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Heatmap: Cluster_38 (HCCA)

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View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are log2 transformed ratios of a genes expression in a sample divided by the mean expression level)

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Gene
12pM Fe,Midday
12pM Fe,Midnight
58pM Fe,Midday
58pM Fe,Midnight
233pM Fe,Midnight
1160pM Fe,Midday
1160pM Fe,Midnight
High carbon,Dark
High carbon,Light
Low carbon,Dark
Phloroglucinol
Silicon starvation,12h
1.25 0.3 0.6 -0.04 -0.31 0.33 -1.68 -0.26 -0.35 -1.18 -0.41 -0.48
1.29 0.61 0.63 -0.08 -0.8 0.05 -1.08 -0.31 -0.48 -0.72 -0.98 -0.31
0.98 0.37 0.7 -0.36 -0.09 0.1 -1.24 -0.46 -0.82 -0.68 -0.12 0.09
0.9 0.95 0.34 0.14 -0.19 0.14 -1.38 -0.19 -0.82 -0.97 -0.23 -0.59
1.09 0.52 0.47 -0.11 -0.45 0.2 -1.22 -0.15 -0.66 -0.64 -0.82 0.1
1.01 0.85 0.49 -0.09 -0.13 0.16 -1.35 -0.05 -0.48 -1.53 -0.47 -0.6
1.17 0.66 0.59 -0.02 -0.77 0.29 -0.77 -0.53 -1.2 -0.99 0.0 -0.63
1.05 0.41 0.1 -0.11 -0.19 0.32 -1.69 -0.24 -0.9 -0.57 -0.73 0.59
1.16 0.51 0.62 -0.01 -0.48 0.49 -1.51 -0.5 -0.8 -0.8 -0.58 -0.3
0.21 0.67 0.83 0.03 -0.24 0.19 -1.07 -0.83 -0.48 -0.4 -0.06 -0.02
1.36 0.34 0.75 -0.28 -1.06 0.27 -1.37 -0.47 -0.76 -1.08 -0.67 0.23
1.04 0.37 0.44 -0.54 -0.87 0.23 -1.08 -0.25 -0.3 -1.15 0.02 0.37
0.88 0.31 0.62 -0.04 -0.43 0.05 -0.78 -0.27 -0.41 -0.28 -0.47 -0.13
1.38 0.21 1.04 -0.34 -0.58 0.5 -2.49 -0.69 -1.16 -0.09 -0.98 -0.68
1.26 0.41 0.52 -0.07 -0.37 0.37 -1.02 -0.38 -0.67 -1.13 -0.44 -0.45
1.31 0.12 0.3 -0.43 -0.65 0.4 -2.05 -0.58 -0.22 -0.35 -1.2 0.6
1.13 0.53 0.6 -0.08 -0.59 0.39 -1.41 -0.33 -0.84 -0.47 -0.7 -0.19
0.89 0.77 0.15 0.0 -0.45 -0.09 -0.7 -0.62 -0.82 -0.04 -0.21 -0.02
1.32 0.51 0.69 -0.37 -0.58 0.18 -2.77 -0.35 -0.57 -0.82 -0.89 0.25
1.6 -0.09 0.96 -0.84 -2.77 0.49 -2.33 -0.78 -0.8 -0.42 -0.5 0.23
0.69 0.11 0.39 -0.3 -0.18 0.28 -0.55 -0.09 0.01 -0.81 -1.18 0.53
1.21 0.53 0.25 -0.09 -1.01 0.0 -1.04 -0.2 -0.09 -0.67 -0.87 0.19
1.14 0.61 1.01 -0.57 -0.01 -0.18 -1.75 -0.71 -1.15 -1.56 0.03 0.0
1.27 0.49 0.4 -0.45 -0.48 0.02 -1.02 -0.43 -0.56 -0.8 -0.11 -0.02
1.24 0.15 0.77 -0.45 -0.45 0.45 -1.35 -0.53 -0.54 -1.22 -0.32 -0.04
1.0 0.65 0.23 -0.26 -0.62 -0.17 -1.18 0.16 -0.08 -2.0 0.29 -0.13
1.2 0.57 0.2 -0.41 -0.73 -0.33 -1.09 -0.13 -0.37 -1.11 -0.24 0.53
1.09 0.43 0.1 -0.2 -0.25 -0.09 -0.99 -0.34 -0.41 -0.73 0.08 0.12
