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Heatmap: Cluster_96 (HCCA)

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(Values are log2 transformed ratios of a genes expression in a sample divided by the mean expression level)

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Gene
12pM Fe,Midday
12pM Fe,Midnight
58pM Fe,Midday
58pM Fe,Midnight
233pM Fe,Midnight
1160pM Fe,Midday
1160pM Fe,Midnight
High carbon,Dark
High carbon,Light
Low carbon,Dark
Phloroglucinol
Silicon starvation,12h
0.34 0.29 0.24 -0.28 -0.32 -0.01 -0.65 -0.35 -0.67 -0.18 0.48 0.48
0.68 0.88 0.3 0.29 -0.27 -0.12 -1.39 -0.36 -0.93 -0.4 -0.46 0.25
0.66 0.47 0.22 0.17 -0.04 -0.2 -0.61 -0.58 -0.8 -0.8 0.1 0.43
1.18 0.37 0.52 -0.65 -1.02 0.32 -0.71 -0.82 -0.85 -0.95 0.38 0.11
0.35 0.6 0.13 -0.11 0.12 -0.07 -0.64 -0.43 -0.81 -0.19 -0.07 0.45
0.73 0.35 0.44 -0.31 -0.35 -0.0 -1.05 -0.58 -0.73 -0.19 0.21 0.4
0.7 0.73 0.05 -0.31 -0.54 0.13 -0.57 -0.18 -0.33 -0.73 0.36 -0.21
0.52 0.69 0.08 0.1 -0.12 -0.19 -0.57 -0.5 -1.32 -0.78 -0.07 0.76
0.84 0.5 0.36 -0.12 -0.28 0.01 -0.9 -0.53 -0.87 -0.44 0.03 0.29
0.48 0.72 0.62 0.22 -0.45 -0.13 -1.41 -0.28 -0.83 -0.14 -0.23 0.12
1.38 0.33 0.01 -0.13 -0.84 0.18 -1.32 -0.54 -0.11 -0.11 -0.96 0.09
1.28 -0.14 0.3 -0.78 -1.2 -0.03 -2.11 -0.62 -0.83 -0.73 0.86 0.65
0.5 0.49 0.23 0.14 -0.06 0.18 -0.75 -0.33 -0.73 -0.3 -0.07 0.07
0.55 0.6 0.24 0.03 -0.12 -0.06 -0.9 -0.24 -0.63 -0.32 -0.49 0.49
0.57 0.67 0.39 0.16 -0.09 -0.1 -1.09 -0.47 -0.75 -0.58 -0.66 0.62
0.87 0.44 0.24 -0.28 -0.4 0.17 -1.14 -0.28 -0.5 -0.68 -0.23 0.55
0.64 0.59 0.39 0.09 -0.05 -0.0 -0.68 -0.53 -1.13 -0.55 0.01 0.18
0.79 0.14 0.6 -0.5 -0.91 0.13 -0.69 -1.05 -0.8 -1.12 0.81 0.52
0.72 0.59 0.52 -0.39 -0.9 -0.12 -0.88 -0.64 -0.34 -0.68 0.32 0.44
0.52 0.4 0.34 -0.0 -0.0 -0.11 -0.95 -0.06 -0.47 -0.33 -0.1 0.18
0.73 0.58 -0.04 0.18 -0.14 -0.5 -0.65 -0.36 -0.68 -0.54 0.11 0.41
0.63 0.42 0.3 0.0 -0.42 0.06 -1.45 -0.86 -1.04 -0.53 -0.63 1.23
0.82 0.29 0.16 -0.31 -0.39 0.04 -0.69 -0.73 -0.71 -0.33 0.43 0.4
0.83 0.53 0.37 0.18 -0.31 0.29 -1.87 -0.56 -0.89 0.31 0.14 -0.99
0.45 0.73 0.37 0.31 -0.2 -0.08 -0.75 -0.52 -0.89 -1.09 0.41 -0.02
0.24 0.2 0.31 -0.26 -0.59 0.49 -0.9 -0.85 -0.72 -0.72 0.71 0.66
0.86 0.68 0.23 0.02 -0.07 0.03 -1.18 -0.32 -0.95 -0.93 0.14 0.06
