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Heatmap: Cluster_56 (HCCA)

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(Values are log2 transformed ratios of a genes expression in a sample divided by the mean expression level)

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Gene
12pM Fe,Midday
12pM Fe,Midnight
58pM Fe,Midday
58pM Fe,Midnight
233pM Fe,Midnight
1160pM Fe,Midday
1160pM Fe,Midnight
High carbon,Dark
High carbon,Light
Low carbon,Dark
Phloroglucinol
Silicon starvation,12h
-0.4 1.06 0.38 1.42 0.4 -2.59 -1.21 -0.06 -3.19 0.37 -2.86 -0.41
0.58 0.62 0.8 0.94 -0.41 -0.3 -1.68 -0.53 -1.19 -0.37 -1.01 0.05
-0.1 0.28 0.1 1.01 0.03 -0.33 -0.94 -0.22 -0.7 -0.04 -1.1 0.6
0.8 0.48 0.6 0.16 -0.23 0.13 -0.79 -0.22 -0.33 -0.58 -1.3 -0.03
0.55 0.66 0.73 0.49 -0.28 0.04 -1.18 -0.99 -1.18 -0.3 -0.71 0.31
0.52 0.8 0.22 0.67 0.13 -0.43 -0.5 -0.37 -1.5 -0.97 0.33 -0.65
0.43 0.53 0.57 0.52 -0.38 -0.2 -1.08 -0.14 -0.46 -0.2 -0.59 0.01
0.93 0.41 0.28 0.47 -0.49 -0.16 -1.25 -0.27 -0.82 -0.48 0.31 -0.35
0.1 0.22 -0.07 0.84 0.56 -0.17 -0.74 -0.22 -0.63 -0.14 -1.57 0.38
0.36 0.22 0.07 0.5 -0.02 0.13 -0.51 -0.01 -0.36 -0.2 -0.5 -0.07
0.15 0.11 -0.16 0.44 -0.18 -0.1 -1.05 -0.25 -0.33 0.15 0.31 0.35
0.71 0.26 0.05 0.63 -0.42 -0.5 -0.53 -0.29 -0.69 -1.12 0.41 0.28
0.32 0.53 -0.0 0.66 0.34 0.11 -0.55 -0.43 -0.84 -0.56 -1.7 0.48
0.61 0.32 0.07 0.62 0.0 0.21 -0.89 -0.29 -0.71 -0.42 -0.3 -0.08
0.72 0.65 0.32 0.67 -0.83 -0.12 -1.02 -0.68 -1.26 -0.93 0.55 -0.1
0.35 0.58 -0.27 0.77 0.29 -0.35 -1.33 -0.24 -1.23 -0.29 -0.0 0.28
0.85 0.61 0.37 0.36 -0.64 0.11 -1.12 -0.32 -0.67 -0.14 0.08 -0.98
0.36 0.45 0.21 0.62 0.17 -0.12 -0.4 -0.1 -0.82 -0.51 -0.12 -0.45
0.54 0.41 -0.2 0.32 -0.31 0.03 -0.76 -0.25 -0.7 -0.74 -0.2 0.81
0.58 0.7 0.52 0.4 0.17 0.23 -0.96 -0.34 -0.51 -0.03 -1.03 -1.56
0.63 0.32 0.31 0.46 -0.34 -0.0 -1.03 -0.45 -0.41 -0.47 -0.22 0.31
0.01 0.27 0.15 0.69 0.39 0.04 -0.76 -0.13 -0.64 -0.99 -0.5 0.46
0.82 0.77 0.55 0.7 -0.47 -0.19 -0.82 -0.19 -1.11 -1.15 0.01 -1.05
0.7 0.67 0.83 0.71 -0.22 -0.35 -0.59 -0.41 -0.86 -0.85 -0.42 -1.11