0.58 0.57 0.37 -0.12 0.19 -0.17 -0.84 -0.03 -0.46 -0.64 -0.23 0.03
0.62 0.39 0.27 -0.13 -0.32 -0.02 -1.36 -0.04 -0.63 -0.42 -0.21 0.7
1.02 0.18 0.27 -0.08 -0.37 -0.26 -0.84 -0.4 -0.68 -0.57 -0.2 0.67
0.87 0.38 0.63 0.01 -0.51 -0.0 -0.98 -0.03 -0.57 -0.93 -0.15 0.04
1.77 -0.03 1.03 -1.21 -2.51 0.52 -4.39 -0.9 -1.43 -0.93 0.07 -0.01
1.4 0.45 0.68 -0.07 -0.9 0.3 -1.99 -0.31 -0.84 -0.79 0.1 -1.35
0.98 0.52 0.29 -0.09 -0.65 0.04 -1.06 -0.06 -0.42 -1.01 0.01 0.1
1.1 0.62 0.51 -0.18 -0.68 0.01 -1.0 -0.16 -0.06 -0.98 -0.76 -0.09
1.21 0.33 0.54 -0.44 -0.83 0.3 -2.08 -0.33 -0.65 -0.74 0.04 0.21
0.85 0.55 0.48 -0.02 -0.45 0.26 -1.17 -0.12 -0.69 -0.24 -0.4 -0.27
1.67 -0.07 1.18 -1.52 -1.61 0.61 -2.94 -0.75 -0.78 -0.99 -0.12 -0.57
1.16 -0.01 0.71 -0.93 0.2 0.14 -1.82 -0.36 -0.67 -0.48 -0.83 0.47
1.2 0.34 0.74 -0.43 -0.49 0.27 -1.28 -0.26 -0.9 -0.61 -0.54 -0.01
1.4 0.13 0.52 -0.4 -0.81 0.31 -1.43 -0.27 -0.72 -0.83 -0.1 -0.05
1.43 0.4 0.7 -0.48 -0.47 0.22 -2.53 -0.59 -0.79 -0.42 -1.57 0.34
0.9 0.25 0.25 -0.28 -0.49 -0.07 -1.37 -0.07 -0.71 -0.08 -0.13 0.54
1.17 0.52 0.41 -0.39 -0.9 0.14 -1.55 -0.4 -0.46 -0.49 0.02 0.04
0.71 0.38 0.63 -0.11 -0.65 0.24 -0.62 -0.26 -0.42 -0.8 -0.38 0.26
0.95 0.24 0.37 -0.19 -0.46 0.15 -1.06 -0.18 -0.32 -1.07 0.15 0.19
1.27 0.49 0.36 -0.09 -0.9 0.33 -1.49 -0.28 -0.97 -0.87 -0.01 -0.07
0.96 0.66 0.54 -0.33 -0.54 0.04 -0.46 -0.19 -0.27 -0.55 -0.72 -0.33
0.93 0.6 0.24 -0.3 -0.43 -0.42 -1.16 -0.11 -0.42 -0.53 0.12 0.26
1.17 0.16 0.54 -0.16 -0.8 0.05 -1.55 0.01 -0.31 -1.11 0.13 -0.05
1.24 0.77 0.5 0.04 -1.04 0.15 -0.73 -0.51 -0.9 -1.79 -0.06 -0.34
0.83 0.34 0.44 -0.14 -0.32 0.04 -1.15 0.02 -0.38 -0.68 -0.28 0.23
1.25 0.04 0.59 -0.72 -0.48 0.38 -1.55 -0.27 -0.65 -0.2 -0.26 -0.08
1.03 0.71 0.54 -0.04 -0.47 -0.06 -1.26 -0.15 -0.43 -1.55 -0.17 -0.1
0.99 0.48 0.51 -0.07 -0.78 0.13 -0.68 -0.33 -0.63 -0.6 -0.05 -0.18
0.95 0.19 0.37 -0.22 -0.33 0.39 -0.9 -0.34 -0.47 -0.91 0.4 -0.37
0.97 0.73 0.09 0.08 -0.47 -0.16 -1.37 -0.03 -1.03 -0.83 0.13 0.18
1.48 0.44 0.31 -0.29 -0.76 0.29 -1.19 -0.32 -0.36 -0.76 -1.42 0.01
0.88 0.26 0.25 -0.22 -0.17 -0.16 -1.11 -0.01 -0.63 -1.09 -0.1 0.7
1.24 0.27 0.71 -0.21 -0.83 0.3 -1.23 -0.49 -0.47 -0.89 -0.53 0.06
0.83 0.51 0.33 0.09 -0.42 0.24 -1.0 0.01 -0.73 -0.67 0.03 -0.33
1.16 0.39 0.61 -0.48 -0.57 0.33 -1.82 -0.06 -0.45 -1.46 -0.34 0.19
1.29 0.37 0.7 -0.28 -0.82 0.38 -0.84 -0.49 -0.64 -1.77 -0.29 -0.12
0.78 0.17 0.36 -0.34 0.04 0.18 -0.43 -0.1 -0.09 -0.63 -0.63 0.03