1.05 0.62 0.61 -0.15 -0.69 -0.09 -0.98 -0.63 -0.87 -0.6 0.36 -0.39
0.98 0.41 0.34 -0.09 -0.34 0.24 -0.69 -0.32 -0.65 -1.17 -0.16 0.15
0.84 0.6 0.34 0.15 -0.37 -0.08 -0.91 -0.58 -0.49 -0.27 -0.46 0.16
0.9 0.8 0.09 0.12 -0.06 -0.18 -1.27 -0.4 -1.08 -0.81 0.54 -0.46
0.42 0.54 0.4 0.03 0.08 0.05 -1.02 -0.37 -0.89 -0.56 0.34 0.05
1.05 0.07 0.2 -0.76 -0.46 -0.09 -1.65 -0.77 -0.89 -0.76 0.42 1.07
0.69 0.39 0.21 0.15 -0.09 -0.28 -0.32 -0.5 -0.54 -0.44 0.2 -0.05
0.66 0.42 0.29 -0.07 -0.45 0.09 -1.06 -0.17 -0.61 -0.52 0.05 0.43
0.32 0.09 0.25 -0.04 -0.05 0.27 -0.45 -0.5 -0.69 -0.27 -0.04 0.58
1.61 0.55 0.07 -0.43 -0.65 -0.07 -1.22 -0.81 -0.82 -1.32 0.66 -0.84
0.14 0.46 0.61 -0.02 0.33 0.17 -0.72 -0.55 -0.9 -0.56 0.2 -0.02
1.24 0.69 0.61 -0.45 -1.09 -0.06 -1.11 -0.41 -0.05 0.07 -0.42 -1.45
0.82 0.6 0.5 -0.09 -0.84 -0.11 -1.04 -0.73 -0.94 -0.93 0.24 0.65
0.55 0.6 0.15 0.09 0.0 -0.11 -0.98 -0.08 -0.76 -0.42 0.38 -0.27
0.5 0.47 0.27 -0.05 -0.17 -0.13 -0.48 -0.47 -0.6 -0.54 0.26 0.31
0.27 0.07 0.24 -0.14 -0.01 0.06 -0.77 -0.42 -0.38 -0.31 0.52 0.35
1.47 -0.09 0.74 -0.21 -1.12 0.39 -1.57 -0.08 -0.63 -0.42 -0.62 -0.59
0.52 0.62 -0.34 0.0 0.12 -0.33 -0.53 -0.34 -0.7 0.01 -0.01 0.34
0.86 0.44 0.32 -0.54 -0.53 0.0 -1.35 -0.97 -0.74 -0.73 0.5 0.74
0.75 0.37 0.2 -0.69 -0.55 -0.08 -1.19 -0.31 -0.72 -0.4 0.76 0.41
0.79 0.45 0.52 -0.27 -0.26 0.15 -0.85 -0.41 -0.58 -0.44 -0.34 0.25
0.75 0.53 0.19 -0.17 -0.17 -0.05 -1.12 -0.18 -0.27 -0.01 -0.27 -0.0
0.94 0.32 0.16 -0.22 -0.87 -0.15 -0.81 -0.41 -0.24 -0.37 -0.19 0.67
0.64 0.65 0.48 -0.1 -0.06 0.28 -0.63 -0.41 -1.17 -0.79 0.46 -0.82
0.61 0.3 -0.1 -0.48 -0.49 -0.26 -1.54 -0.38 -0.6 -1.04 0.88 0.96
0.81 0.14 -0.17 -0.76 -0.74 -0.31 -1.36 -1.0 -0.86 -0.83 0.81 1.32
0.49 0.78 -0.1 0.04 -0.08 -0.05 -1.4 -0.57 -1.01 -0.82 -0.29 1.05
0.95 0.39 0.66 0.05 -0.25 -0.0 -1.37 -0.41 -0.55 -0.46 -0.0 -0.41
0.4 0.64 0.16 -0.09 -0.55 -0.14 -0.92 -0.43 -0.64 -0.06 -0.1 0.74
0.74 0.17 0.43 -0.43 -0.69 0.26 -0.65 -0.64 -0.59 -0.8 0.28 0.64
0.74 0.63 0.16 -0.03 -0.15 0.37 -1.45 -0.06 -0.38 -0.67 -0.19 -0.16
0.54 0.51 0.21 0.12 0.25 0.53 -1.5 -0.83 -0.87 -1.01 0.39 -0.03
0.48 0.66 -0.0 0.2 0.2 -0.34 -1.08 -0.49 -1.44 0.11 -0.53 0.68
0.53 0.5 0.27 0.04 -0.14 -0.02 -0.79 -0.32 -0.53 -0.66 0.09 0.31
0.79 0.51 0.52 -0.23 -0.29 0.47 -1.33 -0.37 -0.54 -0.43 0.22 -0.76
