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Heatmap: Cluster_105 (HCCA)

View as: (view raw or row-normalized)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are log2 transformed ratios of a genes expression in a sample divided by the mean expression level)

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Gene
12pM Fe,Midday
12pM Fe,Midnight
58pM Fe,Midday
58pM Fe,Midnight
233pM Fe,Midnight
1160pM Fe,Midday
1160pM Fe,Midnight
High carbon,Dark
High carbon,Light
Low carbon,Dark
Phloroglucinol
Silicon starvation,12h
0.83 0.24 0.08 -0.25 -0.39 0.14 -0.85 0.16 -0.27 -0.66 -0.43 0.48
1.05 0.22 0.35 -0.28 -0.48 -0.16 -1.04 -0.33 -0.29 -0.63 -0.39 0.63
0.81 0.42 0.25 -0.33 -0.41 0.12 -0.82 -0.3 0.01 0.22 -0.49 -0.28
0.66 0.29 0.33 -0.36 -0.51 -0.04 -1.23 -0.36 -0.37 -0.17 0.04 0.66
0.27 0.06 -0.17 -0.32 -0.13 0.02 -0.42 0.13 -0.04 -0.44 -0.46 0.89
1.18 0.27 0.43 -0.49 -1.06 -0.09 -0.94 -0.54 -0.53 0.36 -1.48 0.58
0.42 0.33 0.38 -0.45 -0.38 -0.55 -1.45 0.17 -0.13 -0.06 0.04 0.62
0.53 -0.3 0.18 -0.34 -0.6 -0.27 -0.91 0.18 0.05 0.65 -0.19 0.25
0.04 -0.15 0.07 -0.05 -0.11 0.29 -0.76 -0.15 -0.2 0.17 -0.55 0.79
0.53 -0.19 0.31 -0.38 -0.74 -0.25 -0.7 0.01 0.17 -0.1 -0.14 0.72
0.98 0.45 0.16 -0.35 -0.37 -0.06 -1.63 0.43 -0.03 -0.7 0.07 -0.5
-0.01 0.2 0.59 0.0 -0.02 -0.75 -1.07 -0.19 -0.13 -0.14 -0.51 0.92
0.71 0.27 -0.03 -0.36 -0.44 -0.32 -1.74 -0.38 0.02 -0.32 -0.63 1.22
0.94 0.21 0.52 -0.52 -0.55 0.37 -1.15 -0.02 -0.1 -1.28 0.22 -0.18
0.29 0.17 0.26 -0.35 0.05 -0.11 -1.21 -0.13 -0.61 -0.04 -0.23 0.91
0.6 0.03 0.18 -0.43 -0.51 -0.09 -1.11 -0.03 -0.06 0.55 -0.01 0.13
0.7 0.16 0.2 -0.51 -1.16 -0.28 -1.45 -0.16 -0.34 -0.32 -0.29 1.3
0.26 -0.16 -0.19 -0.7 -0.06 -0.13 -0.54 0.19 0.09 -0.21 -0.6 1.09
0.52 -0.15 -0.18 -0.41 0.06 0.16 -0.86 -0.37 -0.1 0.44 -0.46 0.61
0.91 0.52 0.21 -0.53 -0.91 -0.04 -1.75 -0.68 -0.75 -1.2 0.49 0.98
0.86 0.3 0.19 -0.34 -0.5 0.09 -1.06 -0.37 -0.2 -0.89 0.31 0.44
0.46 0.13 0.03 -0.32 -0.39 -0.38 -0.91 -0.5 -0.03 0.03 -0.4 1.12
0.37 0.4 -0.04 -0.37 -0.19 -0.04 -0.87 -0.06 -0.23 -0.59 0.01 0.82
0.41 0.38 0.15 -0.31 -0.54 -0.2 -1.08 -0.5 -0.26 -0.61 -0.28 1.27
0.79 0.39 0.05 -0.3 -0.41 0.05 -1.34 -0.43 -0.55 -0.4 -0.37 0.98
0.74 0.71 0.29 -0.6 -0.52 -1.07 -2.17 -0.25 -0.41 0.44 -0.59 0.86
0.25 0.42 0.45 -0.2 0.02 -0.04 -1.91 -0.04 0.0 0.22 -0.31 0.06
-0.21 0.18 -0.47 -0.47 0.24 -0.46 -0.96 0.05 0.11 0.49 -0.41 0.9
0.83 -0.23 0.23 -1.22 -1.3 -0.07 -1.81 -0.07 0.19 -0.62 0.07 1.22
1.29 0.04 0.11 -0.89 -0.61 0.12 -2.26 -0.15 0.49 -1.04 -1.66 0.88
