Heatmap: Cluster_30 (HCCA)

View as: (view raw or row-normalized)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are log2 transformed ratios of a genes expression in a sample divided by the mean expression level)

Gene
12pM Fe,Midday
12pM Fe,Midnight
58pM Fe,Midday
58pM Fe,Midnight
233pM Fe,Midnight
1160pM Fe,Midday
1160pM Fe,Midnight
High carbon,Dark
High carbon,Light
Low carbon,Dark
Phloroglucinol
Silicon starvation,12h
0.41 0.4 0.32 -0.2 -0.13 -0.13 -1.29 -0.07 -0.52 -0.09 -0.35 0.69
0.87 0.61 0.68 -0.12 -0.37 -0.16 -1.26 -0.94 -0.72 0.06 -1.25 0.53
0.29 0.87 0.83 -0.26 0.05 0.22 0.24 -0.51 -0.62 -0.53 -2.77 -0.43
0.38 1.0 1.32 -0.38 0.15 0.21 -0.04 -0.79 -0.95 -0.18 -3.84 -2.69
0.63 0.79 1.3 0.15 -0.21 0.01 -1.17 -0.4 -0.9 0.07 -3.78 -1.21
0.82 0.66 1.17 -0.34 -0.5 0.13 -1.1 -0.8 -0.6 0.26 -2.25 -0.5
1.07 0.74 1.32 -0.34 -0.52 -0.12 -1.17 -0.63 -0.75 -0.31 -0.62 -2.43
0.42 0.64 0.97 -0.45 -0.32 -0.29 -0.02 -0.47 -0.78 0.16 -1.33 0.0
-0.19 0.1 0.29 -0.14 -0.22 0.01 -0.53 -0.38 -0.43 -0.02 -1.22 1.29
0.82 0.95 1.38 -0.21 -0.58 -0.04 -0.56 -0.59 -1.1 -0.25 -3.12 -1.2
1.18 0.97 1.05 0.24 -0.96 -0.1 -0.16 -0.88 -1.17 -1.24 -1.53 -1.26
0.5 0.59 1.04 -0.44 -0.28 -0.24 -0.72 -0.34 -0.81 0.12 -1.9 0.39
0.07 0.65 0.46 0.22 0.1 -0.08 0.05 -0.75 -1.64 -0.24 -0.23 0.22
0.24 0.74 0.79 -0.28 0.02 -0.18 -0.49 -0.59 -1.05 0.17 -1.78 0.5
0.11 0.44 0.74 -0.44 -0.17 -0.26 -0.21 -0.45 -1.0 -0.08 -1.63 1.04
0.57 1.42 0.74 0.2 -0.26 -0.35 -0.66 -0.46 -1.16 -0.52 -1.01 -1.37
-0.21 1.25 1.52 0.11 -0.34 -0.38 0.18 -0.55 -1.5 -0.26 -4.27 -2.4
0.89 1.06 1.33 -0.33 -0.19 0.1 -1.25 -0.39 -1.21 -0.82 -2.82 -1.09
0.71 0.88 0.92 -0.11 -0.33 -0.24 -1.05 -0.21 -0.92 -0.4 -1.32 0.03
0.4 0.87 1.1 -0.22 -0.25 -0.16 -0.69 -0.25 -0.83 -0.27 -2.29 0.07
0.51 0.59 1.31 -0.24 -0.36 0.11 -0.25 -0.5 -0.21 -0.69 -0.87 -1.7
0.6 0.61 0.76 -0.24 -0.61 -0.46 -0.58 -0.52 -1.19 0.49 -2.1 0.68
-0.79 0.46 0.85 -0.17 -0.12 -0.06 -0.5 -0.58 -0.65 -0.12 -2.8 1.26