1.43 0.28 0.49 -0.29 -1.74 0.16 -0.58 -0.93 -0.62 -1.26 0.5 -0.38
0.74 0.6 -0.08 0.02 -0.24 -0.02 -1.12 -0.6 -0.93 -0.93 0.13 0.81
0.62 0.28 0.27 -0.39 -0.09 -0.06 -0.46 -0.64 -0.46 -0.33 -0.01 0.59
0.89 0.47 0.67 -0.09 -0.44 0.03 -1.56 -0.31 -0.57 -0.56 0.03 -0.06
0.88 0.51 0.61 -0.14 0.01 0.17 -2.24 -0.3 -1.1 -0.27 -0.37 0.1
0.44 0.73 0.2 0.17 0.29 -0.13 -0.99 -0.61 -1.48 -0.1 -0.15 0.27
0.33 0.59 0.78 -0.11 -0.13 0.26 -0.75 -0.14 -0.63 -0.41 -0.44 -0.26
0.85 0.19 0.24 -0.38 -0.79 0.08 -0.93 -0.52 -0.43 -0.67 0.26 0.74
0.81 0.56 0.2 0.05 -0.11 -0.06 -1.39 -0.62 -1.06 -0.25 0.25 0.24
0.7 0.49 0.89 0.18 -0.24 0.01 -1.98 -0.57 -0.84 0.38 -0.88 -0.32
1.17 0.92 0.63 -0.27 -0.94 -0.05 -1.68 -0.93 -1.11 -0.42 -0.23 0.12
0.6 1.05 -0.31 0.04 -0.37 -1.73 -2.08 -0.7 -2.57 0.15 -0.33 1.37
0.56 0.58 -0.29 -0.08 -0.51 -0.41 -0.91 -0.72 -0.74 -1.1 0.83 0.88
0.75 0.41 0.31 -0.59 -0.47 0.1 -1.09 -0.58 -0.54 -1.13 0.42 0.75
1.08 0.45 0.5 -0.1 -0.7 0.06 -0.92 -0.82 -0.59 -1.09 0.16 0.22
0.87 0.61 0.35 -0.03 -0.18 0.02 -1.0 -0.38 -0.67 -0.6 0.02 -0.11
0.62 0.66 0.63 0.05 -0.34 -0.08 -0.71 -0.71 -0.95 -0.26 -0.37 0.3
0.63 0.5 0.41 -0.06 -0.19 0.1 -1.52 -0.41 -0.87 -0.66 -0.13 0.68
0.67 0.32 -0.03 -0.09 -0.28 -0.05 -1.05 -0.19 -0.53 -0.29 0.05 0.63
0.85 0.64 0.41 -0.01 -0.24 0.08 -1.88 -0.4 -1.19 -0.45 0.18 0.1
0.52 0.47 0.85 -0.35 -0.51 0.06 -1.02 -0.54 -0.59 -0.3 0.25 0.0
0.68 0.41 0.36 -0.1 -0.38 0.07 -0.86 -0.74 -0.74 -0.21 0.76 -0.47
0.71 0.76 -0.35 -0.0 -0.34 0.07 -0.68 -0.48 -0.55 -0.78 0.44 0.11
0.98 0.36 0.69 -0.54 -1.63 0.31 -1.7 -0.85 -0.61 -1.11 0.85 0.12
0.76 0.51 0.38 -0.32 -0.87 0.24 -1.98 -0.88 -1.11 -1.42 -0.08 1.31
0.65 0.24 0.27 -0.17 -0.61 -0.0 -0.74 -0.72 -0.53 -0.48 0.46 0.59
0.84 0.32 0.42 -0.17 -1.1 0.2 -1.17 -0.66 -0.69 -0.75 0.04 0.85
0.68 0.73 0.02 -0.18 -1.52 -0.08 -1.32 -0.61 -0.43 0.45 -0.27 0.64
0.74 0.94 -0.4 -0.13 -0.17 -0.43 -0.62 -0.48 -1.38 -0.52 -0.29 0.88
1.15 0.22 0.51 -0.77 -1.18 0.1 -1.62 -0.66 -0.49 -0.74 0.16 0.77
1.12 0.38 0.1 -0.38 -0.94 0.23 -0.96 -0.71 -1.06 -0.97 0.58 0.46
0.42 0.39 0.34 -0.13 -0.12 0.05 -0.9 -0.18 -0.4 -0.17 -0.06 0.26
0.78 0.58 0.3 -0.21 -0.33 -0.28 -1.1 -0.61 -0.78 -0.49 0.2 0.6
1.29 0.74 0.37 -0.21 -0.72 -0.18 -1.51 -0.61 -0.44 -0.25 -1.38 0.33
0.86 0.32 0.62 -0.37 -0.76 -0.0 -0.82 -0.49 -0.52 -0.26 0.29 0.0