-0.0 0.13 -0.38 0.03 -0.02 -0.31 -0.19 0.03 -0.07 -0.59 -0.33 1.01
1.15 0.6 0.11 -0.49 -0.38 -0.74 -1.45 -0.51 -0.4 -0.53 0.4 0.36
0.31 0.31 -0.06 -0.25 0.03 0.03 -1.47 0.01 -0.02 0.35 -0.61 0.48
0.97 -0.02 -0.27 -0.46 -0.22 -0.24 -1.52 -0.24 -0.28 -0.67 0.01 1.09
0.89 0.49 0.42 -0.36 -0.86 -0.26 -1.66 0.07 0.04 0.1 -0.26 -0.1
0.46 0.35 -0.41 -0.24 -0.26 -0.17 -0.93 0.21 -0.19 -0.31 0.24 0.57
0.38 0.34 0.05 -0.52 -0.01 -0.26 -1.09 -0.07 0.05 0.1 -0.84 0.84
0.8 0.06 -0.42 -0.29 -0.06 0.15 -1.45 -0.29 -0.34 0.1 -0.26 0.76
0.8 0.3 0.03 -1.1 -0.64 -0.26 -2.92 -0.2 0.08 -0.42 0.17 1.09
0.99 0.15 0.43 -0.56 -0.32 -0.37 -1.34 0.04 -0.12 -0.63 -0.49 0.69
1.23 0.11 -0.04 -0.66 -0.34 -0.49 -2.23 -0.35 -0.42 -0.46 -0.25 1.11
0.42 0.09 -0.16 -0.32 -0.37 -0.26 -1.54 -0.02 0.02 -0.19 0.05 1.03
0.83 -0.1 -0.06 -0.73 -0.45 0.07 -1.56 -0.2 0.19 0.13 -1.01 1.01
0.52 0.27 0.18 -0.33 -0.28 -0.05 -1.13 -0.4 -0.38 -1.25 0.22 1.06
0.72 0.12 0.53 -0.35 -0.59 -0.25 -0.8 -0.06 -0.11 -1.21 -0.4 0.91
0.72 0.68 0.25 -0.14 -0.44 -0.06 -1.59 0.0 0.11 -0.28 -1.08 0.33
0.38 0.16 0.12 -0.26 -0.88 -0.02 -0.34 0.21 0.15 0.38 -0.25 -0.09
0.56 -0.0 0.14 -0.41 -0.42 -0.01 -0.94 -0.12 0.16 -0.44 -0.1 0.77
0.69 0.27 0.26 -0.26 -0.58 -0.11 -0.69 -0.17 0.0 0.03 -0.06 0.09
0.34 0.05 0.25 -0.24 -0.35 0.09 -0.73 -0.07 0.12 -0.34 -0.25 0.62
0.66 0.14 0.24 -0.48 -0.53 -0.1 -0.76 0.04 -0.09 -0.46 -0.17 0.7
1.2 0.46 -0.13 -0.5 -0.12 -0.2 -0.93 -0.67 -0.65 -0.55 -0.27 0.7
-0.03 -0.26 0.22 -0.29 -1.2 0.06 -1.22 0.34 0.35 0.52 0.85 -0.92
0.54 0.37 0.36 -0.05 -0.63 -0.2 -0.87 -0.1 0.04 -0.57 -0.04 0.42
0.38 0.12 0.06 -0.47 0.02 -0.12 -1.03 -0.24 -0.15 -0.18 -0.13 0.91
0.76 0.04 0.54 -0.73 -0.53 -0.09 -1.08 -0.22 0.23 0.08 -0.14 0.15
0.95 0.01 0.35 -0.57 -0.26 0.21 -1.19 -0.11 0.1 -0.63 -0.25 0.27
0.56 0.23 -0.1 -0.3 -0.44 0.02 -0.77 -0.26 -0.2 -0.46 0.08 0.83
0.77 0.5 0.39 -0.29 -0.45 -0.1 -1.46 -0.19 -0.36 -0.6 0.15 0.37
0.03 0.1 0.09 -0.5 0.11 0.1 -1.51 -0.01 0.01 -0.03 -0.37 0.91
-0.08 0.35 0.49 -0.31 0.08 -0.41 -1.85 -0.62 -0.71 0.43 -0.04 0.92
0.55 0.01 0.4 -0.53 -0.65 0.1 -1.31 -0.12 0.26 -0.6 -0.59 0.98
0.51 0.12 -0.07 -0.55 -0.98 -0.05 -0.86 0.16 -0.12 0.17 -0.7 1.03
0.79 0.25 0.35 -0.41 -0.61 0.07 -1.39 -0.23 -0.06 -0.43 0.5 -0.01
0.46 0.34 0.48 -0.03 -0.09 0.22 -1.06 -0.2 -0.21 -0.27 -0.72 0.3
0.98 0.35 0.35 -0.43 -1.01 -0.22 -1.29 0.03 -0.14 -0.44 -0.21 0.53
0.92 0.28 0.17 -0.34 -0.25 0.16 -1.04 -0.43 -0.11 -0.68 -0.22 0.46
0.55 0.06 0.36 -0.33 -0.64 -0.29 -0.33 0.19 -0.02 -0.37 -0.56 0.67