0.84 0.48 0.17 0.42 -0.2 -0.28 -1.0 -0.01 -0.72 -0.68 0.21 -0.37
0.36 0.93 -0.09 0.66 0.12 -0.07 -0.79 0.07 -1.23 -0.47 -0.28 -0.59
0.76 0.27 0.76 0.18 -0.58 -0.19 -0.68 -0.5 -0.52 -0.8 -0.57 0.54
0.55 0.09 -0.02 0.25 -0.23 0.19 -1.18 -0.61 -0.76 -0.5 -0.16 1.0
0.34 0.4 0.15 0.84 -0.34 -0.23 -1.17 -0.36 -1.01 -0.32 -0.96 0.88
0.03 0.29 -0.24 0.57 -0.02 0.0 -0.41 -0.27 -0.48 -0.34 -0.04 0.46
0.46 0.08 0.61 0.25 -0.29 0.26 -1.36 -0.34 -0.18 -0.63 -0.63 0.57
0.39 0.38 0.69 0.81 -0.45 -0.04 -1.4 -0.76 -0.81 -1.19 -1.27 0.94
1.12 0.71 0.51 0.6 -0.85 -0.21 -1.31 -0.65 -1.11 -1.4 0.37 -0.59
0.44 0.51 0.06 0.62 -0.71 -0.34 -1.36 -0.25 -0.7 -0.11 -0.11 0.63
0.36 0.71 -0.15 1.0 -0.03 -1.03 -1.6 -0.49 -1.97 0.33 -0.43 0.5
0.63 0.42 0.15 0.58 -0.02 -0.12 -1.05 -0.09 -0.96 -0.32 -0.62 0.28
0.45 0.65 0.23 0.72 -0.3 -0.1 -0.97 -0.3 -1.14 -0.82 0.1 0.12
0.06 0.4 -0.29 0.78 0.4 -0.13 0.09 -0.22 -1.14 -0.53 -0.68 0.24
0.47 0.32 0.42 0.35 -0.27 0.17 -0.79 -0.5 -0.56 -0.42 -1.0 0.67
1.05 0.6 0.95 0.39 -0.53 -0.06 -1.81 -0.81 -1.37 -1.1 -0.9 0.36
0.31 0.62 -0.0 0.64 0.39 -0.09 -0.54 -0.4 -0.99 -0.49 -0.96 0.32
0.32 1.04 -0.5 0.89 0.55 -1.45 -0.41 -0.19 -1.57 -0.91 0.5 -1.35
0.49 0.3 0.12 0.43 -0.56 -0.1 -1.18 -0.78 -0.65 -0.38 -0.11 0.97
0.55 0.02 0.11 0.47 -0.3 0.26 -0.58 -0.43 -0.4 -0.92 -0.39 0.67
0.82 0.76 0.44 1.0 -0.03 -0.62 -0.79 -0.53 -1.53 -0.51 -1.59 -0.15
0.45 0.45 0.38 0.5 0.19 0.02 -1.18 -0.36 -0.84 -0.52 -0.68 0.38
0.18 0.88 -0.06 1.0 0.55 -0.23 -0.86 -0.37 -1.69 -0.57 -1.87 0.23
0.7 0.86 0.42 0.7 0.2 -0.01 -0.8 -0.74 -1.79 -1.15 0.04 -0.96
1.08 1.03 0.66 0.4 -0.39 -0.25 -1.19 -0.2 -0.71 -1.43 -1.03 -0.87
0.6 0.54 0.42 0.74 0.07 0.35 -1.19 -0.56 -1.26 -0.23 -0.41 -0.86
0.7 0.53 0.59 0.4 0.09 -0.12 -0.73 -0.25 -0.46 -0.47 -0.89 -0.54
0.22 0.51 0.26 0.91 0.19 -0.14 -1.14 -0.41 -0.83 -0.79 -0.78 0.45
0.46 0.11 -0.22 0.63 -0.7 -0.31 -0.54 -0.32 -0.39 -0.75 0.5 0.54
0.59 0.52 0.21 0.89 -0.14 -0.21 -1.83 -0.14 -1.17 -0.5 0.3 -0.5
0.79 0.32 0.16 0.73 -0.06 -0.23 -0.81 -0.23 -0.98 -0.11 -1.05 0.12
0.71 0.63 0.07 0.72 -0.51 -0.31 -1.23 -0.36 -0.74 -0.31 -0.03 0.02
