Heatmap: Cluster_213 (HCCA)

View as: (view raw or zlog-transformed)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are normalized against highest expression of the row)

Gene	Light - ZT1	Light - ZT3	Light - ZT5	Light - ZT7	Light - ZT9	Light - ZT11	Light - ZT13	Light - ZT15	Dark - ZT17	Dark - ZT19	Dark - ZT21	Dark - ZT23	Light - ZT25	Nutrient stress - Low nitrogen - 10%	Nutrient stress - Low phosphate - 0%	Nutrient stress - Low sulfate - 2%	Nutrient stress - Low micronutrients - 0%	Nutrient stress - NaCl - 75 mM	Nutrient stress - Mannitol - 100 mM	Nutrient stress - Control	Environmental stress - Prolonged darkness - 72h	Environmental stress - Cold - 4C	Environmental stress - Heat - 37C	Environmental stress - Control	Environmental stress - High light - 150 uE	Environmental stress - Control high light - 40 uE
Cpa\|evm.model.tig00000025.34 (tig00000025_g7943.t1)	0.32	0.26	0.32	0.7	0.56	0.44	0.64	0.75	0.85	0.65	0.8	0.48	0.18	0.34	0.25	0.41	0.34	0.61	0.26	0.28	0.12	0.53	0.97	0.51	1.0	0.55
Cpa\|evm.model.tig00000042.125 (tig00000042_g15522.t2)	0.46	0.37	0.4	0.64	0.75	0.58	0.78	0.84	0.79	0.9	1.0	0.78	0.46	0.45	0.41	0.47	0.43	0.39	0.4	0.39	0.05	0.89	0.84	0.49	0.89	0.53
Cpa\|evm.model.tig00000113.57 (tig00000113_g5632.t1)	0.19	0.31	0.37	0.66	0.56	0.36	0.64	0.67	0.74	0.73	0.87	0.74	0.13	0.53	0.35	0.57	0.38	0.57	0.42	0.25	0.22	0.66	0.94	1.0	0.92	0.49
Cpa\|evm.model.tig00000144.57 (tig00000144_g9048.t1)	0.17	0.14	0.23	0.53	0.46	0.44	0.48	0.53	0.65	0.73	0.71	0.57	0.16	0.23	0.17	0.22	0.18	0.27	0.25	0.18	0.24	0.63	0.88	0.57	1.0	0.58
Cpa\|evm.model.tig00000144.58 (tig00000144_g9049.t1)	0.16	0.17	0.27	0.43	0.37	0.27	0.55	0.56	0.61	0.71	0.69	0.43	0.14	0.3	0.3	0.33	0.27	0.32	0.31	0.24	0.27	0.49	0.92	0.65	1.0	0.53
Cpa\|evm.model.tig00000237.40 (tig00000237_g20489.t1)	0.42	0.21	0.1	0.28	0.34	0.14	0.23	0.32	0.35	0.24	0.37	0.3	0.3	0.07	0.08	0.11	0.08	0.13	0.12	0.07	0.5	0.94	1.0	0.57	0.49	0.33
Cpa\|evm.model.tig00000246.19 (tig00000246_g21512.t1)	0.33	0.39	0.24	0.71	0.67	0.38	0.51	0.59	0.64	0.81	0.82	0.49	0.39	0.53	0.4	0.66	0.54	0.78	0.53	0.39	0.17	0.57	0.85	0.63	0.94	1.0
Cpa\|evm.model.tig00000350.40 (tig00000350_g24339.t1)	0.19	0.17	0.17	0.5	0.49	0.27	0.45	0.48	0.58	0.62	0.78	0.47	0.13	0.25	0.19	0.3	0.21	0.21	0.19	0.15	0.1	0.94	1.0	0.56	0.78	0.33
Cpa\|evm.model.tig00000378.24 (tig00000378_g24516.t1)	0.43	0.31	0.27	0.41	0.39	0.33	0.54	0.66	0.68	0.71	0.84	0.58	0.38	0.19	0.27	0.45	0.3	0.54	0.46	0.29	0.17	0.95	1.0	0.64	0.82	0.52