0.81 0.44 0.1 0.07 -0.01 0.25 -0.59 -0.13 -0.44 -0.94 -0.27 -0.11
1.02 0.37 0.53 -0.34 -0.53 0.38 -1.51 -0.34 -0.49 -1.27 0.06 0.2
0.82 0.05 0.41 -0.3 -0.21 0.27 -0.71 -0.41 -0.36 -0.62 0.1 0.16
1.61 0.25 1.39 -0.57 -1.63 0.17 -2.91 -0.74 -1.07 -0.86 -0.81 -0.57
0.85 0.25 0.24 0.02 -0.78 -0.05 -0.94 -0.08 -0.57 -0.6 -0.38 0.77
0.98 0.95 0.65 -0.01 -0.42 -0.11 -1.23 0.02 -0.83 -1.06 -0.49 -0.58
0.71 0.66 0.64 -0.08 -0.21 0.08 -0.79 -0.48 -0.76 -0.91 -0.3 0.18
0.89 0.48 0.27 -0.04 -0.5 0.07 -0.86 0.23 -0.34 -0.85 0.13 -0.63
0.99 0.5 0.91 -0.04 -0.89 0.26 -1.1 -0.18 -0.55 -0.9 -1.01 -0.09
1.11 0.01 0.71 -0.84 -0.86 0.13 -2.86 -0.35 -0.76 -0.27 0.17 0.61
0.93 0.42 0.86 -0.27 -0.75 0.19 -2.22 -0.42 -0.42 -0.45 0.19 -0.32
1.24 0.37 0.68 -0.48 -0.5 0.18 -1.46 0.01 -0.38 -0.83 -0.58 -0.31
1.15 0.42 0.21 -0.1 -0.54 0.13 -1.07 -0.32 -0.78 -0.49 0.11 -0.12
0.81 0.44 0.34 0.03 -0.42 0.21 -1.29 -0.18 -0.83 -1.02 0.14 0.33
0.91 0.28 0.78 -0.23 -0.23 0.22 -0.87 -0.17 -0.49 -0.83 -0.19 -0.43
1.06 0.25 0.18 -0.45 -1.01 0.13 -1.06 -0.08 -0.1 -0.96 -0.1 0.55
0.77 0.63 0.29 0.11 -0.05 0.03 -0.93 -0.17 -0.87 -0.54 -0.1 -0.18
1.11 0.33 0.74 -0.26 -0.8 0.35 -1.43 -0.37 -0.44 -1.22 -0.16 0.02
1.12 0.64 0.71 -0.07 -0.31 0.01 -1.22 -0.18 -0.51 -1.26 -0.29 -0.69
0.62 0.56 0.78 0.1 -0.25 0.13 -1.8 -0.17 -0.88 -0.49 -0.15 -0.1
1.07 0.56 0.47 -0.2 -0.58 0.14 -1.53 -0.31 -0.73 -0.65 -0.68 0.46
0.92 0.49 0.73 -0.23 -0.22 0.09 -0.96 -0.26 -0.6 -0.85 -0.37 -0.11
0.89 0.47 0.42 -0.27 -0.46 -0.05 -0.69 -0.01 -0.57 -0.95 0.06 0.08
0.95 0.61 0.31 -0.11 -0.35 0.03 -0.61 -0.16 -0.82 -1.0 0.12 -0.21
1.43 0.36 0.92 -0.5 -1.03 0.32 -1.84 -0.37 -1.32 -1.38 -0.12 -0.11
1.52 0.19 0.01 -0.49 -0.73 0.45 -1.82 -0.39 -0.44 -0.86 -0.2 0.14
0.68 0.27 0.48 -0.26 -0.55 0.25 -1.15 -0.23 -0.43 -0.66 0.31 0.25
1.24 0.27 0.71 -0.21 -0.83 0.3 -1.23 -0.49 -0.47 -0.89 -0.53 0.06
0.83 0.51 0.33 0.09 -0.42 0.24 -1.0 0.01 -0.73 -0.67 0.03 -0.33
1.82 0.23 1.01 -1.11 -1.83 0.58 -4.44 -0.68 -1.06 -1.29 -1.46 0.16
0.8 0.45 0.84 -0.13 -0.42 0.09 -1.15 0.15 -0.13 -1.72 -0.49 -0.17
1.52 0.43 0.97 -0.68 -0.7 0.34 -2.23 -0.66 -0.76 -2.11 0.04 -0.68

Details

Dark gray cells indicate values where the raw expression is zero (cannot be log-transformed). Blue cells indicate samples where the expression of the gene is below average and red cells indicate the gene is expressed above average in the sample. White cells are average.