0.7 0.85 1.25 -0.04 -0.73 -0.29 -1.05 -0.91 -1.15 -0.38 0.2 -1.29
0.81 0.55 1.02 -0.02 -0.62 0.31 -0.71 -0.48 -0.86 -0.6 -1.42 -0.04
0.47 -0.1 1.0 -0.22 -0.38 -0.18 -0.19 -0.32 -0.48 -0.52 -0.08 0.16
0.62 0.62 0.88 -0.13 -0.2 -0.11 -0.14 -0.27 -1.11 0.08 -0.89 -0.79
0.03 0.39 0.86 -0.17 -0.4 0.36 -0.43 -0.44 -0.73 0.2 -1.33 0.36
0.51 -0.48 -0.06 -0.53 -0.38 0.98 -0.85 -0.46 -0.73 -0.11 -0.81 1.06
0.12 1.07 0.7 -0.65 -0.38 -0.67 -1.07 -0.12 -0.9 0.15 0.15 0.0
-0.05 0.39 0.73 -0.5 0.17 0.18 -0.59 0.0 -0.5 -0.15 -1.15 0.47
1.17 0.76 1.25 -0.39 -0.43 -0.4 -1.58 -0.84 -0.73 -1.33 -1.43 0.22
0.62 0.16 0.71 -0.32 -0.4 -0.07 -0.87 -0.28 -0.55 0.38 -1.2 0.51
0.86 1.23 0.85 0.5 -0.4 -0.27 -1.07 -0.66 -0.98 -0.17 -2.8 -1.36
1.06 0.69 1.29 -0.79 -0.77 -0.01 -0.86 -0.72 -0.74 -0.24 -3.7 0.03
0.74 0.97 1.02 -0.41 -0.21 -0.16 -0.69 -0.27 -0.79 -0.17 -2.32 -0.47
0.02 0.18 0.73 -0.67 -0.94 -0.03 -1.22 -0.69 -0.64 -0.23 -2.0 1.71
-0.41 0.33 0.53 -0.47 -0.41 -0.1 -0.68 -0.23 -0.57 -0.16 -0.75 1.33
-0.67 0.3 0.51 -0.38 0.01 0.13 -0.62 -0.15 -0.83 0.39 -1.11 0.97
0.8 0.48 0.36 -0.22 -0.7 -0.18 -1.14 -0.21 -0.77 -0.13 -1.26 0.98
0.61 0.82 0.89 -0.28 -0.03 0.18 -0.33 -0.24 -0.83 0.1 -1.55 -1.72
1.02 0.6 0.93 -0.42 -0.5 -0.45 -1.1 -0.42 -0.86 -1.02 -0.98 0.68
0.14 0.33 0.53 -0.01 -0.07 0.27 -1.0 -0.24 -0.48 -0.13 -0.44 0.41
0.64 0.73 1.14 -0.28 -0.45 0.01 -1.44 -0.39 -0.91 -0.2 -0.78 -0.15
0.02 0.56 0.63 -0.55 -0.65 -0.23 -1.11 -0.42 -0.76 -0.4 -0.61 1.36
-2.21 -0.08 0.19 -0.27 0.26 0.7 -0.21 -0.83 -1.45 -0.58 -3.46 1.81
-1.04 0.3 0.83 -1.0 -0.25 0.56 -1.97 -1.04 -1.67 -0.64 -3.75 1.97
-1.56 0.52 0.51 -0.38 0.46 -0.03 -0.87 0.21 -0.52 0.6 -1.52 0.51
0.08 1.47 1.55 0.06 -0.47 0.04 -1.27 -1.19 -1.67 -0.71 -4.71 -0.62
1.48 0.88 0.61 -0.34 -0.7 -0.48 -1.93 -0.93 -1.38 -0.08 -0.92 0.12
0.14 0.67 1.05 0.06 -0.24 -0.06 -0.78 -0.15 -0.33 0.85 -3.16 -2.42
0.42 0.85 1.12 -0.28 -0.32 -0.03 -0.14 -0.12 -0.85 0.33 -2.22 -2.11
0.9 0.73 1.05 -0.25 -0.66 -0.17 -0.51 -0.41 -0.75 0.06 -1.05 -1.05