Cpa\|evm.model.tig00000403.1 (tig00000403_g256.t1)	0.34	0.12	0.14	0.42	0.38	0.24	0.41	0.55	0.66	0.8	1.0	0.71	0.36	0.17	0.09	0.15	0.12	0.33	0.17	0.16	0.01	0.92	0.64	0.69	0.81	0.52
Cpa\|evm.model.tig00000431.23 (tig00000431_g685.t1)	0.04	0.09	0.22	0.63	0.68	0.44	0.5	0.64	0.86	0.82	1.0	0.72	0.06	0.19	0.17	0.19	0.17	0.17	0.19	0.15	0.1	0.8	0.73	0.82	0.95	0.54
Cpa\|evm.model.tig00000448.4 (tig00000448_g837.t1)	0.27	0.27	0.21	0.34	0.35	0.27	0.36	0.39	0.45	0.49	0.59	0.48	0.2	0.31	0.19	0.15	0.15	0.24	0.25	0.17	0.02	0.71	0.72	0.29	1.0	0.41
Cpa\|evm.model.tig00000480.52 (tig00000480_g1320.t1)	0.46	0.34	0.16	0.43	0.39	0.17	0.38	0.45	0.38	0.31	0.41	0.26	0.42	0.14	0.16	0.09	0.08	0.14	0.24	0.09	0.62	1.0	0.92	0.62	0.46	0.5
Cpa\|evm.model.tig00000498.4 (tig00000498_g1579.t1)	0.13	0.19	0.25	0.52	0.61	0.57	0.77	0.7	0.7	0.89	0.93	0.61	0.21	0.41	0.26	0.34	0.37	0.46	0.33	0.3	0.1	0.81	1.0	0.44	0.98	0.6
Cpa\|evm.model.tig00000514.11 (tig00000514_g1799.t1)	0.18	0.34	0.47	0.74	0.95	0.71	0.79	0.74	0.86	0.83	0.94	0.64	0.17	0.26	0.23	0.2	0.3	0.51	0.29	0.41	0.02	1.0	0.79	0.77	1.0	0.64
Cpa\|evm.model.tig00000692.25 (tig00000692_g3219.t1)	0.56	0.35	0.25	0.63	0.65	0.37	0.47	0.57	0.53	0.59	0.75	0.54	0.55	0.27	0.33	0.33	0.3	0.36	0.31	0.23	0.2	1.0	0.63	0.62	0.89	0.55
Cpa\|evm.model.tig00000704.79 (tig00000704_g3360.t1)	0.56	0.57	0.39	0.5	0.49	0.42	0.61	0.66	0.8	0.91	1.0	1.0	0.6	0.32	0.38	0.27	0.26	0.56	0.35	0.25	0.05	0.86	0.91	0.84	0.88	0.68
Cpa\|evm.model.tig00000802.61 (tig00000802_g4310.t1)	0.04	0.15	0.24	0.61	0.49	0.66	0.68	0.62	0.81	0.76	0.87	0.57	0.02	0.34	0.24	0.34	0.31	0.43	0.38	0.22	0.1	0.79	0.94	1.0	0.68	0.49
Cpa\|evm.model.tig00000802.70 (tig00000802_g4317.t1)	0.37	0.32	0.33	0.54	0.47	0.45	0.53	0.57	0.81	0.73	0.96	0.64	0.24	0.24	0.16	0.32	0.19	0.25	0.19	0.15	0.13	0.77	1.0	0.74	0.96	0.62
Cpa\|evm.model.tig00000806.16 (tig00000806_g4344.t1)	0.37	0.21	0.23	0.57	0.5	0.31	0.54	0.64	0.63	0.62	0.59	0.32	0.3	0.23	0.16	0.2	0.14	0.33	0.23	0.12	0.08	1.0	0.55	0.27	0.61	0.46
Cpa\|evm.model.tig00000806.24 (tig00000806_g4351.t1)	0.16	0.3	0.4	0.73	0.68	0.39	0.39	0.55	0.67	0.66	0.87	0.54	0.15	0.18	0.21	0.3	0.26	0.41	0.35	0.3	0.16	1.0	0.67	0.33	0.6	0.57
Cpa\|evm.model.tig00000808.10 (tig00000808_g4394.t1)	0.49	0.38	0.33	0.79	0.88	0.63	0.69	0.56	0.68	0.61	0.77	0.44	0.23	0.27	0.24	0.33	0.29	0.49	0.31	0.36	0.05	0.57	1.0	0.55	0.97	0.58
Cpa\|evm.model.tig00000808.9 (tig00000808_g4393.t1)	0.01	0.01	0.19	0.6	0.6	0.45	0.51	0.61	0.93	0.68	0.77	0.43	0.0	0.22	0.2	0.24	0.27	0.49	0.32	0.24	0.05	1.0	0.65	0.39	0.76	0.56