0.93 0.42 0.62 -0.52 -1.01 0.22 -1.04 -0.65 -0.68 -0.69 0.57 0.03
0.26 0.22 0.26 -0.3 -0.12 0.04 -0.41 -0.39 -0.5 0.01 0.26 0.32
1.16 0.48 0.58 -0.5 -0.75 -0.18 -2.36 -0.74 -1.53 -0.32 0.19 0.69
0.59 0.39 0.5 -0.12 -0.23 0.17 -0.26 -0.47 -0.6 -0.26 -0.32 0.0
0.72 0.37 0.2 -0.34 -0.28 -0.08 -1.27 -0.57 -0.63 -0.59 0.44 0.67
0.6 0.52 0.39 0.05 -0.22 0.25 -1.01 -0.2 -0.76 -0.54 0.11 -0.09
1.17 0.42 0.16 -0.58 -1.06 0.26 -1.88 -0.72 -0.51 -0.18 0.06 0.52
0.52 0.66 0.79 -0.14 -0.41 -0.02 -0.93 -0.48 -0.37 -0.33 -0.36 0.04
1.0 0.57 0.52 -0.05 -0.37 -0.17 -1.4 -0.32 -1.0 -0.44 -0.3 0.3
0.66 0.34 0.13 -0.03 -0.48 -0.26 -1.2 -0.63 -0.48 -0.49 0.29 0.85
0.72 -0.02 0.29 -0.16 -0.48 0.03 -0.48 -0.77 -0.69 -0.2 -0.07 0.82
0.78 0.72 0.26 0.03 -0.07 -0.05 -1.46 -0.28 -0.63 -0.3 -0.06 -0.17
0.76 0.4 0.36 -0.2 -0.08 -0.02 -0.56 -0.49 -1.18 -0.44 0.44 -0.05
0.43 0.86 -0.3 -0.13 -0.16 -0.25 -1.51 -0.25 -0.62 0.41 -0.47 0.58
0.72 0.78 0.13 0.04 -0.12 -0.23 -0.68 -0.27 -0.81 -0.37 0.14 -0.25
1.1 0.4 0.36 -0.28 -0.57 0.29 -0.97 -0.75 -0.81 -1.11 0.35 0.18
0.88 0.69 0.73 -0.16 -0.45 0.02 -0.42 -0.45 -0.71 -0.07 -0.36 -1.22
0.82 0.17 0.46 -0.28 -0.69 0.01 -0.94 -0.36 -0.48 0.08 -0.4 0.53
0.45 0.33 0.38 0.0 -0.06 0.1 -0.77 -0.65 -1.07 0.21 0.07 0.19
1.08 1.15 0.06 0.29 -1.48 -0.62 -1.98 -0.74 -1.38 -0.61 -1.55 1.11
0.37 0.53 0.31 -0.05 -0.03 -0.14 -0.77 -0.31 -0.75 -0.57 0.3 0.36
0.73 0.64 0.46 -0.02 -0.15 0.26 -1.29 -0.2 -0.51 -0.21 -0.77 -0.17
0.6 0.29 0.57 -0.05 -0.74 0.03 -0.85 -0.08 -0.67 0.26 -0.45 0.17
0.55 0.57 0.05 -0.05 -0.12 -0.21 -0.57 -0.56 -1.02 0.18 -0.45 0.65
0.68 0.85 -0.12 -0.32 -0.46 -0.43 -1.93 -0.5 -1.62 0.18 0.09 0.94
0.8 0.35 0.37 -0.28 -1.06 -0.19 -1.39 -0.57 -0.52 -1.19 0.81 0.65
1.06 0.53 0.49 -0.09 -1.37 0.43 -1.02 -1.09 -0.78 -0.93 0.49 -0.14
0.63 0.52 0.08 -0.17 -0.68 -0.14 -1.47 -0.83 -0.85 -0.55 0.68 0.83
0.93 0.41 0.5 0.02 -0.45 -0.11 -0.36 -0.56 -1.03 -0.83 -0.55 0.57
0.04 0.21 -0.06 -0.34 0.1 -0.13 -0.16 -0.44 -0.57 -0.24 0.46 0.64

Details

Dark gray cells indicate values where the raw expression is zero (cannot be log-transformed). Blue cells indicate samples where the expression of the gene is below average and red cells indicate the gene is expressed above average in the sample. White cells are average.