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Heatmap: Cluster_117 (HCCA)

View as: (view raw or row-normalized)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are log2 transformed ratios of a genes expression in a sample divided by the mean expression level)

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Gene
12pM Fe,Midday
12pM Fe,Midnight
58pM Fe,Midday
58pM Fe,Midnight
233pM Fe,Midnight
1160pM Fe,Midday
1160pM Fe,Midnight
High carbon,Dark
High carbon,Light
Low carbon,Dark
Phloroglucinol
Silicon starvation,12h
0.73 0.29 0.11 -0.39 -0.26 -0.17 -1.03 -0.53 -0.72 -0.97 0.23 1.06
0.66 0.02 0.41 -0.48 -0.01 0.0 -0.82 -0.5 -0.48 -1.0 0.14 0.83
0.46 0.03 -0.52 -0.12 -0.16 -0.78 -0.39 -0.43 -0.36 -0.48 -0.35 1.44
-0.12 -0.42 0.41 -0.06 0.32 -0.05 0.76 -0.19 -0.98 -0.78 -1.04 0.75
0.52 0.33 0.95 -0.06 -0.85 -0.46 -1.67 -0.36 -0.55 0.32 -0.8 0.61
0.65 0.22 0.32 -0.49 -0.33 -0.69 -0.2 -0.03 -0.37 -1.41 -0.09 0.96
0.12 0.12 -0.24 -0.51 -0.56 -0.22 -1.0 -0.68 -0.42 -1.0 0.3 1.65
0.01 -0.04 -0.5 -0.4 0.52 -0.39 0.39 0.06 -0.29 -0.26 -0.65 0.77
-0.16 -0.42 -0.2 -0.86 -0.47 -0.08 -1.33 0.06 0.15 -0.46 -0.5 1.72
-0.48 0.06 0.44 -0.53 0.21 -1.56 0.46 0.35 0.1 -0.67 -0.35 0.65
0.48 0.08 -0.11 -0.59 -0.56 -0.36 -0.18 -0.31 -0.33 -0.91 0.4 1.11
-0.06 0.22 -0.91 -0.36 -0.25 -1.13 -0.33 -0.11 -0.62 -0.09 0.24 1.47
-0.48 -0.68 -1.27 -0.86 -0.61 -0.97 -0.98 -0.53 -0.64 -1.09 -1.16 2.53
0.39 -0.08 -0.14 -0.61 0.15 -0.29 0.31 0.22 -0.41 -0.68 -1.64 1.11
-0.21 -0.52 -0.35 -0.82 -0.51 -0.44 -0.66 -0.51 -0.23 -0.72 0.3 1.86
1.18 -0.12 0.67 -0.95 -0.84 0.15 -0.89 -0.42 -0.32 -0.61 -0.14 0.47
1.08 0.24 0.49 -0.71 -1.03 -0.01 -0.83 -0.48 -0.57 -2.03 0.23 0.87
0.6 0.34 0.36 -0.33 -0.41 -0.5 -0.21 -0.19 -0.33 -0.75 -0.08 0.68
0.6 -0.14 0.2 -0.22 -0.47 -0.31 -0.53 -0.49 -1.07 -1.87 0.01 1.52
0.75 0.06 0.11 -0.64 -0.71 -0.44 -0.17 -0.27 -0.18 -0.73 0.56 0.61
0.54 0.28 0.18 -0.48 -0.87 -0.11 -0.9 -0.51 -0.46 -0.66 0.01 1.26
-1.01 -0.49 -2.77 -1.03 -0.88 -0.06 -1.83 -0.39 -0.98 -0.55 0.77 2.24
0.98 -0.27 0.82 -0.92 -0.62 0.11 -0.75 -0.3 -0.18 -0.65 -0.08 0.39
0.77 -0.04 0.31 -0.57 -0.96 -0.09 -0.84 -0.69 -0.59 -1.03 -0.18 1.46
-0.06 -0.29 0.07 -0.52 0.07 0.1 -0.15 -0.52 -1.04 -1.45 0.03 1.53
-0.33 -0.13 0.59 -0.41 0.52 -0.91 0.31 0.34 -0.34 -0.44 -1.35 0.71
