 -0.06 -0.41 -0.37 0.42
0.27 0.03 0.23 -0.05 -0.34 -0.03 -0.53 0.13 0.06 0.47 -0.17 -0.37
-0.05 -0.61 -0.03 -1.13 -1.12 1.57 -3.0 0.29 0.17 1.07 -1.53 -0.73
-2.06 - -0.82 -7.82 0.99 1.38 -3.47 -0.11 1.81 -0.48 -1.69 0.07
0.67 -0.18 0.39 -0.3 -0.5 -0.02 -0.64 -0.12 -0.53 0.45 -0.91 0.63
0.16 0.41 -0.13 0.23 0.02 -0.24 -0.31 -0.15 -0.45 0.33 0.08 -0.23
-0.14 -0.38 0.2 -0.33 0.18 -0.01 -0.8 -0.28 -0.16 0.95 -0.86 0.57
0.69 -0.36 0.85 -0.91 -0.78 0.55 -1.38 -0.2 0.03 -0.34 -0.58 0.57
0.53 -0.25 0.66 -0.6 -0.55 0.43 -1.61 -0.09 -0.04 0.49 -1.42 0.52
0.51 -0.06 0.68 -0.31 -0.95 0.52 -1.42 -0.58 0.15 -0.39 -0.64 0.77
0.34 -0.08 0.61 -0.26 -0.15 0.29 -0.88 0.1 0.34 -0.06 -1.48 0.15
0.79 0.05 0.36 -0.55 -0.45 0.33 -0.6 -0.17 -0.07 -0.56 -0.9 0.65
0.31 0.29 0.36 -0.33 -0.3 0.98 -0.63 0.08 -0.06 0.04 -0.82 -1.26
0.96 0.12 0.35 -0.36 -0.65 0.31 -1.11 -0.28 -0.19 -0.13 -1.37 0.67
0.57 -0.25 -0.3 -0.72 -1.5 0.85 -1.37 -0.84 0.58 -0.88 -0.26 1.18
0.63 -0.03 0.18 -0.28 -0.46 0.1 -1.25 -0.22 0.12 -0.34 -0.28 0.8
1.12 0.06 0.38 -0.41 -1.63 0.44 -2.31 -0.42 -0.15 0.47 0.15 -0.5
0.55 0.19 -0.22 -0.51 -0.18 0.05 -0.83 0.09 0.04 -0.05 -0.16 0.47
0.93 0.27 0.44 -0.29 -0.45 0.49 -1.05 0.12 0.31 0.1 -1.05 -2.26
0.92 -0.5 1.08 -1.56 -2.19 1.17 -4.46 -0.52 0.59 0.36 -2.0 -0.53
-0.16 0.37 -0.27 0.18 0.09 -0.37 0.03 0.1 -0.27 0.27 -0.16 -0.02
1.19 -0.52 0.56 -0.61 0.1 0.61 -1.67 -0.35 -0.65 0.27 -2.02 0.15
0.05 0.42 0.01 0.23 -0.19 -0.32 -0.17 -0.04 -0.4 0.49 -0.51 0.07
0.57 0.27 0.39 -0.3 -0.01 0.27 -0.99 0.06 0.12 -0.38 -1.0 0.13
1.32 0.07 1.0 -0.77 -0.7 0.13 -1.3 -0.09 -0.12 -0.84 -0.74 -0.45
0.78 0.2 0.72 -0.7 -0.88 0.23 -1.28 0.1 0.2 0.03 -0.8 -0.1
0.91 -0.32 0.86 -0.84 -1.12 0.85 -2.96 -0.29 0.29 -0.43 -0.41 0.03
0.33 0.07 0.1 -0.21 -0.79 -0.1 -1.02 0.22 0.1 0.44 -0.82 0.68
0.83 0.19 0.65 -1.46 -0.19 -0.3 -2.48 0.12 0.57 -0.1 -1.17 0.42
0.44 -0.95 0.55 -0.95 -0.49 0.5 -1.44 -0.09 -0.02 0.38 -1.0 0.94
-0.04 0.18 -0.3 -0.22 -0.53 -0.24 -0.12 0.29 0.48 -0.46 0.06 0.45
0.91 -0.11 0.2 -0.54 -1.23 0.15 -0.79 0.02 0.05 0.33 0.5 -0.92
0.54 -0.42 0.19 -0.3 -0.73 0.3 -1.6 -0.17 0.21 -0.66 -0.38 1.16
1.21 0.31 0.92 -0.38 -0.68 0.08 -2.37 -0.02 -0.33 0.14 -0.91 -0.98
-1.72 -2.58 0.45 -0.82 0.74 0.91 -1.08 0.59 0.49 0.66 -1.96 -0.27
-0.07 0.46 0.93 -0.32 -0.62 0.25 -0.81 -0.02 -0.07 0.48 -0.71 -0.73
0.12 0.36 -0.2 -0.51 0.14 -0.66 -0.92 0.14 0.26 0.31 -0.45 0.62
-0.1 0.39 -0.25 -0.18 0.31 -0.83 -0.39 0.16 0.32 -0.13 -0.52 0.57
1.29 0.37 1.01 -0.49 -0.55 0.39 -1.81 -0.42 -0.09 -1.15 -0.57 -1.18
0.87 -0.2 0.64 -0.69 -0.75 0.59 -1.53 0.03 0.23 -0.08 -0.14 -0.68
0.75 -0.47 0.66 -1.54 -0.67 1.02 -3.69 0.0 -0.59 0.25 -1.56 0.8
0.51 -0.16 0.2 -0.37 -0.8 -0.13 -0.7 -0.12 -0.05 0.63 -0.29 0.49
0.94 -0.49 0.64 -1.03 -1.14 0.49 -1.65 -0.08 0.91 -0.44 -0.41 -0.26
-0.19 -0.04 -0.27 -0.03 0.25 -0.44 -0.6 -0.11 -0.08 1.22 -0.63 -0.14
0.7 -0.39 0.69 -1.03 -0.71 0.31 -1.91 0.11 0.23 0.26 -0.86 0.47
0.88 -0.14 0.69 -1.16 -0.86 0.25 -1.65 -0.21 -0.24 0.26 -1.67 0.93
1.58 -0.47 1.35 -1.05 -2.6 -0.1 -3.28 -0.62 -0.3 0.8 -2.45 -0.59
0.06 0.52 -0.52 -0.04 -0.19 -0.02 -1.51 0.11 -0.38 -0.16 0.68 0.39
0.99 -1.88 0.5 -2.01 -3.88 1.65 -2.78 0.48 0.54 -0.6 -0.81 -0.62
0.45 -0.05 0.07 -0.47 -0.02 0.06 -0.72 -0.1 -0.18 0.32 0.07 0.2
0.64 -0.26 0.51 -0.41 -0.53 0.36 -0.72 0.07 0.17 -0.13 -0.24 -0.12

Details

Dark gray cells indicate values where the raw expression is zero (cannot be log-transformed). Blue cells indicate samples where the expression of the gene is below average and red cells indicate the gene is expressed above average in the sample. White cells are average.