1.24 1.54 0.4 1.47 -1.36 -1.13 -2.05 -1.93 -2.51 -2.13 -2.71 -0.45
0.61 0.75 0.17 0.72 0.15 -0.49 -1.5 -0.1 -1.29 -0.42 -1.15 0.37
0.78 0.27 -0.01 0.55 0.04 -0.46 -1.44 -0.19 -0.9 -0.39 -0.0 0.39
0.5 0.55 -0.5 0.84 0.28 -0.84 -1.47 -0.37 -1.93 -0.1 -0.21 0.72
0.8 0.45 0.28 0.29 -0.05 -0.05 -0.97 -0.85 -0.97 -0.54 0.21 0.15
0.7 0.6 0.47 0.54 0.19 0.32 -0.63 -0.79 -1.26 -0.88 -0.03 -1.09
0.92 1.49 0.87 1.41 -0.85 -3.94 -2.59 -0.41 -2.78 -0.65 -2.31 -1.72
0.42 0.0 0.46 0.42 -0.31 -0.05 -1.42 -0.37 -0.42 -0.73 0.06 0.71
0.24 0.68 0.07 0.82 0.12 0.08 -1.15 -0.22 -0.62 -0.75 0.08 -0.59
0.96 0.88 0.31 0.87 -0.73 -0.41 -2.02 -0.43 -1.44 -1.63 -0.27 0.37
0.6 0.25 0.28 0.36 -0.22 -0.13 -0.57 -0.39 -0.63 -0.81 0.52 -0.09
0.61 0.14 1.07 0.69 -0.4 -0.27 -1.08 -0.89 -1.75 -0.9 0.15 0.16
0.84 0.54 1.18 0.66 -0.7 -0.1 -0.78 -0.53 -0.85 -0.12 -2.49 -1.19
0.76 0.47 0.41 0.42 -0.07 0.33 -0.91 -0.48 -0.88 -1.27 -0.67 0.27
0.45 0.35 0.27 0.46 -0.21 -0.04 -2.52 -0.7 -1.01 -0.64 -0.48 1.2
1.1 0.58 0.38 0.72 -0.74 0.07 -0.55 -0.85 -1.36 -1.81 0.26 -0.6
-0.28 0.47 0.92 0.89 -0.05 -0.74 -0.96 -0.3 -1.09 -0.58 -0.81 0.54
0.5 0.36 0.14 0.42 -0.41 -0.26 -1.3 -0.37 -0.33 0.02 0.23 0.15
0.98 0.86 0.27 0.98 0.07 -0.77 -0.66 -0.45 -1.67 -0.64 -1.31 -0.56
0.75 0.6 0.67 0.8 -0.06 0.57 -1.92 -1.04 -1.48 -0.55 -0.97 -0.47
0.73 0.58 -0.17 0.81 -0.5 -0.35 -0.68 -0.64 -0.87 -1.01 0.45 0.05
0.11 0.54 -0.29 0.76 0.3 -0.57 -0.67 -0.13 -0.63 -0.61 -0.63 0.64
0.73 0.72 1.81 0.29 -0.69 0.22 -0.6 -1.2 -1.42 -1.2 -4.07 -2.16
0.89 0.34 0.32 0.53 -0.58 0.03 -0.89 -0.56 -0.61 -0.49 -0.01 -0.13
1.01 0.88 0.19 1.02 -0.38 -0.45 -1.43 -0.66 -1.65 -2.03 0.51 -1.04
0.78 0.06 0.36 0.75 -0.24 -0.16 -0.97 0.08 -0.52 -0.76 -0.27 -0.23
0.28 0.31 0.19 0.24 0.13 -0.23 -0.51 -0.12 -0.38 0.04 -0.57 0.25
0.79 0.99 0.45 1.27 -0.64 -0.0 -1.57 -0.96 -1.58 -1.58 -0.22 -1.02
0.17 0.69 -0.23 0.73 0.01 -0.58 -0.9 -0.07 -0.7 0.03 -1.11 0.56
0.46 0.48 0.28 0.35 -0.21 -0.3 -1.26 -0.5 -0.74 -0.54 0.06 0.68
0.71 0.62 0.32 0.67 0.07 -0.01 -0.11 -0.37 -0.91 -1.07 -0.29 -1.28
