Heatmap: Cluster_92 (HCCA)

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(Values are log2 transformed ratios of a genes expression in a sample divided by the mean expression level)

Gene
12pM Fe,Midday
12pM Fe,Midnight
58pM Fe,Midday
58pM Fe,Midnight
233pM Fe,Midnight
1160pM Fe,Midday
1160pM Fe,Midnight
High carbon,Dark
High carbon,Light
Low carbon,Dark
Phloroglucinol
Silicon starvation,12h
0.11 0.08 -0.51 -0.89 -0.68 -0.52 -1.06 -0.56 -0.42 -0.86 0.82 1.62
0.18 -0.04 0.56 -0.59 -0.48 -0.49 -0.53 0.17 -0.26 -0.51 0.14 0.91
0.35 -0.01 -0.47 -0.66 -0.86 -0.28 -0.33 -0.26 -0.16 -0.65 0.67 1.17
0.27 -0.03 -0.17 -0.36 0.19 -0.19 0.13 0.06 -0.55 -0.57 0.21 0.56
0.91 -0.04 0.28 -0.06 -0.02 -0.31 -0.47 0.64 -0.39 -0.43 -0.59 -0.45
0.23 -0.03 0.3 -0.55 -0.1 0.23 -0.95 0.4 0.11 -0.18 -0.38 0.33
0.74 0.15 -0.04 -0.18 -0.87 -0.41 -0.08 0.41 -0.35 -0.7 0.26 0.26
1.0 0.26 0.4 -0.68 -0.68 0.43 -1.47 -0.66 -0.77 -0.74 -0.26 0.91
0.6 -0.19 0.18 -0.27 -0.76 -0.59 -0.96 0.12 -0.32 0.44 0.19 0.57
0.21 -0.01 -0.3 -0.33 -0.44 -0.37 -0.77 0.02 -0.39 -0.34 0.45 1.14
0.57 -0.04 0.3 -0.51 -1.03 -0.44 -0.57 0.15 -0.45 -0.11 0.49 0.61
-0.0 0.18 -0.76 -0.5 -0.52 -0.91 -0.77 -0.05 -0.64 -1.62 1.01 1.49
0.73 0.0 0.08 -0.71 -0.32 -0.1 -1.04 0.04 -0.56 -0.54 0.25 0.9
0.65 -0.15 0.76 -0.84 -0.6 0.35 -1.62 -0.09 0.13 -0.29 -0.5 0.54
0.67 -0.02 -0.37 -0.81 -0.9 -0.42 -1.12 -0.45 -0.53 -0.66 0.87 1.29
0.74 0.25 0.05 -0.53 -0.64 -0.06 -1.12 -0.9 -0.95 -0.99 0.77 1.06
0.6 0.01 0.16 -0.64 -1.05 -0.28 -1.09 -0.38 -0.24 -0.75 0.29 1.32
0.48 0.15 0.18 -0.44 -0.07 0.09 -1.03 -0.05 -0.17 -0.07 -0.03 0.42
0.28 0.16 0.1 -0.31 -0.28 -0.1 -0.47 0.21 -0.3 -0.48 0.18 0.58
0.56 0.32 0.16 -0.33 -0.54 -0.08 -0.93 0.01 -0.02 -1.32 0.63 0.34
0.27 -0.19 0.64 -0.68 -0.17 -0.11 -1.03 -0.09 -0.15 -0.76 -0.04 1.01
0.26 -0.07 -0.32 -0.3 -0.2 -0.26 0.1 0.05 -0.42 -1.69 0.24 1.13
0.54 0.03 0.01 -0.45 -0.54 0.09 -0.98 0.1 0.08 -0.53 0.21 0.63
0.77 -0.29 0.03 -0.83 -0.87 -0.42 -1.24 -0.49 -0.72 -1.06 0.62 1.5
0.35 -0.24 -0.18 -0.83 -0.15 -0.19 -1.34 0.34 0.03 -0.17 -0.0 1.06
0.33 -0.25 0.3 -0.77 -0.82 -0.64 -0.38 -0.44 -0.51 -0.21 0.04 1.47
0.65 0.33 0.28 -0.47 -0.37 0.15 -1.65 -0.01 -0.17 -0.8 0.27 0.46
0.98 -0.11 0.06 -1.08 -0.55 0.02 -1.9 0.27 0.56 -0.87 -0.7 0.83
0.38 -0.13 0.05 -1.34 -1.04 -0.51 -1.03 -0.38 0.18 -0.5 0.52 1.39