0.3 0.14 0.04 -0.42 -0.49 -0.39 -0.95 -0.48 -0.52 -0.88 0.05 1.54
0.34 0.14 0.62 -0.16 -0.14 -0.39 -0.18 -0.08 -0.23 -0.77 -0.8 0.74
0.56 0.12 -0.44 -0.77 -0.56 -0.66 0.34 -0.27 -0.1 -0.33 0.13 0.9
-0.06 0.09 -0.41 -0.46 -0.1 -0.97 -0.53 0.0 -0.28 -0.39 -1.05 1.72
1.11 -0.48 0.46 -1.38 -1.44 0.23 -1.59 -0.53 0.01 -3.03 -0.56 1.58
1.0 0.04 0.23 -0.65 -0.68 0.13 -0.96 -0.17 -0.48 -0.39 -0.36 0.83
0.53 0.06 1.02 -0.29 -0.18 -0.21 -1.29 -0.28 -0.31 -1.0 -0.24 0.62
0.14 -0.2 -0.08 -0.75 -0.28 -0.5 -1.03 -0.35 -0.45 -1.16 -0.26 1.88
0.61 -0.22 0.05 -1.06 -0.57 -0.44 -0.63 0.04 -0.03 -0.11 -1.56 1.47
0.73 0.15 0.35 -0.6 -0.08 0.12 -0.82 -0.28 -0.45 -1.19 -0.26 0.9
- -1.66 -1.88 -1.65 -2.96 -2.04 -2.76 0.14 -0.63 - 1.0 2.77
0.75 0.09 0.04 -0.4 -0.6 0.21 -0.99 -0.17 -0.39 -0.85 -0.07 0.99
0.36 -0.07 0.14 -0.52 -0.72 -0.38 -0.04 0.24 0.19 -0.74 -0.2 0.88
0.81 -0.09 0.9 -0.7 -0.05 0.02 -1.04 -0.43 -0.24 -0.63 -0.09 0.24
-0.14 0.07 -0.1 -0.6 -0.46 -0.52 -0.84 -0.11 -0.03 0.09 -0.67 1.52
0.46 0.06 -0.09 -0.26 -0.44 -0.1 -0.63 -0.22 -0.35 -0.68 0.22 1.05
0.7 0.14 0.2 -0.7 -0.17 -0.07 -0.48 -0.23 -0.27 -0.18 -0.01 0.48
0.46 -0.04 -0.21 -0.72 -0.98 -0.05 -0.65 -0.39 -0.01 -1.15 0.18 1.45
0.99 0.3 0.2 -0.38 -0.75 -0.42 -0.43 -0.67 -0.43 -0.74 -0.1 0.91
0.64 -0.04 0.48 -0.57 -0.61 -0.42 -0.3 -0.49 -0.11 -0.6 0.24 0.77
0.36 0.2 -0.31 -0.25 0.04 -0.06 0.19 -0.29 -0.85 -1.35 0.21 0.9
0.52 -0.18 0.01 -0.69 -0.77 0.31 -0.44 -0.66 -0.48 0.25 -0.48 1.17
0.91 0.39 -0.08 -0.49 -0.31 -0.01 -1.05 -0.26 -0.43 -0.79 -0.51 1.02
0.72 0.18 0.63 -0.58 -0.65 0.02 -1.01 -0.17 -0.42 -0.77 -0.23 0.83
-0.08 -0.15 -0.28 -0.63 -0.25 -0.18 -0.34 0.13 0.13 0.29 -0.05 0.85
0.69 -0.36 -0.13 -0.94 -1.09 -0.25 -0.25 0.03 0.07 -0.73 -0.24 1.32
0.8 0.14 0.7 -0.58 -0.42 0.37 -1.32 -0.37 0.01 -0.89 0.13 0.01
0.41 -0.05 0.11 -0.54 -0.26 0.03 0.16 -0.1 -0.14 -0.86 0.25 0.46
0.06 0.09 0.12 -0.19 -0.19 -0.19 0.16 -0.12 -0.55 -0.67 0.15 0.79
0.83 0.16 0.56 -0.51 -0.89 -0.14 -0.45 -0.7 -0.4 -1.39 -0.36 1.15
0.89 -0.24 0.41 -0.76 -0.75 0.28 -0.96 -0.51 -0.34 -1.22 0.21 0.99
0.55 -0.28 0.17 -0.85 -0.48 -0.18 -0.38 -0.05 -0.13 -0.2 -0.03 0.96
0.57 0.06 0.19 -0.74 -0.83 0.12 0.02 -0.36 -0.38 0.34 -0.07 0.39
0.75 0.03 0.67 -0.58 -0.46 0.13 -0.69 -0.14 -0.31 -0.59 -0.17 0.42