0.58 0.67 0.77 -0.25 -0.46 -0.29 -0.58 -0.3 -0.67 -0.07 -0.49 0.05
-0.69 0.7 0.78 -0.35 0.2 -0.03 0.12 -0.49 -1.38 -0.68 -1.16 0.9
-1.13 0.17 0.51 -0.3 -0.1 0.06 -0.62 -0.2 -0.49 0.3 -1.28 1.22
0.16 -0.07 1.23 -0.28 -0.59 -0.94 -0.42 -0.24 -0.79 -0.54 -0.13 0.84
0.69 0.14 0.91 -0.6 -1.13 -0.71 -0.54 -0.7 -0.61 -1.13 -0.28 1.29
0.64 0.56 0.99 -0.05 -0.11 0.43 -1.28 -0.59 -1.07 -0.14 -1.37 -0.16
0.57 0.85 1.13 -0.35 -0.55 -0.15 -0.52 -0.54 -0.77 -0.78 -2.32 0.49
-1.0 0.2 -0.75 0.09 0.65 0.34 0.56 -0.42 -1.1 0.08 -1.06 0.71
0.24 0.04 -0.02 -0.06 0.17 0.15 0.12 -0.44 -0.27 -0.2 -0.48 0.46
1.11 0.37 0.76 -0.16 -0.23 -0.13 -0.93 -0.43 -0.91 0.27 -2.29 -0.02
0.02 0.19 0.75 -0.18 -0.33 0.31 -0.71 -0.24 -0.43 -0.06 -1.88 0.85
-0.93 0.55 0.69 -0.3 0.13 0.37 -1.8 -0.84 -1.37 -0.42 -2.79 1.61
-0.09 0.47 0.71 -0.15 -1.15 0.29 -0.08 -0.23 -0.54 0.27 -1.66 0.54
-0.45 0.98 1.51 -0.4 -0.14 -0.14 0.14 -0.83 -1.52 0.11 -2.89 -0.62
0.48 1.37 1.67 -0.16 -0.75 -1.2 -0.44 -0.42 -1.24 -0.6 -2.86 -2.28
0.03 0.52 0.6 0.0 -0.23 0.56 -0.63 -0.0 -0.49 -0.01 -1.6 0.03
1.09 0.06 0.53 -0.78 -1.06 -0.29 -0.67 -0.38 -0.39 -0.62 -0.48 0.99
0.66 1.35 1.77 -0.23 -0.44 -0.08 -1.28 -1.06 -1.87 -0.68 -4.97 -3.1
0.49 0.11 0.27 -0.39 -0.55 -0.14 -1.64 -0.26 -0.59 0.12 -0.94 1.34
-0.16 0.84 1.46 -0.34 -0.03 0.55 0.14 -0.57 -1.06 -0.37 -4.02 -2.01
1.17 0.66 1.2 -0.25 -0.94 0.07 -0.46 -0.25 -0.52 -0.13 -2.04 -4.96
0.56 0.75 1.31 -0.01 -0.46 -0.44 -0.38 -0.56 -1.52 -0.1 -0.53 -1.05
-0.74 1.05 1.5 -0.69 0.39 0.16 0.24 -0.69 -0.93 0.11 -4.74 -7.14
-0.16 1.28 1.73 -0.18 0.02 0.28 -0.21 -0.89 -1.92 -1.03 -4.01 -4.62
0.7 0.14 1.05 -0.5 -0.85 -0.45 -0.43 -0.74 -1.32 -0.3 -0.15 0.81
-0.06 0.58 0.99 -0.28 -0.09 -0.01 -0.2 -0.98 -1.52 -0.41 -0.13 0.5
0.95 0.89 0.82 0.01 -0.25 -0.61 -0.76 -0.33 -1.06 -0.03 -1.5 -0.41
0.1 0.56 1.13 -0.15 -0.42 0.26 -0.72 -0.8 -0.93 -0.41 -1.52 0.69
0.75 0.95 0.99 0.26 -0.4 -0.27 -1.01 -0.77 -1.05 -0.41 -1.68 -0.01