0.99 0.15 0.42 -1.0 -1.62 -0.17 -2.05 -0.18 -0.59 -0.57 0.61 0.89
0.22 0.76 -0.29 -0.22 -0.09 -0.32 -0.64 0.11 -0.52 -0.54 0.52 0.23
0.04 -0.03 -0.65 -0.82 -0.24 -0.63 -1.2 0.19 -0.05 -0.3 0.39 1.39
0.56 -0.23 0.38 -1.06 -0.24 0.12 -1.95 0.49 0.23 -0.61 -0.12 0.64
0.41 -0.51 0.0 -1.29 -0.41 -0.58 -1.45 0.75 0.16 -0.45 0.51 0.86
0.57 0.46 -0.11 -0.89 -0.04 -0.25 -1.29 -0.15 -0.39 0.0 0.45 0.51
-0.13 -0.16 -0.43 -0.76 -0.35 -0.37 -0.09 0.03 -0.26 -0.04 0.04 1.32
0.43 0.09 -0.07 -0.83 -0.22 0.02 -1.63 -0.04 -0.18 -0.0 0.3 0.84
0.35 0.42 -0.47 -0.54 0.25 -0.51 -0.85 -0.14 -0.53 -0.57 0.44 0.92
0.09 -0.18 -0.54 -0.64 -0.41 -0.67 -0.5 0.1 -0.14 0.36 0.23 1.14
0.59 -0.08 0.17 -0.72 -0.16 -0.33 -1.07 0.42 0.12 -0.34 -0.18 0.62
0.47 -0.1 -0.41 -0.61 -0.17 -0.51 -1.01 0.25 0.21 -0.4 -0.71 1.3
0.1 0.52 0.07 0.07 0.21 -0.03 -0.38 -0.3 -0.07 -0.34 -0.12 0.02
0.48 0.34 0.18 -0.1 -0.71 -0.11 -0.77 0.29 -0.34 -0.22 0.17 0.21
0.74 0.22 0.19 -0.44 -0.39 0.01 -0.51 -0.31 -0.56 -0.86 0.35 0.6
0.91 0.39 -0.11 -0.47 -0.18 -0.09 -0.63 -0.04 -0.95 -0.44 0.37 0.23
0.73 0.39 0.52 0.01 -0.05 -0.02 -0.93 0.37 -0.85 -0.88 0.01 -0.49
0.44 -0.18 0.02 -0.48 -0.19 0.03 -0.62 0.05 -0.22 -0.4 0.13 0.79
0.31 -0.08 -0.2 -0.49 -0.33 -0.22 -0.73 0.28 0.12 -0.48 0.12 0.91
0.17 -0.05 -0.66 -0.42 -0.34 -0.1 -0.71 -0.07 -0.35 -1.23 0.57 1.35
0.37 0.38 0.25 -0.17 -0.04 0.07 -0.4 0.13 -0.7 -0.38 0.47 -0.57
0.85 0.07 0.33 -0.32 -0.65 -0.05 -0.53 0.33 -0.19 -1.05 0.34 -0.14
1.08 0.42 0.44 -0.34 -0.4 -0.13 -0.29 -0.24 -1.03 -1.06 0.28 -0.18
0.43 0.06 0.4 -0.58 -0.77 -0.11 -0.89 0.03 -0.36 -0.94 0.12 1.11
0.52 0.29 -0.23 -0.26 -0.25 -0.26 -0.85 0.36 -0.31 -0.56 -0.55 0.97
1.17 0.48 0.6 -0.63 -0.74 -0.74 -0.73 0.27 -0.58 -2.36 0.5 -0.12
0.11 0.35 -0.39 -0.75 -1.05 -0.26 -1.58 -0.04 0.14 -0.27 -0.04 1.46
0.22 0.09 -0.32 -0.37 -0.35 -0.87 -1.27 0.42 -0.53 -0.77 0.39 1.33
0.02 -0.08 -0.3 -0.62 -0.04 -0.59 -0.52 0.3 -0.15 -0.08 -0.01 1.12
0.43 0.44 -0.1 -0.31 0.11 -0.45 -0.34 0.61 -0.17 -0.56 -0.51 0.22
0.63 0.19 0.02 -0.46 -0.54 -0.12 -0.25 -0.4 -0.73 -0.59 0.46 0.78
0.76 -0.08 0.21 -1.28 -0.22 0.14 -2.08 -0.18 -0.45 -0.27 -0.27 1.22
0.68 0.38 0.19 -0.32 -0.18 0.28 -0.61 -0.47 -0.47 -0.82 0.46 0.01
0.45 -0.27 0.09 -0.72 -0.61 0.28 -0.62 0.11 0.2 -0.85 0.44 0.56
0.12 -0.3 0.36 -0.41 -0.4 -0.47 -0.69 0.15 -0.13 -0.78 0.59 0.89