0.38 -0.51 -0.2 -0.88 -1.1 -0.21 -0.66 -0.34 -0.29 -0.86 0.46 1.62
0.45 0.28 0.23 -0.36 -0.21 -0.34 -0.95 -0.27 -0.4 -0.48 -0.05 1.02
0.66 0.21 0.32 -0.46 -1.04 -0.27 -0.47 -0.62 -0.8 0.34 0.09 0.76
0.03 0.06 -0.16 -0.15 -0.88 -0.65 -0.63 -0.25 -0.31 -0.06 -0.12 1.48
0.47 -0.4 -0.01 -0.37 -0.23 -0.17 0.63 0.08 -0.24 -0.85 -0.23 0.58
0.62 0.12 0.38 -0.36 -0.4 0.09 -0.78 -0.43 -0.15 -0.87 -0.29 0.91
-0.45 0.4 0.7 -0.34 0.06 0.22 0.54 -0.37 -0.84 -0.61 -0.02 -0.17
0.52 -0.24 -0.23 -0.65 -0.77 -0.32 -0.52 0.35 0.1 -0.15 0.03 0.91
0.16 0.18 -1.59 -0.18 -2.49 -1.01 -0.59 -0.25 -1.47 -3.99 0.54 2.16
1.05 0.31 0.32 -0.25 -0.94 0.28 -1.39 -0.5 -0.21 -2.71 0.15 0.73
0.98 0.24 0.39 -0.2 -0.51 -0.19 -0.73 -0.18 -0.29 -0.88 0.1 0.23
0.34 -0.36 -0.13 -0.36 -1.04 -0.52 -0.22 -0.29 0.17 -0.32 0.3 1.16
-0.15 0.16 -0.1 -0.32 -0.01 0.13 -0.53 -0.4 -0.52 -0.78 0.22 1.18
-0.32 -0.33 -0.03 -0.4 -0.65 -0.9 -1.66 -0.59 -0.64 0.68 -1.16 1.93
0.61 -0.1 -0.17 -0.51 -0.63 0.17 -0.66 -0.39 -0.23 -1.17 0.4 1.12
0.94 0.11 0.51 -0.77 -0.88 0.33 -1.05 -0.47 -0.25 -0.91 0.1 0.61
0.17 -0.42 -0.16 -0.78 -0.72 -1.11 -0.06 0.49 -0.06 -0.01 0.19 1.08
-0.25 -0.51 -0.33 -0.38 0.34 -0.21 0.72 0.17 -0.42 -0.58 -1.06 1.06
0.91 -0.05 0.64 -0.57 -0.37 0.08 -1.01 -0.44 -0.26 -0.96 0.03 0.57
0.21 0.13 -0.14 -0.39 0.05 -0.09 -0.1 -0.04 -0.32 -0.69 -0.19 0.92
0.64 0.33 0.53 -0.32 -0.4 -0.22 -0.94 -0.76 -0.87 -0.33 -0.63 1.14
1.09 0.51 0.04 -0.38 -0.88 0.03 0.29 -0.64 -0.49 -1.3 0.07 0.08
0.3 0.16 0.06 -0.29 -0.81 -0.47 -0.28 -0.2 -0.5 -0.83 0.47 1.1
-0.3 -0.8 0.53 -1.2 -0.32 0.56 0.91 -0.02 -0.09 -0.73 0.01 0.07
0.5 0.48 0.26 -0.32 -0.68 -0.42 -0.5 -0.67 -0.54 -0.91 0.27 1.04
0.83 0.21 0.16 -0.09 -0.51 -0.31 -0.64 -0.74 -0.77 -0.99 0.09 1.08
- - - -0.99 - - - -0.01 -1.24 - -1.62 3.29
0.87 0.33 0.16 -0.29 -0.26 -0.29 -1.11 -0.48 -0.36 -1.13 0.1 0.89
0.76 -0.04 -0.08 -1.04 -1.3 -0.55 -0.74 -0.2 -0.41 -0.3 0.21 1.39
0.45 -0.12 0.13 -0.6 -0.61 -0.11 -0.32 -0.16 -0.45 -0.37 -0.2 1.2
- - - -1.96 -1.11 -0.7 -0.41 0.49 -0.1 - - 2.92

Details

Dark gray cells indicate values where the raw expression is zero (cannot be log-transformed). Blue cells indicate samples where the expression of the gene is below average and red cells indicate the gene is expressed above average in the sample. White cells are average.