Cpa\|evm.model.tig00000852.5 (tig00000852_g5018.t1)	0.41	0.2	0.18	0.56	0.42	0.27	0.4	0.52	0.51	0.48	0.68	0.5	0.31	0.19	0.16	0.25	0.15	0.28	0.27	0.13	0.2	1.0	0.53	0.58	0.69	0.61
Cpa\|evm.model.tig00000870.39 (tig00000870_g5156.t1)	0.39	0.36	0.45	0.58	0.82	0.75	0.89	0.67	0.9	0.95	0.91	0.78	0.34	0.48	0.35	0.46	0.42	0.83	0.56	0.33	0.06	0.74	0.87	0.61	1.0	0.53
Cpa\|evm.model.tig00000900.15 (tig00000900_g5369.t1)	0.24	0.33	0.33	0.65	0.84	0.64	0.79	0.64	0.69	0.62	0.69	0.6	0.21	0.3	0.29	0.3	0.34	0.36	0.37	0.35	0.14	1.0	0.98	0.91	0.85	0.58
Cpa\|evm.model.tig00000955.31 (tig00000955_g5808.t1)	0.26	0.16	0.19	0.51	0.46	0.44	0.67	0.63	0.85	0.74	0.81	0.7	0.24	0.56	0.24	0.47	0.33	0.45	0.25	0.29	0.28	0.74	1.0	0.65	0.8	0.59
Cpa\|evm.model.tig00001057.9 (tig00001057_g6690.t1)	0.35	0.16	0.17	0.46	0.33	0.15	0.21	0.32	0.34	0.38	0.63	0.44	0.24	0.11	0.11	0.11	0.12	0.19	0.18	0.11	0.56	0.68	1.0	0.53	0.55	0.32
Cpa\|evm.model.tig00001065.1 (tig00001065_g6702.t1)	0.28	0.21	0.11	0.22	0.28	0.28	0.5	0.45	0.63	0.53	0.59	0.38	0.18	0.11	0.12	0.11	0.14	0.28	0.25	0.21	0.01	0.86	0.65	0.43	1.0	0.43
Cpa\|evm.model.tig00001126.16 (tig00001126_g7126.t1)	0.05	0.15	0.03	0.45	0.43	0.1	0.21	0.39	0.32	0.49	0.86	0.44	0.17	0.03	0.03	0.01	0.06	0.11	0.13	0.02	0.02	0.59	1.0	0.38	0.54	0.48
Cpa\|evm.model.tig00001284.8 (tig00001284_g8006.t1)	0.27	0.4	0.44	0.68	0.53	0.43	0.65	0.75	0.69	0.62	0.65	0.56	0.2	0.48	0.35	0.46	0.28	0.46	0.33	0.3	0.11	1.0	0.62	0.56	0.92	0.65
Cpa\|evm.model.tig00001362.3 (tig00001362_g8353.t1)	0.46	0.39	0.27	0.88	0.72	0.35	0.44	0.54	0.65	0.65	0.88	0.63	0.27	0.3	0.24	0.18	0.16	0.33	0.32	0.13	0.12	0.85	1.0	0.59	0.76	0.7
Cpa\|evm.model.tig00001373.7 (tig00001373_g8447.t1)	0.25	0.27	0.25	0.52	0.57	0.41	0.54	0.68	0.82	0.72	0.77	0.55	0.31	0.28	0.21	0.31	0.14	0.41	0.27	0.16	0.08	0.62	1.0	0.27	0.63	0.41
Cpa\|evm.model.tig00001408.13 (tig00001408_g8608.t1)	0.35	0.56	0.54	0.97	0.69	0.54	0.67	0.91	0.98	0.74	0.74	0.68	0.24	0.5	0.44	0.61	0.35	0.7	0.48	0.29	0.06	0.44	1.0	0.34	0.95	0.69
Cpa\|evm.model.tig00001484.7 (tig00001085_g6967.t1)	0.35	0.38	0.37	0.54	0.57	0.44	0.66	0.77	0.86	0.98	1.0	0.8	0.28	0.19	0.17	0.19	0.23	0.35	0.28	0.27	0.05	0.82	0.6	0.6	0.59	0.46
Cpa\|evm.model.tig00001629.5 (tig00001629_g9521.t1)	0.37	0.37	0.3	0.54	0.57	0.57	0.61	0.63	0.87	0.82	1.0	0.8	0.36	0.39	0.32	0.31	0.3	0.45	0.39	0.32	0.04	0.64	0.64	0.54	0.62	0.57
Cpa\|evm.model.tig00001636.12 (tig00001636_g9536.t1)	0.27	0.26	0.21	0.32	0.35	0.22	0.41	0.56	0.69	0.61	0.81	0.61	0.16	0.15	0.16	0.14	0.13	0.38	0.21	0.19	0.01	1.0	0.51	0.76	0.7	0.52