0.81 0.73 -0.04 -0.43 -0.57 0.22 -1.39 0.25 -0.63 -0.37 -1.17 0.68
0.7 0.09 0.17 -0.13 -0.53 -0.02 -0.29 -0.03 -0.58 -1.32 0.03 0.77
0.25 0.38 0.04 -0.11 0.05 -0.02 -0.32 0.31 -0.19 -0.4 -0.39 0.11
0.67 -0.04 0.09 -0.56 -0.35 0.1 -1.66 0.22 -0.21 -0.29 0.0 0.74
0.57 0.32 0.31 -0.3 -0.07 -0.12 -1.45 -0.02 -0.46 -0.39 0.12 0.5
0.1 -0.42 -0.23 -0.98 -0.86 -0.74 -0.53 -0.24 -0.24 -1.08 0.18 1.88
0.64 0.39 0.03 -0.6 -0.64 -0.38 -1.05 -0.19 -0.19 -1.27 0.06 1.23
0.64 0.33 0.5 -0.45 -0.29 0.23 -0.64 -0.38 -0.28 -1.34 0.27 0.27
0.14 0.04 0.02 -0.6 -0.93 -0.67 -0.16 -0.1 -0.53 -0.78 0.78 1.15
0.29 -0.04 0.02 -0.51 -0.12 -0.9 -0.6 0.39 -0.21 -0.13 0.37 0.68
0.18 0.03 -0.07 -0.37 -0.28 -0.09 -0.64 0.29 0.14 -0.78 0.53 0.45
0.66 0.22 -0.12 -0.33 -0.39 0.25 -0.59 -0.61 -1.11 -0.99 0.53 0.9
0.3 -0.24 0.34 -0.87 -0.34 0.47 -2.46 -0.33 -0.58 -0.44 -0.25 1.44
0.48 -0.18 0.09 -0.78 -0.55 -0.23 -0.75 -0.15 -0.07 -0.82 0.41 1.13
0.34 0.34 0.14 0.03 -0.2 -0.25 -0.71 0.02 -0.34 -0.84 0.39 0.43
0.41 0.26 -0.01 -0.06 -0.38 0.14 -0.22 -0.13 -0.29 -0.39 0.06 0.33
-0.46 -0.04 -0.55 -0.43 -0.25 -1.04 -0.81 0.4 -0.22 -0.76 0.37 1.54
0.33 0.13 -0.29 -0.64 -0.34 -0.18 -0.79 0.02 -0.25 -0.43 -0.02 1.24
0.38 0.18 0.17 -0.29 -0.19 -0.18 -1.16 0.08 -0.12 -0.98 -0.16 1.02
0.53 0.06 0.26 -0.72 -0.22 0.2 -1.62 0.03 -0.24 -0.65 0.26 0.73
0.42 0.06 -0.38 -0.2 0.15 -0.51 -0.85 0.04 -0.34 0.23 0.43 0.35
0.62 -0.07 0.21 -0.48 -0.16 0.16 -0.21 -0.38 -1.04 -0.33 -0.1 0.83
0.31 0.18 0.32 -0.19 -0.5 0.01 -0.36 -0.2 -0.42 -1.01 0.58 0.49
0.57 0.14 0.09 -0.55 -1.08 -0.01 -1.71 -0.67 -1.02 -1.62 1.0 1.29
1.12 0.56 0.55 -1.24 -1.42 -0.31 -3.02 -0.08 -0.84 -0.5 0.76 0.34
0.81 0.45 0.27 -0.51 -0.74 0.1 -1.28 -0.34 -0.55 -1.78 0.29 0.93
0.36 0.53 0.28 -0.35 -1.14 -0.23 -1.0 -0.07 -0.11 -0.15 0.59 0.24
0.8 -0.03 0.09 -0.39 -0.67 -0.22 -1.06 0.08 -0.4 -0.16 0.37 0.57
0.54 0.4 -0.04 -0.68 -0.31 -0.11 -0.93 0.22 -0.21 -2.22 0.5 0.77
0.12 -0.1 -0.1 -0.69 -0.9 -0.5 -0.57 -0.21 -0.81 -0.47 0.78 1.4
-0.85 -0.28 0.04 -0.81 -0.63 -0.33 -1.1 0.51 0.2 0.07 0.3 1.17

Details

Dark gray cells indicate values where the raw expression is zero (cannot be log-transformed). Blue cells indicate samples where the expression of the gene is below average and red cells indicate the gene is expressed above average in the sample. White cells are average.