0.53 0.65 0.3 0.73 -0.25 0.04 -0.86 -0.72 -1.15 -0.87 0.25 -0.18
0.32 0.65 -0.42 0.76 0.66 -0.14 -0.43 -0.28 -1.26 -0.76 -0.46 -0.06
0.49 0.27 0.37 0.29 0.08 0.03 -0.58 -0.21 -0.45 -0.63 -0.77 0.37
0.58 0.51 0.56 0.73 -0.14 0.38 -1.78 -0.91 -1.2 0.04 -0.8 -0.19
0.75 0.46 0.43 0.23 -0.56 -0.1 -1.74 -0.72 -0.64 -0.64 0.36 0.41
0.65 0.21 0.48 0.35 -0.17 0.19 -0.95 -0.45 -0.61 -0.66 0.15 -0.1
0.44 0.11 0.03 0.25 -0.3 -0.29 -1.14 -0.56 -0.82 -0.81 -0.34 1.41
0.59 0.86 0.18 0.77 0.3 -0.17 -2.08 -0.63 -1.39 -0.49 -1.03 0.32
0.52 0.61 0.39 0.46 -0.06 0.13 -0.08 -0.62 -0.85 -0.9 -0.04 -0.66
0.7 0.53 0.33 0.34 -0.26 0.04 -1.19 -0.43 -0.78 -0.75 -0.47 0.54
0.89 0.58 0.16 0.81 -0.3 0.06 -1.88 -0.56 -1.07 -0.64 0.21 -0.52
0.27 0.4 0.01 0.64 0.19 0.16 -0.57 -0.71 -0.66 -0.43 -0.77 0.49
0.57 0.4 0.49 0.42 -0.31 -0.18 -1.4 -0.45 -0.57 0.43 -0.72 0.04
0.52 0.64 1.13 0.54 -0.4 0.2 -0.7 -0.74 -1.3 -0.27 -1.71 -0.52
0.77 1.42 0.4 1.01 0.39 -2.08 -2.71 -0.19 -3.81 -0.25 -2.25 -0.75
0.47 0.48 0.67 0.7 -0.28 -0.19 -1.41 -0.36 -0.61 -0.56 -0.22 -0.07
0.8 0.47 0.67 0.41 -0.32 0.06 -1.52 -0.44 -1.04 -0.74 -0.25 0.14
0.37 0.43 -0.03 0.82 -0.2 -0.2 -0.51 -0.73 -1.31 -1.48 0.97 -0.23
0.22 0.86 0.22 0.71 0.47 0.02 -0.98 -0.32 -1.73 -0.25 -0.96 -0.23
-0.02 0.65 0.06 0.94 0.57 -0.82 -0.34 -0.27 -1.53 0.16 -1.65 0.05
0.6 0.68 -0.09 1.21 0.29 -0.06 -0.6 -0.51 -1.26 -0.99 -1.89 -0.17
1.06 0.77 0.33 0.43 -0.07 -0.17 -1.39 -0.43 -1.05 -1.36 0.28 -0.88
0.26 0.26 -0.32 0.39 0.17 -0.09 -0.64 -0.21 -0.7 0.36 0.17 -0.14
0.56 0.93 0.34 1.02 -0.39 -0.69 -0.8 -0.67 -1.07 -0.21 -1.27 -0.03
0.43 0.45 0.34 0.62 -0.1 -0.24 -0.15 -0.34 -0.57 -0.42 0.17 -1.15
0.64 0.44 0.65 0.77 -0.62 -0.07 -1.2 -0.55 -0.82 -1.34 0.44 -0.38
0.6 0.15 0.26 0.28 -0.14 0.36 -1.19 -0.32 -0.45 0.03 -0.62 0.18
0.96 0.57 1.02 0.43 -0.9 -0.08 -1.71 -0.79 -1.0 -0.88 -1.73 0.57
0.74 0.38 0.36 0.31 -0.11 0.29 -0.96 -0.58 -0.83 -1.18 -0.46 0.51
0.19 0.08 0.47 0.58 0.07 0.36 -0.35 -0.53 -0.83 -0.61 -0.28 0.08
0.37 0.38 0.59 0.44 -0.64 0.17 -1.41 -0.87 -1.32 -0.58 -0.15 0.92