-0.93 0.77 1.13 0.09 -0.2 0.04 -1.26 -0.2 -1.11 0.11 -3.8 0.79
0.32 0.01 0.36 -0.13 -0.73 0.1 -2.03 -0.59 -1.4 0.32 -3.16 1.69
0.7 0.82 0.23 0.53 0.58 -0.39 -0.21 -0.81 -1.44 -0.74 0.14 -2.13
0.39 0.81 1.04 -0.1 -0.16 0.18 -0.7 -0.52 -1.01 -0.25 -0.71 -0.61
1.15 0.36 0.61 -0.4 -0.81 -0.33 -0.72 -0.25 -0.55 -0.82 -0.91 0.7
-0.27 0.4 0.66 -0.45 -0.25 -0.03 -1.8 -0.46 -1.0 0.1 -2.35 1.55
-0.15 0.58 0.83 0.19 -0.68 -0.22 -1.19 -0.56 -1.09 -0.09 -0.65 1.03
0.02 0.42 0.99 -0.44 -0.32 0.18 -1.26 -0.47 -1.03 -0.3 -2.2 1.22
-0.02 0.68 1.11 0.19 0.14 -0.14 -0.87 -0.4 -0.78 0.53 -5.47 -0.4
0.32 0.89 1.21 -0.28 -0.65 -0.26 -0.32 -0.16 -0.65 -0.45 -1.59 -0.18
0.37 0.81 1.0 0.04 -0.23 -0.09 -0.29 -0.53 -1.0 -0.08 -2.7 0.03
0.4 0.15 0.41 0.13 -0.44 0.45 -1.5 -0.3 -1.15 -0.33 -1.56 1.19
0.45 0.9 0.98 0.11 -0.46 -0.49 -1.4 -0.61 -0.88 -0.02 -1.32 0.38
0.06 0.23 0.64 -0.13 -0.29 -0.33 -0.61 -0.38 -0.54 0.4 -1.26 0.89
0.56 0.51 0.94 -0.29 -0.36 -0.47 -0.26 -0.29 -0.77 0.05 -0.95 0.12
-0.14 0.46 0.7 -0.07 -0.07 0.39 -1.12 -0.14 -0.77 -0.0 -0.65 0.37
-0.31 0.1 0.4 -0.1 -0.74 0.19 -0.69 -0.43 -0.69 0.24 -2.48 1.47
0.6 0.84 1.24 -0.06 -0.42 -0.09 -0.27 -0.39 -0.81 -0.19 -2.52 -1.1
0.5 0.43 0.39 -0.47 -0.18 0.44 -1.02 -0.29 -0.49 0.02 -0.62 0.36
0.08 0.37 0.51 -0.21 -0.44 0.14 -1.05 -0.36 -0.7 -0.24 -0.85 1.17
0.82 0.46 0.34 -0.53 -0.83 -0.22 -0.47 -0.06 0.02 -0.24 -0.25 0.14
0.67 0.71 0.92 -0.16 -0.32 -0.14 -0.86 -0.56 -1.03 -0.05 -0.16 -0.52
-0.33 0.85 1.72 -0.41 -0.04 0.82 -0.88 -1.09 -1.21 -0.63 -2.01 -1.9
0.52 1.04 1.22 -0.13 -0.15 0.19 -0.8 -0.72 -1.22 -1.01 -0.5 -1.26
-0.53 0.3 0.82 -0.64 0.13 0.27 -0.13 -0.41 -0.32 0.55 -2.64 0.34
1.31 0.25 0.56 -0.46 -0.49 0.07 -1.28 -0.57 -0.92 0.28 -1.09 0.1
1.13 0.4 0.56 -0.26 -0.68 -0.02 -1.22 -0.51 -0.84 0.17 -1.04 0.35
1.11 0.98 1.29 0.08 -1.0 0.13 -0.93 -1.04 -1.62 -0.55 -1.31 -1.5
-0.1 0.68 1.18 -0.53 -0.15 0.33 -0.42 -0.63 -0.65 -0.38 -1.77 0.32
0.45 1.21 1.05 0.08 -0.39 0.11 0.33 -0.49 -1.49 -1.66 -1.52 -1.53