Cpa\|evm.model.tig00001669.10 (tig00001669_g9564.t1)	0.28	0.04	0.05	0.3	0.23	0.04	0.09	0.16	0.33	0.21	0.48	0.22	0.12	0.03	0.08	0.04	0.04	0.09	0.03	0.01	0.2	0.65	1.0	0.2	0.44	0.16
Cpa\|evm.model.tig00020510.45 (tig00020510_g9827.t1)	0.14	0.19	0.27	0.5	0.35	0.25	0.49	0.63	0.69	0.65	0.78	0.56	0.12	0.24	0.24	0.26	0.28	0.32	0.26	0.23	0.1	0.97	0.73	0.47	1.0	0.63
Cpa\|evm.model.tig00020589.2 (tig00020589_g11616.t1)	0.53	0.4	0.48	0.65	0.78	0.73	0.92	0.98	0.87	1.0	0.98	0.7	0.52	0.61	0.51	0.74	0.56	0.51	0.45	0.49	0.12	0.85	0.92	0.73	0.97	0.67
Cpa\|evm.model.tig00020723.105 (tig00020723_g13516.t1)	0.09	0.21	0.35	0.6	0.44	0.33	0.49	0.6	0.56	0.53	0.6	0.53	0.07	0.38	0.33	0.35	0.27	0.29	0.2	0.24	0.23	1.0	0.5	0.49	0.84	0.64
Cpa\|evm.model.tig00020780.53 (tig00020780_g13801.t1)	0.39	0.33	0.26	0.65	0.67	0.55	0.67	0.77	0.71	0.59	0.59	0.39	0.19	0.23	0.25	0.34	0.3	0.59	0.48	0.3	0.05	0.36	0.71	0.58	1.0	0.51
Cpa\|evm.model.tig00020800.22 (tig00020800_g13740.t2)	0.37	0.2	0.18	0.33	0.37	0.35	0.59	0.76	0.84	0.78	1.0	0.7	0.33	0.35	0.28	0.36	0.24	0.42	0.33	0.22	0.07	0.92	0.88	0.55	0.83	0.47
Cpa\|evm.model.tig00020904.32 (tig00020904_g15165.t1)	0.56	0.43	0.4	0.38	0.36	0.3	0.58	0.62	0.73	0.76	0.87	0.94	0.52	0.29	0.28	0.28	0.34	0.49	0.36	0.38	0.08	0.91	0.73	0.7	1.0	0.77
Cpa\|evm.model.tig00020952.5 (tig00020952_g16472.t1)	0.32	0.25	0.36	0.61	0.6	0.55	1.0	0.95	0.89	0.7	0.53	0.55	0.28	0.43	0.28	0.43	0.27	0.58	0.34	0.32	0.12	0.53	0.65	0.36	0.87	0.55
Cpa\|evm.model.tig00020996.12 (tig00020996_g16930.t1)	0.36	0.43	0.31	0.76	0.75	0.38	0.46	0.47	0.44	0.43	0.55	0.54	0.36	0.44	0.21	0.26	0.13	0.25	0.26	0.16	0.19	0.91	1.0	0.64	0.69	0.67
Cpa\|evm.model.tig00021105.59 (tig00021105_g18273.t1)	0.14	0.25	0.22	0.46	0.54	0.58	0.45	0.49	0.63	0.48	0.68	0.46	0.08	0.29	0.17	0.13	0.09	0.36	0.18	0.15	0.06	1.0	0.51	0.9	0.95	0.72
Cpa\|evm.model.tig00021135.23 (tig00021135_g18945.t1)	0.05	0.05	0.1	0.39	0.44	0.38	0.53	0.54	0.76	0.69	0.64	0.4	0.05	0.38	0.18	0.25	0.16	0.32	0.19	0.11	0.12	0.69	1.0	0.5	0.74	0.4
Cpa\|evm.model.tig00021432.20 (tig00021432_g21212.t1)	0.58	0.75	0.63	0.95	0.82	0.66	1.0	0.95	0.72	0.68	0.75	0.62	0.49	0.65	0.56	0.61	0.46	1.0	0.66	0.37	0.1	0.71	0.94	0.63	0.99	0.97
Cpa\|evm.model.tig00021440.9 (tig00021440_g21538.t1)	0.19	0.15	0.15	0.56	0.48	0.24	0.49	0.56	0.58	0.62	0.84	0.4	0.14	0.29	0.16	0.26	0.33	0.31	0.24	0.11	0.07	0.59	1.0	0.8	0.66	0.5

Details

Expression values normalized per gene (using the maximum value, Green cells indicate low expression and red high. (Dark gray cells indicate missing values)