0.52 0.88 -0.77 0.87 0.34 -0.87 -0.2 -0.82 -1.85 -0.56 -0.46 0.47
0.41 0.69 0.47 0.94 -0.22 0.18 -0.78 -0.86 -1.79 -0.93 0.39 -0.96
0.61 0.45 0.72 0.81 -0.32 0.67 -1.43 -1.21 -1.59 -0.56 -0.12 -0.79
1.03 0.55 0.71 0.69 -0.93 0.45 -2.01 -0.48 -0.99 -0.18 -0.27 -2.67
0.16 0.72 -0.05 0.67 0.47 -0.89 -0.42 -0.04 -1.33 -0.18 -0.52 0.07
0.27 0.43 0.16 0.58 0.39 -0.35 -0.63 -0.44 -1.07 -0.22 0.03 -0.01
1.02 0.14 0.57 0.43 -0.67 0.11 -1.07 -1.15 -0.77 -0.76 -0.64 0.66
0.44 0.4 0.05 0.3 0.1 -0.12 -1.04 -0.39 -0.83 -0.49 -0.51 0.88
0.68 -0.03 0.49 0.26 -0.74 -0.17 -0.96 -0.67 -0.61 -0.15 -0.95 1.08
0.46 0.59 0.92 0.72 -0.02 -0.51 -2.39 -0.26 -1.85 -0.12 -2.6 0.6
0.5 0.28 -0.07 0.63 -0.72 -0.11 -1.59 -0.54 -0.78 -0.83 1.0 0.23
0.6 0.3 0.13 0.69 -0.27 0.3 -0.87 -0.84 -0.76 -1.13 0.63 -0.37
0.23 0.44 0.77 0.51 -0.38 0.24 -0.63 -0.6 -0.43 -0.15 -0.79 -0.22
0.45 0.42 0.11 0.33 -0.13 -0.15 -0.89 -0.39 -0.54 0.33 -0.91 0.44
0.47 0.51 0.14 0.5 0.05 -0.42 -0.52 -0.01 -0.56 -0.16 -0.25 -0.35
0.38 0.31 -0.03 0.53 -0.18 0.07 -1.18 -0.2 -0.33 -0.21 -0.28 0.38
0.74 0.61 0.15 0.71 -0.64 -0.41 -0.51 -0.84 -1.13 -0.72 0.33 0.12
0.55 0.2 0.14 0.94 -0.21 -0.03 -0.24 -0.6 -1.12 -0.19 -0.15 -0.35
0.65 0.45 0.65 0.55 0.18 0.53 -0.96 -0.93 -1.16 -0.92 -1.21 -0.0
0.77 0.9 0.15 0.94 -0.37 -0.31 -0.91 -0.28 -1.42 -0.99 0.12 -0.98
0.81 0.32 0.25 0.19 -0.17 0.24 -1.48 -0.53 -0.49 -0.55 -0.52 0.54
0.29 0.7 0.04 0.88 -0.04 -0.65 -0.35 -0.64 -1.1 -1.19 -1.04 0.89
0.54 0.34 0.57 0.59 -1.07 -0.29 -0.67 -0.45 -0.49 -0.41 -0.17 0.35
0.45 0.38 0.23 0.51 0.01 -0.16 -1.56 -0.58 -1.07 -0.15 -0.13 0.62
1.09 1.18 0.47 1.19 -1.28 0.1 -0.78 -1.68 -1.88 -1.94 -0.6 -1.41
0.5 0.51 0.79 1.03 -1.12 -0.33 -1.06 0.15 -1.08 -1.32 -0.95 0.21
0.52 0.47 0.81 0.75 -0.21 0.18 -1.48 -0.04 -0.62 -0.42 -1.3 -0.69
0.1 0.25 -0.33 0.67 -0.9 -0.44 -1.05 -0.1 -0.3 0.06 0.61 0.36
0.14 0.09 0.73 0.45 -0.13 -0.28 -1.02 -0.48 -0.57 -0.34 -0.44 0.73
0.73 0.25 0.3 0.21 -0.64 0.19 -1.78 -0.69 -0.85 -0.2 -0.38 0.91
0.53 0.91 0.41 1.38 0.32 -1.22 -0.75 0.1 -1.6 -1.52 -2.09 -1.04
-0.02 1.25 -0.1 1.24 0.57 -2.48 -1.46 -0.1 -1.85 -0.27 -0.21 -1.33