0.23 1.03 1.69 -0.57 -0.54 0.24 -0.36 -0.89 -1.04 -0.81 -0.89 -3.39
1.0 0.32 0.98 -0.63 -0.9 0.29 -1.49 -0.53 -0.6 -1.37 -1.62 0.96
-0.09 0.86 1.41 -0.15 0.03 0.67 -0.32 -0.74 -1.43 -0.18 -2.58 -2.0
0.31 0.76 1.45 -0.15 -0.35 0.12 -0.42 -0.63 -0.83 -0.18 -2.23 -0.96
0.36 1.15 1.05 0.57 0.18 -0.22 -0.62 -0.5 -1.78 -0.51 -1.45 -2.08
0.76 0.41 0.27 -0.07 -0.72 0.13 -0.61 -0.24 -0.72 -0.17 -1.59 0.83
0.37 0.47 0.62 -0.41 -0.82 -0.05 -0.07 -0.28 -0.25 0.79 0.0 -2.74
0.61 0.53 1.06 -0.49 -0.68 0.13 -0.33 -0.63 -0.49 0.31 -2.53 -0.07
-0.11 -0.12 0.68 -0.72 -1.12 0.24 -0.78 -0.29 -0.67 -0.21 -0.94 1.54
0.45 -0.27 0.11 -0.29 -0.11 0.79 -0.41 -0.39 -0.29 -0.24 -0.11 0.2
0.51 0.57 1.18 -0.6 -0.12 -0.02 -0.67 -0.26 -0.43 0.07 -2.38 -0.31
1.02 0.42 1.24 -0.31 -0.71 -0.08 -1.63 -0.54 -0.71 -0.65 -0.91 0.15
-1.04 0.54 0.35 0.08 0.65 0.21 0.31 -0.23 -0.73 -1.53 -0.03 -0.04
0.42 0.41 -0.37 0.44 0.19 0.36 -0.37 -0.9 -1.38 -0.77 0.91 -0.7
0.57 1.06 1.41 -0.31 -0.5 -0.14 -0.72 -0.39 -0.99 0.08 -4.52 -1.43
0.85 0.54 0.77 -0.31 -0.41 0.19 -0.8 -1.15 -1.32 -1.09 -1.06 0.97
0.01 0.2 0.59 -0.52 -0.32 -0.47 -0.92 -0.32 -1.17 -0.11 -1.53 1.62
0.34 0.77 0.46 0.26 0.31 0.41 -0.28 -0.68 -2.0 -0.58 0.2 -1.4
0.22 0.53 0.98 0.23 0.38 0.34 0.04 -0.67 -1.93 -0.6 -0.27 -1.94
0.5 0.88 1.09 0.0 -0.19 0.27 -0.79 -0.44 -0.96 0.43 -2.44 -2.56
0.73 0.36 1.22 -0.06 -0.23 0.28 -0.54 -0.35 -0.88 -0.08 -1.98 -1.03
0.67 0.8 0.87 0.12 -0.73 -0.16 -0.71 0.18 -0.87 0.32 -2.67 -0.82
-0.12 0.97 1.43 -0.38 -0.5 -0.37 -0.52 -0.18 -0.72 0.45 -1.98 -1.47
0.37 0.52 0.47 0.15 0.27 0.27 0.09 -1.42 -1.04 -0.39 0.2 -0.94
0.56 0.68 0.92 0.03 -0.24 0.22 -0.6 -0.91 -1.09 -0.49 -0.98 0.15

Details

Dark gray cells indicate values where the raw expression is zero (cannot be log-transformed). Blue cells indicate samples where the expression of the gene is below average and red cells indicate the gene is expressed above average in the sample. White cells are average.