0.82 0.49 0.43 -0.42 -0.68 -0.27 -1.83 -0.66 -0.69 -0.97 -0.07 1.19
0.55 0.22 0.38 -0.39 -0.32 0.21 -1.04 -0.28 -0.08 -0.81 -0.11 0.68
0.68 -0.17 0.18 -0.66 -1.15 -0.42 -1.61 -0.0 -0.13 0.01 -0.08 1.23
-0.03 -0.12 0.15 -0.76 0.3 0.2 -1.39 0.12 0.13 0.06 -1.03 0.95
1.08 0.44 0.41 -0.37 -0.55 0.08 -0.98 -0.27 -0.31 -1.04 -0.39 0.37
0.53 0.42 0.18 -0.23 -0.56 -0.33 -1.42 -0.26 -0.44 -0.55 0.03 1.08
0.91 0.06 0.11 -0.41 -0.78 0.09 -1.25 -0.12 0.07 0.03 -0.54 0.59
0.54 -0.29 -0.31 -0.8 -0.19 0.12 -1.24 -0.59 -0.21 0.43 -0.65 1.29
0.51 0.38 0.04 -0.39 0.12 -0.25 -1.04 -0.02 0.06 0.18 -0.66 0.34
0.63 0.06 0.34 -0.42 -0.43 -0.11 -0.95 -0.01 -0.06 -0.04 -0.21 0.5
0.33 -0.02 0.26 -0.36 -0.02 -0.42 -1.52 -0.35 -0.04 0.27 -0.78 1.1
0.54 0.15 0.32 -0.17 -0.54 -0.06 -0.88 0.29 0.18 0.0 -1.2 0.39
0.63 0.46 0.38 -0.39 -0.6 -0.27 -1.63 -0.24 -0.28 -0.06 -0.43 0.87
0.39 -0.09 0.38 -0.27 -0.3 -0.05 -1.19 0.09 0.05 -0.07 -0.31 0.62
0.24 0.26 0.24 -0.35 -0.21 -0.15 -1.18 -0.14 0.14 0.55 -0.04 -0.0
0.99 0.45 0.43 -0.55 -0.84 -0.03 -1.8 -0.57 -0.35 -0.66 0.4 0.47
0.64 0.38 0.0 -0.42 -0.43 -0.12 -1.4 -0.28 -0.44 -0.81 0.79 0.57
0.41 0.3 -0.01 -0.52 -0.07 0.02 -1.37 -0.11 -0.06 -0.27 0.32 0.52
0.43 0.12 0.13 -0.09 0.13 0.08 -1.23 0.08 -0.12 -0.65 -0.07 0.47
0.6 0.32 0.03 -0.4 -0.44 -0.01 -1.43 -0.4 -0.44 -0.05 -0.13 0.98
0.81 0.25 0.19 -0.33 -0.76 0.11 -1.23 -0.09 -0.65 -0.64 -0.48 1.07
1.06 0.26 0.09 -0.64 -0.37 0.13 -1.4 -0.21 -0.13 -1.07 -0.61 0.9
0.16 -0.2 0.22 -0.3 0.11 0.13 -0.72 0.08 -0.22 0.01 -0.54 0.72
0.96 0.36 0.24 -0.25 -0.82 0.09 -1.07 -0.14 -0.13 -1.38 -0.12 0.59
0.62 0.3 0.04 -0.24 -0.27 0.23 -0.83 -0.46 -0.24 -0.49 -0.3 0.76
1.5 0.09 1.08 -0.48 -3.64 -0.23 -2.41 -0.5 -0.42 -0.23 -1.69 0.63
0.35 -0.26 0.26 -0.59 -0.16 0.17 -0.81 -0.47 -0.47 0.39 -1.19 1.17
0.66 -0.02 0.32 -0.65 -0.82 0.03 -1.3 -0.06 0.23 -0.4 -0.18 0.83
0.8 0.35 -0.19 -0.75 -1.01 0.08 -2.05 -0.32 -0.09 0.37 -0.21 0.86
0.09 -0.93 0.47 -0.4 -0.19 -0.15 -1.1 -0.01 -0.31 0.43 -1.25 1.29
0.3 0.14 -0.07 -0.66 -0.65 0.02 -1.55 -0.35 -0.16 -0.24 0.13 1.31
0.68 -0.1 -0.02 -0.65 -1.07 -0.27 -0.93 0.16 0.36 -0.77 -0.1 1.06
0.36 0.11 0.15 -0.33 -0.45 -0.36 -0.54 0.03 -0.07 0.72 -1.24 0.57

Details

Dark gray cells indicate values where the raw expression is zero (cannot be log-transformed). Blue cells indicate samples where the expression of the gene is below average and red cells indicate the gene is expressed above average in the sample. White cells are average.