0.29 0.52 -0.29 0.5 -0.05 -0.21 -1.39 0.16 -0.08 0.2 -0.51 -0.0
0.45 0.76 0.11 0.8 0.05 -0.11 -0.97 -0.58 -0.77 -0.22 -1.11 0.1
-0.06 1.06 -0.78 1.17 0.48 -0.66 -0.7 0.09 -1.9 -0.71 -0.96 0.03
0.71 0.89 -0.0 0.81 -0.08 -0.09 -0.49 -0.73 -1.21 -1.25 -0.18 -0.26
0.73 0.7 0.5 0.91 -0.29 -0.66 -1.85 -0.24 -1.39 -0.4 0.36 -1.21
0.01 0.85 0.8 1.15 0.09 -0.14 -0.54 -0.2 -1.03 -0.94 -1.51 -1.57
0.91 0.65 0.73 0.19 -0.07 0.03 -1.48 -0.37 -0.77 -0.73 -1.3 0.07
0.53 0.28 0.21 0.23 0.29 0.12 -0.53 -0.02 -0.34 -0.52 -1.26 0.18
0.76 0.24 0.24 0.25 -0.45 0.11 -2.42 -0.96 -1.32 -0.64 -1.68 1.53
1.26 0.83 0.56 0.81 -0.23 -0.45 -0.98 -0.75 -1.72 -3.01 0.42 -2.68
0.66 0.54 0.23 0.88 -0.09 0.07 -0.81 -0.34 -0.83 -0.91 -0.62 -0.21
1.34 1.11 -0.18 1.12 -1.6 0.15 -1.74 -1.15 -2.04 -1.72 0.3 -1.82
0.21 0.94 0.29 0.7 0.05 -0.82 -0.66 -0.32 -1.56 -0.08 -0.87 0.29
0.5 0.57 -0.23 0.62 -0.27 -0.1 -1.35 -1.09 -1.46 0.18 0.65 0.02
0.24 0.68 0.28 0.94 0.01 0.06 -0.67 -0.47 -1.02 -0.86 -0.12 -0.5
0.7 0.59 0.39 0.47 -0.22 -0.2 -1.56 -0.31 -1.1 -0.41 -0.53 0.48
0.04 0.36 -0.09 0.58 0.23 0.2 -0.77 -0.68 -0.84 0.19 -0.56 0.43
0.57 0.55 0.51 0.56 -0.08 0.12 -0.58 -0.82 -1.21 -0.82 0.32 -0.68
-0.05 0.53 -0.27 0.73 0.43 -0.67 -0.46 -0.54 -1.09 -0.39 -0.58 0.86
0.67 0.44 0.07 0.67 -0.21 -0.09 -0.86 -0.15 -0.8 -1.14 0.57 -0.66
0.92 0.67 0.74 0.59 -0.87 0.13 -0.67 -0.41 -1.12 -1.46 0.11 -1.29
0.99 0.5 0.33 0.44 -0.43 0.21 -1.83 -0.29 -0.48 -1.18 -0.37 0.1
1.15 0.63 -0.12 1.02 -0.4 -0.37 -0.63 -0.87 -2.23 -1.39 0.65 -1.35
0.78 0.4 0.64 0.44 -0.02 0.08 -1.34 -0.26 -0.86 -0.6 -0.5 -0.23
0.76 0.44 0.58 0.53 -0.25 -0.04 -0.41 -0.52 -1.06 -0.79 0.32 -1.19
0.52 0.97 -0.21 0.8 -0.23 -0.3 -0.32 -0.12 -0.61 -0.32 -0.95 -0.64
0.49 0.49 -0.04 0.48 -0.32 0.1 -0.63 -0.56 -0.63 -0.41 -0.24 0.46

Details

Dark gray cells indicate values where the raw expression is zero (cannot be log-transformed). Blue cells indicate samples where the expression of the gene is below average and red cells indicate the gene is expressed above average in the sample. White cells are average.